Mutační analýza genů BRCA1/BRCA2 u karcinomu prsu

Javascript je ve vašem prohlížeči momentálně vypnutý. Některé funkce tohoto webu nebudou fungovat, když je JavaScript vypnutý.
Zaregistrujte se se svými konkrétními údaji a konkrétním lékem, který vás zajímá, a my vám poskytnuté informace spojíme s články v naší rozsáhlé databázi a obratem vám zašleme kopii PDF e-mailem.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6, 1, 7, klinika Catania University of Catania a Experimental Livia Manz 123, Itálie;2 Centrum pro experimentální onkologii a hematologii, AOU Policlinico „G.Rodolico – San Marco“, Catania , 95123, Itálie;3 Lékařská onkologie, AOU Poliklinika „G.Rodolico – San Marco“, Catania, 95123, Itálie;4 Lékařská genetika, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Itálie;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Itálie;6 Ústav biomedicínských a biotechnologických věd, University of Catania, Lékařská genetika, Catania, Itálie, 95123;7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Itálie Komunikace: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, email [e-mail chráněný];[email protected] Účel: Zárodečné mutace v BRCA1 a BRCA2 a prokázaná rakovina prsu (BC), vaječníků (OC) a další spojené s celoživotním rizikem rakoviny. Testování genu BRCA je klíčem k posouzení individuálního rizika, stejně jako k nalezení metod prevence u zdravých přenašečů a přizpůsobení léčby u pacientů s rakovinou. Přestože existuje široká škála údajů o BRCABR a v CABRCA1 a variantách napříč různými geografickými cestami a variantami V sicilských rodinách chybí studie specificky zaměřené na populace ve východní Sicílii. Cílem naší studie bylo prozkoumat incidenci a distribuci patogenních zárodečných změn BRCA u kohorty pacientů s BC z východní Sicílie a posoudit jejich souvislost se specifickými rysy BC pomocí sekvenování nové generace. Varianta, 17 (49 %) u BRCA1 a 18 (51 %) u BRCA2. Změny BRCA1 převládají u trojitě negativních pacientů s BC, zatímco mutace BRCA2 jsou častější u pacientů s luminálním BC. Ve srovnání s pacienty bez přenašečů měli jedinci s variantami BRCA1 od pacientů s BRCA1 významně vyšší index tumoru a mutace proliferativního stavu u SBC: přehled proliferativních nálezů nesporně a potvrzují úlohu analýzy NGS při identifikaci pacientů s dědičnou BC. Celkově jsou tato data v souladu s předchozími důkazy podporujícími screening BRCA pro správnou prevenci a léčbu rakoviny u přenašečů mutací.
Karcinom prsu (BC) je celosvětově nejrozšířenějším zhoubným nádorem a nejsmrtelnějším zhoubným nádorem u žen.1 Biologické rysy, které určují prognózu a klinické chování BC, byly rozsáhle studovány a částečně objasněny v průběhu času. Ve skutečnosti se v současné době používá několik náhradních markerů pro klasifikaci BC do různých molekulárních podtypů. Jsou to estrogenový (ER) a/nebo progesteronový receptor (receptor progesteronu) ampl2 epidermální růstový faktor, lidský receptor2 pro růstový faktor ampl-2 epidermis, proH 7 a stupeň tumoru (G).2 Kombinace těchto proměnných identifikovala následující kategorie BC: 1) Luminální tumory, vykazující expresi ER a/nebo PgR, představovaly 75 % BC. Tyto tumory byly dále rozděleny na Luminální A, kdy Ki-67 byl pod 20 % a HER2 negativní, a Luminální B, bez ohledu na přítomnost Ki-62 a proliferace HER2 a prolife 2 % a prolife2) HER2+ nádory, které jsou ER a PgR negativní, ale vykazují amplifikaci HER2. Tato skupina představuje 10 % všech nádorů prsu;3) Triple-negativní karcinom prsu (TNBC), který nevykazuje expresi ER a PgR a amplifikaci HER2, tvoří asi 15 % karcinomů prsu.2-4
Mezi těmito podtypy BC představují nádorový stupeň a proliferační index průřezové biomarkery, které jsou přímo a nezávisle spojeny s agresivitou a prognózou nádoru.5,6
Kromě výše zmíněných biologických rysů se v posledních letech stává stále důležitější role dědičných genetických změn vedoucích k rozvoji BC.7 Asi 1 z 10 nádorů prsu je zděděno v důsledku zárodečných alterací specifických genů.8 Dvě velké epidemiologické studie zahrnující více než 180 000 žen nedávno identifikovaly skupinu osmi genů, PA2CABR,2 CHBR1,2,2 RAD51C a RAD51D) primárně odpovědné za dědičné BC. Z těchto genů vykazovaly nejsilnější korelaci s rozvojem nádorů prsu BRCA1 a BRCA2 (dále jen BRCA1/2). a.Ve věku 13 až 80 let je kumulativní incidence BC 72 % u žen s patogenní variantou BRCA1 (PV) a 69 % u žen s BRCA2 PV.14
Nedávná publikace zejména naznačuje, že riziko BC závisí na typu PV. Ve skutečnosti ve srovnání s patogenními zkrácenými variantami jsou do očí bijící missense varianty, zejména v genu BRCA1, spojeny se sníženým rizikem BC, zejména u starších žen.15
Přítomnost BRCA1 nebo BRCA2 PV byla spojena s různými biologickými a klinicko-patologickými rysy.16,17 BRCA1-asociované BC bývají klinicky agresivní, málo diferencované a vysoce proliferativní. Tyto nádory jsou obvykle trojnásobně negativní a mají časný nástup. jsou častější v lumenu B a obvykle se vyskytují u starších dospělých.16-18 Je pozoruhodné, že mutace v BRCA1 a BRCA2 zvyšují citlivost na specifickou léčbu, včetně platinových solí a cílených léků, jako jsou inhibitory poly(ADP-ribóza) polymerázy (PARPi).19,20
Za posledních několik let umožnila implementace sekvenování nové generace (NGS) v klinické praxi rostoucímu počtu pacientů s BC podstoupit molekulární testování syndromů náchylnosti k rakovině, včetně BRCA1/2.21 Současně definice založené na přesných kritériích týkajících se rodinné anamnézy, demografických a klinicko-patologických charakteristik pro lepší identifikaci jedinců hodných BRCA1/2 screeningového testování v tomto kontextu specifického screeningu BRCA1/2 jsou v CAm specifických důkazech.22 s, zdůrazňující rozdíly mezi geografickými oblastmi.24–27 Ačkoli existují zprávy o kohortě BC v západní Sicílii, je k dispozici méně údajů o screeningu BRCA1/2 v populaci východní Sicílie.28,29
Popisujeme zde výsledky zárodečného screeningu BRCA1/2 u pacientů s BC z východní Sicílie a dále korelujeme přítomnost mutací BRCA1 nebo BRCA2 s hlavními klinickopatologickými rysy těchto nádorů.
Retrospektivní studie byla provedena v „Centru experimentální onkologie a hematologie“ v Policlinico Hospital.Rodolico – San Marco v Catanii. Od ledna 2017 do března 2021 bylo do naší molekulárně genetické laboratoře odesláno celkem 455 pacientů s rakovinou prsu a vaječníků, melanomem, rakovinou slinivky nebo prostaty. před molekulární analýzou.
Histologické a biologické charakteristiky (stav ER, PgR, HER2, Ki-67 a stupeň) BC byly hodnoceny na vzorcích jádrové biopsie nebo chirurgických vzorcích, přičemž byly uvažovány pouze agresivní složky nádoru. Na základě těchto charakteristik byly BC klasifikovány následovně: luminální A (ER+ a/nebo PgR+, HER2-, Ki-67<20 %), luminální PgR2+, B-2, B-2, B7≥ HER2+,-0-6 %) HER2+ (ER a/nebo PgR+, HER2+), HER2+ (ER a PgR-, HER2+) nebo trojnásobně negativní (ER a PgR-, HER2-).
Před posouzením stavu mutace BRCA1 a BRCA2 provedl multidisciplinární tým zahrnující onkologa, genetika a psychologa u každého pacienta konzultaci týkající se genetiky nádoru, aby určil přítomnost BRCA1 a/nebo BRCA1.nebo jedinci s vysokým rizikem PV v genu BRCA2. Výběr pacientů byl proveden podle pokynů Italské společnosti lékařské onkologie (AIOM) a místních sicilských doporučení.30,31 Tato kritéria zahrnují: (i) rodinnou anamnézu známých patogenních variant v genech citlivosti (např. BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN);(ii) muži s BC;(iii) ty s BC a OC;(iv) ženy s BC <36 let, TNBC <60 let nebo bilaterální BC <50 let;(v) osobní anamnéza BC < 50 let a alespoň jeden příbuzný prvního stupně: (a) BC < 50 let;b) nemucinózní a nehraniční OC jakéhokoli věku;(c) bilaterální BC;(d) samec BC;(e) rakovinu slinivky;(f) rakovina prostaty;(vi) dvě nebo více Osobní anamnéza BC > 50 let a rodinná anamnéza BC, OC nebo rakoviny slinivky u příbuzných, kteří jsou navzájem příbuzní prvního stupně (včetně příbuzných, s nimiž je příbuzná prvního stupně);(vii) Osobní anamnéza OC a alespoň jeden příbuzný prvního stupně: (a) BC <50 let;(b) NOC;(c) bilaterální BC;(d) samec BC;vii) samice s vysoce kvalitní serózní OC.
Od každého pacienta bylo odebráno 20 ml vzorku periferní krve a odebráno do EDTA zkumavek (BD Biosciences). Genomová DNA byla izolována z 0,7 ml vzorků plné krve pomocí QIAsymphony DSP DNA Midi kit Isolation Kit (QIAGEN, Hilden, Itálie) podle instrukcí výrobce a prošla Qubit® 3.0 Fishertific S Fluortific, USA.Obohacení cíle a přípravu knihovny provádí Oncomine™ BRCA Research Assay Chef, připravený k vložení do soupravy Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 Kit pro automatickou přípravu knihovny podle pokynů výrobce. Souprava se skládá ze dvou multiplexních poolů PCR primerů, které lze použít ke studiu všech genů BRCA1 (NM_00730030.3) a BRCA1 (NM_00730030.3) a 5 ul každého zředěného vzorku DNA (10 ng) bylo přidáno na destičky s čárovým kódem pro přípravu knihovny a všechna činidla a spotřební materiál byly vloženy do přístroje Ion Chef™. Automatická příprava knihovny a shromažďování knihovny vzorků s čárovým kódem byly poté provedeny na přístroji Ion Chef™. Počet připravených knihoven byl poté vyhodnocen pomocí Qubit®, Waltcient® 3.0, podle instrukcí výrobce Fisher, Fisher, Scientham, USA, výrobce Fisher .Nakonec jsou knihovny kombinovány v ekvimolárních poměrech ve vzorkových zkumavkách knihovny Ion Chef™ (zkumavky s čárovým kódem) a vloženy do přístroje Ion Chef™. Sekvenování bylo provedeno pomocí přístroje Ion Torrent S5 (Thermo Fisher Scientific) (Thermo Fisher Scientific) s použitím analýzy Ion 510 Ampli (ThermoFisercon Suite) a Ion 510 Amplicon Suite (ThermoDrl) Reportérský software.
Všechny varianty názvosloví se řídily aktuálními pokyny Human Genome Variation Consortium, dostupnými online (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Klinický význam variant BRCA1/2 byl definován pomocí klasifikace mezinárodního konsorcia ENIGMA (Evidence-Based Network for Interpreting Germline Mutant Alleles) a databáze AR konzultujte různé databáze UPigmacsorg, např. CAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD a UMD. Klasifikace zahrnuje pět odlišných kategorií rizika: benigní (kategorie I), pravděpodobně benigní (kategorie II), varianta nejisté významnosti (VUS, kategorie III), pravděpodobně patogenní (kategorie IV) a patogenní (kategorie V). VarSome také analyzoval účinek mutací a přístup k databázi, informativní nástroj3 na strukturu proteinu3
K přiřazení potenciální klinické významnosti každému VUS byly použity následující výpočetní algoritmy pro predikci proteinů: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) a (agvgdhttp://pph2/) agvgdhttp://pph. input.php). Varianty klasifikované jako třída 1 a 2 byly považovány za divoký typ.
Sangerovo sekvenování potvrdilo přítomnost každé patogenní varianty. Stručně řečeno, pro každou detekovanou variantu byl navržen pár specifických primerů s použitím referenčních sekvencí genu BRCA1 a BRCA2 (NG_005905.2, NM_007294.3 a NG_012772.3, NM_000059.3, v tomto pořadí bylo provedeno sekvenování PCR).
Pacienti s negativním testem na gen BRCA1/2 byli testováni multiplexní amplifikací sondy závislé na ligaci (MLPA) podle pokynů výrobce k posouzení přítomnosti velkých genomických přestaveb (LGR). Stručně řečeno, vzorky DNA jsou denaturovány a je použito až 60 sond specifických pro gen BRCA1 a BRCA2, z nichž každá detekuje specifickou sekvenci DNA s přibližně 60 nukleotidovou délkou a nukleotidovou PCR. amplikony, byly poté analyzovány kapilární elektroforézou a softwarem Cofalyser.Net ve spojení s příslušnými dávkově specifickými tabulkami Cofalyser (www.mrcholland.com).
Vybrané klinicko-patologické proměnné (histologický stupeň a index proliferace Ki-67 %) byly spojeny s přítomností BRCA1/2 PV, vypočítané pomocí softwaru Prism v. 8.4 s použitím Fisherova exaktního testu za předpokladu, že p-hodnota <0,05 je významná.
Mezi lednem 2017 a březnem 2021 bylo vyšetřeno 455 pacientů na zárodečné mutace BRCA1/2. Testování mutací bylo provedeno v Centru experimentální onkologie a hematologie nemocnice Policlinico. Podle sicilské směrnice (http://www.gurs.regione.sicilia.it/Indicep.20.1 Genio.it/Indicep. 0), Rodolico of Catania – San Marco“, celkem 389 pacientů. Vyskytla se rakovina prsu, 37 rakovina vaječníků, 16 rakovina slinivky, 8 rakovina prostaty a 5 melanom.Rozdělení pacientů podle typu rakoviny a výsledků analýzy je znázorněno na obrázku 1.
Obrázek 1 ukazuje vývojový diagram znázorňující přehled studie. Pacienti s nádory prsu, melanomu, pankreatu, prostaty nebo vaječníků byli testováni na mutace v genech BRCA1 a BRCA2.
Zkratky: PVs, patogenní varianta;VUS, varianta nejistého významu;WT, sekvence BRCA1/2 divokého typu.
Naše studie jsme selektivně zaměřili na kohorty karcinomu prsu. Medián věku pacientek byl 49 let (rozmezí 23-89) a byly převážně ženy (n=376, neboli 97 %).
Z těchto subjektů mělo 64 (17 %) mutace BRCA1/2 a všechny byly ženy. 35 (9 %) mělo PV a 29 (7,5 %) mělo VUS. Sedmnáct (48,6 %) z 35 patogenních variant se vyskytlo u BRCA1 a 18 (51,4 %) u BRCA2 a 8 %) (8 %), zatímco u 24 5 BR82. CA2 (obrázky 1 a 2). LGR nebyl přítomen v analýze MLPA.
Obrázek 2. Analýza mutací BRCA1 a BRCA2 u 389 pacientek s rakovinou prsu. (A) Distribuce patogenních variant (PV) (červená), variant s nejistým významem (VUS) (oranžová) a WT (modrá) u 389 pacientek s rakovinou prsu;(B) 389 pacientek s rakovinou prsu 35 (9 %) mělo patogenní varianty (PV) BRCA1/2. Mezi nimi bylo 17 (48,6 %) přenašečů BRCA1 PV (tmavě červená) a 18 (51,4 %) přenašečů BRCA2 (světle červená);(C) 29 (7,5 %) z 389 subjektů neslo VUS, 5 (17,2 %) geny BRCA1 (tmavě oranžová) a 24 (82,8 %) geny BRCA2 (světle oranžová).
Zkratky: PVs, patogenní varianta;VUS, varianta nejistého významu;WT, sekvence BRCA1/2 divokého typu.
Dále jsme zkoumali prevalenci molekulárních podtypů BC u pacientů s BRCA1/2 PV. Distribuce zahrnovala 2 (5,7 %) luminální A, 15 (42,9 %) luminální B, 3 (8,6 %) luminální B-HER2+, 2 (5,7 %) HER2+ a 13 (37,1 %) luminálních pacientů s TN2BC. B BC mělo 2 (11,8 %) onemocnění HER2+ a 10 (58,8 %) mělo TNBC. Nádory bez mutací BRCA1 byly buď luminální A nebo luminální B-HER2+ (obrázek 3). V BRCA2-pozitivní podskupině bylo 10 (55,6 %) tumorů (HER167+, 3 %) luminálních B-3 %) (HER267+, 3 %) TNBC a 2 (11,1 %) byly luminální A (obrázek 3). V této skupině nebyly přítomny žádné nádory HER2+. Mutace BRCA1 tedy převládají u pacientů s TNBC, zatímco změny BRCA2 převládají u jedinců s lumenem B.
Obrázek 3 Prevalence podtypů rakoviny prsu u pacientek s patogenními variantami v BRCA1 a BRCA2. Histogramy ukazující distribuci BRCA1- (tmavě červená) a BRCA2- (světle červená) PV mezi molekulárními podtypy pacientek s rakovinou prsu. Čísla uvedená v každém rámečku představují procento pacientek s BRCA1 a BRCA2 PV pro každý podtyp PV prsu.
Zkratky: PVs, patogenní varianta;HER2+, lidský receptor epidermálního růstového faktoru 2 pozitivní;TNBC, triple-negativní rakovina prsu.
Následně jsme hodnotili typ a genovou lokalizaci BRCA1 a BRCA2 PVs. U BRCA1 PV jsme pozorovali 7 jednonukleotidových variant (SNV), 6 delecí, 3 duplikace a 1 inzerci. Pouze jedna mutace (c.5522delG) představuje nový objev. Nejběžnější BRCA1 alter alter byl detekován u obou subjektů. delece pěti nukleotidů (CTAAT) v BRCA1 exonu 15, což vede k substituci aminokyseliny leucinu tyrosinem v kodonu 1679 a v důsledku translačního posunu čtecího rámce s předpokládaným alternativním stop kodonem vede k předčasnému zkrácení proteinu. Všechny ostatní změny jsou detekovány pouze v jednom případě. Pozoruhodné je, že jedna z hlášených oblastí spojování T57+ byla lokalizována G>43 (T5 PVc1) 1).
Pokud jde o BRCA2 PV, pozorovali jsme 6 delecí, 6 SNV a 2 duplikace. Žádná z nalezených změn není nová. V naší populaci se znovu objevily tři mutace, c.428dup a c.8487+1G>A pozorované u 3 subjektů, po nichž následovalo c.5851_5854 indelace dvou případů extrakce48TT se týkaly c. 5 z BRCA2, u kterého se předpokládá, že kóduje zkrácený nefunkční protein. Mutace c.8487+1G>A se vyskytuje v intronové oblasti intronu BRCA2 19 (± 1,2) a ovlivňuje konsenzuální sekvenci sestřihu, což vede ke změně sestřihu, což vede k abnormálnímu nebo chybějícímu nukleotidu v důsledku delece nukleotidu c.58451AG na variantu nukleotidu c.5851-5TT_5 51 až 5854 v kódujícím exonu 10 genu BRCA2 a vede k translačnímu posunu čtecího rámce s předpokládaným alternativním stop kodonem (p.S1951WfsTer). Je pozoruhodné, jak již bylo dříve uvedeno, obě alterace c.631G>A a c.7008-2A>T byly detekovány u stejné mutace (a2) u 7 pacientů s adenoinem BR4. guanin (G) obsahující nukleotid vedoucí ke změně valinu na isoleucin na kodonu 211, isoleucin Aminokyselina je aminokyselina s velmi podobnými vlastnostmi. Tato změna ovlivňuje normální sestřih mRNA. Druhá varianta se nachází v intronové oblasti a vede k dvojité substituci A za thymin (T) před exonem 13, může generovat mnohočetná změna kódování cBR-CA2A genu cBR0.07 genu cBR0. různé délky. Dále ve skupině BRCA2 PV byly 4 z 18 změn (22,2 %) intronické.
Poté jsme zmapovali škodlivé mutace BRCA1/2 ve funkčních doménách a oblastech vázajících protein (obr. 4). V genu BRCA1 bylo 50 % PV lokalizováno v oblasti klastru rakoviny prsu (BCCR), zatímco 22 % mutací bylo lokalizováno v oblasti klastru rakoviny vaječníků (OCCR) (obr. 4A). % mutací bylo lokalizováno v OCCR (obr. 4B). Dále jsme hodnotili umístění PV v proteinových doménách BRCA1 a BRCA2. U proteinu BRCA1 jsme našli tři PV v doménách smyčky a coiled coil a dvě mutace v doméně BRCT (obr. 4A). byly detekovány v oligo/oligosacharid-vazebných (OB) a věžových (T) doménách (obrázek 4B).
Obrázek 4 Schematické znázornění proteinů BRCA1 a BRCA2 a lokalizace patogenních variant. Tento obrázek ukazuje distribuci patogenních variant BRCA1 (A) a BRCA2 (B) u pacientek s rakovinou prsu. Exonické mutace jsou zobrazeny modře, zatímco intronové varianty jsou zobrazeny oranžově. Výška sloupce představuje počet případů. Uváděné proteiny BRCA1 a jejich domény BRCA1 jsou funkční. ING) a jadernou lokalizační sekvencí (NLS), coiled-coil doménou, SQ/TQ klastrovou doménou (SCD) a BRCA1 C-terminální doménou (BRCT).(B) Protein BRCA2 obsahuje osm BRC repetic, DNA-vazebnou doménu s helikální doménou (Helical), tři oligonukleotidy/oligosacharidy na postranní doméně, C.A. ast Cancer Cluster Region (BCCR) a Ovarian Cancer Cluster Region (OCCR) jsou zobrazeny dole.*Představuje mutace, které určují stop kodony.
Poté jsme zkoumali BC klinickopatologické rysy, které by mohly korelovat s přítomností BRCA1/2 PV. Kompletní klinické záznamy byly k dispozici pro 181 BRCA1/2-negativních pacientů (nepřenašečů) a všech přenašečů (n = 35). Existovala korelace mezi rychlostí proliferace tumoru a stupněm.
Vypočítali jsme distribuci Ki-67 na základě mediánu naší kohorty (25 %, rozmezí <10-90 %). Subjekty s Ki-67 < 25 % byly definovány jako „nízké Ki-67″, zatímco jedinci s hodnotami ≥ 25 % byli považováni za „vysoké Ki-67″. Významné rozdíly mezi přenašeči Ki-67 a CA-1 byly nalezeny < PV BR. 5A).
Obrázek 5 Korelace Ki-67 s distribucí stupňů u žen s rakovinou prsu s BRCA1 a BRCA2 PV a bez nich.(A) Boxplot ukazující střední hodnoty Ki-67 u 181 pacientek s BC bez přenašeče versus BRCA1 (18) nebo BRCA2 (17) pacientek s PV (hodnoty Hist t 2 a G3) podle stavu mutace BRCA1 a BRCA2 (subjekty WT, nositelé BRCA1 a BRCA2 PVs).
Podobně jsme zkoumali, zda stupeň nádoru koreluje s přítomností BRCA1/2 PV. Vzhledem k tomu, že G1 BC v naší populaci chyběl, rozdělili jsme pacienty do dvou skupin (G2 nebo G3). V souladu s výsledky Ki-67 analýza odhalila statisticky významnou korelaci mezi stupněm nádoru a mutací BRCA1, s vyšším podílem nádorů G3 ve srovnání s BRCA105 (obr. ).
Pokroky v technologii sekvenování DNA umožnily bezprecedentní pokroky v genetickém testování BRCA1/2 s zásadními důsledky pro pacienty s rodinnou anamnézou rakoviny. K dnešnímu dni bylo identifikováno a klasifikováno přibližně 20 000 variant BRCA1/2 podle American Society of Medical Genetics 35 a systému ENIGMA.35,36 Je dobře známo, že v BRCA1/2 geografickém spektru je široce známo, že v BRCA1/2 geografickém spektru. BRCA1/2 PV se pohybovalo od 8 % do 37 %, což vykazovalo širokou variabilitu v rámci země.38,39 S téměř 5 miliony obyvatel je Sicílie pátý největší region v Itálii z hlediska počtu obyvatel. Přestože existují údaje o distribuci BRCA1/2 na západní Sicílii, ve východní části ostrova neexistují žádné rozsáhlé důkazy.
Naše studie je jednou z prvních zpráv o incidenci BRCA1/2 PV u pacientů s BC ve východní Sicílii.28 Naši analýzu jsme zaměřili na BC, protože jde o zdaleka nejčastější onemocnění v naší kohortě.
Při testování 389 pacientů před naším letopočtem mělo 9 % BRCA1/2 PV, rovnoměrně rozložené mezi BRCA1 a BRCA2. Tyto výsledky jsou v souladu s výsledky dříve hlášenými v italské populaci.28 Je zajímavé, že 3 % (13/389) naší kohorty byli muži. Tato míra je vyšší, než se očekávalo u mužské populace rakoviny prsu (1 % všech našich výběrů 2 BC na základě rizika),40 BR. u mužů se vyvinula BRCA1/2 PV, takže byli kandidáty na další molekulární analýzu, aby se vyloučila přítomnost méně běžných mutací, jako jsou mimo jiné PALB2, RAD51C a D. Varianty nejisté významnosti byly získány u 7 % subjektů, u kterých byl evidentní BRCA2 VUS. I tento výsledek je v souladu s již existujícími důkazy.28,41,42
Když jsme analyzovali distribuci molekulárních podtypů BC u mutantních žen BRCA1/2, potvrdili jsme známé souvislosti mezi TNBC a BRCA1 PV (58,8 %) a mezi luminálním B BC a BRCA2 PV (55,6 %).16,43 Luminální A a HER2+ tumory u BRCA1 a BRCA2 PV jsou v souladu s 1 existujícími údaji z literatury3, 4 nositeli PV
Poté se zaměřujeme na typ a umístění BRCA1/2 PV. V našem souboru byla nejčastější BRCA1 PV c.5035_5039delCTAAT. Ačkoli Incorvaia et al.nepopsali tuto variantu ve své sicilské kohortě, jiní autoři ji uvedli jako zárodečnou linii BRCA1 PV.34 V naší kohortě bylo nalezeno několik BRCA1 PV – např. c.181T>G, c.514del, c.3253dupA a c.5266dupC – které byly pozorovány na Sicílii28> těchto dvou,1.81 mutace BRCA1 a 1.81. .5266dupC) se běžně vyskytují u aškenázských Židů ve východní a střední Evropě (Polsko, Česká), slovinská, rakouská, maďarská, běloruská a německá), 44,45 a ve Spojených státech a Argentině byla nedávno definována jako „recidivující zárodečná varianta“ u italských pacientů s BC a OC. 34c.514rozhodná varianta u pacientů s rakovinou prsu S.514, v Messině byla dříve identifikována dokonce u pacientů s rakovinou prsu na severu 34c.514. vaia a kol.našli variantu c.3253dupA v některých rodinách v Catanii.28 Nejreprezentativnějšími BRCA2 PV jsou c.428dup, c.5851_5854delAGTT a intronická varianta c.8487+1G>A, které byly podrobněji popsány 28 u pacienta v Palermu s c.428PVsever. tern Sicílie, hlavně v regionech Trapani a Palermo, zatímco c.5851_5854delAGTT PV byla pozorována v domácnostech na severozápadě Sicílie. Varianta 8487+1G>A byla běžnější u subjektů z Messiny, Palerma a Caltanissetta.28 Rebbeck et al.již dříve popsali změnu c.5851_5854delAGTT v Kolumbii.37 Další BRCA2 PV, c.631+1G>A, byla nalezena u pacientů s BC a OC ze Sicílie (Agrigento, Siracusa a Ragusa). pacient, o kterém jsme předpokládali, že je segregovaný v cis módu, jak bylo dříve uvedeno.34,46 Tyto BRCA2 uble mutace jsou skutečně často pozorovány v italské oblasti a bylo zjištěno, že zavádějí předčasné stop kodony, ovlivňují sestřih messenger RNA a způsobují selhání proteinu BRCA2.47,48
Také jsme mapovali BRCA1 a BRCA2 PVs v domnělých OCCR a BCCR oblastech proteinových domén a genů. Tyto oblasti popsali Rebbeck et al.jako rizikové oblasti pro rozvoj rakoviny vaječníků a prsu.49 Důkazy týkající se souvislosti mezi lokalizací zárodečných variant a rizikem rakoviny prsu nebo vaječníků však zůstávají kontroverzní.28,50-52 V naší populaci byly BRCA1 PV převážně lokalizovány v oblasti BCCR, zatímco BRCA2 PV byly převážně nalezeny v jakékoli oblasti OCOC a byly umístěny v jakékoli oblasti. To může být způsobeno omezeným počtem pacientů s mutacemi BRCA1/2. Z pohledu proteinové domény jsou BRCA1 PV distribuovány podél celého proteinu a změny BRCA2 se přednostně nacházejí v doméně repetice BRC.
Nakonec jsme korelovali BC klinickopatologické rysy s BRCA1/2 PV. Vzhledem k omezenému počtu zahrnutých pacientů jsme nalezli pouze významnou korelaci mezi Ki-67 a stupněm tumoru. Přestože hodnocení a interpretace Ki-67 zůstává poněkud kontroverzní, je jisté, že vysoká míra proliferace je spojena se zvýšeným rizikem recidivy onemocnění a „nízkým datem přežití“7 je „nízká hranice přežití“2 Ki-6. %.Tento práh se však nevztahuje na naši populaci pacientů s mutací BRCA1/2, která má střední hodnotu Ki-67 25 %.Tento trend ve vysokých hodnotách Ki-67 lze vysvětlit prevalencí v našich luminálních kohortách B a TNBC, z nichž bylo přítomno jen málo luminálních A tumorů. Některé důkazy však naznačují, že vyšší hranice Ki-67 podle jejich prognózy může být lepší (5,5 %) (5,5 %) pacientů. Výsledky naší analýzy, významná korelace není překvapující. Vyskytuje se mezi vysokou hodnotou Ki-67 a stupněm a přítomností BRCA1 PV. Ve skutečnosti jsou nádory související s BRCA1 typické pro TNBC a vykazují agresivnější rysy.16,17
Závěrem lze říci, že tato studie poskytuje zprávu o mutačním stavu BRCA1/2 v kohortě BC z východní Sicílie. Celkově jsou naše zjištění v souladu s již existujícími důkazy, a to jak z hlediska prevalence mutací, tak klinickopatologických rysů v BC. Více studií u větších populací BRCA1/2-mutovaných pacientů s BC, které jsou odlišné od mutací a u pacientů s častými mutacemi rozšířenými na multigenomy, jako je například přítomnost mutací a multigenomů rozšířených na PV BRCA1/2. To umožní identifikaci a správnou léčbu rostoucího počtu subjektů se zvýšeným rizikem rakoviny v důsledku genetických mutací.
Potvrdili jsme, že pacienti podepsali informovaný souhlas s anonymním uvolněním vzorků svých nádorů pro výzkumné účely. Všichni pacienti podepsali písemný informovaný souhlas podle Helsinské deklarace. Podle politiky AOU Policlinico „G.Rodolico – S.Marco“ byla tato studie vyjmuta z etického přezkumu, protože analýza BRCA1/2 byla provedena v souladu s klinickou praxí a všichni pacienti také dali písemný informovaný souhlas s použitím údajů k použití.Pati.Pati.
Děkujeme Prof. Paolu Vignerimu za jeho pomoc při péči o pacientky s rakovinou prsu, jak to požadovala Etická komise.
Federica Martorana hlásí honoráře od Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. Ostatní autoři prohlašují, že v této práci nejsou střety zájmů.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN odhaduje incidenci a mortalitu 36 druhů rakoviny ve 185 zemích světa.


Čas odeslání: 15. dubna 2022