Nature.com পরিদর্শন করার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ.আপনি যে ব্রাউজার সংস্করণটি ব্যবহার করছেন তাতে সীমিত CSS সমর্থন রয়েছে৷সেরা অভিজ্ঞতার জন্য, আমরা আপনাকে একটি আপডেট করা ব্রাউজার ব্যবহার করার পরামর্শ দিই (অথবা ইন্টারনেট এক্সপ্লোরারে সামঞ্জস্য মোড অক্ষম করুন)৷ইতিমধ্যে, অব্যাহত সমর্থন নিশ্চিত করতে, আমরা স্টাইল এবং জাভাস্ক্রিপ্ট ছাড়াই সাইটটিকে রেন্ডার করব।
অ্যাঙ্গুস্টিফোলিয়াস লুপিন (NLL, Lupinus angustifolius L.) হল একটি লেবুজাতীয় উদ্ভিদ যা খাদ্য উৎপাদন এবং মাটির উন্নতির জন্য ব্যবহৃত হয়।ফসল হিসেবে এনএলএল-এর বিশ্বব্যাপী বিস্তার লুপিন অ্যানথ্রাকনোজ সহ অনেক প্যাথোজেনিক ছত্রাককে আকৃষ্ট করেছে, যা ধ্বংসাত্মক অ্যানথ্রাকনোজ রোগের কারণ।দুটি অ্যালিল, Lanr1 এবং AnMan, যা বর্ধিত প্রতিরোধ ক্ষমতা প্রদান করে, NLL প্রজননে ব্যবহার করা হয়েছে, কিন্তু অন্তর্নিহিত আণবিক প্রক্রিয়াগুলি অজানা থেকে যায়।এই গবেষণায়, ল্যানর 1 এবং আনম্যান মার্কারগুলি ইউরোপীয় এনএলএল নমুনাগুলি স্ক্রীন করতে ব্যবহৃত হয়েছিল।একটি নিয়ন্ত্রিত পরিবেশে ভ্যাকসিনের পরীক্ষা উভয় প্রতিরোধী দাতাদের কার্যকারিতা নিশ্চিত করেছে।ডিফারেনশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলিং প্রতিনিধি প্রতিরোধী এবং সংবেদনশীল লাইনে সম্পাদিত হয়েছিল।অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ জিন অন্টোলজি পদ "GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া", "GO:0055114 রেডক্স প্রক্রিয়া", এবং "GO:0015979 সালোকসংশ্লেষণ" এর অত্যধিক প্রকাশের সাথে যুক্ত ছিল।উপরন্তু, ল্যানর1(83A:476) লাইনটি ইনোকুলেশনের পরে দ্রুত উল্লেখযোগ্য ট্রান্সক্রিপ্টোম রিপ্রোগ্রামিং দেখায়, অন্য লাইনগুলি এই প্রতিক্রিয়ায় প্রায় 42 ঘন্টা বিলম্ব দেখায়।প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলি টিআইআর-এনবিএস, সিসি-এনবিএস-এলআরআর এবং এনবিএস-এলআরআর জিন, প্যাথোজেনেসিসে জড়িত 10টি প্রোটিন, লিপিড ট্রান্সফার প্রোটিন, এন্ডোগ্লুকান-1,3-বিটা-গ্লুকোসিডেস, গ্লাইসিন-সমৃদ্ধ কোষ প্রাচীর প্রোটিন এবং অক্সিজেনের প্রতিক্রিয়াশীল পথের জিনের সাথে যুক্ত।83A:476-এর প্রাথমিক প্রতিক্রিয়া, যার মধ্যে সালোকসংশ্লেষণের সাথে জড়িত জিনগুলির সতর্ক দমন, ছত্রাকের জীববিজ্ঞানের উদ্ভিজ্জ বৃদ্ধির পর্যায়ে সফল সুরক্ষার সাথে মিলে যায়, যা পরামর্শ দেয় যে একটি প্রভাবক অনাক্রম্যতাকে ট্রিগার করে।সামগ্রিক অনুভূমিক ড্র্যাগের মতো ম্যান্ডেলুপ প্রতিক্রিয়া মন্থর হয়।
সরু-পাতার লুপিন (NLL, Lupinus angustifolius L.) একটি উচ্চ প্রোটিন খাদ্যশস্য যা পশ্চিম ভূমধ্যসাগরীয় অঞ্চলে উদ্ভূত হয় 1,2।এটি বর্তমানে প্রাণী এবং মানুষের জন্য একটি খাদ্য ফসল হিসাবে উত্থিত হয়।সিম্বিওটিক নাইট্রোজেন ফিক্সিং ব্যাকটেরিয়া দ্বারা নাইট্রোজেন ফিক্সেশন এবং মাটির গঠনের সামগ্রিক উন্নতির কারণে এটিকে শস্য আবর্তন পদ্ধতিতে সবুজ সার হিসাবেও বিবেচনা করা হয়।এনএলএল গত শতাব্দীতে গৃহপালনের একটি দ্রুত প্রক্রিয়ার মধ্য দিয়ে গেছে এবং এখনও উচ্চ প্রজনন চাপের মধ্যে রয়েছে3,4,5,6,7,8,9,10,11,12।এনএলএল-এর ব্যাপক চাষের ফলে, প্যাথোজেনিক ছত্রাকের উত্তরাধিকার নতুন কৃষি কুলুঙ্গি তৈরি করে এবং নতুন ফসল ধ্বংসকারী রোগের সৃষ্টি করে। লুপিন চাষি এবং প্রজননকারীদের জন্য সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য ছিল অ্যানথ্রাকনোজের উপস্থিতি, যা প্যাথোজেনিক ছত্রাক, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13 দ্বারা সৃষ্ট। লুপিন চাষি এবং প্রজননকারীদের জন্য সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য ছিল অ্যানথ্রাকনোজের উপস্থিতি, যা প্যাথোজেনিক ছত্রাক, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13 দ্বারা সৃষ্ট। Наиболее примечательным для фермеров и селекционеров люпина было появление антракноза, вызванного патогеннымирбернымич, вызванного патогенныминеров Hagedorn13. লুপিন চাষি এবং প্রজননকারীদের কাছে সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য ছিল প্যাথোজেনিক ছত্রাক Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13 দ্বারা সৃষ্ট অ্যানথ্রাকনোসের উদ্ভব।对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原农民和饲养者来说, ফেইল বার্গেড, ফেইল বার্গেট লুপিন, orn13 引起的.对于羽扇豆农民和饲养者来说,最引人注目的是炭疽病的出现,它是由病原真走可 Наиболее поразительным для фермеров и селекционеров люпина является появление антракноза, вызываемого патомерберков патомербегон , Feiler & Hagedorn13. লুপিন চাষি এবং প্রজননকারীদের কাছে সবচেয়ে আকর্ষণীয় হল প্যাথোজেনিক ছত্রাক Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler এবং Hagedorn13 দ্বারা সৃষ্ট অ্যানথ্রাকনোসের উদ্ভব।রোগের প্রথম দিকের রিপোর্টগুলি ব্রাজিল এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র থেকে এসেছে, যথাক্রমে 1912 এবং 1929 সালে সাধারণত লক্ষণগুলি উপস্থিত হয়েছিল।যাইহোক, প্রায় 30 বছর পর, প্যাথোজেনটিকে Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz হিসাবে মনোনীত করা হয়েছিল। এবং স্যাক।, টেলিমর্ফ গ্লোমেরেলা সিঙ্গুলাটা (স্টোনম্যান) স্পালড। এবং স্যাক।, টেলিমর্ফ গ্লোমেরেলা সিঙ্গুলাটা (স্টোনম্যান) স্পালড। & Sacc., телеоморф Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. এবং স্যাক।, গ্লোমেরেলা সিঙ্গুলাটা (স্টোনম্যান) স্পালডের টেলিমর্ফ। এবং স্যাক। এবং স্যাক। & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld в Целенаправленной морфологии. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld in Targeted Morphology. এবং এইচ. শ্রেঙ্ক,। এবং এইচ. শ্রেঙ্ক, .এবং এইচ. শ্রেঙ্ক। এবং এইচ. 施伦克,। এবং এইচ. 施伦克,।এবং এইচ. শ্লেঙ্ক, .20 শতকের মাঝামাঝি সময়ে করা প্রাথমিক রোগের ফিনোটাইপিং NLL এবং হলুদ লুপিন (L. luteus L.) অ্যাকসেশানে কিছুটা প্রতিরোধ দেখায়, কিন্তু পরীক্ষিত সমস্ত সাদা লুপিন (L. albus L.) অ্যাক্সেসগুলি অত্যন্ত সংবেদনশীল ছিল15,16।গবেষণায় দেখা গেছে যে অ্যানথ্রাকনোজের বিকাশ বর্ধিত বৃষ্টিপাত (বাতাসের আর্দ্রতা) এবং তাপমাত্রা (12-28 ডিগ্রি সেলসিয়াসের মধ্যে) এর সাথে যুক্ত, যা উচ্চ তাপমাত্রায় প্রতিরোধের লঙ্ঘনের দিকে পরিচালিত করে 17, 18। প্রকৃতপক্ষে, কনিডিয়া অঙ্কুরিত হতে এবং রোগ শুরু হওয়ার জন্য প্রয়োজনীয় সময় , 4 গুণ কম ছিল (1 ° সেন্টিগ্রেড 4 ঘন্টার কম) শর্ত19.এইভাবে, চলমান বৈশ্বিক উষ্ণতা এনথ্রাকনোজের বিস্তারের দিকে পরিচালিত করেছে।যাইহোক, ফ্রান্স (1982) এবং ইউক্রেন (1983) এ রোগটি একটি আসন্ন হুমকির আশ্রয়দাতা হিসাবে পরিলক্ষিত হয়েছিল, কিন্তু 20,21 সময়ে লুপিন শিল্প দ্বারা দৃশ্যত উপেক্ষা করা হয়েছিল।কয়েক বছর পরে, এই বিধ্বংসী রোগটি সারা বিশ্বে ছড়িয়ে পড়ে এবং অস্ট্রেলিয়া, পোল্যান্ড এবং জার্মানির মতো প্রধান লুপিন উৎপাদনকারী দেশগুলিকেও প্রভাবিত করে 22,23,24।1990-এর দশকের মাঝামাঝি একটি অ্যানথ্রাকনোজ প্রাদুর্ভাবের পরে, ব্যাপক স্ক্রিনিংয়ের ফলে NLL19 নমুনাগুলিতে বেশ কয়েকটি প্রতিরোধী দাতা সনাক্ত করা হয়েছিল।অ্যানথ্রাকনোজের এনএলএল প্রতিরোধ বিভিন্ন জার্মপ্লাজম উত্সে পাওয়া দুটি পৃথক প্রভাবশালী অ্যালিল দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়: চাষে তানজিল এবং ওংগা এবং কাল্টিভারে আনমান।মান্দালে 25, 26. এই অ্যালিলগুলি আণবিক মার্কারগুলির পরিপূরক যা প্রজনন কর্মসূচিতে প্রতিরোধী জার্মপ্লাজম নির্বাচনকে সমর্থন করে 25,26,27,28,29,30৷প্রতিরোধী প্রজনন লাইন 83A:476 ল্যানর1 অ্যালিল বহনকারী সংবেদনশীল বন্য রেখা P27255 দিয়ে অতিক্রম করা হয়েছিল অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের জন্য আলাদা করে একটি RIL জনসংখ্যা পাওয়ার জন্য, যার ফলে ক্রোমোজোম NLL-1131, lo332. locinging, 32. ম্যাপ ম্যাপ থেকে ল্যানর1 লোকাসকে ক্রোমোজোম NLL-1131-এ বরাদ্দ করা সম্ভব হয়েছিল। একটি জিনোমিক ফ্রেমওয়ার্কের সাথে অ্যানথ্রাকনোজ করার জন্য, NLL একই ক্রোমোজোমে (NLL-11) তিনটি অ্যালিলের অবস্থান প্রকাশ করেছে, কিন্তু ভিন্ন অবস্থানে 29,34,35।যাইহোক, RIL-এর স্বল্প সংখ্যক এবং মার্কার এবং সংশ্লিষ্ট অ্যালিলের মধ্যে বড় জেনেটিক দূরত্বের কারণে, তাদের অন্তর্নিহিত জিন সম্পর্কে কোনও নির্ভরযোগ্য সিদ্ধান্তে পৌঁছানো যায় না।অন্যদিকে, লুপিনগুলিতে বিপরীত জেনেটিক্সের ব্যবহার তাদের খুব কম পুনর্জন্ম সম্ভাবনার কারণে কঠিন, যা জেনেটিক ম্যানিপুলেশনকে জটিল করে তোলে37।
83A:476 (Lanr1) এবং Mandelup (AnMan) এর মতো সমজাতীয় অবস্থায় কাঙ্খিত অ্যালিল বহনকারী গৃহপালিত জার্মপ্লাজমের বিকাশ বন্য জনগোষ্ঠীতে অ্যালিলের বিরোধী সংমিশ্রণের উপস্থিতির মুখে অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের অধ্যয়নের দরজা খুলে দিয়েছে।আণবিক প্রক্রিয়ার সম্ভাবনা।নির্দিষ্ট জিনোটাইপ দ্বারা উত্পন্ন প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া তুলনা.এই গবেষণায় এনএলএল-এর প্রাথমিক ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়া সি. লুপিনি ভ্যাকসিনেশনের মূল্যায়ন করা হয়েছে।প্রথমত, 215 লাইন সমন্বিত একটি ইউরোপীয় NLL জার্মপ্লাজম প্যানেল আণবিক মার্কার ব্যবহার করে স্ক্রীন করা হয়েছিল যা Lanr1 এবং AnMan অ্যালিলগুলিকে চিহ্নিত করে।অ্যানথ্রাকনোজ ফেনোটাইপিং তারপরে 50টি এনএলএল লাইনে সঞ্চালিত হয়েছিল, যা আগে আণবিক মার্কারগুলির জন্য নিয়ন্ত্রিত অবস্থায় নির্বাচিত হয়েছিল।এই পরীক্ষাগুলির উপর ভিত্তি করে, দুটি পরিপূরক পদ্ধতি ব্যবহার করে ডিফারেনশিয়াল ডিফেন্স জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলিংয়ের জন্য অ্যানথ্রাকনোজ রেজিস্ট্যান্স এবং Lanr1/AnMan অ্যালিলিক কম্পোজিশনের মধ্যে পৃথক চারটি লাইন নির্বাচন করা হয়েছিল: উচ্চ-থ্রুপুট আরএনএ সিকোয়েন্সিং এবং রিয়েল-টাইম পিসিআর কোয়ান্টিফিকেশন।
Lanr1 (Anseq3 এবং Anseq4) এবং AnMan (Anseq4) এবং AnMan (AnManM1) মার্কার সহ NLL জার্মপ্লাজম (N = 215) এর একটি সেটের স্ক্রীনিং দেখায় যে শুধুমাত্র একটি লাইন (95726, Salamanca-b এর কাছে) "প্রতিরোধের" সমস্ত মার্কারের জন্য "প্রতিরোধ" পাওয়া যায় 158 (~73.5%) লাইনে সমস্ত মার্কারের অনুপাত।তেরোটি লাইন Lanr1 মার্কারের দুটি "প্রতিরোধী" অ্যালিল তৈরি করেছে এবং 8টি লাইন Lanr1-এর "প্রতিরোধী" অ্যালিল তৈরি করেছে।চিহ্নিতকারীAnMan মার্কারের "প্রতিরোধ" অ্যালিল (পরিপূরক সারণী S1)।Anseq3 চিহ্নের জন্য দুটি লাইন ছিল ভিন্নধর্মী এবং AnManM1 চিহ্নিতকারীর জন্য একটি ভিন্নধর্মী।42 লাইন (19.5%) Anseq3 এবং Anseq4 অ্যালিলের বিপরীত পর্যায়গুলি বহন করে, যা এই দুটি অবস্থানের মধ্যে পুনর্মিলনের একটি উচ্চ ফ্রিকোয়েন্সি নির্দেশ করে।নিয়ন্ত্রিত অবস্থার অধীনে অ্যানথ্রাকনোজ ফেনোটাইপগুলি (পরিপূরক সারণী S2) পরীক্ষিত জিনোটাইপগুলির প্রতিরোধে পরিবর্তনশীলতা প্রকাশ করেছে, যা অ্যানথ্রাকনোজের তীব্রতায় প্রতিফলিত হয়েছিল।গড় স্কোরের পার্থক্য 1.8 (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী) থেকে 6.9 (সংবেদনশীল) এবং উদ্ভিদের ওজনের পার্থক্য 0.62 (সংবেদনশীল) থেকে 4.45 গ্রাম (প্রতিরোধী) পর্যন্ত। পরীক্ষার দুটি প্রতিলিপিতে পরিলক্ষিত মানগুলির মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য সম্পর্ক ছিল (রোগের তীব্রতার স্কোরের জন্য 0.51, উদ্ভিদের ওজনের জন্য P = 0.00017 এবং 0.61, P < 0.0001) পাশাপাশি এই দুটি প্যারামিটারের মধ্যে (− 0.59 এবং − 0.77, P < 0.000)। পরীক্ষার দুটি প্রতিলিপিতে পর্যবেক্ষণ করা মানগুলির মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য সম্পর্ক ছিল (রোগের তীব্রতার স্কোরের জন্য 0.51, উদ্ভিদের ওজনের জন্য P = 0.00017 এবং 0.61, P < 0.0001) পাশাপাশি এই দুটি পরামিতির মধ্যে (− 0.59 এবং − 0.77, P <100)। Выявлена ​​достоверная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях эксперимента (0,51 для балоя, баловями, 0,51 и 0,61 для массы растения, P < 0,0001), а также между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,77, Р < 0,00001) 0,0001)। পরীক্ষার দুটি পুনরাবৃত্তিতে পরিলক্ষিত মানগুলির মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য পারস্পরিক সম্পর্ক পাওয়া গেছে (রোগের তীব্রতার স্কোরের জন্য 0.51, উদ্ভিদের ওজনের জন্য P = 0.00017 এবং 0.61, P < 0.0001), সেইসাথে এই দুটি পরামিতির মধ্যে (- 0.59 এবং -0.77, P < 0 010)।在两次重复实验中观察到的值之间存在显着相关性（疾病严重程度评分为程度评分为0.51,0.51 0.61, P < 0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 和- 0.77, P <0.0001)।在 两 次 重复 实验 中 观察 的 值 之间 存在 相关性 （疾病 严重 程度 严重 程度 评 分丈 5 0.00017 ， 植物 为 0.61 ， p <0.0001） 以及 两 个 参数 之间 （（（（- 0.59 和–59和-59和- 0.77, P < 0.0001)। নাম растения 0,61, P <0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,0001) 0,77, P <0,0001। সদৃশ মানগুলির মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য সম্পর্ক ছিল (রোগের তীব্রতা স্কোর 0.51, P = 0.00017 এবং উদ্ভিদের ওজন 0.61, P < 0.0001) এবং এই দুটি প্যারামিটারের মধ্যে (-0.59 এবং -0 .0001) 0.707, P<001। ).সংবেদনশীল গাছগুলিতে দেখা যায় এমন সাধারণ লক্ষণগুলির মধ্যে রয়েছে "মেষপালকের ধনুকের" কাঠামোর মতো কান্ডের কাঁটা এবং বাঁকানো, এর পরে কমলা/গোলাপী স্পোরোজয়েটগুলির সাথে ডিম্বাকৃতির ক্ষত (পরিপূরক চিত্র 1)।ল্যানর1 (83A:476 এবং তানজিল) এবং অ্যানম্যান (ম্যান্ডেলআপ) জিন বহনকারী অস্ট্রেলিয়ান অ্যাক্সেসগুলি মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, 0.0331 এবং 0.0036)।কিছু লাইন যা "প্রতিরোধী" Lanr1 এবং/অথবা AnMan অ্যালিলও বহন করে রোগের লক্ষণ দেখায়।
মজার ব্যাপার হল, কিছু এনএলএল লাইনে কোনো "প্রতিরোধী" মার্কার অ্যালিলের অভাব রয়েছে যা উচ্চ স্তরের অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের (Lanr1 বা AnMan জিনোটাইপের তুলনায় তুলনীয় বা বেশি) প্রকাশ করেছে, যেমন বোরগিন (উভয় প্যারামিটারের জন্য P মান <0.0001), বোজার (P মান <0.0001 এবং B-09/4/4/4-এর জন্য উদ্ভিদ ওজন) (স্কোরের জন্য P মান <0.0001 এবং ওজনের জন্য অ-গুরুত্বপূর্ণ)। মজার ব্যাপার হল, কিছু এনএলএল লাইনে কোনো "প্রতিরোধী" মার্কার অ্যালিলের অভাব রয়েছে যা উচ্চ স্তরের অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের (Lanr1 বা AnMan জিনোটাইপের তুলনায় তুলনীয় বা বেশি) প্রকাশ করেছে, যেমন বোরগিন (উভয় প্যারামিটারের জন্য P মান <0.0001), বোজার (P মান <0.0001 এবং B-09/4/4/4-এর জন্য উদ্ভিদ ওজন) (স্কোরের জন্য P মান <0.0001 এবং ওজনের জন্য অ-গুরুত্বপূর্ণ)। Интересно, что несколько линий NLL, лишенных какого-либо «резистентного» маркерного аллеля, показали высокий уровень увастень высокий уровень увости вимый или более высокий, чем для генотипов Lanr1 или AnMan), таких как Boregine (значение P <0,0001 для обоих параметров), বোরজিন, বোরজিন и 0,001 для массы растения) и популяции B-549/79b (значение P <0,0001 для оценки и незначимо для массы)। মজার বিষয় হল, কোনো 'প্রতিরোধী' মার্কার অ্যালিলের অভাব নেই এমন বেশ কয়েকটি NLL লাইন অ্যানথ্রাকনোজ (Lanr1 বা AnMan জিনোটাইপের তুলনায় তুলনীয় বা তার চেয়ে বেশি), যেমন বোরগিন (উভয় প্যারামিটারের জন্য P মান <0.0001), বোজার (P মান <0.001 এবং উদ্ভিদের ওজন 0.0501 এবং B-4001 ওজন)। /79b (মূল্যায়নের জন্য P মান <0.0001 এবং ওজনের জন্য উল্লেখযোগ্য নয়)।有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽病抗怗型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001）得分两0.0001）得分两0.0001，例如参高）种群B-549/79b（得分P 值< 0.0001, 重量不显着）। এটি আকর্ষণীয় যে কিছু NLL সিস্টেমে যেগুলির কোনও "অ্যান্টিজেনিক" মার্কার নেই সেগুলি উচ্চ অনুভূমিক প্রতিরোধের (Lanr1 বা AnMan জিনের সমতুল্য বা উচ্চতর) দেখায়, যেমন বোরজিন (উভয় প্যারামিটার P < 0.0001), বোজার (P মান < 0.0001, উদ্ভিদের ওজন) 0.4/7 মান 0.09/ 0.091 1, ওজন উল্লেখযোগ্য নয়)। Интересно, что некоторые линии NLL, лишенные каких-либо маркерных аллей «резистентности», показали высокие уровни устовымисти или выше, чем у генотипов Lanr1 или AnMan), такие как Boregine (значение P для обоих параметров <0,0001), বোজার (значение P <0,000п,001,00001,0001) ляция B-549/79b (оценка P-значение <0,0001, масса незначительна)। মজার বিষয় হল, কিছু এনএলএল লাইনে কোনো 'প্রতিরোধ' মার্কার অ্যালিলের অভাব রয়েছে উচ্চ মাত্রার অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের (Lanr1 বা AnMan জিনোটাইপের সাথে তুলনীয় বা তার চেয়ে বেশি), যেমন বোরগিন (উভয় প্যারামিটারের জন্য P মান <0.0001), বোজার (P-মান <0. 0. 9/0, জনসংখ্যার ওজন 0. 019 এবং উদ্ভিদের ওজন) P-মান <0.0001, ওজন উল্লেখযোগ্য নয়)।এই ঘটনাটি প্রতিরোধের একটি অভিনব জেনেটিক উত্সের সম্ভাবনার পরামর্শ দেয়, মার্কার জিনোটাইপ এবং রোগের ফিনোটাইপগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্কের পরিলক্ষিত অভাব ব্যাখ্যা করে (~0.42 থেকে ~0.98 পর্যন্ত P মান)।এইভাবে, কোলমোগোরভ-স্মিরনভ পরীক্ষায় দেখা গেছে যে অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের ডেটা প্রায় স্বাভাবিকভাবে স্কোর (P-মান 0.25 এবং 0.11) এবং উদ্ভিদের ভর (P-মান 0.47 এবং 0.55) এর জন্য বিতরণ করা হয়েছিল, পরামর্শ দেয় যে আমি অনুমান করি যে AnM এবং Lanan এর চেয়ে বেশি অ্যালিল জড়িত।
অ্যানথ্রাকনোজ রেজিস্ট্যান্স স্ক্রীনিং-এর ফলাফলের উপর ভিত্তি করে, ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণের জন্য 4টি লাইন নির্বাচন করা হয়েছিল: 83A:476, বোরেগিন, ম্যান্ডেলআপ, এবং জনসংখ্যা 22660। এই লাইনগুলিকে RNA সিকোয়েন্সিং দ্বারা ইনোকুলেশন পরীক্ষায় অ্যানথ্রাক্স প্রতিরোধের জন্য পুনরায় পরীক্ষা করা হয়েছিল, যদি তারা পূর্ববর্তী পরীক্ষায় একই ছিল।স্কোরের মানগুলি নিম্নরূপ ছিল: বোরেগিন (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), ম্যান্ডেলপ (3.82 ± 1.42) এবং জনসংখ্যা 22660 (6.11 ± 1.29)।
Illumina NovaSeq 6000 প্রোটোকল প্রতি নমুনা (29.7 থেকে 54.4 Mreads) (পরিপূরক সারণী S3) গড়ে 40.5 Mread জোড়া অর্জন করেছে।রেফারেন্স সিকোয়েন্সে অ্যালাইনমেন্ট স্কোর 75.5% থেকে 88.6% পর্যন্ত।জৈবিক প্রতিলিপিগুলির মধ্যে পরীক্ষামূলক বৈকল্পিকগুলির মধ্যে পঠিত গণনার ডেটার গড় পারস্পরিক সম্পর্ক 0.812 থেকে 0.997 (মানে 0.959) পর্যন্ত। বিশ্লেষণ করা 35,170টি জিনের মধ্যে 2917টি কোনো অভিব্যক্তি প্রকাশ করেনি এবং অন্যান্য 4785টি জিন নগণ্য স্তরে প্রকাশ করা হয়েছিল (বেস গড় <5)। বিশ্লেষণ করা 35,170টি জিনের মধ্যে 2917টি কোনো অভিব্যক্তি প্রকাশ করেনি এবং অন্যান্য 4785টি জিন নগণ্য স্তরে প্রকাশ করা হয়েছিল (বেস গড় <5)। Из 35 170 проанализированных генов 2917 не проявляли экспрессии, а остальные 4785 генов экспрессировались на незвнализированных генов 2917 е <5)। বিশ্লেষণ করা 35,170টি জিনের মধ্যে 2917টি কোনো অভিব্যক্তি দেখায়নি এবং অবশিষ্ট 4785টি জিন একটি নগণ্য স্তরে প্রকাশ করা হয়েছিল (বেস মানে <5)।在分析的35,170 个基因中，2917 个没有表达，其他4785 个基因的表达可以因的表达可以忽略不计﹡）35,170 Из 35 170 проанализированных генов 2917 не экспрессировались, а остальные 4785 генов имели незначительную экспрессировались (<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ) বিশ্লেষণ করা 35,170টি জিনের মধ্যে 2917টি প্রকাশ করা হয়নি এবং বাকি 4785টি জিনের নগণ্য অভিব্যক্তি ছিল (বেস মানে <5)।এইভাবে, পরীক্ষার সময় প্রকাশ করা জিনের সংখ্যা (বেস গড় ≥ 5) ছিল 27,468 (78.1%) (পরিপূরক সারণী S4)।
প্রথম সময় থেকে, সমস্ত এনএলএল লাইন ট্রান্সক্রিপ্টোম (সারণী 1) পুনঃপ্রোগ্রামিং করে সি. লুপিনি (স্ট্রেন কোল-08) এর ইনোকুলেশনে প্রতিক্রিয়া জানায়, তবে, লাইনগুলির মধ্যে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য পরিলক্ষিত হয়।এইভাবে, প্রতিরোধ রেখা 83A:476 (Lanr1 জিন বহন করে) এই সময় পয়েন্টে অন্যান্য সময় পয়েন্টের তুলনায় বিচ্ছিন্ন আপ-এবং ডাউন-জিনের সংখ্যা 31-69-গুণ বৃদ্ধির সাথে প্রথম টাইম পয়েন্টে (6 hpi) উল্লেখযোগ্য ট্রান্সক্রিপ্টোম রিপ্রোগ্রামিং দেখায়।উপরন্তু, এই শিখরটি স্বল্পস্থায়ী ছিল, কারণ দ্বিতীয় সময় বিন্দুতে (12 hpi) শুধুমাত্র কয়েকটি জিনের অভিব্যক্তি উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত ছিল।মজার বিষয় হল, বোরগিন, যা গ্রাফ্ট পরীক্ষায় উচ্চ স্তরের প্রতিরোধও দেখিয়েছিল, পরীক্ষার সময় এত বড় ট্রান্সক্রিপশনাল রিপ্রোগ্রামিং করেনি।যাইহোক, ডিফারেন্সিয়ালভাবে প্রকাশিত জিনের সংখ্যা (DEG) বোরগিনের জন্য একই ছিল এবং 83A:476 12 HPI-তে।ম্যান্ডেলুপ এবং জনসংখ্যা 22660 উভয়ই শেষ সময় বিন্দুতে (48 l/s) ডিইজি শিখর দেখিয়েছে, যা প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়ায় একটি আপেক্ষিক বিলম্ব নির্দেশ করে।
কারণ 83A:476 অন্যান্য সমস্ত লাইনের তুলনায় 6 HPI-তে C. লুপিনির প্রতিক্রিয়ায় ব্যাপক ট্রান্সক্রিপ্টোম রিপ্রোগ্রামিং করেছে, এই সময়ে পর্যবেক্ষণ করা ডিইজিগুলির ~91% ছিল বংশ-নির্দিষ্ট (চিত্র 1)।যাইহোক, অধ্যয়ন লাইনের মধ্যে প্রাথমিক প্রতিক্রিয়াগুলিতে কিছু ওভারল্যাপ ছিল, যেমন 68.5%, 50.9%, এবং 52.6% DEG বোরগিন, ম্যান্ডেলআপ এবং জনসংখ্যা 22660, নির্দিষ্ট সময়ে নির্দিষ্ট সময়ে 83A:476 তে পাওয়া সেইগুলির সাথে ওভারল্যাপ হয়েছে।যাইহোক, এই ডিইজিগুলি বর্তমানে 83A:476 ব্যবহার করে সনাক্ত করা সমস্ত ডিইজিগুলির মধ্যে শুধুমাত্র একটি ছোট ভগ্নাংশের (0.97-1.70%) জন্য দায়ী।উপরন্তু, সমস্ত লাইন থেকে 11টি ডিইজি এই সময়ে সুসঙ্গত ছিল (পরিপূরক সারণী S4-S6), যার মধ্যে উদ্ভিদের প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলির সাধারণ উপাদানগুলি অন্তর্ভুক্ত ছিল: লিপিড ট্রান্সফার প্রোটিন (TanjilG_32225), এন্ডোগ্লুকান-1,3-β-গ্লুকোসাইড এনজাইম (TanjilG_233384), দুটি স্ট্রেস প্রোটিন (S4-2384) jilG_31531), মৌলিক ল্যাটেক্স প্রোটিন (TanjilG_32352), এবং দুটি গ্লাইসিন-সমৃদ্ধ কাঠামোগত কোষ প্রাচীর প্রোটিন (TanjilG_19701 এবং TanjilG_19702)।83A:476 এবং বোরেগিনের মধ্যে 24 HPI (মোট 16-38% DEG) এবং Mandelup এবং জনসংখ্যা 22660-এর মধ্যে 48 HPI (মোট 14-20% DEG) এর মধ্যে ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়াগুলির মধ্যে তুলনামূলকভাবে উচ্চ ওভারল্যাপ ছিল।
ভেন ডায়াগ্রামে কোলেটোট্রিকাম লুপিনি (পোল্যান্ডের উইরজেনিসে লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত স্ট্রেন Col-08) সংকীর্ণ-লেভড লুপিন (NLL) লাইনে ডিফারেন্সিয়ালভাবে প্রকাশিত জিনের সংখ্যা (DEG) দেখানো হয়েছে।এনএলএল লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছে: 83A:476 (প্রতিরোধী, ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), বোরগিন (প্রতিরোধী, জেনেটিক পটভূমি অজানা), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে) এবং জনসংখ্যা 22660 (খুব সংবেদনশীল)।সংক্ষিপ্ত রূপ এইচপিআই টিকা দেওয়ার কয়েক ঘন্টা পরে থাকে।গ্রাফটি সরল করার জন্য শূন্য মানগুলি সরানো হয়েছে।
ক্যানোনিকাল আর জিন ডোমেনগুলির উপস্থিতির জন্য 6 এইচপিআই-তে ওভার এক্সপ্রেসড জিনের সেট বিশ্লেষণ করা হয়েছিল (পরিপূরক সারণী S7)।এই গবেষণায় শুধুমাত্র 83A:476 এ NBS-LRR ডোমেনের সাথে ক্লাসিক রোগ প্রতিরোধের জিনের ট্রান্সক্রিপ্টোম ইনডাকশন প্রকাশ করা হয়েছে।এই সেটটিতে একটি TIR-NBS-LRR জিন (tanjilg_05042), পাঁচটি CC-NBS-LRR জিন (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, এবং 611LG, tanjilg, এবং 61LG, Tanjilg-640) 62), এবং চারটি NBS-LRRE (tanjilg_16162) পাশাপাশি চারটি NBS-Lrr (tanjilg_16162) এবং চারটি NBS-LRR (TANJILG_16162)৷এই সমস্ত জিনের ক্যানোনিকাল ডোমেনগুলি সংরক্ষিত ক্রমগুলিতে সাজানো রয়েছে।এনবিএস-এলআরআর ডোমেইন জিনগুলি ছাড়াও, 6 এইচপিআই-তে বেশ কয়েকটি আরএলএল কাইনেস সক্রিয় করা হয়েছিল, যেমন একটি বোরেগিনে (তানজিলজি_19877), দুটি ম্যান্ডেলুপে (তানজিলজি_07141 এবং তানজিলজি_19877) এবং জনসংখ্যা 22660 (তানজিলজি1304 এবং তানজিলজি1304)। 27:476।
সি. লুপিনি (স্ট্রেন Col-08) এর সাথে ইনোকুলেশনের প্রতিক্রিয়ায় উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত অভিব্যক্তি সহ জিনগুলি জিন অন্টোলজি (GO) সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ (পরিপূরক সারণী S8) এর শিকার হয়েছিল। সর্বাধিক ঘন ঘন জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দটি ছিল "GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া" যা উচ্চ তাত্পর্য (P মান <0.001) (চিত্র 2) সহ 16টির মধ্যে 6টি (সময় × লাইন) সংমিশ্রণে উপস্থিত হয়েছিল। সর্বাধিক ঘন ঘন জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দটি ছিল "GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া" যা উচ্চ তাত্পর্য (P মান <0.001) (চিত্র 2) সহ 16টির মধ্যে 6টি (সময় × লাইন) সংমিশ্রণে উপস্থিত হয়েছিল। Наиболее часто часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 защитный ответный ответ, время × линия) комбинаций с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2)। সর্বাধিক ঘন ঘন জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দটি ছিল 'GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া', যা 16টির মধ্যে 6টিতে (সময় × বংশ) উচ্চ তাত্পর্য (P মান <0.001) (চিত্র 2) এর সমন্বয়ে উপস্থিত হয়েছিল।最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”，它出现在16 个（时间程个（时间程具有高显着性（P 值< 0.001）（图2）। সবচেয়ে প্রতিনিধিত্বমূলক জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দটি হল "GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া", যা 16টির মধ্যে 6টিতে (时间×线) সংমিশ্রণে দেখা যায়, উচ্চ তাত্পর্য সহ (P মান <0.001) (图2)। Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া», который появленным который появленным мя × линия) с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2)। সর্বাধিক ঘন ঘন জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দটি ছিল 'GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া', যা উচ্চ তাত্পর্য (P মান <0.001) (চিত্র 2) সহ 16টির মধ্যে 6টি সংমিশ্রণে (সময় × লাইন) উপস্থিত হয়েছিল।এই শব্দটি 83A: 476 এবং বোরগিন (6 এবং 24 এইচপিআই) এবং এক সময়ে ম্যান্ডেলআপ এবং জনসংখ্যা 22660 (যথাক্রমে 12 এবং 6 এইচপিআই) এ দুটি সময় পয়েন্টে অতিরিক্তভাবে উপস্থাপন করা হয়েছিল।এটি একটি প্রত্যাশিত ফলাফল, প্রতিরোধী লাইনের অ্যান্টিফাঙ্গাল প্রতিক্রিয়া হাইলাইট করে।উপরন্তু, 83A:476 "GO:0055114 রেডক্স প্রক্রিয়া" শব্দটি দ্বারা উপস্থাপিত অক্সিডেটিভ বিস্ফোরণের সাথে সম্পর্কিত জিনগুলিকে দ্রুত প্ররোচিত করে সি. লুপিনির প্রতি প্রতিক্রিয়া জানায়, একটি নির্দিষ্ট প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া নির্দেশ করে, যখন বোরগিন 'GO' শব্দটির সাথে সম্পর্কিত নির্দিষ্ট প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া প্রকাশ করে।:0006950 স্ট্রেস প্রতিক্রিয়া”।জনসংখ্যা 22660 সেকেন্ডারি মেটাবোলাইট জড়িত অনুভূমিক প্রতিরোধের প্রতিক্রিয়া সক্রিয় করেছে, "GO:0016104 প্রসেস অফ ট্রাইটারপিন বায়োসিন্থেসিস" এবং "GO:0006722 প্রসেস অফ ট্রাইটারপেন মেটাবলিজম" (উভয়টি পরিভাষা এনজিও-এর পরিভাষা হিসাবে বিবেচনা করে) অত্যধিক সংখ্যক পদ হাইলাইট করেছে। সিস, ম্যান্ডেলুপ প্রতিক্রিয়া স্থায়িত্ব ছিল বোরগিন এবং জনসংখ্যা 22660 এর মধ্যে। উপরন্তু, প্রাথমিক প্রতিক্রিয়া 83A:476 (6 hpi) এবং বিলম্বিত প্রতিক্রিয়া ম্যান্ডেলুপ এবং জনসংখ্যা 22660-এর মধ্যে রয়েছে GO:0015979 'সালোকসংশ্লেষণ' এবং অন্যান্য সম্পর্কিত জৈবিক প্রক্রিয়া।
অ্যানথ্রাক্স লুপিন (1999 সালে পোল্যান্ডের উইরজেনিসে লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত কোল-08 স্ট্রেন) দ্বারা ইনোকুলেট করা সংকীর্ণ-লেভড লুপিন (NLL) এর ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার সময় ডিফারেন্সিয়ালভাবে প্রকাশিত জিনের টীকাতে নির্বাচিত বায়োপ্রসেস জিন অন্টোলজি পদগুলি ব্যাপকভাবে অতিরঞ্জিত।বিশ্লেষণ করা এনএলএল লাইনগুলি হল: 83A:476 (প্রতিরোধী, সমজাতীয় ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), বোরগিন (প্রতিরোধী, অজানা জেনেটিক পটভূমি), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, হোমোজাইগাস অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে) এবং জনসংখ্যা 22660 (সংবেদনশীল)।
যেহেতু এই অধ্যয়নের লক্ষ্য অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধে অবদান রাখে এমন জিনগুলি সনাক্ত করা, তাই GO “GO: 0006952 প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়া” এবং “GO: 0055114 রেডক্স প্রসেস” শব্দগুলির জন্য নির্ধারিত জিনগুলি কাট-অফের সাথে বিশ্লেষণ করা হয়েছিল যেহেতু বেসলাইন মানে কমপক্ষে একটি লাইন ≥ 30।লগ 2 (ভাঁজ পরিবর্তন) এর পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য মানগুলিকে একত্রিত করে × সময়ের মধ্যে বিন্দু।এই মানদণ্ড পূরণকারী জিনের সংখ্যা GO:0006952-এর জন্য 65 এবং GO:0055114-এর জন্য 524 ছিল।
83A:476 GO:0006952 শব্দটি দিয়ে টীকাযুক্ত দুটি DEG শিখর প্রকাশ করেছে, প্রথমটি প্রতি ইঞ্চিতে 6 জিন (64 জিন, আপ এবং ডাউন রেগুলেশন) এবং দ্বিতীয়টি প্রতি ইঞ্চিতে 24 জিন (15 জিন, শুধুমাত্র আপ রেগুলেশন)।বোরগিন আরও দেখিয়েছে যে GO:0006952 একই সময়ে শীর্ষে উঠেছে, কিন্তু কম DEG (11 এবং 8) এবং অগ্রাধিকারমূলক অ্যাক্টিভেশন সহ।ম্যান্ডেলূপ GO:0006952 এর দুটি শিখর 12 এবং 48 HPI তে দেখায়, উভয়েই 12টি জিন বহন করে (প্রথমটি সক্রিয় জিন সহ, এবং দ্বিতীয়টি শুধুমাত্র দমনকারী জিন সহ), যেখানে 6 HPI (13 জিন) তে 22660 জনসংখ্যা বৃদ্ধির একটি বৃহত্তর প্রাধান্য ছিল।প্রবিধানএটি উল্লেখ করা উচিত যে এই শিখরগুলিতে GO:0006952 DEG-এর 96.4% একই ধরণের প্রতিক্রিয়া (উপর বা নীচে) ছিল, যা জড়িত জিনের সংখ্যার পার্থক্য থাকা সত্ত্বেও প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলিতে একটি উল্লেখযোগ্য ওভারল্যাপ নির্দেশ করে।GO:0006952 শব্দের সাথে সম্পর্কিত ক্রমগুলির বৃহত্তম গ্রুপটি স্টারভেশন স্ট্রেস-অ্যাসোসিয়েটেড মেসেজ প্রোটিন 22 (SAM22-এর মতো) এনকোড করে, যা ক্লাস 10 প্যাথোজেনেসিস-সম্পর্কিত প্রোটিন (PR-10) প্রোটিন ক্লেড এবং কোর প্রোটিন ল্যাটেক্সের অন্তর্গত।অনুরূপ (MLP-এর মতো) প্রোটিন) প্রোটিন (চিত্র 3)।অভিব্যক্তির প্রকৃতি এবং প্রতিক্রিয়ার দিকনির্দেশনায় দুটি দল ভিন্ন ছিল।SAM22-এর মতো প্রোটিনের এনকোডিং জিনগুলি প্রাথমিক সময় পয়েন্টগুলিতে (6 বা 12 hpi) সামঞ্জস্যপূর্ণ এবং উল্লেখযোগ্য আনয়ন দেখিয়েছিল এবং পরীক্ষার শেষে সাধারণত প্রতিক্রিয়াহীন ছিল (48 hpi), যখন MLP-এর মতো প্রোটিনগুলি 6 hpi-তে সমন্বয় দেখিয়েছিল।এইচপিআই83A:476 এবং Mandelup 48 hp/in-এ, প্রায় অন্যান্য সমস্ত ডেটা পয়েন্ট প্রতিক্রিয়াহীন ছিল।উপরন্তু, SAM22-এর মতো প্রোটিন জিনের এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের পার্থক্যগুলি অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধে পর্যবেক্ষিত পরিবর্তনশীলতাকে অনুসরণ করে, কারণ আরও বেশি প্রতিরোধী রেখায় এই জিনগুলিকে আরও বেশি সংবেদনশীল জিনের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে প্ররোচিত করে।আরেকটি LlR18A/B-এর মতো PR-10 জিন SAM22-এর মতো প্রোটিন জিনের সাথে খুব অনুরূপ অভিব্যক্তির ধরণ দেখায়।
জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দের প্রধান উপাদান "GO:0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া" এবং ল্যানর1 এবং অ্যানম্যান অ্যালিলের প্রার্থী জিনের অভিব্যক্তির ধরণগুলি চিহ্নিত করা হয়েছিল।Log2 স্কেল একই সময়ে ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত, Wizhenica, Poland, 1999) এবং নিয়ন্ত্রণ (sham-inculated) উদ্ভিদের মধ্যে log2 মান (ভাঁজ পরিবর্তন) প্রতিনিধিত্ব করে।নিম্নলিখিত ন্যারোলিফ লুপিন লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল: 83A:476 (প্রতিরোধী, সমজাতীয় ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), বোরেগিন (প্রতিরোধী, জেনেটিক পটভূমি অজানা), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, হোমোজাইগাস অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে), এবং জনসংখ্যা 22660 ()।
উপরন্তু, RNA-seq প্রার্থীর জিন Lanr1 (TanjilG_05042) এবং AnMan (TanjilG_12861) এর এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলি মূল্যায়ন করা হয়েছিল (চিত্র 3)।TanjilG_05042 জিন শুধুমাত্র প্রথম টাইম পয়েন্টে (6 hpi) 83A:476 এ একটি উল্লেখযোগ্য প্রতিক্রিয়া (অ্যাক্টিভেশন) দেখায়, যখন TanjilG_12861 ম্যান্ডেলূপে শুধুমাত্র দুটি টাইম পয়েন্টে উল্লেখযোগ্য ছিল: 6 hpi (ডাউন রেগুলেশন) এবং 24 hpi (6 hpi)।সঙ্গে.).সামঞ্জস্যযোগ্য))।
GO:0055114 "রিডক্স প্রসেস" শব্দটিতে সর্বাধিক অতিপ্রকাশিত জিনগুলি ছিল সাইটোক্রোম P450 প্রোটিন এবং পারক্সিডেস (চিত্র 4) এনকোডিং জিন।6 HPI-তে 83A:476 থেকে বিচ্ছিন্ন নমুনার জন্য, সর্বাধিক বা সর্বনিম্ন লগ 2 (ভাঁজ পরিবর্তন) মানগুলি (86.6% জিনের জন্য) সাধারণত ইনোকুলেটেড এবং কন্ট্রোল প্ল্যান্টের মধ্যে পরিলক্ষিত হয়, যা যৌন টিকা দেওয়ার জন্য এই জিনোটাইপের উচ্চ প্রতিক্রিয়া হাইলাইট করে।83A:476 সবচেয়ে তাৎপর্যপূর্ণ GO: 0055114 DEG দেখিয়েছে 6 hpi (503 জিন), বাকি লাইন 48 hpi এ (বোরগিন, 31 জিন; ম্যান্ডেলপ, 85 জিন; এবং জনসংখ্যা 22660, 78 জিন)।GO:0055114 পরিবারের বেশিরভাগ জিনে, টিকাকরণের (অ্যাক্টিভেশন এবং ইনহিবিশন) দুই ধরনের প্রতিক্রিয়া পরিলক্ষিত হয়েছে।মজার বিষয় হল, GO: 0055114 শব্দের জন্য চিহ্নিত ডিইজিগুলির 97.6% পর্যন্ত 48 hp এ ম্যান্ডেলুপে এই পর্যবেক্ষণগুলি ইঙ্গিত করে যে, উল্লেখযোগ্যভাবে ছোট স্কেল থাকা সত্ত্বেও (অর্থাৎ, মিউটেটেড রেডক্স জিনের সংখ্যা, 85 বনাম 503), বিলম্বিত ট্রান্সক্রিপ্টের প্যাটার্নটি প্রারম্ভিক ম্যানডেলুপে 48 এইচপি-এর অনুরূপ প্রতিক্রিয়ার অনুরূপ। 76.বোরগিন এবং জনসংখ্যা 22660-এ, এই অভিসারতা যথাক্রমে 51.6% এবং 75.6% এ কম।
জৈবিক প্রক্রিয়া "GO:0055114 Redox প্রক্রিয়া" শব্দের প্রধান উপাদানগুলির প্রকাশের ধরণগুলি প্রকাশিত হয়েছিল।Log2 স্কেল একই সময়ে ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত, Wizhenica, Poland, 1999) এবং নিয়ন্ত্রণ (sham-inculated) উদ্ভিদের মধ্যে log2 মান (ভাঁজ পরিবর্তন) প্রতিনিধিত্ব করে।নিম্নলিখিত ন্যারোলিফ লুপিন লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল: 83A:476 (প্রতিরোধী, সমজাতীয় ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), বোরেগিন (প্রতিরোধী, জেনেটিক পটভূমি অজানা), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, হোমোজাইগাস অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে), এবং জনসংখ্যা 22660 ()।
83A:476 সি. লুপিনি (স্ট্রেন কোল-08) এর সাথে ইনোকুলেশনের প্রতিলিপির প্রতিক্রিয়াগুলির মধ্যে GO:0015979 "সালোকসংশ্লেষণ" এবং অন্যান্য সম্পর্কিত জৈবিক প্রক্রিয়াগুলি (FIG. 5) এর জন্য দায়ী জিনের সমন্বিত নীরবতা অন্তর্ভুক্ত ছিল।এই GO:0015979 DEG সেটটিতে 105টি জিন রয়েছে যা 83A:476 এ 6 hpi-তে উল্লেখযোগ্যভাবে দমন করা হয়েছিল।এই উপসেটে, 22660 জনসংখ্যার মধ্যে একই সময়ে 48 এইচপিআই এবং 35টি ম্যান্ডেলুপে 37টি জিনকে নিয়ন্ত্রণ করা হয়েছিল, উভয় জিনোটাইপের জন্য সাধারণ 19টি ডিইজি সহ।GO: 0015979 শব্দের সাথে সম্পর্কিত কোনো ডিইজি উল্লেখযোগ্যভাবে কোনো সংমিশ্রণে সক্রিয় করা হয়নি (লাইন x সময়)।
জৈবিক প্রক্রিয়া "GO:0015979 সালোকসংশ্লেষণ" শব্দটির মূল উপাদানগুলির প্রকাশের ধরণগুলি প্রকাশিত হয়েছিল।Log2 স্কেল একই সময়ে ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত, Wizhenica, Poland, 1999) এবং নিয়ন্ত্রণ (sham-inculated) উদ্ভিদের মধ্যে log2 মান (ভাঁজ পরিবর্তন) প্রতিনিধিত্ব করে।নিম্নলিখিত ন্যারোলিফ লুপিন লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল: 83A:476 (প্রতিরোধী, সমজাতীয় ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), বোরেগিন (প্রতিরোধী, জেনেটিক পটভূমি অজানা), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, হোমোজাইগাস অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে), এবং জনসংখ্যা 22660 ()।
ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণের ফলাফলের উপর ভিত্তি করে এবং সম্ভবত প্যাথোজেনিক ছত্রাকের বিরুদ্ধে প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াতে জড়িত, সাতটি জিনের এই সেটটিকে রিয়েল-টাইম পিসিআর (পরিপূরক সারণী S9) দ্বারা এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের পরিমাণ নির্ধারণের জন্য নির্বাচিত করা হয়েছিল।
পুটেটিভ প্রোটিন জিন TanjilG_10657 নিয়ন্ত্রণ (নকল) উদ্ভিদের (পরিপূরক টেবিল S10, S11) তুলনায় সমস্ত অধ্যয়ন করা লাইন এবং সময় পয়েন্টগুলিতে উল্লেখযোগ্যভাবে প্ররোচিত হয়েছিল।উপরন্তু, TanjilG_10657-এর এক্সপ্রেশন প্রোফাইল সমস্ত লাইনের জন্য পরীক্ষা চলাকালীন একটি ক্রমবর্ধমান প্রবণতা দেখায়।22660 জনসংখ্যা 114-গুণ সক্রিয়করণের সাথে ইনোকুলেশনের জন্য TanjilG_10657-এর সর্বোচ্চ সংবেদনশীলতা এবং 24 HPI (চিত্র 6a) তে সর্বোচ্চ আপেক্ষিক অভিব্যক্তি স্তর (4.4 ± 0.4) দেখিয়েছে।PR10 LlR18A প্রোটিন জিন TanjilG_27015 এছাড়াও বেশিরভাগ ডেটা পয়েন্টে পরিসংখ্যানগত তাত্পর্য সহ সমস্ত লাইন এবং সময় বিন্দু জুড়ে সক্রিয়তা দেখিয়েছে (চিত্র 6b)।TanjilG_10657-এর মতই, TanjilG_27015-এর সর্বোচ্চ আপেক্ষিক অভিব্যক্তি স্তর 24 HPI (19.5 ± 2.4) এ 22660 টিকা দেওয়া জনসংখ্যার মধ্যে পরিলক্ষিত হয়েছিল।Boregine 6 hpi (চিত্র 6c) ব্যতীত অ্যাসিড এন্ডোকাইটিনেস জিন TanjilG_04706 উল্লেখযোগ্যভাবে সমস্ত লাইনে এবং সব সময় বিন্দুতে উন্নীত ছিল।এটি 83A:476 এ প্রথম টাইম পয়েন্টে (6 HPI) দৃঢ়ভাবে প্ররোচিত হয়েছিল (10.5 গুণ দ্বারা) এবং অন্যান্য লাইনে (6.6-7.5 গুণ দ্বারা) মাঝারিভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে।পরীক্ষা চলাকালীন, TanjilG_04706-এর অভিব্যক্তি 83A:476 এবং Boregine-এ একই স্তরে ছিল, যখন Mandelup এবং জনসংখ্যা 22660-এ এটি উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে, তুলনামূলকভাবে উচ্চ মানগুলিতে পৌঁছেছে (যথাক্রমে 5.9 ± 1.5 এবং 6.2 ± 1.5)।এন্ডোগ্লুকান-1,3-β-গ্লুকোসিডেস-সদৃশ জিন TanjilG_23384 জনসংখ্যা 22660 (চিত্র 6d) ব্যতীত সমস্ত লাইনে প্রথম দুটি সময় বিন্দুতে (6 এবং 12 hpi) উচ্চ সক্রিয়তা দেখিয়েছে।Mandelup (2.7 ± 0.3) এবং 83A:476 (1.5 ± 0.1) এ TanjilG_23384-এর সর্বোচ্চ আপেক্ষিক অভিব্যক্তির মাত্রা দ্বিতীয় টাইম পয়েন্টে (12 hpi) পরিলক্ষিত হয়েছে।24 HPI তে, TanjilG_23384 অভিব্যক্তিটি সমস্ত অধ্যয়ন করা লাইনে তুলনামূলকভাবে কম ছিল (0.04 ± 0.009 থেকে 0.44 ± 0.12 পর্যন্ত)।
পরিমাণগত PCR দ্বারা প্রকাশিত নির্বাচিত জিন (ag) এর এক্সপ্রেশন প্রোফাইল।সংখ্যা 6, 12 এবং 24 টিকা দেওয়ার কয়েক ঘন্টা পরে।LanDExH7 এবং LanTUB6 জিনগুলি স্বাভাবিককরণের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল এবং LanTUB6 আন্তঃ-সিরিজ ক্রমাঙ্কনের জন্য ব্যবহৃত হয়েছিল।ত্রুটি বারগুলি তিনটি জৈবিক প্রতিলিপির উপর ভিত্তি করে মানক বিচ্যুতির প্রতিনিধিত্ব করে, যার প্রতিটি তিনটি প্রযুক্তিগত প্রতিলিপির গড়। ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, 1999 সালে Wierzenica, Poland-এর লুপিন ফিল্ড থেকে প্রাপ্ত) এবং কন্ট্রোল (মক-ইনোকুলেটেড) উদ্ভিদের মধ্যে অভিব্যক্তি স্তরের পার্থক্যের পরিসংখ্যানগত তাত্পর্য ডেটা পয়েন্টের উপরে চিহ্নিত করা হয়েছে (*P মান <0.05, ***⤉ P মান < 0.05, ***⤉ 0.05, 01)। ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, 1999 সালে Wierzenica, Poland-এর লুপিন ফিল্ড থেকে প্রাপ্ত) এবং কন্ট্রোল (মক-ইনোকুলেটেড) উদ্ভিদের মধ্যে অভিব্যক্তি স্তরের পার্থক্যের পরিসংখ্যানগত তাত্পর্য ডেটা পয়েন্টের উপরে চিহ্নিত করা হয়েছে (*P মান <0.05, ***⤉ P মান < 0.05, ***⤉ 0.05, 01)। Статистическая значимость различий в уровнях экспрессии между инокулированными (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, получен в в19. рженице, Польша) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечена над точками данных (*значение P <0,05, P <0,05, P,01*** ≤ 0,001)। ইনোকুলেটেড (Colletotrichum lupini, strain Col-08, 1999 সালে Wierzhenice, Poland-এর একটি লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত) এবং নিয়ন্ত্রণ (sham-inoculated) উদ্ভিদের মধ্যে অভিব্যক্তির মাত্রার মধ্যে পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য ডেটা পয়েন্টের উপরে উল্লেখ করা হয়েছে (*P মান <0.05, ***P-value≤0.**P-05, **P-001 মান। )接种（Colletotrichum lupini，Col-08株，1999年从波兰Wierzenica的羽扇豆田获得）和对照得）和对照弈模拟接苴苗顯龍得差异的统计学显着性标记在数据点上方（*P值< 0.05, **P 值≤ 0.01, ***P 值≤ 0.001)।接种 （colletotrichum lupini ， color-08 株 ， 1999 年 波兰 波兰 wierzenica 的 羽扇 获得） 和 对照 湴湴卤弈接片差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值 <0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001)। Статистически значимые различия в уровнях экспрессии между инокулированными (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, полученный Полученный Полученный Полученный, ольша, 1999 সালে ение ≤ 0,001)। 1999 সালে পোল্যান্ডের ভেরজেনিসের লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08) এবং নিয়ন্ত্রণ (শ্যাম-ইনোকুলেটেড) উদ্ভিদের মধ্যে অভিব্যক্তির মাত্রার মধ্যে পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য ডেটা পয়েন্টের উপরে উল্লেখ করা হয়েছে (*P মান <0.05, ***P-value **P-value 0.05, ***P-value ≤0. 1)।এনএলএল লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছে: 83A:476 (প্রতিরোধী, সমজাতীয় ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, সমজাতীয় অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে), বোরগিন (প্রতিরোধী, অজানা জেনেটিক পটভূমি) এবং জনসংখ্যা 22660 (সংবেদনশীল)।
ল্যানর1 লোকাসে প্রার্থী জিন TanjilG_05042 RNA-seq গবেষণা (চিত্র 6e) থেকে প্রাপ্ত প্রোফাইল থেকে একটি উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন অভিব্যক্তি প্যাটার্ন দেখিয়েছে।ম্যান্ডেলুপ এবং 22660 জনসংখ্যায় (যথাক্রমে 39.7 এবং 11.7 বার পর্যন্ত) এই জিনের উল্লেখযোগ্য সক্রিয়তা পরিলক্ষিত হয়েছিল, যার ফলে তুলনামূলকভাবে উচ্চ অভিব্যক্তি স্তর (যথাক্রমে 1.4 ± 0.14 এবং 7.2 ± 1.3 পর্যন্ত)।83A:476 এছাড়াও TanjilG_05042 জিনের (3.8-গুণ পর্যন্ত) কিছু আপগ্রেশন প্রকাশ করেছে, তবে, অর্জিত আপেক্ষিক অভিব্যক্তি স্তরগুলি (0.044 ± 0.002) ম্যান্ডেলুপ এবং 22660 জনসংখ্যার তুলনায় 30-গুণ কম ছিল।qPCR দ্বারা বিশ্লেষিত মক-ভ্যাকসিন (নিয়ন্ত্রণ) ভেরিয়েন্টের জিনোটাইপগুলির মধ্যে অভিব্যক্তি স্তরে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য দেখায়, 22660 এবং 83A:476 জনসংখ্যার মধ্যে 58-গুণ পার্থক্য, সেইসাথে 22660 এবং 22660 জনসংখ্যার মধ্যে। একটি দ্বিগুণ এবং ম্যানডালআপের মধ্যে পার্থক্য ছিল।
AnMan লোকাস, TanjilG_12861-এর প্রার্থী জিনটি 83A:476 এবং Mandelup-এ টিকা দেওয়ার প্রতিক্রিয়া হিসাবে সক্রিয় হয়েছিল, 22660 জনসংখ্যার মধ্যে নিরপেক্ষ ছিল এবং বোরগিনে (চিত্র 6f) নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল।তানজিলজি_12861 জিনের আপেক্ষিক অভিব্যক্তিটি ইনোকুলেটেড 83A: 476 (0.14±0.01) এর মধ্যে সর্বোচ্চ ছিল।17.4 kDa ক্লাস I হিট শক প্রোটিন জিন TanjilG_05080 HSP17.4 সমস্ত অধ্যয়ন করা স্ট্রেন এবং সময় বিন্দুতে নিম্ন আপেক্ষিক অভিব্যক্তির মাত্রা দেখিয়েছে (চিত্র 6g)।22660 জনসংখ্যার মধ্যে 24 HPI-তে সর্বোচ্চ মান পরিলক্ষিত হয়েছে (0.14 ± 0.02, টিকা দেওয়ার প্রতিক্রিয়ায় আট গুণ বৃদ্ধি)।
জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের তুলনা (চিত্র 7) TanjilG_10657 এবং অন্যান্য চারটি জিনের মধ্যে একটি উচ্চ সম্পর্ক প্রকাশ করেছে: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.7), এবং TanjilG_05042 (r = 0.7).এই ধরনের ফলাফল প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়ার সময় এই জিনগুলির সহ-নিয়ন্ত্রণ নির্দেশ করতে পারে।TanjilG_12861 এবং TanjilG_23384 জিনগুলি অন্যান্য জিনের তুলনায় নিম্ন পিয়ারসন পারস্পরিক সম্পর্ক সহগ মান (যথাক্রমে 0.08 থেকে 0.43 এবং -0.19 থেকে 0.28 পর্যন্ত) সহ বিভিন্ন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল দেখায়।
জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্কগুলি পরিমাণগত পিসিআর ব্যবহার করে সনাক্ত করা হয়েছিল।নিম্নলিখিত ন্যারোলিফ লুপিন লাইনগুলি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল: 83A:476 (প্রতিরোধী, হোমোজাইগাস ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে), ম্যান্ডেলপ (মাঝারিভাবে প্রতিরোধী, সমজাতীয় অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে), বোরগিন (প্রতিরোধী, জেনেটিক পটভূমি অজানা), এবং জনসংখ্যা 22660 (sceptible)।তিনটি টাইম পয়েন্ট গণনা করা হয়েছিল (ইনোকুলেশনের পরে 6, 12 এবং 24 ঘন্টা), যার মধ্যে রয়েছে টিকা দেওয়া (Colletotrichum lupini, স্ট্রেন Col-08, 1999 সালে পোল্যান্ডের Wierzhenice এর লুপিন ক্ষেত্র থেকে প্রাপ্ত) এবং নিয়ন্ত্রণ (শাম-ইনোকুলেটেড) উদ্ভিদ।স্কেলটি পিয়ারসন পারস্পরিক সম্পর্ক সহগের মান দেখায়।
প্রতি ইঞ্চিতে 6 হর্সপাওয়ারে প্রাপ্ত ডেটার উপর ভিত্তি করে, WGCNA 9981 ডিইজিতে সঞ্চালিত হয়েছিল যা প্রাথমিক প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলিতে ফোকাস করার জন্য ইনোকুলেটেড এবং কন্ট্রোল প্ল্যান্টের তুলনা করে চিহ্নিত করা হয়েছিল (পরিপূরক সারণী S12)।বাইশটি জিন মডিউল (গুচ্ছ) জিনোটাইপ এবং পরীক্ষামূলক রূপের মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্কযুক্ত (ইতিবাচক বা নেতিবাচক) এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের সাথে পাওয়া গেছে। গড়ে, জিনের অভিব্যক্তির মাত্রা 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 ক্রমানুসারে কমছিল (যদিও, উভয় রূপেই, এই প্রবণতা নিয়ন্ত্রণ উদ্ভিদে শক্তিশালী ছিল)। গড়ে, জিনের অভিব্যক্তির মাত্রা 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 ক্রমানুসারে কমছিল (যদিও, উভয় রূপেই, এই প্রবণতা নিয়ন্ত্রণ উদ্ভিদে শক্তিশালী ছিল)। В среднем уровни экспрессии генов снижались в порядке 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 трольных растений)। গড়ে, জিনের প্রকাশের মাত্রা 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 ক্রমে হ্রাস পেয়েছে (যদিও, এই প্রবণতা নিয়ন্ত্রণ উদ্ভিদের ক্ষেত্রেই শক্তিশালী ছিল)।平均而言，基因表达水平按83A:476 > Mandelup > Boregine > জনসংখ্যা 22660植物中更强).平均 而 言 ， 基因 水平 按 83a: 476> mandelup> boregine> জনসংখ্যা 22660 的 顺序 下降 在漈，在种 䙭翭更)।।।।।।।।।।।।।।।।।।।।।।। В среднем уровни экспрессии генов снижались в ряду 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 х растений)। গড়ে, 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 সিরিজে জিনের অভিব্যক্তির মাত্রা কমেছে (তবে, উভয় রূপেই, এই প্রবণতা নিয়ন্ত্রণ উদ্ভিদে শক্তিশালী ছিল)।ভ্যাকসিনেশনের ফলে জিনের অভিব্যক্তি উন্নীত হয়েছে, বিশেষ করে মডিউল 18, 19, 14, 6 এবং 1 (প্রভাবের অবতরণ ক্রমে), নেতিবাচক নিয়ন্ত্রণ (যেমন মডিউল 9 এবং 20) বা নিরপেক্ষ প্রভাবের সাথে (যেমন মডিউল 11, 22, 8 এবং 13)।GO টার্ম সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ (পরিপূরক সারণী S13) qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_233384, TanjilG_233384, TanjilG_233381, TanjilG_233381, TanjilG_23381, TanjilG_233706, TanjilG_233374, TanjilG_23381, TanjilG_04706) সহ সর্বাধিক সক্রিয়করণ সহ সর্বাধিক সক্রিয়করণ সহ ইনোকুলেটেড মডিউল (18) এর জন্য "GO: 0006952 প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়া" প্রকাশ করেছে। অনেক ইনোকুলেট সবচেয়ে চাপা সালোকসংশ্লেষণ মডিউল (9)।মডিউল 18 কনসেনট্রেটর (চিত্র 8) তানজিলজি_26536 জিন হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল যা PR-10-এর মতো LlR18B প্রোটিনকে এনকোড করছে, এবং মডিউল 9 কনসেনট্রেটরকে তানজিলজি_28955 জিন হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল যেটি ফটোসিস্টেম II PsbQ প্রোটিনকে এনকোড করছে।একজন প্রার্থী অ্যানথ্রাকনোজ রেজিস্ট্যান্স জিন Lanr1, TanjilG_05042, মডিউল 22 (চিত্র 9) এ পাওয়া গেছে এবং "GO:0044260 সেলুলার ম্যাক্রোমলিকুলার মেটাবলিক প্রসেস" এবং "GO:0006355 ট্রান্সক্রিপশনাল ডিএনএবি টেম্পলেশন টেম্পলেশন টেম্পলেশন"-এর সাথে যুক্ত।জিন হিট স্ট্রেস ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর A-4a (HSFA4a) এনকোড করে।
অতিরিক্তভাবে উপস্থাপন করা জৈবিক প্রক্রিয়া শর্তাবলী "GO: 0006952 প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া" সহ মডিউলগুলির জিন সহ-প্রকাশের ওজনযুক্ত নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ।qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 এবং TanjilG_27015) দ্বারা বিশ্লেষণ করা চারটি জিন হাইলাইট করার জন্য লিগেশনকে সরলীকৃত করা হয়েছিল।
একটি অতিরিক্তভাবে উপস্থাপন করা জৈবিক প্রক্রিয়া শব্দ "GO: 0006355: ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেশন, DNA টেমপ্লেটিং" এবং ক্যান্ডিডেট অ্যানথ্রাকনোজ রেজিস্ট্যান্স জিন Lanr1 TanjilG_05042 বহন করে একটি মডিউলের জিন সহ-অভিব্যক্তির ওজনযুক্ত নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ।তানজিলজি_05042 জিন এবং কেন্দ্রীয় তানজিলজি_01212 জিনকে আলাদা করার জন্য লিগেশনকে সরলীকৃত করা হয়েছিল।
অস্ট্রেলিয়ায় সংগৃহীত অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের স্ক্রিনিং দেখায় যে প্রথম দিকে মুক্তি পাওয়া বেশিরভাগ কাল্টিভারগুলি সংবেদনশীল ছিল;কাল্যা, কোরোমুপ এবং ম্যান্ডেলুপকে মাঝারিভাবে প্রতিরোধী হিসাবে বর্ণনা করা হয়েছে, যখন ওয়াঙ্গা, তানজিল এবং 83A:476 কে অত্যন্ত প্রতিরোধী 26,27,31 হিসাবে বর্ণনা করা হয়েছে।একই প্রতিরোধের অ্যালিল ছিল, মনোনীত ল্যানর1, এবং কোরোমপ এবং ম্যান্ডেলুপের একটি আলাদা অ্যালিল ছিল, মনোনীত AnMan10, 26, 39, যখন কাল্যা একটি ভিন্ন অ্যালিলে অতিক্রম করেছিল।, Lanr2।জার্মানিতে অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের জন্য স্ক্রীনিংয়ের ফলে ল্যানর1 ব্যতীত অন্য প্রার্থী অ্যালিলের সাথে একটি প্রতিরোধী রেখা Bo7212 সনাক্ত করা হয়েছে, মনোনীত LanrBo36।
আমাদের গবেষণায় পরীক্ষিত জার্মপ্লাজমে ল্যানর1 অ্যালিলের খুব কম ফ্রিকোয়েন্সি (প্রায় 6%) প্রকাশ করা হয়েছে।এই পর্যবেক্ষণ Anseq3 এবং Anseq4 মার্কার ব্যবহার করে পূর্ব ইউরোপীয় জার্মপ্লাজম স্ক্রীন করার ফলাফলের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ, যা দেখায় যে ল্যানর1 অ্যালিল শুধুমাত্র দুটি বেলারুশিয়ান লাইনে উপস্থিত।এটি পরামর্শ দেয় যে ল্যানর1 অ্যালিল এখনও স্থানীয় প্রজনন প্রোগ্রামগুলির দ্বারা ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয় না, অস্ট্রেলিয়ার বিপরীতে, যেখানে এটি মার্কার-সহায়তা প্রজননের জন্য অন্যতম প্রধান অ্যালিল।এটি অস্ট্রেলিয়ান রিপোর্টের তুলনায় ইউরোপীয় ক্ষেত্রের পরিস্থিতিতে Lanr1 অ্যালিল দ্বারা প্রদত্ত নিম্ন স্তরের প্রতিরোধের কারণে হতে পারে।উপরন্তু, অস্ট্রেলিয়ার উচ্চ বৃষ্টিপাত অঞ্চলে অ্যানথ্রাকনোজের গবেষণায় দেখা গেছে যে ল্যানর1 অ্যালিলের মধ্যস্থতা প্রতিরোধের প্রতিক্রিয়াগুলি আবহাওয়ার পরিস্থিতিতে কার্যকর নাও হতে পারে যা রোগজীবাণুর বৃদ্ধি এবং দ্রুত বিকাশের পক্ষে থাকে।প্রকৃতপক্ষে, বর্তমান গবেষণায়, ল্যানর1 অ্যালিল বহনকারী জিনোটাইপগুলিতে অ্যানথ্রাকনোজের কিছু লক্ষণও পরিলক্ষিত হয়েছে, যা পরামর্শ দেয় যে সি. লুপিনির বিকাশের জন্য সর্বোত্তম পরিস্থিতিতে প্রতিরোধ অদৃশ্য হয়ে যেতে পারে।উপরন্তু, Anseq3 এবং Anseq4 মার্কারের উপস্থিতির মিথ্যা ইতিবাচক ব্যাখ্যা, যা Lanr1 লোকাস থেকে আনুমানিক 1 সেমি, সম্ভব 28,30,43।
আমাদের গবেষণায় দেখা গেছে যে 83A:476, ল্যানর1 অ্যালিল বহন করে, প্রথম বিশ্লেষিত সময় বিন্দুতে (6 এইচপিআই) বড় আকারের ট্রান্সক্রিপ্টোম রিপ্রোগ্রামিং সহ সি. লুপিনি ইনোকুলেশনে সাড়া দেয়, যখন ম্যান্ডেলুপে, অ্যানম্যান অ্যালিল বহন করে, ট্রান্সক্রিপ্টমিক প্রতিক্রিয়া অনেক পরে পরিলক্ষিত হয়।(24 থেকে 48 এইচপি পর্যন্ত)।প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলির এই সাময়িক বৈচিত্রগুলি রোগের লক্ষণগুলির পার্থক্যের সাথে যুক্ত, প্রতিরোধের সফল প্রতিক্রিয়ার জন্য প্রাথমিক প্যাথোজেন স্বীকৃতির গুরুত্ব তুলে ধরে।উদ্ভিদের টিস্যুকে সংক্রামিত করার জন্য, অ্যানথ্রাক্স স্পোরগুলিকে অবশ্যই হোস্ট পৃষ্ঠের বিভিন্ন বিকাশের পর্যায়ে যেতে হবে, যার মধ্যে অঙ্কুরোদগম, কোষ বিভাজন এবং একটি অ্যাপ্রেসোরিয়াম গঠন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।একটি উপশিষ্ট একটি সংক্রামক কাঠামো যা হোস্টের পৃষ্ঠের সাথে সংযুক্ত থাকে এবং হোস্ট টিস্যুতে প্রবেশের সুবিধা দেয়।এইভাবে, মটরের নির্যাসে C. gloeosporioides-এর spores 75-90 মিনিটের ইনকিউবেশনের পর নিউক্লিয়াসের প্রথম বিভাজন, 90-120 মিনিটের পরে একটি জীবাণু টিউব গঠন এবং 4 ঘন্টা পর দমন দেখায়।আমের সি. গ্লিওস্পরিওয়েডগুলি 3 ঘন্টার ইনকিউবেশনের পরে 40% এরও বেশি কনিডিয়াল অঙ্কুরোদগম দেখায় এবং 4 ঘন্টা পরে প্রায় 20% অ্যাপ্রেসর গঠন করে।C. gloeosporioides-এর ভাইরুলেন্স-সম্পর্কিত CAP20 জিন 4 ঘন্টা 46 মিনিটের পরে CAP20 প্রোটিনের উচ্চ ঘনত্বের সাথে অ্যাভোকাডো পৃষ্ঠের মোমে 3.5 ঘন্টা ইনকিউবেশনের পরে এপিফাইট-গঠনকারী কনিডিয়াতে ট্রান্সক্রিপশনাল কার্যকলাপ দেখায়।একইভাবে, সি. ট্রাইফোলিতে মেলানিন জৈবসংশ্লেষণ জিনের কার্যকলাপ 2-ঘণ্টার ইনকিউবেশনের সময় প্ররোচিত হয়েছিল এবং 1 ঘন্টা পরে একটি অ্যাপ্রেসোরিয়াম তৈরি হয়েছিল।পাতার টিস্যুগুলির গবেষণায় দেখা গেছে যে C. acutatum দিয়ে ইনোকুলেট করা স্ট্রবেরি 8 hpi-এ প্রথম দমন করে, যখন C. coccodes দিয়ে ইনোকুলেট করা টমেটোর প্রথম দমন হয় 4 hpi48,49 এ।Colletotrichum spp এর টাইম স্কেলের সাথে অনেকাংশে সামঞ্জস্যপূর্ণ।সংক্রামক প্রক্রিয়া।83A:476-এর দ্রুত প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলি এই লাইনে উদ্ভিদ প্রতিরোধ এবং ইফেক্টর-ট্রিগারড ইমিউনিটি (ইটিআই) জিনের সম্পৃক্ততার পরামর্শ দেয়, যখন ম্যান্ডেলপের বিলম্বিত প্রতিক্রিয়াগুলি মাইক্রো-সম্পর্কিত আণবিক প্যাটার্ন-ট্রিগারড ইমিউনিটি (এমটিআই) হাইপোথিসিসকে সমর্থন করে।বিলম্বিত প্রতিক্রিয়ায় আপ- বা ডাউন-নিয়ন্ত্রিত জিনের মধ্যে আংশিক ওভারল্যাপও এই ধারণাটিকে সমর্থন করে, কারণ ইটিআই প্রায়শই একটি ত্বরান্বিত এবং বর্ধিত এমটিআই প্রতিক্রিয়া হিসাবে বিবেচিত হয় যা সংক্রমণের জায়গায় প্রোগ্রাম করা কোষের মৃত্যুতে পরিণত হয়, যা অ্যানাফিল্যাকটিক শক 51,52 নামে পরিচিত।
জিন অন্টোলজি GO:0006952 "ডিফেন্স রেসপন্স"-এর অত্যধিক উপস্থাপিত শব্দের জন্য দায়ী বেশিরভাগ জিন হল স্ট্রেস-প্ররোচিত উপবাস বার্তার 11টি সমগোত্রীয় 22 প্রোটিন (SAM22-এর মতো) এবং সাতটি প্রধান ল্যাটেক্স প্রোটিন-লাইক (MLPs)।প্রোটিন 31, 34, 43 এবং 423 অনুক্রমের সাদৃশ্য দেখিয়েছে।SAM22-এর মতো জিনগুলি উল্লেখযোগ্য অ্যাক্টিভেশন দেখায় যা দীর্ঘস্থায়ী হয়, অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের বর্ধিত মাত্রা দেখায় (83A:476 এবং বোরেগিন)।যাইহোক, এমএলপি-এর মতো জিনগুলি কেবলমাত্র প্রার্থী প্রতিরোধের অ্যালিল বহনকারী লাইনগুলিতে নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল (6 এইচপিআইতে 83এ: 476/ল্যানর1 এবং 24 এইচপিআইতে ম্যান্ডেলআপ/আনম্যান)।এটি উল্লেখ করা উচিত যে সমস্ত চিহ্নিত SAM22-এর মতো হোমোলগগুলি আনুমানিক 105 kb বিস্তৃত একটি জিন ক্লাস্টার থেকে উদ্ভূত হয়, যখন MLP-এর মতো জিনগুলি জিনোমের পৃথক অঞ্চল থেকে উদ্ভূত হয়।এই জাতীয় SAM22-এর মতো জিনগুলির সমন্বিত সক্রিয়করণ আমাদের ডায়াপোর্থেটোক্সিকা ইনোকুলেশনের এনএলএল প্রতিরোধের পূর্ববর্তী গবেষণায়ও পাওয়া গিয়েছিল, পরামর্শ দেয় যে তারা প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়ার অনুভূমিক উপাদানগুলির সাথে জড়িত।এই উপসংহারটি স্যালিসিলিক অ্যাসিড, ছত্রাক উদ্দীপক, বা হাইড্রোজেন পারক্সাইড দিয়ে আঘাত বা চিকিত্সার জন্য SAM22-এর মতো জিনের ইতিবাচক প্রতিক্রিয়ার রিপোর্ট দ্বারাও সমর্থিত।
এমএলপি-এর মতো জিনগুলিকে অনেক উদ্ভিদ প্রজাতিতে ব্যাকটেরিয়া, ভাইরাল এবং প্যাথোজেনিক ছত্রাক সংক্রমণ সহ বিভিন্ন অ্যাবায়োটিক এবং জৈব স্ট্রেসের প্রতিক্রিয়া দেখানো হয়েছে55।উদ্ভিদ এবং রোগজীবাণুগুলির মধ্যে নির্দিষ্ট মিথস্ক্রিয়াগুলির প্রতিক্রিয়ার দিকগুলি দৃঢ়ভাবে বৃদ্ধি (অর্থাৎ, ভার্টিসিলিয়াম ডাহলিয়ার সাথে তুলার আক্রমণের সময়) থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস (অর্থাৎ, অল্টারনারিয়ার এসপিপি দ্বারা আপেল গাছের সংক্রমণের পরে) 56,57 পর্যন্ত ছিল।এফ. নাইজার সংক্রমণের অ্যাভোকাডো প্রতিরক্ষার সময় এবং আপেল গাছ বোট্রিওসফেরিয়া বেরেনজিরিয়ানা এফ-এর সংক্রমণের সময় এমএলপি-এর মতো 423 জিনের উল্লেখযোগ্য হ্রাস লক্ষ্য করা গেছে।cn.পিরিকোলা এবং অল্টারনারিয়া অল্টারনাটা হল আপেল প্যাথোটাইপ ৫৮,৫৯।উপরন্তু, আপেল কলির MLP-এর মতো 423 জিনের মাত্রাতিরিক্ত এক্সপ্রেসিং প্রতিরোধ-সম্পর্কিত জিনের প্রকাশ কম ছিল এবং ছত্রাক সংক্রমণের জন্য বেশি সংবেদনশীল ছিল।Fusarium oxysporum f অনুসরণ করে, MLP-এর মতো 423 জিনটি প্রতিরোধী সাধারণ শিমের জার্মপ্লাজমেও দমন করা হয়েছিল।cn.শিমের সংক্রমণ 60.
আমাদের RNA-seq গবেষণায় চিহ্নিত PR-10 পরিবারের অন্যান্য সদস্যরা ছিল LlR18A এবং LlR18B জিনগুলি আপগ্র্যুলেশনের প্রতিক্রিয়ায়, সেইসাথে লিপিড ট্রান্সফার প্রোটিন DIR1 এর জন্য আপগ্রেগুলেটেড (1 জিন) বা ডাউনরেগুলেটেড (3 জিন) জিন।.উপরন্তু, WGCNA এই মডিউলে LlR18B জিনকে একটি হাব হিসাবে হাইলাইট করে, যা টিকা দেওয়ার জন্য অত্যন্ত সংবেদনশীল এবং বেশ কয়েকটি প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়া জিন বহন করে।LlR18A এবং LlR18B জিনগুলি প্যাথোজেনিক ব্যাকটেরিয়ার প্রতিক্রিয়া হিসাবে হলুদ লুপিন পাতায় প্ররোচিত হয়েছিল, সেইসাথে D. টক্সিকা ইনোকুলেশনের পরে NLL কান্ডে, যখন এই জিনের চালের হোমোলগ, RSOsPR10, দ্রুত প্ররোচিত হয়েছিল একটি ছত্রাকজনিত অ্যাসিডের সংকেত, যা 6 প্রিসোম ব্যাকটেরিয়া দ্বারা সংঘটিত হয়েছিল। DIR1 জিন অনির্দিষ্ট লিপিড পরিবহন প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে যা সিস্টেমিক অর্জিত প্রতিরোধের (SAR) সূচনার জন্য প্রয়োজনীয়।প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়ার বিকাশের সাথে, DIR1 প্রোটিন দূরবর্তী অঙ্গগুলিতে SAR প্ররোচিত করার জন্য ফ্লোয়েমের মাধ্যমে সংক্রমণের কেন্দ্রস্থল থেকে পরিবাহিত হয়।মজার বিষয় হল, TanjilG_02313 DIR1 জিনটি 84A:476 এবং জনসংখ্যা 22660 লাইনের প্রথম পয়েন্টে উল্লেখযোগ্যভাবে প্ররোচিত হয়েছিল, কিন্তু অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ ক্ষমতা শুধুমাত্র 84A:476 লাইনে সফলভাবে বিকশিত হয়েছিল।এটি এনএলএল-এ ডিআইআর1 জিনের কিছু সাব-ফাংশনালাইজেশন নির্দেশ করতে পারে, যেহেতু বাকি তিনটি হোমোলগ শুধুমাত্র 6 এইচপিআই-এ 83A:476 লাইনে ইনোকুলেশনে সাড়া দিয়েছিল এবং এই প্রতিক্রিয়াটি নীচের দিকে নির্দেশিত হয়েছিল।
আমাদের গবেষণায়, "GO:0055114 রেডক্স প্রক্রিয়া" নামক জৈবিক প্রক্রিয়ার সাথে সম্পর্কিত সবচেয়ে সাধারণ উপাদানগুলি হল সাইটোক্রোম P450 প্রোটিন, পারক্সিডেস, লিনোলিক অ্যাসিড 9S-/13S-লিপোক্সিজেনেস এবং 1-অ্যামিনোসাইক্লোপ্রোপেন-1-কারবক্সিলিক অ্যাসিড অক্সিডেস।এছাড়াও, আমাদের WGCNA HSFA4a হোমোলগকে একটি হাব বহনকারী মডিউল যেমন Lanr1 রেজিস্ট্যান্স জিন প্রার্থী TanjilG_05042 হিসাবে সংজ্ঞায়িত করে।HSFA4a হল উদ্ভিদে পারমাণবিক ট্রান্সক্রিপশনের রেডক্স-নির্ভর নিয়ন্ত্রণের একটি উপাদান।
সাইটোক্রোম P450 প্রোটিনগুলি হল অক্সিডোরেডাক্টেস যা NADPH এবং/অথবা O2-নির্ভর হাইড্রোক্সিলেশন প্রতিক্রিয়াগুলিকে অনুঘটক করে প্রাথমিক এবং মাধ্যমিক বিপাকের মধ্যে, যার মধ্যে জেনোবায়োটিকের বিপাক, সেইসাথে হরমোন, ফ্যাটি অ্যাসিড, স্টেরল, কোষের প্রাচীরের উপাদান, বায়োপলিমার এবং 6-এর অধ্যয়নের বায়োপলিমার, এবং 9-এর অধ্যয়নের জৈববৈশিকতা রক্ষা করে। প্ল্যান্ট সাইটোক্রোম P450 ফাংশন -10.6 log2 (ভাঁজ পরিবর্তন) থেকে কমিয়ে 5.7 করা হয়েছিল কারণ প্রচুর পরিমাণে পরিবর্তিত হোমোলগ (37) এবং নির্দিষ্ট জিনের মধ্যে প্রতিক্রিয়া প্যাটার্নের পার্থক্য, একটি ঊর্ধ্বমুখী সংশোধন প্রতিফলিত করে।.এত বড় প্রোটিন সুপারফ্যামিলিতে NLL জিনের পুউটেটিভ জৈবিক ফাংশন ব্যাখ্যা করার জন্য শুধুমাত্র RNA-seq ডেটা ব্যবহার করা অত্যন্ত অনুমানমূলক হবে।যাইহোক, এটি লক্ষণীয় যে কিছু সাইটোক্রোম P450 জিন প্যাথোজেনিক ছত্রাক বা ব্যাকটেরিয়া প্রতিরোধের বৃদ্ধির সাথে যুক্ত, যার মধ্যে এলার্জি প্রতিক্রিয়া 69,70,71 অবদান রয়েছে।
ক্লাস III পারক্সিডেসগুলি হল বহুমুখী উদ্ভিদ এনজাইম যা উদ্ভিদের বৃদ্ধি এবং বিকাশের সময় বিস্তৃত বিপাকীয় প্রক্রিয়ার সাথে জড়িত, সেইসাথে পরিবেশগত চাপ যেমন লবণাক্ততা, খরা, উচ্চ আলোর তীব্রতা এবং প্যাথোজেন আক্রমণ72 এর প্রতিক্রিয়া হিসাবে।পেরোক্সিডেসগুলি অ্যানথ্রাসিসের সাথে বেশ কয়েকটি উদ্ভিদ প্রজাতির মিথস্ক্রিয়ায় জড়িত, যার মধ্যে রয়েছে স্টাইলোস্যান্থেস হুমিলিস এবং সি. গ্লোওস্পরিওয়েডস, লেন্স কুলিনারিস এবং সি. ট্রুনকাটাম, ফেসোলাস ভালগারিস এবং সি. লিন্ডেমুথিয়ানাম, কুকুমিস স্যাটিভাস এবং সি. ল্যাজেনারিয়াম73,76,74।প্রতিক্রিয়া খুব দ্রুত হয়, কখনও কখনও এমনকি 4 HPI-তেও, ছত্রাক গাছের টিস্যুতে প্রবেশ করার আগে73।পারক্সিডেস জিনও ডি. টক্সিকা এনএলএল ইনোকুলেশনে সাড়া দেয়।অক্সিডেটিভ বিস্ফোরণ নিয়ন্ত্রণ বা অক্সিডেটিভ স্ট্রেস নির্মূল করার জন্য তাদের সাধারণ ফাংশন ছাড়াও, পেরোক্সিডেসগুলি নির্দিষ্ট যৌগগুলির লিগনিফিকেশন, সাবইউনিট বা ক্রস-লিংকিংয়ের সময় কোষ প্রাচীরের শক্তিশালীকরণের উপর ভিত্তি করে শারীরিক বাধা তৈরি করে প্যাথোজেন বৃদ্ধিতে হস্তক্ষেপ করতে পারে।সিলিকোতে এই ফাংশনটিকে দায়ী করা যেতে পারে TanjilG_03329 জিন এনকোডিং একটি পুটেটিভ লিগনিন-ফর্মিং অ্যানিয়ন পারক্সিডেস যা আমাদের গবেষণায় 6 HPI-তে 83A:476 প্রতিরোধী লাইনে উল্লেখযোগ্যভাবে আপ-রেগুলেট করা হয়েছিল, কিন্তু অন্যান্য স্ট্রেন এবং সময় বিন্দুতে নয় যা সাড়া দেয়নি।
লিনোলিক অ্যাসিডের 9S-/13S-লিপোক্সিজেনেস হল লিপিড জৈব সংশ্লেষণ78 এর অক্সিডেটিভ পাথওয়ের প্রথম ধাপ।এই পথের পণ্যগুলির উদ্ভিদের প্রতিরক্ষায় একাধিক কাজ রয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে কলোজ এবং পেকটিন জমার মাধ্যমে কোষ প্রাচীর শক্তিশালীকরণ, এবং প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতি79,80,81,82,83 উৎপাদনের মাধ্যমে অক্সিডেটিভ স্ট্রেস নিয়ন্ত্রণ করা।বর্তমান সমীক্ষায়, লিনোলিক অ্যাসিড 9S-/13S-লিপোক্সিজেনেসের অভিব্যক্তি সমস্ত স্ট্রেইনে পরিবর্তিত হয়েছিল, কিন্তু সংবেদনশীল জনসংখ্যা 22660-এর মধ্যে, বিভিন্ন সময় বিন্দুতে আপগ্র্যুলেশন বিরাজ করে, যখন প্রতিরোধী ল্যানর1 এবং অ্যানম্যান অ্যালিল বহনকারী স্ট্রেনে, এটি এই অক্সিজেন লেয়ারের মধ্যে বৈচিত্র্যময় প্রতিক্রিয়ার উপর জোর দেয়। .
1-অ্যামিনোসাইক্লোপ্রোপেন-1-কারবক্সিলেট অক্সিডেস (ACO) হোমোলগ উল্লেখযোগ্যভাবে আপ-রেগুলেটেড (9 জিন) বা ডাউনরেগুলেটেড (2 জিন) যখন লুপিন দিয়ে টিকা দেওয়া হয়েছিল।দুটি ব্যতিক্রম ছাড়া, এই সমস্ত প্রতিক্রিয়া 6 এইচপি এ ঘটেছে।83A:476 এ।ACO প্রোটিন দ্বারা মধ্যস্থতা করা এনজাইমেটিক প্রতিক্রিয়া ইথিলিন উৎপাদনের হার-সীমিত পদক্ষেপ এবং তাই অত্যন্ত নিয়ন্ত্রিত 84।ইথিলিন একটি উদ্ভিদ হরমোন যা উদ্ভিদের বিকাশ এবং অ্যাবায়োটিক এবং জৈবিক চাপের অবস্থার প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে বিভিন্ন ভূমিকা পালন করে।ACO ট্রান্সক্রিপশনের আনয়ন এবং ইথিলিন সিগন্যালিং পাথওয়ের সক্রিয়করণ প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতি এবং ফাইটোঅ্যালেক্সিনগুলির উত্পাদন নিয়ন্ত্রণ করে হেমিবায়োট্রফিক ছত্রাক ওরিজা ওরিজায় ধানের প্রতিরোধ ক্ষমতা বৃদ্ধিতে জড়িত।M. oryzae এবং C. lupini88,89-এর মধ্যে পাওয়া একটি খুব অনুরূপ পাতার সংক্রমণ প্রক্রিয়া, এই গবেষণায় রিপোর্ট করা 83A:476 লাইনে ACO হোমোলগগুলির একটি উল্লেখযোগ্য আপগ্র্যুলেশনের পটভূমিতে, এনএলএল অ্যানথ্রাকনোজ ইথিলিনকে একটি সংকেত কেন্দ্রিক পদক্ষেপে প্রতিরোধ করার সম্ভাবনাকে পরিবর্তন করে।
বর্তমান সমীক্ষায়, সালোকসংশ্লেষণের সাথে যুক্ত অনেক জিনের বড় আকারের দমন 83A:476-এ 6 এইচপিআই এবং ম্যান্ডেলূপে 48 এইচপিআই এবং 22660 জনসংখ্যায় পরিলক্ষিত হয়েছে।এই পরিবর্তনগুলির ব্যাপ্তি এবং অগ্রগতি স্তরের সমানুপাতিক।এই পরীক্ষায় অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ লক্ষ্য করা গেছে।সম্প্রতি, প্যাথোজেনিক ব্যাকটেরিয়া এবং ছত্রাক সহ উদ্ভিদ-প্যাথোজেন মিথস্ক্রিয়াগুলির বেশ কয়েকটি মডেলে সালোকসংশ্লেষণ-সম্পর্কিত প্রতিলিপিগুলির শক্তিশালী এবং প্রাথমিক দমনের রিপোর্ট করা হয়েছে।তাড়াহুড়ো (কিছু মিথস্ক্রিয়ায় 2 এইচপিআই থেকে) এবং সংক্রমণের প্রতিক্রিয়ায় সালোকসংশ্লেষণের সাথে যুক্ত জিনের বিশ্বব্যাপী দমন প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতির স্থাপনার উপর ভিত্তি করে উদ্ভিদের অনাক্রম্যতা ট্রিগার করতে পারে এবং অ্যালার্জির প্রতিক্রিয়া 90,94 এর মধ্যস্থতা করার জন্য স্যালিসিলিক অ্যাসিড পথের সাথে তাদের মিথস্ক্রিয়া।
উপসংহারে, সবচেয়ে প্রতিরোধী বংশের (83A:476) জন্য প্রস্তাবিত প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়া প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে রয়েছে R জিন (সম্ভবত TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) দ্বারা দ্রুত রোগজীবাণু সনাক্তকরণ এবং এলার্জি প্রতিক্রিয়া-মধ্যস্থিত স্যালিসিলিক অ্যাসিড এবং দীর্ঘস্থায়ী S-এর সংকেত দ্বারা ইথিলিন-এর সংকেত।ক্রিয়াটি DIR-1 প্রোটিন দ্বারা সমর্থিত।এটি উল্লেখ করা উচিত যে সি. লুপিনি সংক্রমণের জন্য বায়োট্রফিক সময়কাল খুব ছোট (প্রায় 2 দিন), তারপরে নেক্রোটিক বৃদ্ধি95।এই পর্যায়গুলির মধ্যে রূপান্তরটি নেক্রোসিস এবং ইথিলিন-ইনডুসিবল প্রোটিনের প্রকাশের সাথে যুক্ত হতে পারে যা হোস্ট উদ্ভিদে অতি সংবেদনশীল প্রতিক্রিয়ার জন্য ট্রিগার হিসাবে কাজ করে।অতএব, বায়োট্রফিক পর্যায়ে সি. লুপিনি সফলভাবে ধরার সময় উইন্ডোটি খুবই সংকীর্ণ।83A:476 তে 6 hpi-তে পর্যবেক্ষণ করা রেডক্স এবং সালোকসংশ্লেষণের সাথে যুক্ত জিনের পুনঃপ্রোগ্রামিং ছত্রাকের হাইফাইয়ের অগ্রগতির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ এবং বায়োট্রফিক পর্যায়ে একটি সফল প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়ার বিকাশের সূচনা করে।ম্যান্ডেলুপ এবং 22660 জনসংখ্যার ট্রান্সক্রিপ্টোমিক প্রতিক্রিয়াগুলি নেক্রোটিক বৃদ্ধিতে স্যুইচ করার আগে ছত্রাক ক্যাপচার করতে খুব দেরি হতে পারে, তবে, ম্যান্ডেলআপ 22660 জনসংখ্যার চেয়ে বেশি কার্যকর হতে পারে কারণ PR-10 প্রোটিনের তুলনামূলকভাবে দ্রুত নিয়ন্ত্রণ অনুভূমিক প্রতিরোধের প্রচার করে।
ইটিআই, ক্যানোনিকাল আর জিন দ্বারা চালিত, অ্যানথ্রাকনোজের প্রতি বিন প্রতিরোধের জন্য একটি সাধারণ প্রক্রিয়া বলে মনে হয়।এইভাবে, মডেল লেগুম মেডিকাগো ট্রাঙ্কাটুলাতে, অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ ক্ষমতা RCT1 জিন দ্বারা প্রদান করা হয়, TIR-NBS-LRR97 উদ্ভিদ R জিন শ্রেণীর সদস্য।সংবেদনশীল উদ্ভিদে স্থানান্তরিত করার সময় এই জিনটি আলফালফাতে বিস্তৃত-স্পেকট্রাম অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ ক্ষমতা প্রদান করে।সাধারণ বিন (P. vulgaris) এ, এখন পর্যন্ত দুই ডজনেরও বেশি অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধী জিন চিহ্নিত করা হয়েছে।এই জিনগুলির মধ্যে কিছু এমন অঞ্চলে পাওয়া যায় যেখানে কোনও ক্যানোনিকাল R জিনের অভাব রয়েছে, তবে অন্য অনেকগুলি TIR-NBS-LRRs99 সহ NBS-LRR জিন ক্লাস্টার বহনকারী ক্রোমোজোমের প্রান্তে অবস্থিত।জিনোম-ওয়াইড এসএসআর অধ্যয়নটি সাধারণ শিমের অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের সাথে এনবিএস-এলআরআর জিনের সংযোগ নিশ্চিত করেছে।সাদা লুপিন 101-এ প্রধান অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের লোকাস বহনকারী জিনোমিক অঞ্চলে ক্যানোনিকাল R জিনটিও পাওয়া গেছে।
আমাদের কাজ দেখায় যে একটি তাত্ক্ষণিক প্রতিরোধের প্রতিক্রিয়া, যা উদ্ভিদ সংক্রমণের প্রাথমিক পর্যায়ে সক্রিয় হয় (12 hpi এর পরে নয়), কার্যকরভাবে প্যাথোজেনিক ছত্রাক Collelotrichum lupini দ্বারা সৃষ্ট অ্যানথ্রাকনোজ থেকে সরু-পাতার লুপিনকে রক্ষা করে।উচ্চ থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে, আমরা Lanr1 এবং AnMan রেজিস্ট্যান্স জিন দ্বারা মধ্যস্থতা করা NLL উদ্ভিদে অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধ জিনের ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলি প্রদর্শন করেছি।সফল প্রতিরক্ষার মধ্যে একটি প্যাথোজেনের সাথে উদ্ভিদের প্রথম যোগাযোগের কয়েক ঘন্টার মধ্যে রেডক্স, সালোকসংশ্লেষণ এবং প্যাথোজেনেসিসে জড়িত প্রোটিনের জন্য জিনগুলি যত্ন সহকারে ডিজাইন করা জড়িত।অনুরূপ প্রতিরক্ষামূলক প্রতিক্রিয়া, কিন্তু সময় বিলম্বিত, রোগ থেকে গাছপালা রক্ষা করার জন্য অনেক কম কার্যকর।Lanr1 জিন দ্বারা মধ্যস্থতা করা অ্যানথ্রাক্স প্রতিরোধ R জিনের সাধারণ দ্রুত প্রতিক্রিয়ার সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ (ইফেক্টর-ট্রিগারড ইমিউনিটি), যখন AnMan জিন সম্ভবত একটি অনুভূমিক প্রতিক্রিয়া প্রদান করে (অনাক্রম্যতা একটি জীবাণু-সম্পর্কিত আণবিক প্যাটার্ন দ্বারা ট্রিগার হয়), একটি মাঝারি স্তরের স্থায়িত্ব প্রদান করে।
অ্যানথ্রাকনোজ মার্কারগুলির জন্য স্ক্রিন করার জন্য ব্যবহৃত 215 NLL লাইনগুলির মধ্যে রয়েছে 74টি জাত, 60টি লাইন ক্রসিং বা প্রজননের মাধ্যমে প্রাপ্ত, 5টি মিউট্যান্ট এবং 76টি বন্য বা আসল জার্মপ্লাজম।লাইনগুলি 17টি দেশ থেকে এসেছে, প্রধানত পোল্যান্ড (58), স্পেন (47), জার্মানি (27), অস্ট্রেলিয়া (26), রাশিয়া (19), বেলারুশ (7), ইতালি (5) এবং অন্যান্য লাইন থেকে।10টি দেশ থেকে।সেটটিতে রেফারেন্স প্রতিরোধী রেখাও রয়েছে: 83A:476, তানজিল, ল্যানর1 অ্যালিল বহনকারী ওংগা এবং আনম্যান অ্যালিল বহনকারী ম্যান্ডেলুপ।পজনান প্ল্যান্ট ব্রিডিং লিমিটেড, ওয়াইট্রোভো, পোল্যান্ড (পরিপূরক সারণী S1) দ্বারা পরিচালিত ইউরোপীয় লুপিন জেনেটিক রিসোর্স ডেটাবেস থেকে লাইনগুলি প্রাপ্ত হয়েছে।
গাছপালা নিয়ন্ত্রিত অবস্থায় জন্মানো হয়েছিল (ফটোপিরিয়ড 16 ঘন্টা, তাপমাত্রা দিনে 25 ডিগ্রি সেলসিয়াস এবং রাতে 18 ডিগ্রি সেলসিয়াস)।দুটি জৈবিক প্রতিলিপি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।প্রোটোকল অনুযায়ী DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany) ব্যবহার করে তিন সপ্তাহের পুরনো পাতা থেকে DNA বিচ্ছিন্ন করা হয়েছিল।বিচ্ছিন্ন ডিএনএর গুণমান এবং ঘনত্ব স্পেকট্রোফোটোমেট্রিক পদ্ধতি দ্বারা মূল্যায়ন করা হয়েছিল (NanoDrop 2000; থার্মো ফিশার সায়েন্টিফিক, ওয়ালথাম, এমএ, ইউএসএ)।AnManM1 চিহ্নিতকারী অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধী জিন AnMan (cv. Mandelup থেকে প্রাপ্ত) এবং Anseq3 এবং Anseq4 জিন Lanr1 (cv. তানজিল থেকে প্রাপ্ত) চিহ্নিতকারী 11,26,28 বিশ্লেষণ করা হয়েছে।প্রতিরোধী অ্যালিলের জন্য হোমোজাইগোটগুলিকে "1″ হিসাবে, সংবেদনশীল - হিসাবে "0″ হিসাবে এবং হেটেরোজাইগোটগুলি - 0.5 হিসাবে স্কোর করা হয়েছিল।
AnManM1, AnSeq3 এবং AnSeq4 চিহ্নিতকারীর স্ক্রীনিংয়ের ফলাফল এবং চূড়ান্ত ফলো-আপ পরীক্ষা-নিরীক্ষার জন্য বীজের প্রাপ্যতার উপর ভিত্তি করে, অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের ফেনোটাইপিংয়ের জন্য 50টি NLL লাইন নির্বাচন করা হয়েছিল।বিশ্লেষণটি একটি কম্পিউটার নিয়ন্ত্রিত গ্রিনহাউসে 14 ঘন্টা ফটোপিরিয়ড সহ দিনে 22 ডিগ্রি সেলসিয়াস এবং রাতে 19 ডিগ্রি সেলসিয়াস তাপমাত্রার সাথে সদৃশভাবে সঞ্চালিত হয়েছিল।বীজের আবরণ খুব শক্ত হওয়ার কারণে বীজের সুপ্ততা রোধ করতে এবং সমান অঙ্কুরোদগম নিশ্চিত করার জন্য বপনের আগে বীজগুলি আঁচড়ানো হয় (ভ্রূণের বিপরীত দিকের বীজের আবরণটি একটি ধারালো ব্লেড দিয়ে কেটে ফেলা হয়)।জীবাণুমুক্ত মাটি (TS-1 REC 085 Medium Basic, Klasmann-Deilmann Polska, Warsaw, Poland) সহ পাত্রে (11 × 11 × 21 সেমি) গাছপালা জন্মানো হয়েছিল।কোলেটোট্রিকাম লুপিনি Col-08 স্ট্রেন দিয়ে টিকা দেওয়া হয়েছিল, 1999 সালে বৃহত্তর পোল্যান্ডের ভেরঝেনিতসা (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E) একটি মাঠে জন্মানো সরু-পাতাযুক্ত লুপিন গাছের ডালপালা থেকে জন্মানো হয়েছিল।একটি এলাকা পান।স্পোরুলেশন প্ররোচিত করার জন্য 21 দিনের জন্য কালো আলোতে 20° C তাপমাত্রায় SNA মাধ্যমে বিচ্ছিন্ন করা হয়েছিল।বীজ বপনের চার সপ্তাহ পরে, যখন গাছগুলি 4-6 পাতার পর্যায়ে পৌঁছেছিল, তখন প্রতি মিলি 0.5 x 106 কনিডিয়া ঘনত্বে কনিডিয়া সাসপেনশন দিয়ে স্প্রে করে টিকা দেওয়া হয়েছিল।টিকা দেওয়ার পর, কনিডিয়ার অঙ্কুরোদগম এবং সংক্রমণ প্রক্রিয়ার সুবিধার্থে প্রায় 98% আর্দ্রতা এবং 25 ডিগ্রি সেলসিয়াস তাপমাত্রায় গাছগুলিকে 24 ঘন্টা অন্ধকারে রাখা হয়েছিল।তারপরে গাছগুলি 14-ঘন্টা ফটোপিরিয়ডের অধীনে 22°C দিনে/19°C রাতে এবং 70% আর্দ্রতায় জন্মানো হয়েছিল।রোগের স্কোর টিকা দেওয়ার 22 দিন পরে তৈরি হয়েছিল এবং ডালপালা এবং পাতায় নেক্রোটিক ক্ষতগুলির উপস্থিতি বা অনুপস্থিতির উপর নির্ভর করে 0 (ইমিউন) থেকে 9 (খুবই সংবেদনশীল)।উপরন্তু, স্কোর করার পরে, গাছপালা ওজন পরিমাপ করা হয়েছিল।মার্কার জিনোটাইপ এবং রোগের ফিনোটাইপগুলির মধ্যে সম্পর্কগুলি বিন্দু দ্বি-ক্রম পারস্পরিক সম্পর্ক হিসাবে গণনা করা হয়েছিল (অ্যানথ্রাকনোজ প্রতিরোধের ফিনোটাইপ বিশ্লেষণের জন্য লাইনের সেটে হেটেরোজাইগাস মার্কারগুলির অনুপস্থিতি)।