Dadansoddiad treiglad o enynnau BRCA1/BRCA2 mewn canser y fron

Mae Javascript wedi'i analluogi yn eich porwr ar hyn o bryd. Ni fydd rhai nodweddion o'r wefan hon yn gweithio pan fydd javascript wedi'i analluogi.
Cofrestrwch gyda'ch manylion penodol a chyffur o ddiddordeb penodol a byddwn yn paru'r wybodaeth a roddwch ag erthyglau yn ein cronfa ddata helaeth ac yn e-bostio copi PDF atoch yn brydlon.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6, 7 Marco Fichera, Adran Feddygaeth 6, 1 Cateri, 1, 1, Livia Cateri, 1, 7, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, experia cateri, 7, 1, 1, 1, experia cateri, 7, 1, 1, 1, 1, experian cateri, 6, 6, 1, experia cateri, 6, 1, 1, 1, 1, 1, 1, experian cateri. ania, 95123, yr Eidal;2 Canolfan Oncoleg a Haematoleg Arbrofol, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania , 95123, yr Eidal;3 Oncoleg Feddygol, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, yr Eidal;4 Geneteg Feddygol, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, yr Eidal;5 Geneteg Meddygaeth, ASP, Syracuse, 96100, yr Eidal;6 Adran y Gwyddorau Biofeddygol a Biotechnoleg, Prifysgol Catania, Geneteg Feddygol, Catania, yr Eidal, 95123;7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Italy Communications: Stefania Stella, ffôn +39 095 378 1946, email [email protected];[e-bost a ddiogelir] Pwrpas: Treigladau germline yn BRCA1 a BRCA2 a chanser y fron sefydledig (BC), ofari (OC) ac eraill sy'n gysylltiedig â risg oes o ganser.Profi ar gyfer y genyn BRCA yn allweddol i asesu risg unigol, yn ogystal ag ar gyfer dod o hyd i ddulliau atal mewn cludwyr iach a theilwra triniaethau mewn cleifion canser.The nifer yr achosion o BRCA1 a BRCA2 newidiadau data yn eang ar draws rhanbarthau daearyddol pathogenig, ac astudiaethau BRCA2 yn bodoli'n eang, Nod ein hastudiaeth oedd ymchwilio i amlder a dosbarthiad newidiadau i linell eginyn pathogenig BRCA mewn carfan o gleifion CC o ddwyrain Sisili ac asesu eu cysylltiad â nodweddion BC penodol gan ddefnyddio dilyniannu cenhedlaeth nesaf. CA1 a 18 (51%) yn BRCA2.BRCA1 newidiadau yn gyffredin mewn cleifion BC triphlyg-negyddol, tra bod treigladau BRCA2 yn fwy cyffredin mewn cleifion BC luminal. O'i gymharu â rhai nad ydynt yn gludwyr, pynciau ag amrywiadau BRCA1 oedd gradd tiwmor sylweddol uwch a mynegai lluosog.Casgliadau: Mae ein canfyddiadau yn darparu trosolwg o gleifion SCAly statws eastional swyddogaeth yn cadarnhau ei statws cleifion NCA luminal gyda'r dadansoddiad o'i statws cleifion NBC luminal yn nodi statws tiwmor sylweddol uwch a mynegai lluosog. BC.Yn gyffredinol, mae'r data hyn yn gyson â thystiolaeth flaenorol sy'n cefnogi sgrinio BRCA ar gyfer atal a thrin canser yn briodol mewn cludwyr mwtaniad.
Canser y fron (BC) yw'r malaenedd mwyaf cyffredin yn fyd-eang a'r canser mwyaf marwol mewn merched.1 Mae'r nodweddion biolegol sy'n pennu prognosis CC ac ymddygiad clinigol wedi'u hastudio'n helaeth a'u hegluro'n rhannol dros amser. mynegai amlhau Ki-67 a gradd tiwmor (G).2 Nododd y cyfuniad o'r newidynnau hyn y categorïau BC canlynol: 1) Roedd tiwmorau luminal, sy'n dangos mynegiant ER a/neu PgR, yn cyfrif am 75% o BCs. Rhannwyd y tiwmorau hyn ymhellach yn Luminal A, pan oedd Ki-67 yn is na 20% a phresenoldeb HER2 negyddol, a Luminal am 60% yn uwch na'r gyfradd negyddol, ac roedd Luminal B, neu 2 pl, yn hafal i Ki-67% yn uwch na'r HER2. mynegai amlhau;2) Tiwmorau HER2+ sy'n ER a PgR negatif ond sy'n dangos mwyhad HER2. Mae'r grŵp hwn yn cyfrif am 10% o holl diwmorau'r fron;3) Mae canser y fron triphlyg-negyddol (TNBC), nad yw'n dangos mynegiant ER a PgR ac ymhelaethiad HER2, yn cyfrif am tua 15% o ganserau'r fron.2-4
Ymhlith yr isdeipiau CC hyn, mae gradd tiwmor a mynegai amlhau yn cynrychioli biomarcwyr traws-adrannol sy'n gysylltiedig yn uniongyrchol ac yn annibynnol ag ymosodol tiwmor a prognosis.5,6
Yn ogystal â'r nodweddion biolegol a grybwyllwyd uchod, mae rôl newidiadau genetig etifeddol sy'n arwain at ddatblygiad CC wedi dod yn fwyfwy pwysig dros yr ychydig flynyddoedd diwethaf.7 Mae tua 1 o bob 10 tiwmor y fron yn cael eu hetifeddu oherwydd newidiadau germlin mewn genynnau penodol.8 Yn ddiweddar, mae dwy astudiaeth epidemiolegol fawr yn cynnwys mwy na 180,000 o fenywod wedi nodi grŵp o wyth o enynnau (ARD), BRCA2, ATM, BR2, B1, BRCA2, ATM, BCA2, BRCA2, ATM, BR2, BCA2, BRCA2, ATM, BRCA2, BRCA2, ATM, BR2, BCA2, ATM 1, BCA2, ATM, BCA2, ATM, BCA2, BRCA2, ATM, BR2, BCA2, ATM, BR2, BCA2, ATM, BCA2, BRCA2, ATM, BR1, C. RAD51C, a RAD51D) yn bennaf gyfrifol am etifeddol BC.Ymhlith y genynnau hyn, BRCA1 a BRCA2 (y cyfeirir ati yma wedi hyn fel BRCA1/2) yn dangos y cydberthynas cryfaf gyda datblygiad tiwmorau y fron.9-12 Mewn gwirionedd, germline treigladau BRCA1/2 yn cynyddu'n sylweddol y risg oes o BC yn ogystal â eraill malaenaidd, pancreas 1/2 oed, pancreatig, pancreatig, ac oedran pancreatig. 3 i 80 mlynedd, mae nifer yr achosion cronnus o BC yn 72% mewn menywod ag amrywiad pathogenig BRCA1 (PV) a 69% mewn menywod â BRCA2 PV.14
Yn nodedig, mae cyhoeddiad diweddar yn awgrymu bod risg BC yn dibynnu ar y math o PV. Mewn gwirionedd, o gymharu ag amrywiadau cwtogi pathogenig, mae amrywiadau amlwg missense, yn enwedig yn y genyn BRCA1, yn gysylltiedig â llai o risg o BC, yn enwedig mewn menywod hŷn.15
Roedd presenoldeb BRCA1 neu BRCA2 PV yn gysylltiedig â nodweddion biolegol a chlinigopatholegol gwahanol.16,17 BCs sy'n gysylltiedig â BRCA1 yn tueddu i fod yn ymosodol yn glinigol, wedi'u gwahaniaethu'n wael, ac yn amlhau iawn. yn lwmen B ac fel arfer yn digwydd mewn oedolion hŷn.16-18 Yn nodedig, mae mwtaniadau yn BRCA1 a BRCA2 yn cynyddu sensitifrwydd i driniaethau penodol, gan gynnwys halwynau platinwm a chyffuriau wedi'u targedu fel atalyddion polymeras poly(ADP-ribose) (PARPi).19,20
Dros yr ychydig flynyddoedd diwethaf, mae gweithredu dilyniannu cenhedlaeth nesaf (NGS) mewn ymarfer clinigol wedi galluogi nifer cynyddol o gleifion CC i gael profion moleciwlaidd ar gyfer syndromau tueddiad canser, gan gynnwys BRCA1/2.21 Ar yr un pryd, mae diffiniadau yn seiliedig ar feini prawf manwl yn ymwneud â hanes teuluol, demograffig, a nodweddion clinigopatholegol i nodi'n well unigolion sy'n deilwng o brofion sgrinio poblogaeth BRCA1/23, ac mewn cyd-destun penodol BRCA1/2322. amlygu gwahaniaethau ar draws rhanbarthau daearyddol.24–27 Er bod adroddiadau ar y garfan BC yng ngorllewin Sisili, mae llai o ddata ar gael ar sgrinio BRCA1/2 ym mhoblogaeth ddwyreiniol Sisili.28,29
Rydym yn disgrifio yma ganlyniadau sgrinio germline BRCA1/2 mewn cleifion CC o ddwyrain Sisili, gan gydberthyn ymhellach bresenoldeb treigladau BRCA1 neu BRCA2 â phrif nodweddion clinigopatholegol y tiwmorau hyn.
Cynhaliwyd astudiaeth ôl-weithredol yn y “Canolfan Oncoleg a Haematoleg Arbrofol” yn Ysbyty Policlinico. rhoddodd yr holl gyfranogwyr ganiatâd gwybodus ysgrifenedig cyn dadansoddiad moleciwlaidd.
Histological and biological characteristics (ER, PgR, HER2 status, Ki-67, and grade) of BC were assessed on core biopsy or surgical samples, considering only aggressive tumor components.Based on these characteristics, BCs were classified as follows: luminal A (ER+ and/or PgR+, HER2-, Ki-67<20%), luminal B (ER+ and/or PgR+, HER2-, Ki-67≥20%), luminal B-HER2+ (ER and/or PgR+, HER2+), HER2+ (ER and PgR-, HER2+) or triple negative (ER and PgR-, HER2-).
Cyn asesu statws treiglo BRCA1 a BRCA2, cynhaliodd tîm amlddisgyblaethol gan gynnwys oncolegydd, genetegydd, a seicolegydd ymgynghoriad geneteg tiwmor ar gyfer pob claf i bennu presenoldeb BRCA1 a / neu BRCA1.neu unigolion sydd â risg uchel o PV yn y genyn BRCA2. Perfformiwyd detholiad cleifion yn unol â chanllawiau Cymdeithas Oncoleg Feddygol yr Eidal (AIOM) ac argymhellion Sicilian lleol.30,31 Mae'r meini prawf hyn yn cynnwys: (i) hanes teuluol o amrywiadau pathogenig hysbys mewn genynnau tueddiad (ee, BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN);( ii ) gwrywod â BC;(iii) y rhai â BC ac OC;(iv) merched â BC <36 mlynedd, TNBC <60 mlynedd, neu BC dwyochrog <50 mlynedd;(v) hanes meddygol personol o BC <50 mlynedd ac o leiaf un perthynas gradd gyntaf: (a) BC < 50 mlynedd;( b ) OC nad yw'n mucinous ac nad yw'n ffinio o unrhyw oedran;( c ) dwyochrog BC;( ch ) gwrywaidd CC;( d ) canser y pancreas;( dd ) canser y prostad;(vi) dwy neu fwy o hanes personol BC > 50 mlynedd a hanes teuluol o BC, OC, neu ganser y pancreas ar gyfer perthnasau sy'n berthnasau gradd gyntaf i'w gilydd (gan gynnwys perthnasau y mae hi'n berthnasau gradd gyntaf â nhw);(vii) Hanes personol OC ac o leiaf un perthynas gradd gyntaf: (a) CC <50 mlynedd;( b ) NOC;( c ) dwyochrog BC;( ch ) gwrywaidd CC;(vii) benywaidd ag OC difrifol o radd uchel.
Cafwyd sampl gwaed ymylol 20 ml gan bob claf a'i gasglu i mewn i diwbiau EDTA (biowyddorau BD). Roedd DNA Genomig wedi'i ynysu o samplau gwaed cyfan 0.7 ml gan ddefnyddio pecyn ynysu cit DNA MIDI Qiasymphony DSP , Ma, UDA) Perfformio Meintioli.Cyflawnir cyfoethogi targed a pharatoi'r llyfrgell gan Gogydd Assay Assay Research Oncomine™ BRCA, yn barod i'w lwytho i mewn i Becyn Adweithyddion Cogydd Ion AmpliSeq™ DL8 ar gyfer paratoi llyfrgell awtomataidd yn unol â chyfarwyddiadau'r gwneuthurwr. Ychwanegwyd µL o bob sampl DNA gwanedig (10 ng) at blatiau cod-bar ar gyfer paratoi'r llyfrgell a llwythwyd yr holl adweithyddion a nwyddau traul ar yr offeryn Ion Chef™. Yna perfformiwyd paratoi llyfrgell awtomataidd a chronni llyfrgell sampl cod-bar ar offeryn Ion Chef™. Yna aseswyd nifer y llyfrgelloedd a baratowyd gan wneuthurwr Qubit® 3.0 Fluorometer, USA, y gwneuthurwr Fluorometer, Qubit® 3.0 (M.A.) yn unol â chyfarwyddiadau gwneuthurwr Qubit® 3.0 Waltha, USA, Sluorometer. Fel arall, mae llyfrgelloedd yn cael eu cyfuno mewn cymarebau cyfwerth mewn tiwbiau sampl llyfrgell Ion Chef™ (tiwbiau cod bar) a'u llwytho ar offeryn Ion Chef™. Perfformiwyd dilyniannu gan ddefnyddio offeryn Ion Torrent S5 (Thermo Fisher Scientific) (Thermo Fisher Scientific) gan ddefnyddio Sglodion Ion 510 (Thermo Fisher Scientific). Perfformiwyd dadansoddiad data gan Amplitmar Reporter Suite (Thermo Fisher Scientific).
Roedd yr holl enwau amrywiadol yn dilyn canllawiau presennol y Consortiwm Amrywiad Genom Dynol, sydd ar gael ar-lein (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Diffiniwyd arwyddocâd clinigol amrywiadau BRCA1/2 gan ddefnyddio dosbarthiad y Consortiwm Rhyngwladol ENIGMA (Rhwydwaith yn Seiliedig ar Dystiolaeth ar gyfer Dehongli Germline Mutnomen) fel gwahanol ymgynghorwr Germline Mutnomen, a chronfeydd data BRCA1/2 gwahanol fel Alleligens/Germline Mutnomen. CAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD, ac UMD.Mae'r dosbarthiad yn cynnwys pum categori risg penodol: anfalaen (categori I), anfalaen tebygol (categori II), amrywiad o arwyddocâd ansicr (VUS, categori III), pathogenig tebygol (categori IV), a phathogenig (categori V).
Er mwyn pennu arwyddocâd clinigol posibl i bob VUS, defnyddiwyd yr algorithmau rhagfynegi protein cyfrifiannol a ganlyn: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:///genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) ac Align-GVGudhd. ).Ystyriwyd amrywiadau a ddosbarthwyd fel dosbarth 1 a 2 yn fathau gwyllt.
Cadarnhaodd dilyniannu Sanger bresenoldeb pob amrywiad pathogenig. Yn gryno, dyluniwyd pâr o preimio penodol ar gyfer pob amrywiad a ganfuwyd trwy ddefnyddio dilyniannau cyfeirio genynnau BRCA1 a BRCA2 (NG_005905.2, NM_007294.3 a NG_012772.3, NM_000059, dilynwyd Sanger, yn ôl eu trefn, gan ddilyniannu PCR, wedi'i dargedu.
Profwyd cleifion a brofodd yn negyddol am y genyn BRCA1/2 gan ymhelaethiad chwiliedydd amlblecs-ddibynnol (MLPA) yn unol â chyfarwyddiadau'r gwneuthurwr i asesu presenoldeb ad-drefniadau genomig mawr (LGR). amplicons, yn cael eu dadansoddi wedyn gan electrofforesis capilari a gan feddalwedd Cofalyser.Net ar y cyd â'r tablau Cofalyser swp-benodol priodol (www.mrcholland.com).
Roedd newidynnau clinigopatholegol dethol (gradd histolegol a mynegai amlhau Ki-67%) yn gysylltiedig â phresenoldeb BRCA1/2 PV, a gyfrifwyd gan ddefnyddio meddalwedd Prism v. 8.4 gan ddefnyddio union brawf Fisher gan dybio bod gwerth-p <0.05 yn arwyddocaol.
Rhwng Ionawr 2017 a Mawrth 2021, cafodd 455 o gleifion eu sgrinio am dreigladau germline BRCA1/2. Perfformiwyd profion treigladau yng Nghanolfan Oncoleg Arbrofol a Hematoleg Ysbyty Policlinico. dolico of Catania – San Marco” yn gyffredinol, 389 o gleifion Roedd canser y fron, 37 o ganser yr ofari, 16 canser y pancreas, 8 canser y prostad a 5 melanoma.Dangosir dosbarthiad cleifion yn ôl math o ganser a chanlyniadau dadansoddi yn Ffigur 1.
Mae Ffigur 1 yn dangos siart llif sy'n dangos trosolwg o'r astudiaeth. Profwyd cleifion â thiwmorau'r fron, melanoma, pancreatig, y prostad neu'r ofari am fwtaniadau yn y genynnau BRCA1 a BRCA2.
Byrfoddau: PVs, amrywiad pathogenig;VUS, amrywiad o arwyddocâd ansicr;WT, dilyniant BRCA1/2 gwyllt.
Gwnaethom ganolbwyntio'n ddetholus ar garfannau canser y fron. Roedd gan y cleifion oedran canolrifol o 49 oed (ystod 23-89) ac roeddent yn bennaf yn fenywod (n=376, neu 97%).
O'r pynciau hyn, roedd gan 64 (17%) dreigladau BRCA1/2 ac roedden nhw i gyd yn fenywaidd. Roedd gan dri deg pump (9%) PV a 29 (7.5%) wedi cael VUS.Digwyddodd saith ar bymtheg (48.6%) o'r 35 amrywiad pathogenig yn BRCA1 a 18 (51.4%) yn BRCA1 (51.4%) yn BRCA2, tra digwyddodd 51.4% yn BRCA2 (9%) yn BRCA1 (9%) yn. au 1 a 2). Nid oedd LGR yn bresennol yn y dadansoddiad MLPA.
Ffigur 2. Dadansoddiad o dreigladau BRCA1 a BRCA2 mewn 389 o gleifion canser y fron.(A) Dosbarthiad amrywiadau pathogenig (PV) (coch), amrywiadau o arwyddocâd ansicr (VUS) (oren), a WT (glas) mewn 389 o gleifion canser y fron;(B) 389 o gleifion canser y fron Roedd gan dri deg pump (9%) amrywiad pathogenig BRCA1/2 (PVs). Yn eu plith, roedd 17 (48.6%) yn gludwyr PV BRCA1 (coch tywyll) ac roedd 18 (51.4%) yn gludwyr BRCA2 (coch golau);(C) Roedd 29 (7.5%) o 389 o bynciau yn cario VUS, 5 (17.2%) genynnau BRCA1 (oren tywyll) a 24 (82.8%) o enynnau BRCA2 (oren ysgafn).
Byrfoddau: PVs, amrywiad pathogenig;VUS, amrywiad o arwyddocâd ansicr;WT, dilyniant BRCA1/2 gwyllt.
Gwnaethom ymchwilio nesaf i nifer yr achosion o isdeipiau moleciwlaidd BC mewn cleifion â BRCA1/2 PV. Roedd y dosraniad yn cynnwys 2 (5.7%) luminal A, 15 (42.9%) luminal B, 3 (8.6%) luminal B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+ a 13 (37.1%) cleifion luminal B-HER2+, 13 (37.1%) luminal B-HER2+, 13 (37.1%) (claf 37.1-positive) TN. CC, roedd gan 2 (11.8%) glefyd HER2+, a 10 (58.8%) wedi TNBC. Roedd tiwmorau heb dreigladau BRCA1 naill ai'n luminal A neu luminal B-HER2+ (Ffigur 3). Roedd 2 (11.1%) yn luminal A (Ffigur 3). Nid oedd unrhyw diwmorau HER2+ yn bresennol yn y grŵp hwn. Felly, mae mwtaniadau BRCA1 yn gyffredin ymhlith cleifion TNBC, tra bod addasiadau BRCA2 yn bennaf mewn unigolion lumen B.
Ffigur 3 Nifer yr achosion o isdeipiau canser y fron mewn cleifion ag amrywiadau pathogenig yn BRCA1 a BRCA2.Histogramau sy'n dangos dosbarthiad PVs BRCA1- (coch tywyll) a BRCA2- (coch golau) ymhlith isdeipiau moleciwlaidd o gleifion canser y fron.
Byrfoddau: PVs, amrywiad pathogenig;HER2+, derbynnydd ffactor twf epidermaidd dynol 2 positif;TNBC, canser y fron triphlyg-negyddol.
Yn dilyn hynny, fe wnaethom asesu math a lleoleiddio genynnau BRCA1 a BRCA2 PVs.Yn BRCA1 PV, gwelsom 7 amrywiad niwcleotid sengl (SNVs), 6 dileadau, 3 dyblygu ac 1 mewnosodiad.Dim ond un treiglad (c.5522delG) sy'n cynrychioli darganfyddiad newydd. yn cynnwys dileu pum niwcleotid (CTAAT) yn BRCA1 exon 15, gan arwain at amnewid y leucine asid amino gan tyrosine yn codon 1679, ac oherwydd newid ffrâm cyfieithu gyda chodon atal rhagfynegedig arwain at blaendorri protein cynamserol.All newidiadau eraill yn cael eu canfod mewn un achos yn unig. Adroddwyd conPV3s un o'r safle yn un o'r rhanbarth sp sens. >T) (Tabl 1).
O ran BRCA2 PV, gwelsom 6 yn cael eu dileu, 6 SNV a 2 ddyblygiad.Nid oes yr un o'r newidiadau a ganfuwyd yn newydd. Ailadroddodd tri threiglad yn ein poblogaeth, tua 428dup a c.8487+1G>A a arsylwyd mewn 3 phwnc, ac yna c.5851_5854delAGTT. CA2, rhagwelir y bydd yn amgodio protein cwtogi, anweithredol. Mae'r c.8487+1G>A treiglad yn digwydd yn rhanbarth intronic BRCA2 intron 19 (± 1,2) ac yn effeithio ar y dilyniant consensws splicing, gan arwain at splicing wedi'i newid gan arwain at brotein annormal neu absennol. s 5851 i 5854 yn exon codio 10 y genyn BRCA2 ac yn arwain at newid ffrâm trosiadol gyda chodon atal amgen a ragfynegir (p.S1951WfsTer). 7 gyda guanine (G) sy'n cynnwys niwcleotid gan arwain at newid o valine i isoleucine yn codon 211, isoleucine asid Amino yn asid amino gyda briodweddau hynod debyg. Ymhellach, yn y grŵp o BRCA2 PVs, roedd 4 allan o 18 o newidiadau (22.2%) yn gynhenid.
Yna fe fapiwyd treigladau niweidiol BRCA1/2 mewn parthau swyddogaethol a rhanbarthau sy'n rhwymo protein (Ffig. 4). Yn y genyn BRCA1, roedd 50% o PVs wedi'u lleoli yn rhanbarth clwstwr canser y fron (BCCR), tra bod 22% o'r treigladau wedi'u lleoli yn rhanbarth clwstwr canser yr ofari (OCCR) (Ffig. 4A). .8% o'r treigladau wedi'u lleoli yn y OCCR (Ffig. 4B).Nesaf, rydym yn asesu lleoliad PV o fewn y protein BRCA1 a BRCA2 domains.For y protein BRCA1, canfuom dri PVs yn y dolen a parthau coil torchog, a dau treigladau yn y parth BRCT (Ffig. 4A).Ar gyfer y BRCAPVs 3 newidiadau parth, tra bod 4 BRC wedi'u mapio yn ailadrodd, a 4A) Ar gyfer y BRCAPV3 newidiadau parth, a chanfod 4 BRC yn ail-fapio yn y parth expic 3 mapped a 4A. ed yn y parthau rhwymo oligo/oligosaccharid (OB) a thŵr (T) (Ffigur 4B).
Ffigur 4 Cynrychiolaeth sgematig o broteinau BRCA1 a BRCA2 a lleoleiddio amrywiadau pathogenig. Mae'r ffigur hwn yn dangos dosbarthiad amrywiadau pathogenig BRCA1 (A) a BRCA2 (B) mewn cleifion canser y fron. Dangosir treigladau ecsonig mewn glas, tra bod amrywiadau intronic yn cael eu dangos mewn oren. Mae uchder y bar yn cynrychioli nifer yr achosion. dilyniant lleoleiddio niwclear (NLS), parth coil torchog, parth clwstwr SQ/TQ (SCD), a pharth terfynell C BRCA1 (BRCT).(B) Mae'r protein BRCA2 yn cynnwys wyth ailadroddiad BRC, parth sy'n rhwymo DNA gyda pharth helical (Helical), tri oligonucleotide/oligosaccharid-rhwymo a parth C-terminal (OBS) sy'n plygu ar ochr Breastr (OBS). Dangosir Rhanbarth (BCCR) a Rhanbarth Clwstwr Canser yr Ofari (OCCR) ar y gwaelod.* Yn cynrychioli treigladau sy'n pennu codonau stop.
Yna fe wnaethom ymchwilio i nodweddion clinigopatholegol CC a allai fod yn cyfateb i bresenoldeb BRCA1/2 PV. Roedd cofnodion clinigol cyflawn ar gael ar gyfer 181 o gleifion BRCA1/2-negyddol (nad ydynt yn gludwyr) a phob cludwr (n = 35). Roedd cydberthynas rhwng cyfradd amlhau tiwmor a gradd.
Rydym yn cyfrifo dosbarthiad Ki-67 yn seiliedig ar ganolrif ein carfan (25%, ystod <10-90%).Diffiniwyd pynciau gyda Ki-67 < 25% fel “Ki-67 isel″, tra bod unigolion â gwerthoedd ≥ 25% yn cael eu hystyried yn “uchel Ki-67″.Canfuwyd gwahaniaethau arwyddocaol Ki-671ca (PVs-671ca). 5A).
Ffigur 5 Cydberthynas Ki-67 â dosbarthiad gradd mewn menywod canser y fron gyda a heb BRCA1 a BRCA2 PVs.(A) Boxplot yn dangos canolrif gwerthoedd Ki-67 yn 181 cleifion BC nad ydynt yn cario yn erbyn BRCA1 (18) neu BRCA2 (17) PV cleifion.P gwerthoedd isod 0.5(B) eu hystyried yn arwyddocaol o ran cleifion canser yn grwpiau ystadegol gradd BC a'i aseiniad BCG yn cynrychioli ei grwpiau ystadegol arwyddocaol. G3) yn ôl statws treiglo BRCA1 a BRCA2 (pynciau WT, BRCA1 a BRCA2 PVs cludwyr).
Yn yr un modd, archwiliwyd a oedd gradd tiwmor yn cydberthyn â phresenoldeb BRCA1/2 PV. Gan fod G1 CC yn absennol yn ein poblogaeth, rhannwyd y cleifion yn ddau grŵp (G2 neu G3). ).
Mae datblygiadau mewn technoleg dilyniannu DNA wedi galluogi datblygiadau digynsail ym mhrofion genetig BRCA1/2, gyda goblygiadau hollbwysig i gleifion â hanes teuluol o ganser. Roedd 1/2 PV yn amrywio o 8% i 37%, gan ddangos amrywiaeth eang o fewn y wlad.38,39 Gyda phoblogaeth o bron i 5 miliwn, Sisili yw pumed rhanbarth mwyaf yr Eidal o ran nifer y trigolion. Er bod data yn bodoli ar ddosbarthiad BRCA1/2 yng ngorllewin Sisili, nid oes tystiolaeth helaeth yn rhan ddwyreiniol yr ynys.
Ein hastudiaeth yw un o'r adroddiadau cyntaf ar yr achosion o BRCA1/2 PV mewn cleifion CC yn nwyrain Sisili.28 Canolbwyntiwyd ein dadansoddiad ar BC, gan mai hwn yw'r clefyd mwyaf cyffredin o bell ffordd yn ein carfan.
Wrth brofi 389 o gleifion CC, roedd 9% yn cario BRCA1/2 PVs, wedi'u dosbarthu'n gyfartal rhwng BRCA1 a BRCA2. BRCA1/2 PV, felly roeddent yn ymgeiswyr ar gyfer dadansoddiad moleciwlaidd pellach i ddiystyru presenoldeb treigladau llai cyffredin fel PALB2, RAD51C a D, ymhlith eraill.Adalwyd amrywiadau o arwyddocâd ansicr mewn 7% o bynciau lle'r oedd BRCA2 VUS yn amlwg. Mae hyd yn oed y canlyniad hwn yn gyson â thystiolaeth a oedd yn bodoli eisoes.28,41,42
Pan ddadansoddwyd dosbarthiad isdeipiau moleciwlaidd BC mewn menywod mutant BRCA1/2, cadarnhawyd cysylltiadau hysbys rhwng TNBC a BRCA1 PV (58.8%) a rhwng luminal B BC a BRCA2 PV (55.6%).16,43 Mae tiwmorau luminal A a HER2+ yn BRCA1 a BRCA2 PV436 yn gyson â data cludwyr presennol.
Yna rydym yn canolbwyntio ar fath a lleoliad y BRCA1/2 PV.Yn ein carfan, y BRCA1 PV mwyaf cyffredin oedd c.5035_5039delCTAAT.Although Incorvaia et al.heb ddisgrifio'r amrywiad hwn yn eu carfan Sicilian, mae awduron eraill wedi ei adrodd fel llinell germ BRCA1 PV.34 Canfuwyd sawl PV BRCA1 yn ein carfan – ee c.181T>G, c.514del, c.3253dupA a c.5266dupC – sydd wedi'u harsylwi yn Sisili (dau BRCA1). dupC) i'w cael yn gyffredin mewn Iddewon Ashkenazi o Ddwyrain a Chanolbarth Ewrop (Gwlad Pwyl, Tsiec), Slofenia, Awstria, Hwngari, Belarwseg ac Almaeneg ), 44,45 ac, yn yr Unol Daleithiau a'r Ariannin, fe'i diffiniwyd yn ddiweddar fel “amrywiad germline rheolaidd” mewn cleifion Eidalaidd â BC ac OC. orvaia et al.dod o hyd i'r amrywiad c.3253dupA mewn rhai teuluoedd yn Catania.28 Y PVs BRCA2 mwyaf cynrychioliadol yw c.428dup, c.5851_5854delAGTT a'r amrywiad intronic c.8487+1G>A, sydd wedi'i adrodd yn fanylach 28 mewn claf yn Palermoup gyda c.484 PV c.4845 oedd c. s yng ngogledd-orllewin Sisili, yn bennaf yn rhanbarthau Trapani a Palermo, tra bod c.5851_5854delAGTT PV i'w weld mewn cartrefi yng ngogledd-orllewin Sisili.a ddisgrifiwyd yn flaenorol y newid c.5851_5854delAGTT yng Ngholombia.37 Canfuwyd PV BRCA2 arall, tua 631+1G>A, mewn cleifion BC ac OC o Sisili (Agrigento, Siracusa a Ragusa).28 Yn nodedig, gwelsom fod dau amrywiad BRCA2 yn cydfodoli, c.63+1G>A, c.631+ yr un claf (BRCAG28> c.630>-claf) yn cydfodoli. , yr oeddem yn tybio ei fod wedi'i wahanu yn y modd cis, fel yr adroddwyd yn flaenorol fel 'na.34,46 Mae'r treigladau BRCA2 uble hyn yn wir yn cael eu harsylwi'n aml yn rhanbarth yr Eidal a chanfuwyd eu bod yn cyflwyno codonau stopio cynamserol, gan effeithio ar splicing RNA negesydd ac achosi i'r protein BRCA2 fethu.47,48
Fe wnaethom hefyd fapio PVs BRCA1 a BRCA2 mewn rhanbarthau tybiedig OCCR a BCCR o barthau protein a genynnau. Disgrifiwyd y rhanbarthau hyn gan Rebbeck et al.fel meysydd risg ar gyfer datblygu canser yr ofari a chanser y fron, yn y drefn honno.49 Fodd bynnag, mae'r dystiolaeth ynghylch y cysylltiad rhwng lleoliad amrywiadau germline a'r risg o ganser y fron neu ganser yr ofari yn parhau i fod yn ddadleuol.28,50-52 Yn ein poblogaeth, roedd PVs BRCA1 wedi'u lleoli'n bennaf yn rhanbarth BCCR, tra nad oedd PVs BRCA2 wedi'u lleoli'n bennaf rhwng rhanbarthau BCCR, fodd bynnag, nid oedd modd dod o hyd i unrhyw gysylltiad rhwng rhanbarthau PVCR a'n rhanbarth yn bennaf. a nodweddion BC. Gall hyn fod oherwydd y nifer cyfyngedig o gleifion â threigladau BRCA1/2. O safbwynt parth protein, mae PVs BRCA1 yn cael eu dosbarthu ar hyd y protein cyfan, ac mae newidiadau BRCA2 i'w cael yn ffafriol yn y parth ailadrodd BRC.
Yn olaf, cydberthnaswyd nodweddion clinigopatholegol BC gyda BRCA1/2 PV.Oherwydd y nifer cyfyngedig o gleifion a gynhwyswyd, dim ond cydberthynas arwyddocaol rhwng Ki-67 a gradd tiwmor a welsom. , nid yw'r trothwy hwn yn berthnasol i'n poblogaeth cleifion treiglo BRCA1/2, sydd â gwerth Ki-67 canolrif o 25%.Gellir esbonio'r duedd hon mewn cyfraddau Ki-67 uchel gan nifer yr achosion yn ein carfannau luminal B a TNBC, ac ychydig o diwmorau luminal A oedd yn bresennol. Fodd bynnag, ymddengys bod rhywfaint o dystiolaeth yn awgrymu y gallai toriad Ki-673% uwch (25% i 673% yn well) yn ôl y toriad Ki-673% uwch (25 i 673% yn well). ein dadansoddiad, nid yw cydberthynas sylweddol yn surprise.Occurs rhwng uchel Ki-67 a graddau a phresenoldeb BRCA1 PV.Yn wir, tiwmorau sy'n gysylltiedig â BRCA1 yn nodweddiadol o TNBC ac yn arddangos nodweddion mwy ymosodol.16,17
I gloi, mae'r astudiaeth hon yn darparu adroddiad ar statws treiglo BRCA1/2 mewn carfan BC o ddwyrain Sicily.Yn gyffredinol, mae ein canfyddiadau'n gyson â thystiolaeth sy'n bodoli eisoes, o ran mynychder treiglo a nodweddion clinigopatholegol yn BC.More astudiaethau mewn poblogaethau mwy o BRCA1/2-mutant BC cleifion, megis defnyddio dadansoddiadau amlgenaidd llai aml-genyn yn cael eu hasesu yn fwy na phresenoldeb amlgenomau gwahanol. CA1/2.Bydd hyn yn caniatáu adnabod a rheoli'n briodol y nifer cynyddol o bynciau sydd mewn mwy o berygl o gael canser oherwydd treigladau genetig.
Gwnaethom gadarnhau bod cleifion yn llofnodi caniatâd gwybodus i ryddhau eu samplau tiwmor yn ddienw at ddibenion ymchwil. Roedd pob claf wedi llofnodi caniatâd gwybodus ysgrifenedig yn unol â Datganiad Helsinki.Yn ôl polisi AOU Policlinico “G.Rodolico – S.Marco”, eithriwyd yr astudiaeth hon rhag adolygiad moesegol oherwydd bod dadansoddiad BRCA1/2 wedi'i berfformio yn unol ag arfer clinigol a rhoddodd yr holl gleifion gydsyniad gwybodus ysgrifenedig i'r defnydd o ddata hefyd.
Diolchwn i'r Athro Paolo Vigneri am ei gymorth i ofalu am gleifion canser y fron yn unol â chais y Pwyllgor Moeseg.
Mae Federica Martorana yn adrodd honoraria gan Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. Nid yw'r awduron eraill yn datgan unrhyw wrthdaro buddiannau yn y gwaith hwn.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al.Global Cancer Statistics 2020: Mae GLOBOCAN yn amcangyfrif nifer yr achosion a marwolaethau o 36 o ganserau mewn 185 o wledydd ledled y byd.CA Canser J Clin.2021;71(3):209-249.doi: 106.21ac


Amser post: Ebrill-15-2022