BRCA1 / BRCA2 geenide mutatsioonianalüüs rinnavähi korral

Javascript on praegu teie brauseris keelatud. Mõned selle veebisaidi funktsioonid ei tööta, kui JavaScript on keelatud.
Registreeruge oma konkreetsete andmete ja konkreetse huvipakkuva ravimiga ning me ühendame teie esitatud teabe meie ulatuslikus andmebaasis olevate artiklitega ja saadame teile viivitamatult PDF-koopia.
Näitajad Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6, 7, Catellalini ülikooli meditsiiniosakond ja Catellalini ülikooli meditsiiniosakond, 7, Livia21 Manz , 95123, Itaalia;2 Eksperimentaalse onkoloogia ja hematoloogia keskus, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Itaalia;3 Meditsiiniline onkoloogia, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Itaalia;4 Medical Genetics, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Itaalia;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Itaalia;6 Catania ülikooli biomeditsiini ja biotehnoloogia teaduste osakond, meditsiinigeneetika, Catania, Itaalia, 95123;7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Itaalia Side: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, e-post [email protected];[email protected] Eesmärk: BRCA1 ja BRCA2 idutee mutatsioonid ning väljakujunenud rinnavähk (BC), munasarjavähk (OC) ja muu, mis on seotud eluaegse vähiriskiga. BRCA geeni testimine on võtmetähtsusega individuaalse riski hindamisel, samuti ennetusmeetodite leidmisel tervetel kandjatel ja ravi kohandamisel vähihaigetele. BRCABR-i levimus on laias piirkonnas ja erinevates piirkondades ja variatsioonides. patogeensed variandid Sitsiilia perekondades, puuduvad spetsiifiliselt Ida-Sitsiilia populatsioonidele suunatud uuringud. Meie uuringu eesmärk oli uurida BRCA patogeensete idutee muutuste esinemissagedust ja jaotumist Ida-Sitsiiliast pärit BC-patsientide rühmas ning hinnata nende seost spetsiifiliste BC tunnustega, kasutades järgmise põlvkonna kasvajate järjestusi. %) oli BRCA patogeenne variant, 17 (49%) BRCA1 ja 18 (51%) BRCA2 puhul. BRCA1 muutused on levinud kolmiknegatiivsete BC patsientide puhul, samas kui BRCA2 mutatsioonid on sagedasemad luminaalse BC patsientidel. Võrreldes mittekandjatega, pakuvad meie kasvaja proliferatsiooniindeksiga katsealused oluliselt kõrgema astme BRCA1 variante. rahvuslikku staatust Ida-Sitsiiliast pärit BC-patsientidel ja kinnitavad NGS-analüüsi rolli päriliku BC-ga patsientide tuvastamisel. Üldiselt on need andmed kooskõlas varasemate tõenditega, mis toetavad BRCA-sõeluuringut vähi õigeks ennetamiseks ja raviks mutatsioonikandjate puhul.
Rinnavähk (BC) on maailmas kõige levinum pahaloomuline kasvaja ja kõige surmavam vähk naistel.1 Bioloogilised tunnused, mis määravad BC prognoosi ja kliinilise käitumise, on põhjalikult uuritud ja aja jooksul osaliselt välja selgitatud. Praegu kasutatakse BC klassifitseerimiseks erinevatesse molekulaarsetesse alatüüpidesse mitmeid surrogaatmarkereid. Need on östrogeeni (ER) ja/või progesterooni retseptori 2 proliferatsioonifaktori (PHER) retseptori kasvu faktor (P on) -67 ja kasvaja aste (G).2 Nende muutujate kombinatsioon tuvastas järgmised BC kategooriad: 1) Luminal kasvajad, millel oli ER ja/või PgR ekspressioon, moodustasid 75% BC-dest. Need kasvajad jaotati veel luminaalseks A-ks, kui Ki-67 oli alla 20% ja HER2 negatiivne ning Luminal B oli võrdne 0-ga, kui Ki-6 amplit on võrdne 0 ja üle7. leviku indeks;2) HER2+ kasvajad, mis on ER- ja PgR-negatiivsed, kuid näitavad HER2 amplifikatsiooni. See rühm moodustab 10% kõigist rinnakasvajatest;3) Kolmiknegatiivne rinnavähk (TNBC), mis ei näita ER ja PgR ekspressiooni ega HER2 amplifikatsiooni, moodustab umbes 15% rinnavähkidest.2-4
Nende BC alatüüpide hulgas esindavad kasvaja aste ja proliferatsiooniindeks ristlõike biomarkereid, mis on otseselt ja sõltumatult seotud kasvaja agressiivsuse ja prognoosiga.5,6
Lisaks eelnimetatud bioloogilistele tunnustele on viimastel aastatel üha olulisemaks muutunud pärilike geneetiliste muutuste roll, mis viivad BC väljakujunemiseni.7 Umbes üks kümnest rinnakasvajast pärineb spetsiifiliste geenide idutee muutuste tõttu.8 Kaks suurt epidemioloogilist uuringut, milles osales enam kui 180 000 naist, on hiljuti tuvastanud ACAARD geeni, TM1BR. CHK2, PALB2, RAD51C ja RAD51D), mis vastutavad peamiselt päriliku BC eest. Nendest geenidest näitasid BRCA1 ja BRCA2 (edaspidi BRCA1/2) tugevaimat korrelatsiooni rinnanäärme kasvajate tekkega. pankrease, kolorektaalne ja melanoom. Vanuses 13 kuni 80 aastat on BC kumulatiivne esinemissagedus 72% naistel, kellel on BRCA1 patogeenne variant (PV) ja 69% naistel, kellel on BRCA2 PV.14
Eelkõige viitab hiljutine väljaanne, et BC risk sõltub PV tüübist. Võrreldes patogeensete kärbivate variantidega, on silmatorkavad missense variandid, eriti BRCA1 geenis, seotud BC riski vähenemisega, eriti vanematel naistel.15
BRCA1 või BRCA2 PV esinemist seostati erinevate bioloogiliste ja kliiniliste patoloogiliste tunnustega.16,17 BRCA1-ga seotud BC-d kipuvad olema kliiniliselt agressiivsed, halvasti diferentseeruvad ja väga proliferatiivsed. Need kasvajad on tavaliselt kolm korda negatiivsed ja algavad mõõdukas vanuses patsientidel. Kasvajad, mis esinevad BRCA2-tüüpi hästi prolifereeruva ja varieeruva astmega, hästi diferentseerunud astmega patsientidel. ces.Need kasvajad on sagedasemad luumenis B ja esinevad tavaliselt vanematel täiskasvanutel.16-18 Nimelt suurendavad BRCA1 ja BRCA2 mutatsioonid tundlikkust spetsiifiliste ravimeetodite, sealhulgas plaatinasoolade ja sihtravimite, nagu polü(ADP-riboosi) polümeraasi inhibiitorite (PARPi) suhtes.19,20
Viimase paari aasta jooksul on järgmise põlvkonna sekveneerimise (NGS) rakendamine kliinilises praktikas võimaldanud üha suuremal arvul BC-patsientidel läbida vähitundlikkuse sündroomide, sealhulgas BRCA1/2.21 molekulaarsed testid. Samal ajal on perekonna ajaloo, demograafiliste ja kliiniliste patoloogiliste tunnuste täpsetel kriteeriumidel põhinevad määratlused väärt üksikisikute identifitseerimiseks2. BRCA1/2 sõeluuringu põhjal teatud populatsioonides, tuues esile erinevused geograafiliste piirkondade lõikes.24–27 Kuigi Lääne-Sitsiilia BC kohordi kohta on teateid, on BRCA1/2 sõeluuringu kohta Sitsiilia idaosas vähem andmeid.28,29
Kirjeldame siin idutee BRCA1 / 2 sõeluuringu tulemusi Ida-Sitsiiliast pärit BC patsientidel, korreleerides veelgi BRCA1 või BRCA2 mutatsioonide olemasolu nende kasvajate peamiste kliiniliste patoloogiliste tunnustega.
Retrospektiivne uuring viidi läbi Policlinico haigla „Eksperimentaalse onkoloogia ja hematoloogia keskuses. Rodolico – San Marco in Catania. Jaanuarist 2017 kuni märtsini 2021 suunati kokku 455 rinna- ja munasarjavähi, melanoomi, pankrease või eesnäärmevähiga patsienti. Selle uuringu geenidiagnostika CA/2 kohaselt suunati meie molekulaarse BR-i uuringusse. Helsingi selgitus ja kõik osalejad andsid enne molekulaaranalüüsi kirjaliku teadliku nõusoleku.
BC histoloogilisi ja bioloogilisi omadusi (ER, PgR, HER2 staatus, Ki-67 ja aste) hinnati tuumbiopsia või kirurgiliste proovide põhjal, võttes arvesse ainult agressiivseid kasvaja komponente. Nende tunnuste alusel klassifitseeriti BC-d järgmiselt: luminaalne A (ER+ ja/või PgR+, HER2-, B++ER,7/HER20%) ja HER20%), Ki-6/7. Ki-67≥20%), luminaalne B-HER2+ (ER ja/või PgR+, HER2+), HER2+ (ER ja PgR-, HER2+) või kolmiknegatiivne (ER ja PgR-, HER2-).
Enne BRCA1 ja BRCA2 mutatsiooni staatuse hindamist viis multidistsiplinaarne meeskond, kuhu kuulusid onkoloog, geneetik ja psühholoog, iga patsiendi jaoks kasvajageneetika konsultatsiooni, et teha kindlaks BRCA1 ja/või BRCA1 olemasolu.või isikud, kellel on BRCA2 geenis kõrge PV risk.Patsientide valik viidi läbi vastavalt Itaalia Meditsiinilise Onkoloogia Seltsi (AIOM) juhistele ja kohalikele Sitsiilia soovitustele.30,31 Need kriteeriumid hõlmavad järgmist: (i) tundlikkuse geenide teadaolevate patogeensete variantide perekonna ajalugu (nt BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN);(ii) BC-ga isased;(iii) need, kellel on BC ja OC;(iv) naised, kellel on BC <36 aastat, TNBC <60 aastat või kahepoolne BC <50 aastat;(v) isiklik haiguslugu eKr <50 aastat ja vähemalt üks esimese astme sugulane: a) eKr < 50 aastat;b) mis tahes vanuses mitte-limaskestlik ja piiriülene OC;c) kahepoolne BC;(d) isane BC;(e) kõhunäärmevähk;(f) eesnäärmevähk;(vi) kaks või enam eKr > 50 aastat ja BC, OC või kõhunäärmevähi perekonna ajalugu sugulastel, kes on üksteise esimese astme sugulased (sealhulgas sugulased, kellega ta on esimese astme sugulased);vii) organiseeritud kuritegevuse ja vähemalt ühe esimese astme sugulase isiklik ajalugu: (a) eKr <50 aastat;(b) NOC;c) kahepoolne BC;(d) isane BC;vii) kõrge astme seroosse OC-ga emane.
Igalt patsiendilt võeti 20 ml perifeerse vere proov ja koguti EDTA tuubidesse (BD Biosciences). Genoomne DNA eraldati 0,7 ml täisvereproovidest, kasutades QIAsymphony DSP DNA Midi komplekti isolatsioonikomplekti (QIAGEN, Hilden, Itaalia) vastavalt tootja juhistele ja lasti läbi Qubitlumo®, SWalometer. Tehke kvantifitseerimine.Sihtmärgi rikastamise ja raamatukogu ettevalmistamise viib läbi Oncomine™ BRCA Research Assay Chef, mis on valmis laadimiseks Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 komplekti, et teha automaatne raamatukogu ettevalmistamine vastavalt tootja juhistele. Komplekt koosneb kahest multiplekssest PCR praimerite kogumist, mida saab kasutada kõigi BRCA1 (NM_0.00)N3BRCA1 (NM_0.00)N3BRCA1 (NM_0.00)5M geenide uurimiseks. s. Lühidalt, 15 µl iga lahjendatud proovi DNA-st (10 ng) lisati vöötkoodiga plaatidele raamatukogu ettevalmistamiseks ning kõik reaktiivid ja kulumaterjalid laaditi Ion Chef™ instrumendile. Seejärel teostati Ion Chef™ instrumendiga automaatne raamatukogu ettevalmistamine ja vöötkoodiga prooviraamatukogude ühendamine. Seejärel hinnati ettevalmistatud Fisher®- või 30-bitise mõõturiga raamatukogude arv. Waltham, MA, USA) vastavalt tootja juhistele. Lõpuks ühendatakse raamatukogud ekvimolaarsetes suhetes Ion Chef™ raamatukogu prooviklaasides (triipkoodiga torud) ja laaditakse Ion Chef™ instrumendile. Sekveneerimine viidi läbi, kasutades Ion Torrent S5 (Thermo Scientific Scientific) instrumenti (Thermo FisherDaponific (Thermo FisherDaponific)1, kasutades Fisher Scientific (Thermo Fisher Scientific)1 analüüsi. Amplicon Suite (SmartSeq srl) ja tarkvara Ion Reporter.
Kõik variantide nomenklatuur järgis Human Genome Variation Consortiumi kehtivaid juhiseid, mis on saadaval veebis (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). BRCA1/2 variantide kliiniline tähtsus määrati kindlaks rahvusvahelise konsortsiumi ENIGMA (Evidence-Based Network for Interpreting Germline, Inc./Consort:UP/Consortiumingig.orgmas) klassifikatsiooni alusel. , BRCAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD ja UMD. Klassifikatsioon sisaldab viit erinevat riskikategooriat: healoomuline (I kategooria), tõenäoliselt healoomuline (II kategooria), ebakindla tähtsusega variant (VUS, III kategooria), tõenäoline patogeenne (IV kategooria) ja patogeenne (analüüsib andmebaasi valgu struktuuri 0-struktuur ja V kategooria valgu struktuurimuutuse tööriist, 0 kategooria). .32
Võimaliku kliinilise tähtsuse määramiseks igale VUS-ile kasutati järgmisi arvutuslikke valgu prognoosimise algoritme: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu/pph2//) ja Agvutagh.g.g. d_input.php).Klassi 1 ja 2 klassifitseeritud variandid loeti metsiktüübiks.
Sangeri sekveneerimine kinnitas iga patogeense variandi olemasolu. Lühidalt, iga tuvastatud variandi jaoks kavandati paar spetsiifilisi praimereid, kasutades geeni BRCA1 ja BRCA2 võrdlusjärjestusi (NG_005905.2, NM_007294.3 ja NG_012772.3, NM_012772.3, NM_000005 järjestus, millele järgnes NM_300059 järjestus). .
Patsiente, kelle test oli BRCA1/2 geeni suhtes negatiivne, testiti vastavalt tootja juhistele mitmekordse ligeerimisest sõltuva sondi amplifikatsiooni (MLPA) abil, et hinnata suurte genoomsete ümberkorralduste (LGR) esinemist. Lühidalt öeldes denatureeritakse DNA proovid ja kasutatakse kuni 60 BRCA1 ja BRCA2 geenispetsiifilist toodet, mis on proamplifikatsioonispetsiifilise DNA järjestuse kindlaksmääramisel. , mis koosnesid ainulaadsest PCR amplikonide komplektist, analüüsiti seejärel kapillaarelektroforeesi ja Cofalyser.Net tarkvaraga koos sobivate partiipõhiste Cofalyseri tabelitega (www.mrcholland.com).
Valitud kliinilisi patoloogilisi muutujaid (histoloogiline aste ja Ki-67% proliferatsiooniindeks) seostati BRCA1/2 PV olemasoluga, mis arvutati tarkvara Prism v. 8.4 abil, kasutades Fisheri täpset testi, eeldades, et p-väärtus <0,05 on oluline.
Ajavahemikus 2017. aasta jaanuarist kuni 2021. aasta märtsini skriiniti 455 patsienti idutee BRCA1/2 mutatsioonide suhtes. Mutatsioonitestid viidi läbi Policlinico haigla eksperimentaalse onkoloogia ja hematoloogia keskuses. Vastavalt Sitsiilia juhistele (http://www.gurs.regione.1ndicepenerm,1ì-Vìener1.0it. o 2020), Catania Rodolico – San Marco” kokku 389 patsienti. Esineb rinnavähki, 37 munasarjavähki, 16 kõhunäärmevähki, 8 eesnäärmevähki ja 5 melanoomi.Patsientide jaotus vähi tüübi ja analüüsitulemuste järgi on näidatud joonisel 1.
Joonisel 1 on kujutatud vooskeemi, mis näitab uuringu ülevaadet. Rinna-, melanoomi-, pankrease-, eesnäärme- või munasarjakasvajatega patsiente testiti geenide BRCA1 ja BRCA2 mutatsioonide suhtes.
Lühendid: PV, patogeenne variant;VUS, ebakindla tähendusega variant;WT, metsiktüüpi BRCA1/2 järjestus.
Keskendusime oma uuringutes valikuliselt rinnavähi kohortidele. Patsientide keskmine vanus oli 49 aastat (vahemikus 23–89) ja nad olid valdavalt naised (n=376 ehk 97%).
Nendest katsealustest 64 (17%) olid BRCA1/2 mutatsiooniga ja kõik olid naised.Kolmekümne viiel (9%) oli PV ja 29 (7,5%) VUS. Seitseteist (48,6%) 35 patogeensest variandist esines BRCA1-s ja 18 (51,4%) BRCA2-s ja 18 (51,4%) BRCA2-s, samas kui 18 (51,4%) esines BRCA2-s ja 18-l (2%) (28%). BRCA2 (joonised 1 ja 2). LGR-i MLPA analüüsis ei esinenud.
Joonis 2. BRCA1 ja BRCA2 mutatsioonide analüüs 389 rinnavähiga patsiendil.(A) Patogeensete variantide (PV) (punane), ebakindla tähtsusega variantide (VUS) (oranž) ja WT (sinine) jaotus 389 rinnavähiga patsiendil;(B) 389 rinnavähiga patsiendil 35 (9%) olid BRCA1/2 patogeensed variandid (PV-d). Nende hulgas oli 17 (48,6%) BRCA1 PV kandjat (tumepunane) ja 18 (51,4%) BRCA2 kandjat (helepunane);(C) 389 katsealusest 29 (7,5%) kandis VUS-i, 5 (17,2%) BRCA1 geeni (tumeoranž) ja 24 (82,8%) BRCA2 geeni (heleoranž).
Lühendid: PV, patogeenne variant;VUS, ebakindla tähendusega variant;WT, metsiktüüpi BRCA1/2 järjestus.
Järgmisena uurisime BC molekulaarsete alatüüpide esinemissagedust BRCA1/2 PV-ga patsientidel. Jaotus hõlmas 2 (5,7%) luminaalset A-d, 15 (42,9%) luminaalset B-d, 3 (8,6%) luminaalset B-HER2+, 2 (5,7%) HER2+ patsienti ja 13 (5,7%) HER2+ patsienti ja 13 (37,1%) TNBC2,1,1% positiivset NBC2,1,5 m2 patsienti. oli luminaalne B BC, 2 (11,8%) HER2+ haigus ja 10 (58,8%) TNBC. Ilma BRCA1 mutatsioonideta kasvajad olid kas luminaalne A või luminaalne B-HER2+ (joonis 3). BRCA2-positiivses alarühmas oli 10 (55,6%) B kasvajat . 6,7%) TNBC ja 2 (11,1%) olid luminaalne A (joonis 3). Selles rühmas HER2+ kasvajaid ei esinenud. Seega on BRCA1 mutatsioonid TNBC patsientidel levinud, samas kui BRCA2 muutused on ülekaalus valendiku B indiviididel.
Joonis 3 Rinnavähi alatüüpide levimus BRCA1 ja BRCA2 patogeensete variantidega patsientidel. Histogrammid, mis näitavad BRCA1- (tumepunane) ja BRCA2- (helepunane) PV-de jaotumist rinnavähiga patsientide molekulaarsete alatüüpide vahel. Igas kastis esitatud numbrid näitavad BRCA1- ja BRCA2-alatüübi PV-ga patsientide protsenti.
Lühendid: PV, patogeenne variant;HER2+, inimese epidermaalse kasvufaktori retseptor 2 positiivne;TNBC, kolmiknegatiivne rinnavähk.
Seejärel hindasime BRCA1 ja BRCA2 PV tüüpi ja geenide lokalisatsiooni. BRCA1 PV puhul täheldasime 7 ühe nukleotiidi varianti (SNV), 6 deletsiooni, 3 dubleerimist ja 1 insertsiooni. Ainult üks mutatsioon (c.5522delG) esindab uut avastust.Kõige levinum cTA5C5 PV tuvastati 9CA1-s30del. .See muutus hõlmab viie nukleotiidi (CTAAT) deletsiooni BRCA1 eksonis 15, mille tulemuseks on aminohappe leutsiini asendamine türosiiniga koodonis 1679 ja translatsioonikaadri nihke tõttu prognoositud alternatiivse stoppkoodoniga põhjustab valgu enneaegse kärpimise. Kõik muud PV muutused ei tuvastatud ilmselt ainult ühes kohas. piirkond (c.4357+1G>T) (tabel 1).
Seoses BRCA2 PV-ga täheldasime 6 deletsiooni, 6 SNV-d ja 2 dubleerimist. Ükski leitud muutustest ei ole uudne. Meie populatsioonis kordus kolm mutatsiooni, c.428dup ja c.8487+1G>A, mida täheldati 3 katsealusel, millele järgnes c.5851_5854del c.5854del kahel AGTT-l korduval juhul. 5 BRCA2, mis kodeerib eeldatavasti kärbitud mittefunktsionaalset valku. Mutatsioon c.8487+1G>A toimub BRCA2 introni 19 intronipiirkonnas (± 1,2) ja see mõjutab splaissimise konsensusjärjestust, mille tulemuseks on splaissimise muutumine, mille tulemuseks on c. BRCA2 geeni kodeeriva eksoni 10. nukleotiidide positsioonidelt 5851 kuni 5854 tehtud 4-nukleotiidilise deletsiooni tõttu ja tulemuseks on translatsiooniline kaadrinihe prognoositud alternatiivse stoppkoodoniga (p.S1951WfsTer). Nagu varem teatatud, tuvastati patsiendil nii muutused c.631A>08 kui ka c.631A>08. ioon hõlmab adenosiini (A) asendamist BRCA2 eksonis 7 guaniini (G) sisaldava nukleotiidiga, mille tulemuseks on valiin muutumine isoleutsiiniks koodonis 211, isoleutsiin Aminohape on väga sarnaste omadustega aminohape. See muutus mõjutab normaalset mRNA splaissimist. Teine variant paikneb enne geeni A-slamistumise (introonilise piirkonna A1) ja thynnatsiooniga. BRCA2. Muutus c.7008-2A>T võib genereerida mitu erineva pikkusega transkripti. Peale selle olid BRCA2 PV-de rühmas 4 muudatust 18-st (22,2%) sisemised.
Seejärel kaardistasime BRCA1/2 kahjulikud mutatsioonid funktsionaalsetes domeenides ja valku siduvates piirkondades (joonis 4). BRCA1 geenis paiknes 50% PV-dest rinnavähi klastri piirkonnas (BCCR), samas kui 22% mutatsioonidest paiknes munasarjavähi klastri piirkonnas (OCCR) (joonis 4CR 5 PV 7, 7% PVCR5 piirkonnas). ja 42,8% mutatsioonidest paiknesid OCCR-is (joonis 4B). Järgmisena hindasime PV asukohta BRCA1 ja BRCA2 valgu domeenides. BRCA1 valgu puhul leidsime kolm PV-d silmus- ja mähispooli domeenides ning kaks PV-d BRCT-domeenis, PV kordusdomeenis BRC2-domeenis (joonis 4-4BRC2s). oligo/oligosahhariidi siduvates (OB) ja tornis (T) domeenides tuvastati sisemised ja 3 eksoonilist muutust (joonis 4B).
Joonis 4 BRCA1 ja BRCA2 valkude skemaatiline esitus ja patogeensete variantide lokaliseerimine. Sellel joonisel on näidatud BRCA1 (A) ja BRCA2 (B) patogeensete variantide jaotus rinnavähiga patsientidel. Eksoonilised mutatsioonid on näidatud sinisega, samas kui intronilised variandid on näidatud oranžiga. Tulba kõrgus näitab nende funktsionaalsete valkude ja valkude arvu. sisaldab silmusdomeeni (RING) ja tuuma lokaliseerimisjärjestust (NLS), coiled-coil domeeni, SQ/TQ klastri domeeni (SCD) ja BRCA1 C-terminaalset domeeni (BRCT).(B) BRCA2 valk sisaldab kaheksat BRC kordust, DNA-d siduvat domeeni koos spiraalse domeeniga (Helical), kolme oligonukleotiid-/oligonukleotiid-/oligonukleotiidi LS-iga (aOB-toide) C poolel.Pirad, mida nimetatakse rinnavähi klastri piirkonnaks (BCCR) ja munasarjavähi klastri piirkonnaks (OCCR), on näidatud allosas.*Esitab mutatsioone, mis määravad stoppkoodonid.
Seejärel uurisime BC kliinilisi patoloogilisi tunnuseid, mis võivad korreleeruda BRCA1/2 PV esinemisega. Täielikud kliinilised andmed olid saadaval 181 BRCA1/2-negatiivse patsiendi (mittekandjad) ja kõigi kandjate (n = 35) kohta. Kasvaja proliferatsiooni määra ja astme vahel oli korrelatsioon.
Arvutasime Ki-67 jaotuse meie kohordi mediaani põhjal (25%, vahemik <10–90%). Isikud, kelle Ki-67 oli < 25%, määratleti kui "madal Ki-67", samas kui isikud, kelle väärtus oli ≥ 25%, loeti "kõrgeks Ki-67". Märkimisväärsed Ki-67-i kandjate (CA-1p) erinevused leiti <6070-1 BR-i kandjate vahel. (joonis 5A).
Joonis 5 Ki-67 korrelatsioon astme jaotusega rinnavähiga naistel, kellel on BRCA1 ja BRCA2 PV-d ja ilma nendeta.(A) Boxplot näitab Ki-67 mediaanväärtusi 181 mittekandjaga BC-patsiendil versus BRCA1 (18) või BRCA2 (17) PV-patsiendiga. Tema vähi väärtusi loeti statistiliselt oluliseks alla 0,5 B. bioloogilise astme rühmad (G2 ja G3) vastavalt BRCA1 ja BRCA2 mutatsiooni staatusele (WT subjektid, BRCA1 ja BRCA2 PV-de kandjad).
Samuti uurisime, kas kasvaja aste korreleerus BRCA1/2 PV esinemisega. Kuna meie populatsioonis G1 BC puudus, jagasime patsiendid kahte rühma (G2 või G3). Kooskõlas Ki-67 tulemustega näitas analüüs statistiliselt olulist korrelatsiooni kasvaja astme ja BRCA1 mutatsiooni vahel, võrreldes G3 mittekandjate suurema osakaaluga (BRCA1-kasvajate hulgas. 5B).
DNA sekveneerimistehnoloogia edusammud on võimaldanud enneolematuid edusamme BRCA1/2 geneetilises testimises, millel on otsustav mõju patsientidele, kelle perekonnas on esinenud vähktõbe. Praeguseks on Ameerika Meditsiinigeneetika Ühingu 35 ja ENIGMA süsteemi järgi tuvastatud ja klassifitseeritud ligikaudu 20 000 BRCA1/2 varianti. graafilised piirkonnad.37 Itaalias jäi BRCA1/2 PV-de määr vahemikku 8% kuni 37%, mis näitab suurt riigisisest varieeruvust.38,39 Peaaegu 5 miljoni elanikuga Sitsiilia on elanike arvult Itaalia suuruselt viies piirkond. Ehkki BRCA1/2 leviku kohta on olemas andmeid, pole Sii idaosas saarel ulatuslikke tõendeid.
Meie uuring on üks esimesi aruandeid BRCA1/2 PV esinemissageduse kohta BC patsientidel Ida-Sitsiilias.28 Keskendusime oma analüüsis BC-le, kuna see on meie rühmas kõige levinum haigus.
Kui testiti 389 eKr patsienti, oli 9% BRCA1/2 PV-d, mis olid ühtlaselt jaotunud BRCA1 ja BRCA2 vahel. Need tulemused on kooskõlas Itaalia populatsioonis varem teatatud tulemustega.28 Huvitaval kombel olid 3% (13/389) meie kohordist mehed. See määr on kõrgem, kui eeldati meeste rinnavähi riskide puhul (140 kõigist populatsioonidest, mis põhinevad mutatsioonidel põhinevad rinnavähi riskid) (140 kõigist populatsioonidest 140 CA). Siiski ei arenenud ühelgi neist meestest BRCA1/2 PV, mistõttu nad olid kandidaadid edasiseks molekulaaranalüüsiks, et välistada muu hulgas vähem levinud mutatsioonide, nagu PALB2, RAD51C ja D, olemasolu. Ebakindla tähtsusega variandid leiti 7% katsealustest, kelle puhul BRCA2 VUS ilmnes. Isegi see tulemus on kooskõlas22,4 eelnev tõend41.
Kui analüüsisime BC molekulaarsete alatüüpide jaotust BRCA1/2 mutantsete naiste seas, kinnitasime teadaolevaid seoseid TNBC ja BRCA1 PV vahel (58,8%) ning luminaalse B BC ja BRCA2 PV vahel (55,6%).16,43 Luminaalsed A ja HER2+ kasvajad BRCA1 ja BRCA1 ja HER2+ kasvajate puhul on kooskõlas3 kirjanduse andmetega BRCA2,4 PV kandjatega.
Seejärel keskendume BRCA1/2 PV tüübile ja asukohale. Meie kohordis oli kõige levinum BRCA1 PV c.5035_5039delCTAAT. Kuigi Incorvaia et al.ei kirjeldanud seda varianti oma Sitsiilia kohordis, teised autorid on teatanud, et see on idutee BRCA1 PV.34 Meie kohordist leiti mitu BRCA1 PV-d – nt c.181T>G, c.514del, c.3253dupA ja c.5266dupC –, mida on täheldatud Sitsiilias leitud mutatsioonidest c.181T>G. .5266dupC) on tavaliselt leitud Ida- ja Kesk-Euroopa (Poola, Tšehhi), Sloveenia, Austria, Ungari, Valgevene ja Saksamaa Ashkenazi juutidel 44,45 ning Ameerika Ühendriikides ja Argentinas määratleti see hiljuti kui „korduvat idutee varianti” Itaalia patsientidel, kellel oli BC ja OC. ina.Huvitaval kombel isegi Incorvaia jt.leidis Catania mõnes perekonnas variandi c.3253dupA.28 Kõige tüüpilisemad BRCA2 PV-d on c.428dup, c.5851_5854delAGTT ja introniline variant c.8487+1G>A, mida on üksikasjalikumalt kirjeldatud 28 Palermos leibkonna patsiendil, kelle leibkonnas on c.4258dup1AG, c.4258dup1AG oli Lääne-Sitsiilias, peamiselt Trapani ja Palermo piirkonnas, samas kui Sitsiilia loodeosas leiti leibkondades ca.5851_5854delAGTT PV. Variant 8487+1G>A oli levinum Messina, Palermo ja Caltanissetta katsealustel.28 Rebbeck et al.varem kirjeldas c.5851_5854delAGTT muutust Colombias.37 Veel üks BRCA2 PV, c.631+1G>A, on leitud Sitsiiliast pärit BC ja OC patsientidel (Agrigento, Siracusa ja Ragusa).28 Märkimisväärselt täheldasime kahe BRCAG22 variandi kooseksisteerimist: c. sama patsient, keda eeldasime olevat eraldatud cis-režiimis, nagu varem niimoodi kirjeldatud.34,46 Neid BRCA2 uble-mutatsioone täheldatakse Itaalia piirkonnas tõepoolest sageli ja on leitud, et need toovad sisse enneaegseid stoppkoodoneid, mõjutades RNA signaale splaissimist ja põhjustades BRCA2 valgu ebaõnnestumist.47,48
Samuti kaardistasime BRCA1 ja BRCA2 PV-d valgu domeenide ja geenide oletatavates OCCR ja BCCR piirkondades. Neid piirkondi kirjeldasid Rebbeck et al.riskipiirkondadena vastavalt munasarja- ja rinnavähi tekkeks.49 Siiski on tõendid seoste kohta idutee variantide paiknemise ja rinna- või munasarjavähi riski vahel endiselt vastuolulised.28,50-52 Meie populatsioonis paiknesid BRCA1 PV-d valdavalt BCCR piirkonnas, samas kui BRCA2 PV-d paiknesid valdavalt eales leidmata seost OCCR-i piirkonna vahel. BCCR piirkonnad ja BC tunnused. See võib olla tingitud BRCA1/2 mutatsioonidega patsientide piiratud arvust. Valgudomeeni vaatenurgast on BRCA1 PV-d jaotunud piki kogu valku ja BRCA2 muutused leitakse eelistatavalt BRC kordusdomeenis.
Lõpuks korreleerisime BC kliinilised patoloogilised tunnused BRCA1/2 PV-ga. Kaasatud patsientide piiratud arvu tõttu leidsime olulise korrelatsiooni ainult Ki-67 ja kasvaja astme vahel. Kuigi Ki-67 hindamine ja tõlgendamine on endiselt mõnevõrra vastuoluline, on kindel, et kõrge proliferatsioonimäär on seotud suurenenud riskiga haiguse kordumise ja haiguse kordumise vähenemise vahel. -67 on 20%. Kuid see lävi ei kehti meie BRCA1/2 mutatsiooniga patsientide populatsiooni kohta, mille Ki-67 keskmine väärtus on 25%. Seda kõrge Ki-67 määrade suundumust saab seletada levimusega meie luminaalses B ja TNBC kohordis, millest vähesed luminaalsed A kasvajad näivad olevat paremad, kuid mõned tõendid võivad viidata sellele, et 6 kiht on suurem. muuta patsiente vastavalt nende prognoosile.53,54 Meie analüüsi tulemuste põhjal ei ole oluline korrelatsioon üllatav.Esineb kõrge Ki-67 ja hinnete ning BRCA1 PV esinemise vahel.Tegelikult on BRCA1-ga seotud kasvajad tüüpilised TNBC-le ja neil on agressiivsemad tunnused.16,17
Kokkuvõtteks võib öelda, et see uuring annab aruande BRCA1/2 mutatsiooniseisundi kohta BC kohordis Ida-Sitsiiliast. Üldiselt on meie leiud kooskõlas juba olemasolevate tõenditega nii mutatsioonide levimuse kui ka kliiniliste patoloogiliste tunnuste osas BC-s. Rohkem uuringuid BRCA1/2-mutantse BC patsientide suuremate populatsioonidega, näiteks PV eristuvate BC-patsientide arvukuse hindamiseks, nt. kui BRCA1/2. See võimaldab identifitseerida ja korralikult hallata kasvavat hulka isikuid, kellel on geneetiliste mutatsioonide tõttu suurenenud risk haigestuda vähki.
Kinnitasime, et patsiendid allkirjastasid teadliku nõusoleku oma kasvajaproovide anonüümseks väljastamiseks uurimiseesmärkidel.Kõik patsiendid allkirjastasid kirjaliku teadliku nõusoleku vastavalt Helsingi deklaratsioonile.Vastavalt AOU Policlinico “G.Rodolico – S.Marco” poliitikale oli see uuring vabastatud eetilisest läbivaatusest, kuna BRCA1/2 analüüs viidi läbi. patsiendid andsid kirjaliku nõusoleku kliinilise uuringu andmete kasutamiseks.
Täname prof Paolo Vignerit abi eest rinnavähiga patsientide hooldamisel vastavalt eetikakomitee palvele.
Federica Martorana annab Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartise, Pfizeri honorarid. Teised autorid ei kinnita selles töös huvide konflikti.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL jt.Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN hindab 36 vähi esinemissagedust ja suremust 185 riigis üle maailma.CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.doi: 10/ca60ac.321.


Postitusaeg: 15. aprill 2022