Nature.com ની મુલાકાત લેવા બદલ આભાર.તમે જે બ્રાઉઝર સંસ્કરણનો ઉપયોગ કરી રહ્યાં છો તે મર્યાદિત CSS સપોર્ટ ધરાવે છે.શ્રેષ્ઠ અનુભવ માટે, અમે ભલામણ કરીએ છીએ કે તમે અપડેટ કરેલ બ્રાઉઝરનો ઉપયોગ કરો (અથવા Internet Explorer માં સુસંગતતા મોડને અક્ષમ કરો).આ દરમિયાન, સતત સમર્થન સુનિશ્ચિત કરવા માટે, અમે શૈલીઓ અને JavaScript વિના સાઇટને રેન્ડર કરીશું.
એંગુસ્ટીફોલીયસ લ્યુપિન (NLL, Lupinus angustifolius L.) એ એક કઠોળ છોડ છે જેનો ઉપયોગ ખાદ્ય ઉત્પાદન અને જમીન સુધારણા માટે થાય છે.પાક તરીકે NLL ના વૈશ્વિક વિસ્તરણે લ્યુપિન એન્થ્રેકનોઝ સહિત ઘણા રોગકારક ફૂગને આકર્ષ્યા છે, જે વિનાશક એન્થ્રેકનોઝ રોગનું કારણ બને છે.બે એલીલ્સ, Lanr1 અને AnMan, જે વધેલા પ્રતિકારને પ્રદાન કરે છે, તેનો ઉપયોગ NLL સંવર્ધનમાં કરવામાં આવ્યો છે, પરંતુ અંતર્ગત મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સ અજ્ઞાત છે.આ અભ્યાસમાં, Lanr1 અને AnMan માર્કર્સનો ઉપયોગ યુરોપીયન NLL નમૂનાઓને સ્ક્રીન કરવા માટે કરવામાં આવ્યો હતો.નિયંત્રિત વાતાવરણમાં રસીનું પરીક્ષણ બંને પ્રતિરોધક દાતાઓની અસરકારકતાની પુષ્ટિ કરે છે.વિભેદક જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલિંગ પ્રતિનિધિ પ્રતિરોધક અને સંવેદનશીલ રેખાઓ પર કરવામાં આવી હતી.એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર જનીન ઓન્ટોલોજી શબ્દો "GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ", "GO:0055114 રેડોક્સ પ્રક્રિયા", અને "GO:0015979 પ્રકાશસંશ્લેષણ" ના અતિશય અભિવ્યક્તિ સાથે સંકળાયેલો હતો.વધુમાં, Lanr1(83A:476) લાઇન ઇનોક્યુલેશન પછી ઝડપથી નોંધપાત્ર ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ રિપ્રોગ્રામિંગ દર્શાવે છે, જ્યારે અન્ય લાઇનોએ આ પ્રતિભાવમાં લગભગ 42 કલાકનો વિલંબ દર્શાવ્યો હતો.સંરક્ષણ પ્રતિભાવો TIR-NBS, CC-NBS-LRR અને NBS-LRR જનીનો, પેથોજેનેસિસમાં સામેલ 10 પ્રોટીન, લિપિડ ટ્રાન્સફર પ્રોટીન, એન્ડોગ્લુકન-1,3-β-ગ્લુકોસિડેઝ, ગ્લાયસીન-સમૃદ્ધ કોષ દિવાલ પ્રોટીન અને ઓક્સિજનના પ્રતિક્રિયાશીલ માર્ગમાંથી જનીનો સાથે સંકળાયેલા છે.83A:476 ના પ્રારંભિક પ્રતિભાવો, જેમાં પ્રકાશસંશ્લેષણ સાથે સંકળાયેલા જનીનોને સાવચેતીપૂર્વક દબાવવાનો સમાવેશ થાય છે, જે ફૂગના જીવવિજ્ઞાનના વનસ્પતિ વિકાસના તબક્કા દરમિયાન સફળ રક્ષણ સાથે સુસંગત છે, જે સૂચવે છે કે અસરકર્તા રોગપ્રતિકારક શક્તિને ઉત્તેજિત કરે છે.મેન્ડેલૂપ પ્રતિક્રિયા ધીમી થાય છે, જેમ કે એકંદર આડી ખેંચો.
સાંકડી પાંદડાવાળા લ્યુપિન (NLL, લ્યુપીનસ એંગસ્ટીફોલીયસ એલ.) પશ્ચિમી ભૂમધ્ય પ્રદેશ 1,2 માં ઉદ્દભવતું ઉચ્ચ પ્રોટીન અનાજ છે.હાલમાં તે પ્રાણીઓ અને મનુષ્યો માટે ખાદ્ય પાક તરીકે ઉગાડવામાં આવે છે.સિમ્બાયોટિક નાઇટ્રોજન ફિક્સિંગ બેક્ટેરિયા દ્વારા નાઇટ્રોજન ફિક્સેશન અને જમીનની રચનામાં એકંદર સુધારણાને કારણે તેને પાક પરિભ્રમણ પ્રણાલીમાં લીલા ખાતર તરીકે પણ ગણવામાં આવે છે.એનએલએલ છેલ્લી સદીમાં ઘરેલું બનાવવાની ઝડપી પ્રક્રિયામાંથી પસાર થયું છે અને હજુ પણ ઉચ્ચ સંવર્ધન દબાણ 3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 હેઠળ છે.NLLની વ્યાપક ખેતી સાથે, પેથોજેનિક ફૂગના ઉત્તરાધિકારથી નવા કૃષિ માળખાં વિકસિત થયા અને નવા પાકને નષ્ટ કરનારા રોગોનું કારણ બન્યું. લ્યુપિન ખેડૂતો અને સંવર્ધકો માટે સૌથી નોંધપાત્ર એંથ્રેકનોઝનો દેખાવ હતો, જે પેથોજેનિક ફૂગ, કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની (બોન્ડર) નિરેનબર્ગ, ફીલર અને હેગેડોર્ન 13ને કારણે થાય છે. લ્યુપિન ખેડૂતો અને સંવર્ધકો માટે સૌથી નોંધપાત્ર એંથ્રેકનોઝનો દેખાવ હતો, જે પેથોજેનિક ફૂગ, કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની (બોન્ડર) નિરેનબર્ગ, ફીલર અને હેગેડોર્ન 13ને કારણે થાય છે. Наиболее примечательным для фермеров и селекционеров люпина было появление антракноза, вызванного примечательным для фермеров и селекционеров હેગેડોર્ન13. લ્યુપિન ખેડૂતો અને સંવર્ધકો માટે સૌથી વધુ નોંધનીય એ પેથોજેનિક ફૂગ કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની (બોન્ડર) નિરેનબર્ગ, ફેઈલર અને હેગેડોર્ન 13 દ્વારા થતા એન્થ્રેકનોઝનો ઉદભવ હતો.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原农民和饲养者来说orn13 引起的.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原真走 Наиболее поразительным для фермеров и селекционеров люпина является появление антракноза, вызываемого для фермеров , ફીલર અને હેગેડોર્ન13. લ્યુપિન ખેડુતો અને સંવર્ધકો માટે સૌથી વધુ આઘાતજનક એ પેથોજેનિક ફૂગ કોલેટોટ્રીચમ લ્યુપિની (બોન્ડર) નિરેનબર્ગ, ફેઈલર અને હેગેડોર્ન13 દ્વારા થતા એન્થ્રેકનોઝનો ઉદભવ છે.આ રોગના પ્રારંભિક અહેવાલો બ્રાઝિલ અને યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સમાંથી આવ્યા હતા, જેમાં લાક્ષણિક લક્ષણો અનુક્રમે 1912 અને 1929માં દેખાયા હતા.જો કે, લગભગ 30 વર્ષ પછી, પેથોજેનને કોલેટોટ્રિચમ ગ્લોઓસ્પોરિયોઇડ્સ (પેન્ઝ.) પેન્ઝ તરીકે નિયુક્ત કરવામાં આવ્યું હતું. & Sacc., ટેલીમોર્ફ ગ્લોમેરેલા સિંગ્યુલાટા (સ્ટોનમેન) સ્પાઉલ્ડ. & Sacc., ટેલીમોર્ફ ગ્લોમેરેલા સિંગ્યુલાટા (સ્ટોનમેન) સ્પાઉલ્ડ. & Sacc., телеоморф Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., ગ્લોમેરેલા સિંગ્યુલાટા (સ્ટોનમેન) સ્પાઉલ્ડનું ટેલીમોર્ફ. & Sacc.,有目的形态的Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc.,有目的形态的Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld в Целенаправленной морфологии. અને સેક., ગ્લોમેરેલા સિન્ગ્યુલાટા (સ્ટોનમેન) સ્પેલ્ડ ઇન ટાર્ગેટેડ મોર્ફોલોજી. એન્ડ એચ. શ્રેન્ક,. એન્ડ એચ. શ્રેન્ક, .અને એચ. શ્રેન્ક. & H. 施伦克,. & H. 施伦克,.અને એચ. સ્લેન્ક, .20મી સદીના મધ્યમાં કરવામાં આવેલા પ્રારંભિક રોગ ફેનોટાઈપિંગમાં NLL અને પીળા લ્યુપિન (L. luteus L.) એક્સેસન્સમાં થોડો પ્રતિકાર જોવા મળ્યો હતો, પરંતુ તમામ સફેદ લ્યુપિન (L. albus L.) એક્સેસન્સનું પરીક્ષણ કરવામાં આવ્યું હતું તે અત્યંત સંવેદનશીલ હતા15,16.અભ્યાસોએ દર્શાવ્યું છે કે એન્થ્રેકનોઝનો વિકાસ વરસાદ (હવા ભેજ) અને તાપમાન (12-28 ° સે ની રેન્જમાં) સાથે સંકળાયેલ છે, જે ઊંચા તાપમાને પ્રતિકારનું ઉલ્લંઘન તરફ દોરી જાય છે17, 18. વાસ્તવમાં, કોનિડિયાને અંકુરિત થવા માટે અને રોગ શરૂ થવા માટે જરૂરી સમય, 4 ગણો ઓછો હતો (1 ° સે 4 ° સે 4 ° સે 4 કલાક કરતાં ઓછો ભેજ) શરતો19.આમ, ચાલી રહેલી ગ્લોબલ વોર્મિંગને કારણે એન્થ્રેકનોઝનો ફેલાવો થયો છે.જો કે, ફ્રાંસ (1982) અને યુક્રેન (1983)માં આ રોગ તોળાઈ રહેલા ખતરા તરીકે જોવામાં આવ્યો હતો, પરંતુ 20,21 સમયે લ્યુપિન ઉદ્યોગ દ્વારા દેખીતી રીતે તેની અવગણના કરવામાં આવી હતી.થોડા વર્ષો પછી, આ વિનાશક રોગ સમગ્ર વિશ્વમાં ફેલાઈ ગયો અને ઓસ્ટ્રેલિયા, પોલેન્ડ અને જર્મની જેવા મોટા લ્યુપિન ઉત્પાદક દેશોને પણ અસર કરી 22,23,24.1990 ના દાયકાના મધ્યમાં એન્થ્રેકનોઝ ફાટી નીકળ્યા પછી, વ્યાપક તપાસના પરિણામે NLL19 નમૂનાઓમાં કેટલાક પ્રતિરોધક દાતાઓની ઓળખ થઈ.એન્થ્રેકનોઝનો એનએલએલ પ્રતિકાર વિવિધ જર્મપ્લાઝમ સ્ત્રોતોમાં જોવા મળતા બે અલગ-અલગ પ્રભાવશાળી એલીલ્સ દ્વારા નિયંત્રિત થાય છે: કલ્ટીવારમાં લેન્ર1 તંજીલ અને વોંગા અને કલ્ટીવારમાં એનમેન.મંડલય 25, 26. આ એલીલ્સ પરમાણુ માર્કર્સને પૂરક બનાવે છે જે સંવર્ધન કાર્યક્રમો25,26,27,28,29,30 માં પ્રતિરોધક જર્મપ્લાઝમની પસંદગીને સમર્થન આપે છે.એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર માટે અલગ થતી RIL વસ્તી મેળવવા માટે Lanr1 એલીલને વહન કરતી પ્રતિરોધક સંવર્ધન રેખા 83A:476 ને સંવેદનશીલ જંગલી રેખા P27255 વડે ઓળંગવામાં આવી હતી, જેના કારણે લૅનઆર1 લોકસને રંગસૂત્ર NLL-1131, 3. 32, 32, 32, 32, 32, 32. જીનોમિક ફ્રેમવર્ક સાથે એન્થ્રેકનોઝ કરવા માટે, NLL એ એક જ રંગસૂત્ર (NLL-11) પર ત્રણેય એલીલ્સનું સ્થાન જાહેર કર્યું, પરંતુ અલગ-અલગ સ્થિતિમાં 29,34,35.જો કે, આરઆઈએલની ઓછી સંખ્યા અને માર્કર અને અનુરૂપ એલીલ્સ વચ્ચેના મોટા આનુવંશિક અંતરને કારણે, તેમના અંતર્ગત જનીનો વિશે કોઈ વિશ્વસનીય નિષ્કર્ષ કાઢી શકાતા નથી.બીજી બાજુ, લ્યુપિન્સમાં રિવર્સ જિનેટિક્સનો ઉપયોગ તેમની ખૂબ જ ઓછી પુનર્જીવન ક્ષમતાને કારણે મુશ્કેલ છે, જે આનુવંશિક મેનીપ્યુલેશનને બોજારૂપ બનાવે છે37.
83A:476 (Lanr1) અને Mandelup (AnMan) જેવી સજાતીય સ્થિતિમાં ઇચ્છિત એલીલ વહન કરતા પાળેલા જર્મપ્લાઝમના વિકાસે જંગલી વસ્તીમાં એલીલના વિરોધી સંયોજનોની હાજરીમાં એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારનો અભ્યાસ કરવાનો દરવાજો ખોલ્યો છે.મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સની શક્યતાઓ.વિશિષ્ટ જીનોટાઇપ્સ દ્વારા જનરેટ કરવામાં આવેલ સંરક્ષણ પ્રતિભાવોની તુલના કરો.આ અભ્યાસે NLL થી C. લ્યુપિની રસીકરણના પ્રારંભિક ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિભાવનું મૂલ્યાંકન કર્યું.સૌપ્રથમ, 215 રેખાઓ ધરાવતી યુરોપીયન NLL જર્મપ્લાઝમ પેનલને મોલેક્યુલર માર્કરનો ઉપયોગ કરીને તપાસવામાં આવી હતી જે Lanr1 અને AnMan એલીલ્સને ચિહ્નિત કરે છે.એન્થ્રેકનોઝ ફેનોટાઇપિંગ પછી 50 NLL લાઇન પર કરવામાં આવ્યું હતું, જે અગાઉ મોલેક્યુલર માર્કર્સ માટે પસંદ કરવામાં આવ્યું હતું, નિયંત્રિત પરિસ્થિતિઓ હેઠળ.આ પ્રયોગોના આધારે, બે પૂરક અભિગમોનો ઉપયોગ કરીને વિભેદક સંરક્ષણ જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલિંગ માટે એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર અને Lanr1/AnMan એલેલિક રચનામાં ભિન્ન ચાર રેખાઓ પસંદ કરવામાં આવી હતી: ઉચ્ચ-થ્રુપુટ આરએનએ સિક્વન્સિંગ અને રીઅલ-ટાઇમ પીસીઆર પ્રમાણીકરણ.
Lanr1 (Anseq3 અને Anseq4) અને AnMan (Anseq4) અને AnMan (AnManM1) માર્કર્સ સાથે NLL જર્મપ્લાઝમ (N = 215) ના સમૂહની સ્ક્રીનીંગ દર્શાવે છે કે માત્ર એક જ લીટી (95726, Salamanca-b નજીક) "પ્રતિરોધક" માર્કર્સ માટે તમામ "પ્રતિરોધક" માર્કર્સને વિસ્તૃત કરે છે. 158 (~73.5%) રેખાઓમાં તમામ માર્કર્સનું પ્રમાણ.તેર લીટીઓએ Lanr1 માર્કરના બે "પ્રતિરોધક" એલીલ્સ ઉત્પન્ન કર્યા, અને 8 લીટીઓએ Lanr1 ના "પ્રતિરોધક" એલીલ્સ ઉત્પન્ન કર્યા.માર્કરAnMan માર્કરનું "પ્રતિકાર" એલીલ (પૂરક કોષ્ટક S1).Anseq3 માર્કર માટે બે લીટીઓ હેટરોઝાયગસ અને AnManM1 માર્કર માટે એક હેટરોઝાયગસ હતી.42 રેખાઓ (19.5%) Anseq3 અને Anseq4 એલીલ્સના વિરુદ્ધ તબક્કાઓ વહન કરે છે, જે આ બે સ્થાનો વચ્ચે પુનઃસંયોજનની ઉચ્ચ આવર્તન દર્શાવે છે.એન્થ્રેકનોઝ ફિનોટાઇપ્સ નિયંત્રિત પરિસ્થિતિઓ (પૂરક કોષ્ટક S2) હેઠળ પરીક્ષણ કરાયેલ જીનોટાઇપ્સના પ્રતિકારમાં પરિવર્તનશીલતા દર્શાવે છે, જે એન્થ્રેકનોઝની તીવ્રતામાં પ્રતિબિંબિત થાય છે.સરેરાશ સ્કોર્સમાં તફાવત 1.8 (સાધારણ પ્રતિરોધક) થી 6.9 (સંવેદનશીલ) અને છોડના વજનમાં તફાવત 0.62 (સંવેદનશીલ) થી 4.45 ગ્રામ (પ્રતિરોધક) સુધીનો હતો. પ્રયોગની બે નકલોમાં જોવા મળેલા મૂલ્યો (રોગની તીવ્રતાના સ્કોર માટે 0.51, છોડના વજન માટે P = 0.00017 અને 0.61, P < 0.0001) તેમજ આ બે પરિમાણો (− 0.59 અને − 0.77, P < 0.000) વચ્ચે નોંધપાત્ર સહસંબંધ હતો. પ્રયોગની બે નકલોમાં અવલોકન કરાયેલ મૂલ્યો વચ્ચે નોંધપાત્ર સંબંધ હતો (રોગની તીવ્રતાના સ્કોર્સ માટે 0.51, છોડના વજન માટે P = 0.00017 અને 0.61, P < 0.0001) તેમજ આ બે પરિમાણો (− 0.59 અને − 0.77, P <10) વચ્ચે. Выявлена ​​достоверная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях эксперимента (0,51 для бажду, бажловле, 0,51 и 0,61 для массы растения, P < 0,0001), а также между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,77, Р < 0,00001) 0,0001). પ્રયોગના બે પુનરાવર્તનોમાં અવલોકન કરાયેલા મૂલ્યો (રોગની તીવ્રતાના સ્કોર્સ માટે 0.51, છોડના વજન માટે P = 0.00017 અને 0.61, P < 0.0001), તેમજ આ બે પરિમાણો (- 0.59 અને -0.77, P < 010. 0.10) વચ્ચે નોંધપાત્ર સહસંબંધ જોવા મળ્યો હતો.在两次重复实验中观察到的值之间存在显着相关性（疾病严重程度评分为程度评分为0.0.51,0.51 0.61，P <0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 和- 0.77，P <0.0001).在 两 次 重复 实验 中 观察 的 值 之间 存在 相关性 （疾病 严重 程度 严重 程度 评 分丈 5 0.00017 ， 植物 为 0.61 ， p <0.0001） 以及 两 个 参数 之间 （（（（- 0.59 和–59和–59和- 0.77, P < 0.0001). Наблюдалась значительная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях (оценка тяжести заболева, P0101010101018) растения 0,61, P <0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,0001) 0,77, P <0,0001. ડુપ્લિકેટ (રોગની તીવ્રતા સ્કોર 0.51, P = 0.00017 અને છોડનું વજન 0.61, P < 0.0001) અને આ બે પરિમાણો (-0.59 અને -0 .0001) 0.707, P<0001 વચ્ચે જોવા મળેલા મૂલ્યો વચ્ચે નોંધપાત્ર સંબંધ હતો. ).અતિસંવેદનશીલ છોડમાં જોવા મળતા લાક્ષણિક લક્ષણોમાં "ભરવાડના ધનુષ્ય" સંરચના જેવું લાગતું દાંડીનું કિંકિંગ અને વળી જવું, ત્યારબાદ નારંગી/ગુલાબી સ્પોરોઝોઇટ્સ સાથે અંડાકાર જખમ (પૂરક ફિગ. 1) નો સમાવેશ થાય છે.Lanr1 (83A:476 અને Tanjil) અને AnMan (Mandelup) જનીનો વહન કરતા ઓસ્ટ્રેલિયન જોડાણો સાધારણ પ્રતિરોધક છે, 0.0331 અને 0.0036).કેટલીક રેખાઓ કે જે "પ્રતિરોધક" Lanr1 અને/અથવા AnMan એલીલ્સ પણ ધરાવે છે તે રોગના લક્ષણો દર્શાવે છે.
રસપ્રદ વાત એ છે કે, "પ્રતિરોધક" માર્કર એલીલનો અભાવ ધરાવતી કેટલીક NLL લાઇનોએ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારનું ઊંચું સ્તર જાહેર કર્યું (Lanr1 અથવા AnMan જિનોટાઇપ્સ કરતાં તુલનાત્મક અથવા વધુ), જેમ કે બોરેગીન (બંને પરિમાણો માટે P મૂલ્ય < 0.0001), બોજાર (P મૂલ્ય < 0.0001 અને B-095 માટે B-095 અને છોડના વજન માટે 0.0001). (સ્કોર માટે P મૂલ્ય < 0.0001 અને વજન માટે બિન-નોંધપાત્ર). રસપ્રદ વાત એ છે કે, "પ્રતિરોધક" માર્કર એલીલનો અભાવ ધરાવતી કેટલીક NLL લાઇનોએ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારનું ઊંચું સ્તર જાહેર કર્યું (Lanr1 અથવા AnMan જિનોટાઇપ્સ કરતાં તુલનાત્મક અથવા વધુ), જેમ કે બોરેગીન (બંને પરિમાણો માટે P મૂલ્ય < 0.0001), બોજાર (P મૂલ્ય < 0.0001 અને B-095 માટે B-095 અને છોડના વજન માટે 0.0001). (સ્કોર માટે P મૂલ્ય < 0.0001 અને વજન માટે બિન-નોંધપાત્ર). Интересно, что несколько линий NLL, лишенных какого-либо «резистентного» маркерного аллеля, показали высокий уровень уровень уастем высокий вимый или более высокий, чем для генотипов Lanr1 или AnMan), таких как Boregine (значение P <0,0001 для обоих параметров), બોજાર (P00001) и 0,001 для массы растения) и популяции B-549/79b (значение P <0,0001 для оценки и незначимо для массы). રસપ્રદ વાત એ છે કે, કોઈપણ 'પ્રતિરોધક' માર્કર એલીલનો અભાવ ધરાવતી ઘણી NLL લાઈનોએ એન્થ્રેકનોઝ (Lanr1 અથવા AnMan જિનોટાઈપ્સ માટે તુલનાત્મક અથવા તેનાથી વધુ) માટે ઉચ્ચ સ્તરનો પ્રતિકાર દર્શાવ્યો હતો, જેમ કે બોરેગીન (બંને પરિમાણો માટે P મૂલ્ય < 0.0001), બોજાર (P મૂલ્ય < 0.0001 અને છોડ માટે વજન < 0.050) /79b (મૂલ્યાંકન માટે P મૂલ્ય < 0.0001 અને વજન માટે નોંધપાત્ર નથી).有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽病抗怗型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001）得分两0.0001）得分两0.0001.种群B-549/79b（得分P 值< 0.0001, 重量不显着）. તે રસપ્રદ છે કે કેટલીક NLL સિસ્ટમો કે જેમાં કોઈ "એન્ટિજેનિક" માર્કર નથી હોતા તે ઉચ્ચ આડી પ્રતિકાર દર્શાવે છે (Lanr1 અથવા AnMan જનીનોની સમકક્ષ અથવા ઉચ્ચ), જેમ કે બોરેગીન (બંને પરિમાણો P < 0.0001), બોજાર (P મૂલ્ય < 0.0001, છોડનું વજન) 0.0/7 0.091 મૂલ્ય અને બી 0.091 (0.4/7) મૂલ્ય 1, વજન નોંધપાત્ર નથી). Интересно, что некоторые линии NLL, лишенные каких-либо маркерных аллей «резистентности», показали высокие уровни устовый высокие уровни или выше, чем у генотипов Lanr1 или AnMan), такие как Boregine (значение P для обоих параметров <0,0001), Bojar (значение P <0,000п,001,00001,0001) ляция B-549/79b (оценка P-значение <0,0001, масса незначительна). રસપ્રદ વાત એ છે કે, કોઈપણ 'પ્રતિકાર' માર્કર એલીલ્સનો અભાવ ધરાવતી કેટલીક NLL લાઈનોએ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારનું ઊંચું સ્તર (Lanr1 અથવા AnMan જિનોટાઈપ્સ સાથે તુલનાત્મક અથવા તેનાથી વધુ) દર્શાવ્યું હતું, જેમ કે બોરેગીન (બંને પેરામીટર્સ માટે P મૂલ્ય <0.0001), બોજાર (P-મૂલ્ય <0.70/b019 અને છોડનું વજન <0. 0.50/b) P-વેલ્યુ <0.0001, વજન નોંધપાત્ર નથી).આ ઘટના પ્રતિકારના નવલકથા આનુવંશિક સ્ત્રોતની શક્યતા સૂચવે છે, માર્કર જીનોટાઇપ્સ અને રોગ ફેનોટાઇપ્સ (~0.42 થી ~0.98 સુધીના P મૂલ્યો) વચ્ચેના સહસંબંધના અવલોકન કરેલ અભાવને સમજાવે છે.આમ, કોલમોગોરોવ-સ્મિર્નોવ પરીક્ષણ દર્શાવે છે કે એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર પરનો ડેટા લગભગ સામાન્ય રીતે સ્કોર (P-મૂલ્યો 0.25 અને 0.11) અને છોડના સમૂહ (P-મૂલ્યો 0.47 અને 0.55) માટે વિતરિત કરવામાં આવ્યો હતો, જે સૂચવે છે કે હું અનુમાન લગાવું છું કે AnM1 કરતાં વધુ એલિલ્સ સામેલ છે.
એન્થ્રેકનોઝ રેઝિસ્ટન્સ સ્ક્રિનિંગના પરિણામોના આધારે, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ વિશ્લેષણ માટે 4 રેખાઓ પસંદ કરવામાં આવી હતી: 83A:476, બોરેગીન, મેન્ડેલુપ અને પોપ્યુલેશન 22660. આ રેખાઓનું આરએનએ સિક્વન્સિંગ દ્વારા ઇનોક્યુલેશન પ્રયોગોમાં એન્થ્રેક્સ પ્રતિકાર માટે ફરીથી પરીક્ષણ કરવામાં આવ્યું હતું, જો કે તેઓ અગાઉના પરીક્ષણમાં સમાન હતા.સ્કોર મૂલ્યો નીચે મુજબ હતા: બોરેગિન (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), મેન્ડેલુપ (3.82 ± 1.42) અને વસ્તી 22660 (6.11 ± 1.29 ).
Illumina NovaSeq 6000 પ્રોટોકોલે નમૂના દીઠ સરેરાશ 40.5 Mread જોડીઓ (29.7 થી 54.4 Mreads) (પૂરક કોષ્ટક S3) પ્રાપ્ત કરી.સંદર્ભ ક્રમમાં સંરેખણ સ્કોર્સ 75.5% થી 88.6% સુધીના હતા.જૈવિક પ્રતિકૃતિઓ વચ્ચેના પ્રાયોગિક પ્રકારો વચ્ચેના વાંચન ગણતરીના ડેટાનો સરેરાશ સહસંબંધ 0.812 થી 0.997 (સરેરાશ 0.959) સુધીનો હતો. પૃથ્થકરણ કરાયેલ 35,170 જનીનોમાંથી, 2917 એ કોઈ અભિવ્યક્તિ જાહેર કરી ન હતી, અને અન્ય 4785 જનીનો નગણ્ય સ્તરે વ્યક્ત કરવામાં આવ્યા હતા (આધાર સરેરાશ <5). પૃથ્થકરણ કરાયેલ 35,170 જનીનોમાંથી, 2917 એ કોઈ અભિવ્યક્તિ જાહેર કરી ન હતી, અને અન્ય 4785 જનીનો નગણ્ય સ્તરે વ્યક્ત કરવામાં આવ્યા હતા (આધાર સરેરાશ <5). Из 35 170 проанализированных генов 2917 не проявляли экспрессии, а остальные 4785 генов экспресссировались на незвналодуате на незвнализированных е <5). પૃથ્થકરણ કરાયેલ 35,170 જનીનોમાંથી, 2917એ કોઈ અભિવ્યક્તિ દર્શાવી ન હતી, અને બાકીના 4785 જનીનો નગણ્ય સ્તરે વ્યક્ત કરવામાં આવ્યા હતા (બેઝ મીન <5).在分析的35,170 个基因中，2917 个没有表达，其他4785 个基因的表达可以因的表达可以忽略不计﹡35,170 પર રાખવામાં આવી છે Из 35 170 проанализированных генов 2917 не экспрессировались, а остальные 4785 генов имели незначительную экспрессировались (<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< " ). પૃથ્થકરણ કરાયેલા 35,170 જનીનોમાંથી, 2917 વ્યક્ત કરવામાં આવ્યા ન હતા અને બાકીના 4785 જનીનોમાં નજીવી અભિવ્યક્તિ હતી (બેઝ મીન <5).આમ, પ્રયોગ દરમિયાન વ્યક્ત (બેઝ મીન ≥ 5) ગણવામાં આવતા જનીનોની સંખ્યા 27,468 (78.1%) (પૂરક કોષ્ટક S4) હતી.
પ્રથમ વખતના બિંદુથી, તમામ NLL રેખાઓએ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ (કોષ્ટક 1) ને પુનઃપ્રોગ્રામ કરીને સી. લ્યુપિની (સ્ટ્રેન કોલ-08) ના ઇનોક્યુલેશનને પ્રતિભાવ આપ્યો હતો, જો કે, રેખાઓ વચ્ચે નોંધપાત્ર તફાવત જોવા મળ્યો હતો.આમ, પ્રતિકારક રેખા 83A:476 (Lanr1 જનીન વહન કરતી) એ પ્રથમ સમયના બિંદુ (6 hpi) પર નોંધપાત્ર ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ રીપ્રોગ્રામિંગ દર્શાવ્યું હતું જે આ સમયના અન્ય સમય બિંદુઓની તુલનામાં અલગ-અલગ ઉપર-અને નીચે-જનીનોની સંખ્યામાં 31-69-ગણો વધારો દર્શાવે છે.વધુમાં, આ શિખર અલ્પજીવી હતી, કારણ કે બીજી વખતના બિંદુ (12 hpi) પર માત્ર થોડા જનીનોની અભિવ્યક્તિ નોંધપાત્ર રીતે બદલાઈ રહી હતી.રસપ્રદ વાત એ છે કે, બોરેજીન, જેણે કલમ પરીક્ષણમાં પણ ઉચ્ચ સ્તરનો પ્રતિકાર દર્શાવ્યો હતો, તે પ્રયોગ દરમિયાન આટલા મોટા પ્રમાણમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રિપ્રોગ્રામિંગમાંથી પસાર થયું ન હતું.જો કે, 12 HPI પર બોરેજીન અને 83A:476 માટે વિભેદક રીતે વ્યક્ત થયેલ જીન્સ (DEG)ની સંખ્યા સમાન હતી.મેન્ડેલુપ અને વસ્તી 22660 બંનેએ છેલ્લા સમયના બિંદુ (48 l/s) પર DEG શિખરો દર્શાવ્યા હતા, જે સંરક્ષણ પ્રતિસાદમાં સંબંધિત વિલંબ સૂચવે છે.
કારણ કે 83A:476 એ અન્ય તમામ રેખાઓની સરખામણીમાં 6 HPI પર C. લ્યુપિનીના પ્રતિભાવમાં મોટા પાયે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ રિપ્રોગ્રામિંગ કરાવ્યું હતું, આ સમયે અવલોકન કરાયેલા ~91% DEGs વંશ-વિશિષ્ટ હતા (ફિગ. 1).જો કે, અભ્યાસ રેખાઓ વચ્ચેના પ્રારંભિક પ્રતિભાવોમાં કેટલાક ઓવરલેપ હતા, કારણ કે બોરેગીન, મેન્ડેલુપ અને વસ્તી 22660માં અનુક્રમે 68.5%, 50.9% અને 52.6% DEG, સમયના અમુક બિંદુઓમાં 83A:476 માં જોવા મળેલા પ્રતિસાદો સાથે ઓવરલેપ થયા હતા.જો કે, આ DEGs હાલમાં 83A:476 નો ઉપયોગ કરીને શોધાયેલ તમામ DEGsમાંથી માત્ર એક નાના અપૂર્ણાંક (0.97–1.70%) માટે જવાબદાર છે.વધુમાં, આ સમયે તમામ રેખાઓમાંથી 11 ડીઇજી સુસંગત હતા (પૂરક કોષ્ટકો S4-S6), જેમાં વનસ્પતિ સંરક્ષણ પ્રતિભાવોના સામાન્ય ઘટકોનો સમાવેશ થાય છે: લિપિડ ટ્રાન્સફર પ્રોટીન (TanjilG_32225), એન્ડોગ્લુકન-1,3-β-ગ્લુકોસાઇડ એન્ઝાઇમ (TanjilG_233384), બે સ્ટ્રેસ પ્રોટીન અને 23384 પ્રોટીન અને તાનજીલજી. jilG_31531), મૂળભૂત લેટેક્ષ પ્રોટીન (TanjilG_32352), અને બે ગ્લાયસીન-સમૃદ્ધ માળખાકીય કોષ દિવાલ પ્રોટીન (TanjilG_19701 અને TanjilG_19702).83A:476 અને બોરેગીન વચ્ચે 24 HPI (કુલ 16-38% DEG) અને મેન્ડેલુપ અને વસ્તી 22660 વચ્ચે 48 HPI (કુલ 14-20% DEG) વચ્ચે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિસાદોમાં પ્રમાણમાં વધુ ઓવરલેપ જોવા મળ્યો હતો.
કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની (વિરઝેનિસ, પોલેન્ડ, 1999માં લ્યુપિન ક્ષેત્રોમાંથી મેળવેલ તાણ કોલ-08) સાથે ઇનોક્યુલેટેડ સાંકડી-પાંદડાવાળા લ્યુપિન (એનએલએલ) રેખાઓમાં વિભિન્ન રીતે વ્યક્ત થયેલ જીન્સ (DEG) ની સંખ્યા દર્શાવતો વેન ડાયાગ્રામ.એનએલએલ રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ અજ્ઞાત), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, AnMan એલીલ વહન કરે છે) અને વસ્તી 22660 (ખૂબ જ સંવેદનશીલ).સંક્ષેપ hpi રસીકરણ પછી કલાકો સુધી રહે છે.ગ્રાફને સરળ બનાવવા માટે શૂન્ય મૂલ્યો દૂર કરવામાં આવ્યા છે.
6 hpi પર ઓવરએક્સપ્રેસ્ડ જનીનોના સમૂહનું કેનોનિકલ R જનીન ડોમેન્સ (પૂરક કોષ્ટક S7) ની હાજરી માટે વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું.આ અભ્યાસમાં માત્ર 83A:476 પર NBS-LRR ડોમેન્સ સાથે ક્લાસિક રોગ પ્રતિકારક જનીનો ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ઇન્ડક્શન જાહેર કરવામાં આવ્યું છે.આ સમૂહમાં એક TIR-NBS-LRR જનીન (tanjilg_05042), પાંચ CC-NBS-LRR જનીનો (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, અને F_11Lg, tanjilg, 6611 tanjilg, tanjilg_22640) નો સમાવેશ થાય છે. 62), અને ચાર NBS-LRRE (tanjilg_16162) તેમજ ચાર NBS-Lrr (tanjilg_16162) અને ચાર NBS-LRR (TANJILG_16162).આ તમામ જનીનોમાં સંરક્ષિત ક્રમમાં ગોઠવાયેલા પ્રમાણભૂત ડોમેન છે.NBS-LRR ડોમેન જનીનો ઉપરાંત, 6 hpi પર ઘણા RLL કિનાઝ સક્રિય થયા હતા, એટલે કે એક બોરેજીનમાં (TanjilG_19877), બે મેન્ડેલુપ (TanjilG_07141 અને TanjilG_19877) અને વસ્તી 22660 (TanjilG1303 અને TanjilG13030) અને બે. 27:476.
સી. લ્યુપિની (સ્ટ્રેન કોલ-08) સાથે ઇનોક્યુલેશનના પ્રતિભાવમાં નોંધપાત્ર રીતે બદલાયેલ અભિવ્યક્તિ ધરાવતા જનીનોને જનીન ઓન્ટોલોજી (GO) સંવર્ધન વિશ્લેષણ (પૂરક કોષ્ટક S8) ને આધિન કરવામાં આવ્યું હતું. સૌથી વધુ વારંવાર રજૂ કરાયેલ જૈવિક પ્રક્રિયા શબ્દ "GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ" હતો જે 16 માંથી 6 (સમય × રેખા) ઉચ્ચ મહત્વ (P મૂલ્ય < 0.001) (ફિગ. 2) સાથે સંયોજનોમાં દેખાયો હતો. સૌથી વધુ વારંવાર રજૂ કરાયેલ જૈવિક પ્રક્રિયા શબ્દ "GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ" હતો જે 16 માંથી 6 (સમય × રેખા) ઉચ્ચ મહત્વ (P મૂલ્ય < 0.001) (ફિગ. 2) સાથે સંયોજનોમાં દેખાયો હતો. Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 защитный ответ», время × линия) комбинаций с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2). સૌથી વધુ વારંવાર રજૂ કરાયેલ જૈવિક પ્રક્રિયા શબ્દ 'GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ' હતો, જે ઉચ્ચ મહત્વ (P મૂલ્ય < 0.001) (ફિગ. 2) સાથે 16માંથી 6 (સમય × વંશ) સંયોજનોમાં દેખાયો હતો.最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”，它出现在16 个（时间程个（时间程具有高显着性（P 值< 0.001）（图2）. સૌથી પ્રતિનિધિ જૈવિક પ્રક્રિયા શબ્દ "GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ" છે, જે 16 માંથી 6 (时间×线) સંયોજનોમાં દેખાય છે, ઉચ્ચ મહત્વ (P મૂલ્ય < 0.001) (图2) સાથે. Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ», который появленным который появленным мя × линия) с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2). જૈવિક પ્રક્રિયાનો સૌથી વધુ વારંવાર રજૂ કરાયેલ શબ્દ 'GO:0006952 ડિફેન્સ રિસ્પોન્સ' હતો, જે 16 માંથી 6 સંયોજનોમાં (સમય × રેખા) ઉચ્ચ મહત્વ (P મૂલ્ય < 0.001) (ફિગ. 2) સાથે દેખાયો હતો.આ શબ્દ 83A: 476 અને બોરેગીન (6 અને 24 hpi) અને એક સમયે મેન્ડેલુપ અને પોપ્યુલેશન 22660 (અનુક્રમે 12 અને 6 hpi) માં બે ટાઈમ પોઈન્ટ પર વધુ પડતો રજૂ કરવામાં આવ્યો હતો.આ એક અપેક્ષિત પરિણામ છે, જે પ્રતિરોધક રેખાઓના એન્ટિફંગલ પ્રતિભાવને પ્રકાશિત કરે છે.વધુમાં, 83A:476 એ "GO:0055114 રેડોક્સ પ્રક્રિયા" શબ્દ દ્વારા રજૂ થતા ઓક્સિડેટીવ બર્સ્ટ સાથે સંબંધિત જનીનોને ઝડપથી પ્રેરિત કરીને સી. લ્યુપિનીને પ્રતિભાવ આપ્યો, જે ચોક્કસ સંરક્ષણ પ્રતિભાવ દર્શાવે છે, જ્યારે બોરેગીને 'GO' શબ્દ સાથે સંબંધિત ચોક્કસ સંરક્ષણ પ્રતિભાવો જાહેર કર્યા હતા.:0006950 તણાવ પ્રતિભાવ”.વસ્તી 22660 એ ગૌણ ચયાપચયને સંડોવતા આડા પ્રતિકાર પ્રતિભાવને સક્રિય કર્યો, "GO:0016104 ટ્રાઇટરપીન જૈવસંશ્લેષણની પ્રક્રિયા" અને "GO:0006722 ટ્રાઇટરપીન ચયાપચયની પ્રક્રિયા" (બંને પરિભાષાઓના સમાન પરિણામોને ધ્યાનમાં લેતા) શબ્દોની વધુ પડતી સંખ્યાને પ્રકાશિત કરે છે. sis, મેન્ડેલુપ પ્રતિક્રિયા સ્થિરતા બોરેગીન અને વસ્તી 22660 વચ્ચે હતી. વધુમાં, પ્રારંભિક પ્રતિક્રિયા 83A:476 (6 hpi) અને વિલંબિત પ્રતિક્રિયા મેન્ડેલુપ અને વસ્તી 22660 માં GO:0015979 'ફોટોસિન્થેસિસ' શબ્દ અને અન્ય સંબંધિત જૈવિક પ્રક્રિયાઓનો સમાવેશ થાય છે.
એન્થ્રેક્સ લ્યુપિન (1999માં પોલેન્ડના વિરઝેનિસમાં લ્યુપિન ક્ષેત્રોમાંથી મેળવેલ કોલ-08 સ્ટ્રેઈન) સાથે ઈનોક્યુલેટેડ નેરો-લીવ્ડ લ્યુપિન (એનએલએલ) ના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિભાવો દરમિયાન વિભિન્ન રીતે વ્યક્ત કરાયેલા જનીનોની એનોટેશનમાં પસંદ કરાયેલ બાયોપ્રોસેસ જનીન ઓન્ટોલોજીના શબ્દો મોટા પ્રમાણમાં અતિશયોક્તિપૂર્ણ છે.એનએલએલ રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, અજ્ઞાત આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાયગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે) અને વસ્તી 22660 (સંવેદનશીલ).
કારણ કે આ અભ્યાસનો હેતુ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારમાં ફાળો આપતા જનીનોને ઓળખવાનો હતો, GO “GO: 0006952 રક્ષણાત્મક પ્રતિભાવો” અને “GO: 0055114 રેડોક્સ પ્રક્રિયાઓ” શબ્દોને સોંપેલ જનીનોનું કટ-ઓફ સાથે વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું કારણ કે બેઝલાઈનનો અર્થ ઓછામાં ઓછી એક લાઇન ≥ 30 છે.લોગ2 (ફોલ્ડ ચેન્જ) ના આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર મૂલ્યોને જોડતો સમયનો × બિંદુ.આ માપદંડોને પૂર્ણ કરતા જનીનોની સંખ્યા GO:0006952 માટે 65 અને GO:0055114 માટે 524 હતી.
83A:476 એ GO:0006952 શબ્દ સાથે બે ડીઇજી શિખરો જાહેર કર્યા, પ્રથમ 6 જીન્સ પ્રતિ ઇંચ (64 જીન્સ, અપ એન્ડ ડાઉન રેગ્યુલેશન) અને બીજું 24 જીન્સ પ્રતિ ઇંચ (15 જીન્સ, માત્ર અપ રેગ્યુલેશન)બોરેજીને એ પણ દર્શાવ્યું હતું કે GO:0006952 તે જ સમયે ટોચ પર છે, પરંતુ ઓછા DEG (11 અને 8) અને પ્રેફરન્શિયલ સક્રિયકરણ સાથે.મેન્ડેલૂપે GO:0006952 ના બે શિખરો 12 અને 48 HPI પર દર્શાવ્યા, બંને 12 જનીનો વહન કરે છે (પ્રથમ સક્રિય જનીનો સાથે, અને બીજું માત્ર દમનકારી જનીનો સાથે), જ્યારે 6 HPI (13 જનીનો) પર 22660 વસ્તીમાં વૃદ્ધિની સૌથી વધુ પ્રબળતા હતી.નિયમનએ નોંધવું જોઈએ કે આ શિખરોમાં GO:0006952 DEG ના 96.4% સમાન પ્રકારનો પ્રતિભાવ (ઉપર અથવા નીચે) ધરાવે છે, જે સામેલ જનીનોની સંખ્યામાં તફાવત હોવા છતાં સંરક્ષણ પ્રતિભાવોમાં નોંધપાત્ર ઓવરલેપ સૂચવે છે.GO:0006952 શબ્દથી સંબંધિત સિક્વન્સનું સૌથી મોટું જૂથ ભૂખમરો સ્ટ્રેસ-એસોસિએટેડ મેસેજ પ્રોટીન 22 (SAM22-જેવા)ને એન્કોડ કરે છે, જે વર્ગ 10 પેથોજેનેસિસ-સંબંધિત પ્રોટીન (PR-10) પ્રોટીન ક્લેડ અને કોર પ્રોટીન લેટેક્સ સાથે સંબંધિત છે.સમાન (MLP-જેવા) પ્રોટીન) પ્રોટીન (ફિગ. 3).બે જૂથો અભિવ્યક્તિની પ્રકૃતિ અને પ્રતિભાવની દિશામાં ભિન્ન હતા.SAM22-જેવા પ્રોટીનને એન્કોડ કરતા જનીનો પ્રારંભિક સમયના બિંદુઓ (6 અથવા 12 hpi) પર સુસંગત અને નોંધપાત્ર ઇન્ડક્શન દર્શાવતા હતા અને પ્રયોગના અંતે (48 hpi) સામાન્ય રીતે બિનપ્રતિભાવ આપતા હતા, જ્યારે MLP જેવા પ્રોટીને 6 hpi પર સંકલન દર્શાવ્યું હતું.hpi83A:476 અને મેન્ડેલુપ 48 hp/in પર, લગભગ તમામ અન્ય ડેટા પોઈન્ટ પ્રતિભાવવિહીન હતા.વધુમાં, SAM22-જેવા પ્રોટીન જનીનોની અભિવ્યક્તિ રૂપરેખાઓમાં તફાવતો એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારમાં અવલોકન કરાયેલ પરિવર્તનશીલતાને અનુસરે છે, કારણ કે વધુ પ્રતિરોધક રેખાઓ વધુ સમયના બિંદુઓ ધરાવે છે જે આ જનીનોને વધુ સંવેદનશીલ જનીનો કરતાં નોંધપાત્ર રીતે પ્રેરિત કરે છે.અન્ય LlR18A/B-જેવા PR-10 જનીન એ SAM22-જેવા પ્રોટીન જનીન સાથે ખૂબ જ સમાન અભિવ્યક્તિ પેટર્ન દર્શાવ્યું હતું.
જૈવિક પ્રક્રિયા શબ્દ "GO:0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવ" ના મુખ્ય ઘટકો અને Lanr1 અને AnMan એલીલ્સના ઉમેદવાર જનીનોની અભિવ્યક્તિની પેટર્ન ઓળખવામાં આવી હતી.લોગ2 સ્કેલ ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, લ્યુપિન ફીલ્ડ્સમાંથી મેળવેલ, વિઝેનિકા, પોલેન્ડ, 1999) અને તે જ સમયે નિયંત્રણ (શેમ-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચે લોગ2 મૂલ્યો (ફોલ્ડ ચેન્જ) દર્શાવે છે.નીચેની સાંકડી લીફ લ્યુપિન રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ અજાણ), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે), અને વસ્તી 22660 (સજાતીય).
વધુમાં, RNA-seq ઉમેદવાર જનીનો Lanr1 (TanjilG_05042) અને AnMan (TanjilG_12861) ની અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સનું મૂલ્યાંકન કરવામાં આવ્યું હતું (ફિગ. 3).TanjilG_05042 જનીન 83A:476 પર માત્ર પ્રથમ સમયના બિંદુ (6 hpi) પર નોંધપાત્ર પ્રતિભાવ (સક્રિયકરણ) દર્શાવે છે, જ્યારે TanjilG_12861 માત્ર બે ટાઈમ પોઈન્ટ્સ: 6 hpi (ડાઉન રેગ્યુલેશન) અને 24 hpi (6 hpi) પર મેન્ડેલૂપમાં નોંધપાત્ર હતું.સાથે.).એડજસ્ટેબલ)).
GO:0055114 "રેડોક્સ પ્રક્રિયા" શબ્દમાં સૌથી વધુ પ્રભાવિત જનીનો સાયટોક્રોમ P450 પ્રોટીન અને પેરોક્સિડેઝ (ફિગ. 4) ને એન્કોડ કરતા જનીનો હતા.6 HPI પર 83A:476 થી અલગ કરાયેલા નમૂનાઓ માટે, મહત્તમ અથવા ન્યૂનતમ લોગ2 (ફોલ્ડ ચેન્જ) મૂલ્યો (86.6% જનીનો માટે) સામાન્ય રીતે ઇનોક્યુલેટેડ અને કંટ્રોલ પ્લાન્ટ્સ વચ્ચે જોવામાં આવ્યા હતા, જે સેક્સને ઇનોક્યુલેટ કરવા માટે આ જીનોટાઇપના ઉચ્ચ પ્રતિભાવને પ્રકાશિત કરે છે.83A:476 એ સૌથી નોંધપાત્ર GO દર્શાવ્યું: 0055114 DEG 6 hpi (503 જનીનો), જ્યારે બાકીની રેખાઓ 48 hpi પર (બોરગીન, 31 જનીનો; મેન્ડેલુપ, 85 જનીનો; અને વસ્તી 22660, 78 જનીનો)).GO:0055114 પરિવારના મોટાભાગના જનીનોમાં, રસીકરણ (સક્રિયકરણ અને નિષેધ) માટે બે પ્રકારના પ્રતિભાવો જોવા મળ્યા હતા.રસપ્રદ વાત એ છે કે, મેન્ડેલુપમાં 48 એચપી પર GO: 0055114 શબ્દ માટે 97.6% જેટલા DEGs ઓળખવામાં આવ્યા છે, આ અવલોકનો સૂચવે છે કે, નોંધપાત્ર રીતે નાના સ્કેલ (એટલે ​​​​કે, પરિવર્તિત રેડોક્સ જનીનોની સંખ્યા, 85 વિરુદ્ધ 503) હોવા છતાં, વિલંબિત ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમના પ્રારંભિક ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિસાદની પેટર્ન સમાન છે. 76.બોરેગીન અને વસ્તી 22660 માં, આ કન્વર્જન્સ અનુક્રમે 51.6% અને 75.6% પર ઓછું છે.
જૈવિક પ્રક્રિયા "GO:0055114 રેડોક્સ પ્રક્રિયા" શબ્દના મુખ્ય ઘટકોની અભિવ્યક્તિની પેટર્ન જાહેર કરવામાં આવી હતી.લોગ2 સ્કેલ ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, લ્યુપિન ફીલ્ડ્સમાંથી મેળવેલ, વિઝેનિકા, પોલેન્ડ, 1999) અને તે જ સમયે નિયંત્રણ (શેમ-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચે લોગ2 મૂલ્યો (ફોલ્ડ ચેન્જ) દર્શાવે છે.નીચેની સાંકડી લીફ લ્યુપિન રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ અજાણ), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે), અને વસ્તી 22660 (સજાતીય).
83A:476 સી. લ્યુપિની (સ્ટ્રેન કોલ-08) સાથે ઇનોક્યુલેશન માટે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક પ્રતિસાદોમાં GO:0015979 "પ્રકાશસંશ્લેષણ" અને અન્ય સંબંધિત જૈવિક પ્રક્રિયાઓ (FIG. 5) શબ્દને આભારી જનીનોનું સંકલિત મૌન પણ સામેલ હતું.આ GO:0015979 DEG સેટમાં 105 જનીનો છે જે 83A:476 પર 6 hpi પર નોંધપાત્ર રીતે દબાયેલા હતા.આ સબસેટમાં, 22660 વસ્તીમાં એક જ સમયે 48 HPI અને 35 પર મેન્ડેલુપમાં 37 જનીનોને પણ ડાઉન રેગ્યુલેટ કરવામાં આવ્યા હતા, જેમાં બંને જીનોટાઇપ માટે સામાન્ય 19 ડીઇજીનો સમાવેશ થાય છે.ટર્મ GO: 0015979 થી સંબંધિત કોઈ DEGs કોઈપણ સંયોજનમાં (લાઈન x સમય) નોંધપાત્ર રીતે સક્રિય થયા નથી.
જૈવિક પ્રક્રિયા "GO:0015979 પ્રકાશસંશ્લેષણ" શબ્દના મુખ્ય ઘટકોની અભિવ્યક્તિની પેટર્ન જાહેર કરવામાં આવી હતી.લોગ2 સ્કેલ ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, લ્યુપિન ફીલ્ડ્સમાંથી મેળવેલ, વિઝેનિકા, પોલેન્ડ, 1999) અને તે જ સમયે નિયંત્રણ (શેમ-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચે લોગ2 મૂલ્યો (ફોલ્ડ ચેન્જ) દર્શાવે છે.નીચેની સાંકડી લીફ લ્યુપિન રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ અજાણ), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે), અને વસ્તી 22660 (સજાતીય).
વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણના પરિણામોના આધારે અને સંભવતઃ પેથોજેનિક ફૂગ સામે સંરક્ષણ પ્રતિસાદમાં સામેલ, સાત જનીનોના આ સમૂહને રીઅલ-ટાઇમ પીસીઆર (પૂરક કોષ્ટક S9) દ્વારા અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલના પરિમાણ માટે પસંદ કરવામાં આવ્યો હતો.
નિયંત્રણ (અનુકરણ) છોડ (પૂરક કોષ્ટકો S10, S11) ની તુલનામાં તમામ અભ્યાસ રેખાઓ અને સમય બિંદુઓમાં પુટેટિવ ​​પ્રોટીન જનીન TanjilG_10657 નોંધપાત્ર રીતે પ્રેરિત કરવામાં આવ્યું હતું.વધુમાં, TanjilG_10657 ની અભિવ્યક્તિ રૂપરેખા તમામ રેખાઓ માટે પ્રયોગ દરમિયાન વધતા જતા વલણને દર્શાવે છે.વસ્તી 22660 એ 24 HPI (ફિગ. 6a) પર 114-ગણો સક્રિયકરણ અને ઉચ્ચતમ સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સ્તર (4.4 ± 0.4) સાથે ઇનોક્યુલેશન માટે TanjilG_10657 ની સૌથી વધુ સંવેદનશીલતા દર્શાવી હતી.PR10 LlR18A પ્રોટીન જનીન TanjilG_27015 એ પણ તમામ રેખાઓ અને સમય બિંદુઓ પર સક્રિયકરણ દર્શાવ્યું, મોટાભાગના ડેટા પોઈન્ટ્સ (ફિગ. 6b) પર આંકડાકીય મહત્વ સાથે.TanjilG_10657 ની જેમ, TanjilG_27015 નું ઉચ્ચતમ સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સ્તર 22660 ઇનોક્યુલેટેડ વસ્તીમાં 24 HPI (19.5 ± 2.4) પર જોવા મળ્યું હતું.બોરેગીન 6 એચપીઆઈ (ફિગ. 6સી) સિવાયના તમામ લાઈનો અને તમામ સમયના બિંદુઓમાં એસિડ એન્ડોચિટીનેઝ જનીન TanjilG_04706 નોંધપાત્ર રીતે અપરેગ્યુલેટ કરવામાં આવ્યું હતું.તે 83A:476 (10.5 ગણા દ્વારા) પર પ્રથમ સમયના બિંદુ (6 HPI) પર મજબૂત રીતે પ્રેરિત કરવામાં આવ્યું હતું અને અન્ય લાઇનોમાં (6.6-7.5 ગણા દ્વારા) સાધારણ વધારો થયો હતો.પ્રયોગ દરમિયાન, TanjilG_04706 ની અભિવ્યક્તિ 83A:476 અને Boregine માં સમાન સ્તરે રહી, જ્યારે Mandelup અને Population 22660 માં તે નોંધપાત્ર રીતે વધી, જે પ્રમાણમાં ઊંચા મૂલ્યો (5.9 ± 1.5 અને 6.2 ± 1.5, અનુક્રમે) સુધી પહોંચી.એન્ડોગ્લુકેન-1,3-β-ગ્લુકોસિડેઝ-જેવા જનીન TanjilG_23384 એ પ્રથમ બે ટાઈમ પોઈન્ટ્સ (6 અને 12 hpi) પર વસ્તી 22660 (ફિગ. 6d) સિવાય તમામ લાઈનોમાં ઉચ્ચ સક્રિયકરણ દર્શાવ્યું હતું.Mandelup (2.7 ± 0.3) અને 83A:476 (1.5 ± 0.1) માં બીજી વખતના બિંદુ (12 hpi) પર TanjilG_23384 ના ઉચ્ચતમ સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સ્તરો જોવા મળ્યા હતા.24 HPI પર, તમામ અભ્યાસ કરેલ રેખાઓમાં TanjilG_23384 અભિવ્યક્તિ પ્રમાણમાં ઓછી હતી (0.04 ± 0.009 થી 0.44 ± 0.12 સુધી).
જથ્થાત્મક PCR દ્વારા જાહેર કરાયેલ પસંદ કરેલ જનીનો (ag) ની અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ.સંખ્યા 6, 12 અને 24 રસીકરણ પછીના કલાકો દર્શાવે છે.LanDExH7 અને LanTUB6 જનીનો નોર્મલાઇઝેશન માટે અને LanTUB6 નો ઉપયોગ આંતર-શ્રેણી માપાંકન માટે કરવામાં આવ્યો હતો.એરર બાર ત્રણ જૈવિક પ્રતિકૃતિઓ પર આધારિત પ્રમાણભૂત વિચલનનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે, જેમાંથી દરેક ત્રણ તકનીકી પ્રતિકૃતિઓની સરેરાશ છે. ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, 1999માં વિરઝેનિકા, પોલેન્ડમાં લ્યુપિન ફિલ્ડમાંથી મેળવેલ) અને નિયંત્રણ (મોક-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચેના અભિવ્યક્તિ સ્તરોમાં તફાવતનું આંકડાકીય મહત્વ ડેટા પોઇન્ટ્સ (*P મૂલ્ય <0.05, ***⤉ 0.05, ***⤉ મૂલ્ય <0.05, 0.05 મૂલ્ય) ઉપર ચિહ્નિત થયેલ છે. 01). ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, 1999માં વિરઝેનિકા, પોલેન્ડમાં લ્યુપિન ફિલ્ડમાંથી મેળવેલ) અને નિયંત્રણ (મોક-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચેના અભિવ્યક્તિ સ્તરોમાં તફાવતનું આંકડાકીય મહત્વ ડેટા પોઇન્ટ્સ (*P મૂલ્ય <0.05, ***⤉ 0.05, ***⤉ મૂલ્ય <0.05, 0.05 મૂલ્ય) ઉપર ચિહ્નિત થયેલ છે. 01). Статистическая значимость различий в уровнях экспрессии между инокулированными (કોલેટોટ્રીચમ લ્યુપિની, штамм Col-08, получен 9 рженице, Польша) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечена над точками данных (*значение P < 0,05, P <0,05, P*01*** ≤ 0,001). ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, 1999માં વિરઝેનિસ, પોલેન્ડમાં લ્યુપિન ફીલ્ડમાંથી મેળવેલ) અને નિયંત્રણ (શેમ-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચેના અભિવ્યક્તિ સ્તરોમાં આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવતો ડેટા પોઈન્ટ (*P મૂલ્ય < 0.05, **P-વેલ્યુ 0.05, **P-વેલ્યુ 0.05, **P-વેલ્યુ 1999) ઉપર નોંધવામાં આવ્યા છે. ).接种（કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, કોલ-08株, 1999年从波兰Wierzenica差异的统计学显着性标记在数据点上方（*P值< 0.05, **P 值≤ 0.01, ***P 值≤ 0.001).接种 （colletotrichum lupini ， color-08 株 ， 1999 年 波兰 波兰 wierzenica 的 羽扇 获得） 和 对照 弈湴湉鍤 和 对照差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值 <0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001). Статистически значимые различия в уровнях экспрессии между инокулированными (કોલેટોટ્રીચમ લ્યુપિની, штамм Col-08, полученнный Полученный Полученный Полученный, ольша, в 1999 г.) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечены над точками данных (* значение P < 0,0,01, *** значение P < 0,05,05,05 ение ≤ 0,001). ઇનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઇન કોલ-08, વર્ઝેનિસ, પોલેન્ડ, 1999માં લ્યુપિન ક્ષેત્રોમાંથી મેળવેલ) અને નિયંત્રણ (શેમ-ઇનોક્યુલેટેડ) છોડ વચ્ચેના અભિવ્યક્તિ સ્તરોમાં આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવતો ડેટા પોઈન્ટ (*P મૂલ્ય < 0.05 , ***P-value , **P-value <0.05 , **P-value 0.00 ≤0) ઉપર નોંધવામાં આવ્યા છે. 1).એનએલએલ રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ લેનર1 એલીલ વહન કરે છે), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાયગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, અજાણી આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ) અને વસ્તી 22660 (સંવેદનશીલ).
Lanr1 લોકસ પર ઉમેદવાર જનીન TanjilG_05042 એ RNA-seq અભ્યાસો (ફિગ. 6e) માંથી મેળવેલ પ્રોફાઇલ્સમાંથી સ્પષ્ટપણે અલગ અભિવ્યક્તિ પેટર્ન દર્શાવ્યું હતું.આ જનીનનું નોંધપાત્ર સક્રિયકરણ મેન્ડેલુપ અને 22660 વસ્તી (અનુક્રમે 39.7 અને 11.7 ગણા સુધી)માં જોવા મળ્યું હતું, પરિણામે પ્રમાણમાં ઉચ્ચ અભિવ્યક્તિ સ્તર (1.4 ± 0.14 અને 7.2 ± 1.3 સુધી, અનુક્રમે).83A:476 એ TanjilG_05042 જનીન (3.8-ગણા સુધી) ના કેટલાક અપગ્ર્યુલેશનને પણ જાહેર કર્યું હતું, જો કે, હાંસલ કરેલ સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સ્તર (0.044 ± 0.002) મેન્ડેલુપ અને 22660 વસ્તીમાં જોવા મળેલા કરતાં 30 ગણા કરતાં વધુ ઓછા હતા.qPCR દ્વારા પૃથ્થકરણમાં મોક-વેક્સિનેટેડ (નિયંત્રણ) ચલોમાં જીનોટાઇપ્સ વચ્ચેના અભિવ્યક્તિ સ્તરોમાં નોંધપાત્ર તફાવત દર્શાવવામાં આવ્યો હતો, જે 22660 અને 83A:476 વસ્તી વચ્ચે 58-ગણા તફાવત સુધી પહોંચે છે, તેમજ 22660 અને 22660 વસ્તી વચ્ચે. બે ગણો અને બોડલ-અપ વચ્ચેનો તફાવત હાંસલ કરવામાં આવ્યો હતો.
AnMan લોકસ, TanjilG_12861 ખાતે ઉમેદવાર જનીન, 83A:476 અને મેન્ડેલુપમાં રસીકરણના પ્રતિભાવમાં સક્રિય થયું હતું, તે 22660 વસ્તીમાં તટસ્થ હતું, અને બોરેગીન (ફિગ. 6f) માં તેને નિયંત્રિત કરવામાં આવ્યું હતું.ઇનોક્યુલેટેડ 83A: 476 (0.14±0.01) માં TanjilG_12861 જનીનની સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સૌથી વધુ હતી.17.4 kDa વર્ગ I હીટ શોક પ્રોટીન જનીન TanjilG_05080 HSP17.4 એ તમામ અભ્યાસ કરેલ તાણ અને સમય બિંદુઓ (ફિગ. 6g) માં નીચા સંબંધિત અભિવ્યક્તિ સ્તર દર્શાવ્યા હતા.22660 વસ્તીમાં સૌથી વધુ મૂલ્ય 24 HPI પર જોવા મળ્યું હતું (0.14 ± 0.02, રસીકરણના પ્રતિભાવમાં આઠ ગણો વધારો).
જનીન અભિવ્યક્તિ રૂપરેખાઓની સરખામણી (ફિગ. 7) TanjilG_10657 અને અન્ય ચાર જનીનો વચ્ચે ઉચ્ચ સહસંબંધ જાહેર કરે છે: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.7), અને TanjilG_05042 (r = 0.7).આવા પરિણામો સંરક્ષણ પ્રતિભાવો દરમિયાન આ જનીનોના સહ-નિયમનને સૂચવી શકે છે.TanjilG_12861 અને TanjilG_23384 જનીનો અન્ય જનીનોની તુલનામાં નીચા પીયર્સન સહસંબંધ ગુણાંક મૂલ્યો (અનુક્રમે 0.08 થી 0.43 અને -0.19 થી 0.28) સાથે વિવિધ અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ દર્શાવે છે.
જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ વચ્ચેના સહસંબંધો માત્રાત્મક PCR નો ઉપયોગ કરીને શોધી કાઢવામાં આવ્યા હતા.નીચેની સાંકડી લીફ લ્યુપિન રેખાઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું: 83A:476 (પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ Lanr1 એલીલ વહન કરે છે), મેન્ડેલુપ (સાધારણ પ્રતિરોધક, હોમોઝાઇગસ એનમેન એલીલ વહન કરે છે), બોરેગીન (પ્રતિરોધક, આનુવંશિક પૃષ્ઠભૂમિ અજાણી), અને વસ્તી 22660 (sceptible).ત્રણ ટાઈમ પોઈન્ટની ગણતરી કરવામાં આવી હતી (ઈનોક્યુલેશન પછી 6, 12 અને 24 કલાક), જેમાં ઈનોક્યુલેટેડ (કોલેટોટ્રીચમ લ્યુપિની, સ્ટ્રેઈન કોલ-08, 1999માં પોલેન્ડના વિરઝેનીસમાં લ્યુપિન ક્ષેત્રોમાંથી મેળવેલ) અને નિયંત્રણ (શેમ-ઈનોક્યુલેટેડ) છોડનો સમાવેશ થાય છે.સ્કેલ પીયર્સન સહસંબંધ ગુણાંકનું મૂલ્ય દર્શાવે છે.
6 હોર્સપાવર પ્રતિ ઇંચના દરે મેળવેલા ડેટાના આધારે, WGCNA 9981 DEG પર કરવામાં આવ્યું હતું જે પ્રારંભિક સંરક્ષણ પ્રતિભાવો પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરવા માટે ઇનોક્યુલેટેડ અને કંટ્રોલ પ્લાન્ટ્સની સરખામણી કરીને ઓળખવામાં આવ્યું હતું (પૂરક કોષ્ટક S12).જીનોટાઇપ્સ અને પ્રાયોગિક પ્રકારો વચ્ચે સહસંબંધિત (સકારાત્મક અથવા નકારાત્મક) અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ સાથે બાવીસ જનીન મોડ્યુલો (ક્લસ્ટર્સ) મળી આવ્યા હતા. સરેરાશ, જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તરો 83A:476 > મેન્ડેલુપ > બોરેગીન > વસ્તી 22660 ક્રમમાં ઉતરતા હતા (જોકે, આ વલણ નિયંત્રણ છોડમાં વધુ મજબૂત હતું). સરેરાશ, જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તરો 83A:476 > મેન્ડેલુપ > બોરેગીન > વસ્તી 22660 ક્રમમાં ઉતરતા હતા (જોકે, આ વલણ નિયંત્રણ છોડમાં વધુ મજબૂત હતું). В среднем уровни экспрессии генов снижались в порядке 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 трольных растений). સરેરાશ, જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તર 83A:476 > મેન્ડેલપ > બોરેગીન > વસ્તી 22660 (બંને ચલોમાં, જોકે, નિયંત્રણ છોડમાં આ વલણ વધુ મજબૂત હતું) માં ઘટાડો થયો છે.平均而言，基因表达水平按83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660植物中更强).平均 而 言, 基因 水平 按 83a: 476> mandelup> boregine> વસ્તી 22660更) ... ... ... ... В среднем уровни экспрессии генов снижались в ряду 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 х растений). સરેરાશ, શ્રેણી 83A:476 > મેન્ડેલુપ > બોરેજીન > વસ્તી 22660 માં જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તરમાં ઘટાડો થયો (જો કે, બંને પ્રકારોમાં, નિયંત્રણ છોડમાં આ વલણ વધુ મજબૂત હતું).રસીકરણના પરિણામે જનીન અભિવ્યક્તિના અપરેગ્યુલેશનમાં પરિણમ્યું, ખાસ કરીને મોડ્યુલો 18, 19, 14, 6 અને 1 (અસરના ઉતરતા ક્રમમાં), નકારાત્મક નિયમન (દા.ત. મોડ્યુલ 9 અને 20) અથવા તટસ્થ અસરો સાથે (દા.ત. મોડ્યુલ 11, 22, 8 અને 13).GO શબ્દ સંવર્ધન વિશ્લેષણ (પૂરક કોષ્ટક S13) એ ઇનોક્યુલેટેડ મોડ્યુલ (18) માટે qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_233384, TanjilG_233874, TanjilG_233384, TanjilG_04706, TanjilG_233874, TanjilG_04706, TanjilG_233874, 5006952) સહિત મહત્તમ સક્રિયકરણ સાથે "GO: 0006952 રક્ષણાત્મક પ્રતિભાવો" જાહેર કર્યા. ઘણા ઇનોક્યુલેટ સૌથી દબાયેલા પ્રકાશસંશ્લેષણ મોડ્યુલો (9).મોડ્યુલ 18 કોન્સેન્ટ્રેટર (ફિગ. 8) એ PR-10-જેવા LlR18B પ્રોટીનને એન્કોડ કરતા TanjilG_26536 જનીન તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું, અને મોડ્યુલ 9 કોન્સેન્ટ્રેટરને TanjilG_28955 જનીન તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું જે ફોટોસિસ્ટમ II PsbQ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે.ઉમેદવાર એન્થ્રેકનોઝ રેઝિસ્ટન્સ જનીન Lanr1, TanjilG_05042, મોડ્યુલ 22 (ફિગ. 9) માં જોવા મળ્યું હતું અને તે "GO:0044260 સેલ્યુલર મેક્રોમોલેક્યુલર મેટાબોલિક પ્રક્રિયાઓ" અને "GO:0006355 ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ ટેમ્પલ રેગ્યુલેશન ડીએનએજી 2, ટેનજીલ 2012નું ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેશન" સાથે સંકળાયેલું છે.જનીન હીટ સ્ટ્રેસ ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર A-4a (HSFA4a)ને એન્કોડ કરે છે.
"GO: 0006952 સંરક્ષણ પ્રતિભાવો" સાથે અતિશય પ્રસ્તુત જૈવિક પ્રક્રિયાના શબ્દો સાથે મોડ્યુલોના જનીન સહ-અભિવ્યક્તિનું ભારિત નેટવર્ક વિશ્લેષણ.qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 અને TanjilG_27015) દ્વારા વિશ્લેષણ કરાયેલા ચાર જનીનોને પ્રકાશિત કરવા માટે લિગેશનને સરળ બનાવવામાં આવ્યું હતું.
"GO: 0006355: ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેશન, DNA ટેમ્પ્લેટિંગ" અને ઉમેદવાર એન્થ્રેકનોઝ રેઝિસ્ટન્સ જનીન Lanr1 TanjilG_05042 ને વહન કરતા એક મોડ્યુલના જનીન સહ-અભિવ્યક્તિનું ભારિત નેટવર્ક વિશ્લેષણ.TanjilG_05042 જનીન અને કેન્દ્રીય TanjilG_01212 જનીનને અલગ કરવા માટે લિગેશનને સરળ બનાવવામાં આવ્યું હતું.
ઑસ્ટ્રેલિયામાં એકત્ર કરાયેલ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર સ્ક્રિનિંગ દર્શાવે છે કે મોટાભાગની શરૂઆતમાં છોડવામાં આવેલી કલ્ટીવર્સ સંવેદનશીલ હતી;કાલ્યા, કોરોમપ અને મેન્ડેલુપને સાધારણ પ્રતિરોધક તરીકે વર્ણવવામાં આવ્યા છે, જ્યારે વોંગા, તંજીલ અને 83A:476 ને અત્યંત પ્રતિરોધક 26,27,31 તરીકે વર્ણવવામાં આવ્યા છે.સમાન પ્રતિરોધક એલીલ હતું, જેને Lanr1 નામ આપવામાં આવ્યું હતું, અને કોરોમપ અને મેન્ડેલુપ પાસે એક અલગ એલીલ હતું, જેને AnMan10, 26, 39 નિયુક્ત કરવામાં આવ્યું હતું, જ્યારે કાલ્યા એક અલગ એલીલ પર પસાર થયા હતા., Lanr2.જર્મનીમાં એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર માટે સ્ક્રિનિંગના પરિણામે લેન્ર1 સિવાયના ઉમેદવાર એલીલ સાથે પ્રતિરોધક રેખા Bo7212ની ઓળખ થઈ, જેને LanrBo36 નામ આપવામાં આવ્યું છે.
અમારા અભ્યાસે પરીક્ષણ કરેલ જર્મપ્લાઝમમાં Lanr1 એલીલની ખૂબ જ ઓછી આવર્તન (લગભગ 6%) જાહેર કરી.આ અવલોકન Anseq3 અને Anseq4 માર્કર્સનો ઉપયોગ કરીને પૂર્વ યુરોપીયન જર્મપ્લાઝમની તપાસના પરિણામો સાથે સુસંગત છે, જે દર્શાવે છે કે Lanr1 એલીલ માત્ર બે બેલારુસિયન રેખાઓમાં હાજર છે.આ સૂચવે છે કે સ્થાનિક સંવર્ધન કાર્યક્રમો દ્વારા Lanr1 એલીલનો હજુ સુધી વ્યાપકપણે ઉપયોગ થતો નથી, ઓસ્ટ્રેલિયાથી વિપરીત, જ્યાં તે માર્કર-સહાયિત સંવર્ધન માટેના મુખ્ય એલીલ્સમાંનું એક છે.આ ઓસ્ટ્રેલિયન અહેવાલની તુલનામાં યુરોપીયન ક્ષેત્રની પરિસ્થિતિઓમાં Lanr1 એલીલ દ્વારા પ્રદાન કરવામાં આવેલ નીચલા સ્તરના પ્રતિકારને કારણે હોઈ શકે છે.વધુમાં, ઑસ્ટ્રેલિયામાં વધુ વરસાદવાળા વિસ્તારોમાં એન્થ્રેકનોઝના અભ્યાસોએ દર્શાવ્યું છે કે લૅનઆર1 એલીલ દ્વારા મધ્યસ્થી કરવામાં આવતી પ્રતિકારક પ્રતિક્રિયાઓ હવામાન પરિસ્થિતિઓમાં અસરકારક ન હોઈ શકે જે રોગકારક 19,42ના વિકાસ અને ઝડપી વિકાસની તરફેણ કરે છે.વાસ્તવમાં, હાલના અભ્યાસમાં, એન્થ્રેકનોઝના કેટલાક લક્ષણો Lanr1 એલીલ વહન કરતા જીનોટાઇપ્સમાં પણ જોવા મળ્યા હતા, જે સૂચવે છે કે સી. લ્યુપિનીના વિકાસ માટે શ્રેષ્ઠ પરિસ્થિતિઓમાં પ્રતિકાર અદૃશ્ય થઈ શકે છે.વધુમાં, Anseq3 અને Anseq4 માર્કર્સની હાજરીના ખોટા હકારાત્મક અર્થઘટન, જે Lanr1 લોકસથી આશરે 1 સેમી છે, શક્ય છે 28,30,43.
અમારો અભ્યાસ દર્શાવે છે કે 83A:476, Lanr1 એલીલ વહન કરે છે, પ્રથમ વિશ્લેષિત સમય બિંદુ (6 hpi) પર મોટા પાયે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ રીપ્રોગ્રામિંગ સાથે C. લ્યુપિની ઇનોક્યુલેશનને પ્રતિસાદ આપે છે, જ્યારે મેન્ડેલુપમાં, AnMan એલીલ વહન કરતા, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક પ્રતિભાવો ખૂબ પાછળથી જોવા મળ્યા હતા.(24 થી 48 એચપી સુધી).સંરક્ષણ પ્રતિભાવોમાં આ ટેમ્પોરલ ભિન્નતાઓ રોગના લક્ષણોમાં તફાવત સાથે સંકળાયેલા છે, જે પ્રતિકારના સફળ પ્રતિભાવ માટે પ્રારંભિક પેથોજેન ઓળખના મહત્વને પ્રકાશિત કરે છે.છોડની પેશીઓને સંક્રમિત કરવા માટે, એન્થ્રેક્સ બીજકણને યજમાન સપાટી પર ઘણા વિકાસના તબક્કામાંથી પસાર થવું જોઈએ, જેમાં અંકુરણ, કોષનું વિભાજન અને એપ્રેસોરિયમની રચનાનો સમાવેશ થાય છે.એપેન્ડેજ એ ચેપી માળખું છે જે યજમાનની સપાટી સાથે જોડાયેલું છે અને યજમાન પેશીઓમાં પ્રવેશને સરળ બનાવે છે.આમ, વટાણાના અર્કમાં સી. ગ્લોઓસ્પોરીયોઇડ્સના બીજકણ 75-90 મિનિટના સેવન પછી ન્યુક્લિયસનું પ્રથમ વિભાજન, 90-120 મિનિટ પછી જર્મ ટ્યુબની રચના અને 4 કલાક પછી દમન દર્શાવે છે.કેરી C. ગ્લોઓસ્પોરીયોઇડ્સ 3 કલાકના સેવન પછી 40% થી વધુ કોનિડિયલ અંકુરણ દર્શાવે છે અને 4 કલાક પછી લગભગ 20% એપ્રેસર્સની રચના દર્શાવે છે.C. gloeosporioides ના વાઇર્યુલન્સ-સંબંધિત CAP20 જનીન 4 કલાક 46 મિનિટ પછી CAP20 પ્રોટીનની ઊંચી સાંદ્રતા સાથે એવોકાડો સપાટી મીણમાં 3.5 કલાકના સેવન પછી એપિફાઇટ-રચના કોનિડિયામાં ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ પ્રવૃત્તિ દર્શાવે છે.એ જ રીતે, સી. ટ્રાઇફોલીમાં મેલાનિન જૈવસંશ્લેષણ જનીનોની પ્રવૃત્તિ 2-કલાકના સેવન દરમિયાન પ્રેરિત કરવામાં આવી હતી અને 1 કલાક પછી એપ્રેસોરિયમની રચના કરવામાં આવી હતી.પાંદડાની પેશીઓના અભ્યાસો દર્શાવે છે કે સી. એક્યુટેટમ સાથે ઇનોક્યુલેટ કરાયેલ સ્ટ્રોબેરીમાં પ્રથમ દમન 8 એચપીઆઈ પર હોય છે, જ્યારે સી. કોકોડ્સ સાથે ઇનોક્યુલેટ કરાયેલા ટામેટાંમાં 4 hpi48,49 પર પ્રથમ દમન હોય છે.કોલેટોટ્રિચમ એસપીપીના સમયના ધોરણ સાથે મોટે ભાગે સુસંગત.ચેપી પ્રક્રિયા.83A:476 માટે ઝડપી સંરક્ષણ પ્રતિસાદો આ લાઇનમાં છોડના પ્રતિકાર અને અસરકર્તા-ટ્રિગર્ડ ઇમ્યુનિટી (ETI) જનીનોની સંડોવણી સૂચવે છે, જ્યારે મેન્ડેલુપના વિલંબિત પ્રતિભાવો માઇક્રો-સંબંધિત મોલેક્યુલર પેટર્ન-ટ્રિગર્ડ ઇમ્યુનિટી (MTI) પૂર્વધારણાને સમર્થન આપે છે.વિલંબિત પ્રતિભાવમાં અપ- અથવા ડાઉન-રેગ્યુલેટેડ જનીનો વચ્ચેનો આંશિક ઓવરલેપ પણ આ ખ્યાલને સમર્થન આપે છે, કારણ કે ETI ને ઘણી વખત પ્રવેગક અને ઉન્નત MTI પ્રતિભાવ તરીકે ગણવામાં આવે છે જે ચેપના સ્થળે પ્રોગ્રામ કરેલ કોષ મૃત્યુમાં પરિણમે છે, જેને એનાફિલેક્ટિક શોક 51,52 તરીકે ઓળખવામાં આવે છે.
જીન ઓન્ટોલોજી GO:0006952 "ડિફેન્સ રિસ્પોન્સ" શબ્દને વધુ રજૂ કરાયેલા મોટા ભાગના જનીનો એ તણાવ-પ્રેરિત ઉપવાસ સંદેશ 22 પ્રોટીન (SAM22 જેવું જ) અને સાત મુખ્ય લેટેક્સ પ્રોટીન-લાઈક્સ (MLPs)ના 11 હોમોલોગ્સ છે.પ્રોટીન 31, 34, 43 અને 423 જેવા ક્રમ સમાનતા દર્શાવે છે.SAM22-જેવા જનીનોએ નોંધપાત્ર સક્રિયકરણ દર્શાવ્યું હતું જે લાંબા સમય સુધી ચાલ્યું હતું, જે એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર (83A:476 અને બોરેગીન)ના વધેલા સ્તરને દર્શાવે છે.જો કે, MLP-જેવા જનીનો માત્ર ઉમેદવાર પ્રતિકારક એલીલ (83A:476/Lanr1 6 hpi પર અને 24 hpi પર મેન્ડેલુપ/AnMan) વહન કરતી રેખાઓમાં જ ડાઉન રેગ્યુલેટ કરવામાં આવ્યા હતા.એ નોંધવું જોઈએ કે તમામ ઓળખાયેલ SAM22-જેવા હોમોલોગ્સ લગભગ 105 kbમાં ફેલાયેલા જનીન ક્લસ્ટરમાંથી ઉદ્દભવે છે, જ્યારે MLP-જેવા જનીનો જીનોમના અલગ પ્રદેશોમાંથી ઉદ્દભવે છે.આવા SAM22-જેવા જનીનોનું સંકલિત સક્રિયકરણ ડાયપોર્થેટોક્સિકા ઇનોક્યુલેશનના NLL પ્રતિકારના અમારા અગાઉના અભ્યાસમાં પણ જોવા મળ્યું હતું, જે સૂચવે છે કે તેઓ સંરક્ષણ પ્રતિભાવના આડા ઘટકોમાં સામેલ છે.આ નિષ્કર્ષને સેલિસિલિક એસિડ, ફંગલ ઇન્ડ્યુસર્સ અથવા હાઇડ્રોજન પેરોક્સાઇડ સાથે ઇજા અથવા સારવાર માટે SAM22-જેવા જનીનોના હકારાત્મક પ્રતિભાવના અહેવાલો દ્વારા પણ સમર્થન મળે છે.
MLP જેવા જનીનો છોડની ઘણી પ્રજાતિઓમાં બેક્ટેરિયલ, વાયરલ અને પેથોજેનિક ફંગલ ઇન્ફેક્શન સહિત વિવિધ અજૈવિક અને જૈવિક તાણને પ્રતિભાવ આપતા દર્શાવવામાં આવ્યા છે55.છોડ અને પેથોજેન્સ વચ્ચેની અમુક ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓના પ્રતિભાવની દિશાઓ મજબૂત રીતે વધી રહી છે (એટલે ​​​​કે, વર્ટીસિલિયમ ડાહલિયા સાથે કપાસના ઉપદ્રવ દરમિયાન) નોંધપાત્ર રીતે ઘટતી (એટલે ​​​​કે, અલ્ટરનેરિયા એસપીપી સાથે સફરજનના ઝાડના ચેપ પછી.) 56,57 સુધી.એમએલપી-જેવા 423 જનીનનું નોંધપાત્ર ડાઉન રેગ્યુલેશન એફ. નાઇજર ચેપ સામે એવોકાડો સંરક્ષણ દરમિયાન અને સફરજનના વૃક્ષ બોટ્રિઓસ્ફેરિયા બેરેન્જેરિયાના એફના ચેપ દરમિયાન જોવા મળ્યું છે.cn.પિરિકોલા અને અલ્ટરનેરિયા અલ્ટરનેટા એપલ પેથોટાઇપ્સ છે 58,59.વધુમાં, MLP-જેવા 423 જનીનને વધારે પડતું એક્સપ્રેસ કરતી સફરજન કેલીમાં પ્રતિકાર-સંબંધિત જનીનોની અભિવ્યક્તિ ઓછી હતી અને તે ફૂગના ચેપ માટે વધુ સંવેદનશીલ હતા59.ફ્યુઝેરિયમ ઓક્સિસ્પોરમ એફને પગલે, પ્રતિરોધક સામાન્ય બીન જર્મપ્લાઝમમાં એમએલપી-જેવું 423 જનીન પણ દબાવવામાં આવ્યું હતું.cn.બીન ચેપ 60.
અમારા RNA-seq અભ્યાસમાં ઓળખાયેલા PR-10 પરિવારના અન્ય સભ્યો અપગ્ર્યુલેશનના પ્રતિભાવમાં LlR18A અને LlR18B જનીનો તેમજ લિપિડ ટ્રાન્સફર પ્રોટીન DIR1 માટે અપરેગ્યુલેટેડ (1 જનીન) અથવા ડાઉનરેગ્યુલેટેડ (3 જનીન) જનીન હતા..વધુમાં, WGCNA આ મોડ્યુલમાં LlR18B જનીનને હબ તરીકે હાઇલાઇટ કરે છે, જે રસીકરણ માટે અત્યંત સંવેદનશીલ છે અને અનેક રક્ષણાત્મક પ્રતિભાવ જનીનો ધરાવે છે.LlR18A અને LlR18B જનીનો પેથોજેનિક બેક્ટેરિયાના પ્રતિભાવમાં પીળા લ્યુપિન પાંદડામાં પ્રેરિત થયા હતા, તેમજ D. ટોક્સિકા ઇનોક્યુલેશન પછી NLL દાંડીમાં, જ્યારે આ જનીનોના ચોખા હોમોલોગ, RSOsPR10, ઝડપથી પ્રેરિત થયા હતા, જે ફંગલ એસિડ ચેપ 56 માં સંડોવાયેલા ફૂગના ચેપના સંકેતો દ્વારા ઝડપથી પ્રેરિત થયા હતા. DIR1 જનીન બિન-વિશિષ્ટ લિપિડ ટ્રાન્સપોર્ટ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે જે પ્રણાલીગત હસ્તગત પ્રતિકાર (SAR) ની શરૂઆત માટે જરૂરી છે.રક્ષણાત્મક પ્રતિક્રિયાઓના વિકાસ સાથે, DIR1 પ્રોટીન દૂરના અવયવોમાં SAR પ્રેરિત કરવા માટે ફ્લોમ દ્વારા ચેપના કેન્દ્રમાંથી પરિવહન થાય છે.રસપ્રદ વાત એ છે કે, TanjilG_02313 DIR1 જનીન 84A:476 અને વસ્તી 22660 લાઇનમાં પ્રથમ સમયે નોંધપાત્ર રીતે પ્રેરિત કરવામાં આવ્યું હતું, પરંતુ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર માત્ર 84A:476 લાઇનમાં સફળતાપૂર્વક વિકસિત થયો હતો.આ NLL માં DIR1 જનીનનું કેટલાક સબફંક્શનલાઇઝેશન સૂચવી શકે છે, કારણ કે બાકીના ત્રણ હોમોલોગ્સ માત્ર 83A:476 લાઇનમાં 6 hpi પર ઇનોક્યુલેશનને પ્રતિભાવ આપે છે, અને આ પ્રતિભાવ નીચે તરફ નિર્દેશિત કરવામાં આવ્યો હતો.
અમારા અભ્યાસમાં, "GO:0055114 Redox પ્રક્રિયા" નામની જૈવિક પ્રક્રિયાને અનુરૂપ સૌથી સામાન્ય ઘટકો સાયટોક્રોમ P450 પ્રોટીન, પેરોક્સિડેઝ, લિનોલીક એસિડ 9S-/13S-લિપોક્સિજેનેઝ અને 1-એમિનોસાયક્લોપ્રોપેન-1-કાર્બોક્સિલિક એસિડ ઓક્સિડેઝ હતા.વધુમાં, અમારું WGCNA HSFA4a હોમોલોગને Lanr1 રેઝિસ્ટન્સ જનીન ઉમેદવાર TanjilG_05042 જેવા મોડ્યુલો વહન કરતા હબ તરીકે વ્યાખ્યાયિત કરે છે.HSFA4a એ છોડમાં પરમાણુ ટ્રાન્સક્રિપ્શનના રેડોક્સ-આધારિત નિયમનનો એક ઘટક છે.
સાયટોક્રોમ P450 પ્રોટીન એ ઓક્સિડોરેડક્ટેસિસ છે જે પ્રાથમિક અને ગૌણ ચયાપચયમાં NADPH અને/અથવા O2-આશ્રિત હાઇડ્રોક્સિલેશન પ્રતિક્રિયાઓને ઉત્પ્રેરિત કરે છે, જેમાં ઝેનોબાયોટિક્સના ચયાપચય, તેમજ હોર્મોન્સ, ફેટી એસિડ્સ, સ્ટીરોલ્સ, કોષ દિવાલના ઘટકો, બાયોપોલિમર્સ અને 6 ની સંકલનક્ષમતા અભ્યાસમાં બાયોપોલિનસિસનું રક્ષણ કરે છે. મોટી સંખ્યામાં બદલાયેલા હોમોલોગ્સ (37) અને ચોક્કસ જનીનો વચ્ચેના પ્રતિભાવ પેટર્નમાં તફાવતને કારણે પ્લાન્ટ સાયટોક્રોમ P450 ફંક્શન -10.6 લોગ2 (ફોલ્ડ ચેન્જ) થી ઘટાડીને 5.7 કરવામાં આવ્યું હતું, જે ઉપરની તરફનું પુનરાવર્તન દર્શાવે છે..આટલા મોટા પ્રોટીન સુપરફેમિલીમાં NLL જનીનોના પુટેટિવ ​​બાયોલોજિકલ ફંક્શનને સ્પષ્ટ કરવા માટે માત્ર RNA-seq ડેટાનો ઉપયોગ કરવો અત્યંત અનુમાનજનક હશે.જો કે, એ નોંધવું યોગ્ય છે કે કેટલાક સાયટોક્રોમ P450 જનીનો રોગકારક ફૂગ અથવા બેક્ટેરિયાના વધતા પ્રતિકાર સાથે સંકળાયેલા છે, જેમાં એલર્જીક પ્રતિક્રિયાઓ 69,70,71માં યોગદાનનો સમાવેશ થાય છે.
વર્ગ III પેરોક્સિડેસિસ એ છોડના વિકાસ અને વિકાસ દરમિયાન મેટાબોલિક પ્રક્રિયાઓની વિશાળ શ્રેણીમાં તેમજ ખારાશ, દુષ્કાળ, ઉચ્ચ પ્રકાશની તીવ્રતા અને પેથોજેન હુમલા72 જેવા પર્યાવરણીય તાણના પ્રતિભાવમાં સામેલ મલ્ટિફંક્શનલ પ્લાન્ટ એન્ઝાઇમ છે.પેરોક્સિડેસિસ એન્થ્રેસીસ સાથે છોડની ઘણી પ્રજાતિઓની ક્રિયાપ્રતિક્રિયામાં સામેલ છે, જેમાં સ્ટાયલોસેન્થેસ હ્યુમિલિસ અને સી. ગ્લોઓસ્પોરીઓઇડ્સ, લેન્સ ક્યુલિનિસ અને સી. ટ્રંકેટમ, ફેસોલસ વલ્ગારિસ અને સી. લિન્ડેમુથિયનમ, કુક્યુમિસ સેટીવસ અને સી. લેજેનેરિયમ 73,754, 76.પ્રતિભાવ ખૂબ જ ઝડપી હોય છે, કેટલીકવાર 4 HPI પર પણ, ફૂગ છોડની પેશીમાં પ્રવેશ કરે તે પહેલાં73.પેરોક્સિડેઝ જનીન ડી. ટોક્સિકા એનએલએલ ઇનોક્યુલેશનને પણ પ્રતિભાવ આપે છે.ઓક્સિડેટીવ વિસ્ફોટને નિયંત્રિત કરવા અથવા ઓક્સિડેટીવ તાણને દૂર કરવા માટેના તેમના વિશિષ્ટ કાર્યો ઉપરાંત, પેરોક્સિડેસેસ ચોક્કસ સંયોજનોના લિગ્નિફિકેશન, સબ્યુનિટ અથવા ક્રોસ-લિંકિંગ દરમિયાન કોષ દિવાલના મજબૂતીકરણ પર આધારિત ભૌતિક અવરોધો બનાવીને રોગકારક વૃદ્ધિમાં દખલ કરી શકે છે.સિલિકોમાં આ કાર્યનું શ્રેય TanjilG_03329 જનીનને આપી શકાય છે જે પુટેટિવ ​​લિગ્નિન-રચના કરનાર આયન પેરોક્સિડેઝને એન્કોડ કરે છે જે 6 HPI પર 83A:476 પ્રતિરોધક રેખામાં અમારા અભ્યાસમાં નોંધપાત્ર રીતે અપરેગ્યુલેટ કરવામાં આવ્યું હતું, પરંતુ અન્ય તાણ અને સમય બિંદુઓમાં નહીં કે જેણે પ્રતિસાદ આપ્યો ન હતો.
લિનોલીક એસિડનું 9S-/13S-લિપોક્સિજેનેઝ એ લિપિડ જૈવસંશ્લેષણ78ના ઓક્સિડેટીવ માર્ગનું પ્રથમ પગલું છે.આ પાથવેના ઉત્પાદનો છોડના સંરક્ષણમાં બહુવિધ કાર્યો કરે છે, જેમાં કોલોઝ અને પેક્ટીન ડિપોઝિટની રચના દ્વારા કોષ દિવાલને મજબૂત બનાવવી, અને પ્રતિક્રિયાશીલ ઓક્સિજન પ્રજાતિઓ79,80,81,82,83ના ઉત્પાદન દ્વારા ઓક્સિડેટીવ તણાવનું નિયમન સામેલ છે.હાલના અભ્યાસમાં, લિનોલીક એસિડ 9S-/13S-લિપોક્સિજેનેઝની અભિવ્યક્તિ તમામ જાતોમાં બદલાઈ હતી, પરંતુ સંવેદનશીલ વસ્તી 22660માં, વિવિધ સમયે અપગ્ર્યુલેશન પ્રવર્તે છે, જ્યારે પ્રતિરોધક લેન્ર1 અને એનમેન એલીલ વહન કરતી તાણમાં, તે આ વિવિધતાઓમાં રક્ષણાત્મક લિપોક્સીજેનેઝના સ્તરો પર ભાર મૂકે છે. .
1-એમિનોસાયક્લોપ્રોપેન-1-કાર્બોક્સિલેટ ઓક્સિડેઝ (ACO) હોમોલોગ નોંધપાત્ર રીતે અપરેગ્યુલેટેડ (9 જનીનો) અથવા ડાઉનરેગ્યુલેટેડ (2 જનીનો) જ્યારે લ્યુપિન સાથે ઇનોક્યુલેટ કરવામાં આવે છે.બે અપવાદો સાથે, આ તમામ પ્રતિભાવો 6 hp પર આવ્યા.83A:476 પર.ACO પ્રોટીન દ્વારા મધ્યસ્થી કરવામાં આવતી એન્ઝાઇમેટિક પ્રતિક્રિયા એ ઇથિલિન ઉત્પાદનમાં દર-મર્યાદિત પગલું છે અને તેથી તે ખૂબ જ નિયંત્રિત છે84.ઇથિલિન એ છોડનું હોર્મોન છે જે છોડના વિકાસ અને અબાયોટિક અને જૈવિક તાણની પરિસ્થિતિઓના પ્રતિભાવને નિયંત્રિત કરવામાં વિવિધ ભૂમિકા ભજવે છે.ACO ટ્રાન્સક્રિપ્શનનું ઇન્ડક્શન અને ઇથિલિન સિગ્નલિંગ પાથવેનું સક્રિયકરણ પ્રતિક્રિયાશીલ ઓક્સિજન પ્રજાતિઓ અને ફાયટોએલેક્સિનના ઉત્પાદનને નિયંત્રિત કરીને હેમિબાયોટ્રોફિક ફૂગ ઓરીઝા ઓરીઝા સામે ચોખાના પ્રતિકારને વધારવામાં સામેલ છે.આ અભ્યાસમાં નોંધાયેલ 83A:476 લાઇનમાં ACO હોમોલોગ્સના નોંધપાત્ર અપગ્ર્યુલેશનની પૃષ્ઠભૂમિ સામે, M. oryzae અને C. lupini88,89 વચ્ચે જોવા મળેલી એક ખૂબ જ સમાન પાંદડાની ચેપ પ્રક્રિયા, NLL એન્થ્રેકનોઝ ઇથિલિનને મોનોલવે સેન્ટ્રલ સિગ્નલિંગ સ્ટેપમાં પ્રતિકાર પ્રદાન કરવાની સંભાવનાને બદલી નાખે છે.
હાલના અભ્યાસમાં, 83A:476માં 6 hpi અને મંડલૂપમાં 48 hpi અને 22660 વસ્તીમાં પ્રકાશસંશ્લેષણ સાથે સંકળાયેલા ઘણા જનીનોનું મોટા પાયે દમન જોવા મળ્યું હતું.આ ફેરફારોની હદ અને પ્રગતિ સ્તરના પ્રમાણસર છે.આ પ્રયોગમાં એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર જોવા મળ્યો હતો.તાજેતરમાં, રોગકારક બેક્ટેરિયા અને ફૂગ સહિત પ્લાન્ટ-પેથોજેન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાના ઘણા મોડેલોમાં પ્રકાશસંશ્લેષણ-સંબંધિત ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સના મજબૂત અને પ્રારંભિક દમનની જાણ કરવામાં આવી છે.ઉતાવળ (કેટલીક ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓમાં 2 HPI થી) અને ચેપના પ્રતિભાવમાં પ્રકાશસંશ્લેષણ સાથે સંકળાયેલ જનીનોનું વૈશ્વિક દમન, પ્રતિક્રિયાશીલ ઓક્સિજન પ્રજાતિઓની જમાવટના આધારે છોડની રોગપ્રતિકારક શક્તિને ઉત્તેજિત કરી શકે છે અને એલર્જીક પ્રતિક્રિયાઓને મધ્યસ્થી કરવા માટે સેલિસિલિક એસિડ માર્ગ સાથે તેમની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા 90,94.
નિષ્કર્ષમાં, સૌથી પ્રતિરોધક વંશ (83A:476) માટે પ્રસ્તાવિત સંરક્ષણ પ્રતિભાવ પદ્ધતિઓમાં R જનીન (સંભવતઃ TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) દ્વારા ઝડપી પેથોજેન ઓળખ અને એલર્જિક પ્રતિભાવ-મધ્યસ્થી સેલિસિલિક એસિડ અને લાંબા સમય સુધી S AR ની સ્થાપના સિગ્નલિંગ દ્વારા ઇથિલિનનો સમાવેશ થાય છે.ક્રિયા DIR-1 પ્રોટીન દ્વારા સમર્થિત છે.એ નોંધવું જોઈએ કે સી. લ્યુપિની ચેપ માટે બાયોટ્રોફિક સમયગાળો ખૂબ જ ટૂંકો છે (આશરે 2 દિવસ), ત્યારબાદ નેક્રોટિક વૃદ્ધિ થાય છે95.આ તબક્કાઓ વચ્ચેનું સંક્રમણ નેક્રોસિસ અને ઇથિલિન-ઇન્ડ્યુસિબલ પ્રોટીનની અભિવ્યક્તિ સાથે સંકળાયેલ હોઈ શકે છે જે યજમાન છોડમાં અતિસંવેદનશીલતા પ્રતિક્રિયાઓ માટે ટ્રિગર તરીકે કાર્ય કરે છે.તેથી, બાયોટ્રોફિક સ્ટેજ પર સી. લ્યુપિનીને સફળતાપૂર્વક કેપ્ચર કરવા માટેની સમય વિન્ડો ખૂબ જ સાંકડી છે.83A:476 માં 6 એચપીઆઈ પર અવલોકન કરાયેલ રેડોક્સ અને પ્રકાશસંશ્લેષણ સાથે સંકળાયેલ જનીનોનું પુનઃપ્રોગ્રામિંગ ફંગલ હાઈફાઈની પ્રગતિ સાથે સુસંગત છે અને બાયોટ્રોફિક તબક્કે સફળ રક્ષણાત્મક પ્રતિભાવના વિકાસની શરૂઆત કરે છે.મેન્ડેલુપ અને 22660 વસ્તીના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક પ્રતિભાવો નેક્રોટિક વૃદ્ધિ તરફ સ્વિચ કરતા પહેલા ફૂગને પકડવામાં ખૂબ વિલંબિત થઈ શકે છે, જો કે, મેન્ડેલુપ 22660 વસ્તી કરતા વધુ અસરકારક હોઈ શકે છે કારણ કે PR-10 પ્રોટીનનું પ્રમાણમાં ઝડપી નિયમન આડી પ્રતિકારને પ્રોત્સાહન આપે છે.
ETI, કેનોનિકલ R જનીન દ્વારા સંચાલિત, એન્થ્રેકનોઝ સામે બીન પ્રતિકાર માટે એક સામાન્ય પદ્ધતિ હોવાનું જણાય છે.આમ, મોડલ લેગ્યુમ મેડિકાગો ટ્રંકાટુલામાં, એન્થ્રેકનોઝ સામે પ્રતિકાર RCT1 જનીન દ્વારા આપવામાં આવે છે, જે TIR-NBS-LRR97 પ્લાન્ટ R જીન વર્ગના સભ્ય છે.જ્યારે આ જનીન અતિસંવેદનશીલ છોડમાં સ્થાનાંતરિત થાય છે ત્યારે આલ્ફાલ્ફામાં બ્રોડ-સ્પેક્ટ્રમ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર પણ પ્રદાન કરે છે.સામાન્ય બીન (પી. વલ્ગારિસ) માં, આજ સુધી બે ડઝનથી વધુ એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારક જનીનોની ઓળખ કરવામાં આવી છે.આમાંના કેટલાક જનીનો એવા પ્રદેશોમાં જોવા મળે છે જેમાં કોઈ પ્રામાણિક R જનીનોનો અભાવ હોય છે, જો કે અન્ય ઘણા NBS-LRR જનીન ક્લસ્ટર વહન કરતા રંગસૂત્રોની ધાર પર સ્થિત છે, જેમાં TIR-NBS-LRRs99નો સમાવેશ થાય છે.જીનોમ-વ્યાપી SSR અભ્યાસે પણ NBS-LRR જનીનનું સામાન્ય બીનમાં એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર સાથે જોડાણની પુષ્ટિ કરી છે.કેનોનિકલ R જનીન સફેદ લ્યુપિન 101માં મુખ્ય એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારક સ્થાન ધરાવતા જીનોમિક પ્રદેશમાં પણ જોવા મળ્યું હતું.
અમારું કાર્ય દર્શાવે છે કે તાત્કાલિક પ્રતિરોધક પ્રતિક્રિયા, જે છોડના ચેપના પ્રારંભિક તબક્કે સક્રિય થાય છે (પ્રાધાન્ય 12 hpi કરતાં પાછળથી નહીં), અસરકારક રીતે સાંકડી-પાંદડાવાળા લ્યુપિનને પેથોજેનિક ફૂગ કોલેલોટ્રીચમ લ્યુપિની દ્વારા થતા એન્થ્રેકનોઝથી રક્ષણ આપે છે.ઉચ્ચ થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગનો ઉપયોગ કરીને, અમે Lanr1 અને AnMan પ્રતિકાર જનીનો દ્વારા મધ્યસ્થી NLL છોડમાં એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારક જનીનોના વિભેદક અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સનું નિદર્શન કર્યું.સફળ સંરક્ષણમાં રેડોક્સ, પ્રકાશસંશ્લેષણ અને પેથોજેનેસિસમાં સામેલ પ્રોટીન માટે જનીનોની કાળજીપૂર્વક રચનાનો સમાવેશ થાય છે જ્યારે છોડના પેથોજેન સાથે પ્રથમ સંપર્ક થાય છે.સમાન રક્ષણાત્મક પ્રતિક્રિયાઓ, પરંતુ સમયસર વિલંબિત, છોડને રોગોથી બચાવવામાં ઘણી ઓછી અસરકારક છે.Lanr1 જનીન દ્વારા મધ્યસ્થી કરેલ એન્થ્રેક્સ પ્રતિકાર R જનીન (ઇફેક્ટર-ટ્રિગર ઇમ્યુનિટી) ના લાક્ષણિક ઝડપી પ્રતિભાવ જેવું લાગે છે, જ્યારે AnMan જનીન મોટે ભાગે આડી પ્રતિભાવ (સૂક્ષ્મજીવાણુ-સંબંધિત મોલેક્યુલર પેટર્ન દ્વારા ઉશ્કેરાયેલી પ્રતિરક્ષા) પ્રદાન કરે છે, જે ટકાઉપણુંનું મધ્યમ સ્તર પૂરું પાડે છે.
એન્થ્રેકનોઝ માર્કર્સ માટે સ્ક્રીનીંગ કરવા માટે વપરાતી 215 NLL લાઇનમાં 74 કલ્ટિવર્સ, ક્રોસિંગ અથવા બ્રીડિંગ દ્વારા મેળવવામાં આવેલી 60 રેખાઓ, 5 મ્યુટન્ટ્સ અને 76 જંગલી અથવા મૂળ જર્મપ્લાઝમનો સમાવેશ થાય છે.આ રેખાઓ 17 દેશોમાંથી આવી છે, જેમાં મુખ્યત્વે પોલેન્ડ (58), સ્પેન (47), જર્મની (27), ઓસ્ટ્રેલિયા (26), રશિયા (19), બેલારુસ (7), ઇટાલી (5) અને અન્ય લાઇનો છે.10 દેશોમાંથી.સમૂહમાં સંદર્ભ પ્રતિરોધક રેખાઓનો પણ સમાવેશ થાય છે: 83A:476, તાંજીલ, વોંગા લેન્ર1 એલીલ વહન કરે છે અને મેન્ડેલુપ અનમેન એલીલ વહન કરે છે.આ રેખાઓ પોઝનાન પ્લાન્ટ બ્રીડિંગ લિ., વિઆટ્રોવો, પોલેન્ડ (પૂરક કોષ્ટક S1) દ્વારા જાળવવામાં આવતા યુરોપિયન લ્યુપિન આનુવંશિક સંસાધન ડેટાબેઝમાંથી મેળવવામાં આવી હતી.
છોડ નિયંત્રિત સ્થિતિમાં ઉગાડવામાં આવ્યા હતા (ફોટોપીરિયડ 16 કલાક, તાપમાન દિવસ દરમિયાન 25 ° સે અને રાત્રે 18 ° સે).બે જૈવિક પ્રતિકૃતિઓનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું.પ્રોટોકોલ અનુસાર ડીએનએસી પ્લાન્ટ મીની કીટ (કિયાજેન, હિલ્ડન, જર્મની) નો ઉપયોગ કરીને ત્રણ અઠવાડિયા જૂના પાંદડામાંથી ડીએનએ અલગ કરવામાં આવ્યું હતું.આઇસોલેટેડ ડીએનએની ગુણવત્તા અને સાંદ્રતાનું મૂલ્યાંકન સ્પેક્ટ્રોફોટોમેટ્રિક પદ્ધતિઓ દ્વારા કરવામાં આવ્યું હતું (NanoDrop 2000; થર્મો ફિશર સાયન્ટિફિક, વોલ્થમ, MA, USA).એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકારક જનીન AnManM1 માર્કર (cv. Mandelup માંથી ઉતરી આવેલ) અને Anseq3 અને Anseq4 જનીન Lanr1 (cv. Tanjil માંથી ઉતરી આવેલ) નું ચિહ્નિત કરતા 11,26,28 નું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું.પ્રતિરોધક એલીલ માટે હોમોઝાયગોટ્સને “1″, સંવેદનશીલ – “0″ તરીકે અને હેટરોઝાયગોટ્સ – 0.5 તરીકે સ્કોર કરવામાં આવ્યા હતા.
AnManM1, AnSeq3 અને AnSeq4 માર્કર્સ માટે સ્ક્રીનીંગના પરિણામો અને અંતિમ અનુવર્તી પ્રયોગો માટે બીજની ઉપલબ્ધતાના આધારે, 50 NLL લાઈનો એન્થ્રેકનોઝ રેઝિસ્ટન્સ ફેનોટાઈપિંગ માટે પસંદ કરવામાં આવી હતી.વિશ્લેષણ ડુપ્લિકેટમાં કમ્પ્યુટર નિયંત્રિત ગ્રીનહાઉસમાં 14 કલાકના ફોટોપીરિયડ સાથે દિવસ દરમિયાન 22°C અને રાત્રે 19°Cની તાપમાન શ્રેણી સાથે કરવામાં આવ્યું હતું.બીજનો કોટ ખૂબ સખત હોવાને કારણે બીજની નિષ્ક્રિયતા અટકાવવા અને એકસરખા અંકુરણની ખાતરી કરવા માટે વાવણી પહેલાં બીજને ઉઝરડા કરવામાં આવે છે (ગર્ભની વિરુદ્ધ બાજુના બીજના કોટને તીક્ષ્ણ બ્લેડથી કાપીને).જંતુરહિત માટી (TS-1 REC 085 મીડિયમ બેઝિક, ક્લાસમેન-ડીલમેન પોલ્સ્કા, વોર્સો, પોલેન્ડ) સાથે પોટ્સ (11 × 11 × 21 સેમી) માં છોડ ઉગાડવામાં આવ્યા હતા.કોલેટોટ્રિચમ લ્યુપિની કોલ-08 સ્ટ્રેઇન સાથે ઇનોક્યુલેશન હાથ ધરવામાં આવ્યું હતું, જે 1999માં ગ્રેટર પોલેન્ડના વર્ઝેનિત્સા (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E)માં ખેતરમાં ઉગાડવામાં આવેલા સાંકડા પાંદડાવાળા લ્યુપિન છોડના દાંડીમાંથી ઉગાડવામાં આવ્યું હતું.વિસ્તાર મેળવો.સ્પોર્યુલેશનને પ્રેરિત કરવા માટે 21 દિવસ માટે કાળા પ્રકાશ હેઠળ SNA માધ્યમમાં 20° C પર આઇસોલેટ્સનું સંવર્ધન કરવામાં આવ્યું હતું.વાવણીના ચાર અઠવાડિયા પછી, જ્યારે છોડ 4-6 પાંદડાના તબક્કામાં પહોંચી ગયા હતા, ત્યારે કોનિડિયાના સસ્પેન્શન સાથે 0.5 x 106 કોનિડિયા પ્રતિ મિલી ની સાંદ્રતા પર છંટકાવ કરીને ઇનોક્યુલેશન હાથ ધરવામાં આવ્યું હતું.ઇનોક્યુલેશન પછી, કોનિડિયાના અંકુરણ અને ચેપ પ્રક્રિયાને સરળ બનાવવા માટે લગભગ 98% ભેજ અને 25 ° સે તાપમાને છોડને 24 કલાક માટે અંધારામાં રાખવામાં આવ્યા હતા.ત્યારબાદ 22°C દિવસ/19°C રાત્રે અને 70% ભેજ પર 14-કલાકના ફોટોપીરિયડ હેઠળ છોડ ઉગાડવામાં આવ્યા હતા.રોગનો સ્કોર ઇનોક્યુલેશનના 22 દિવસ પછી બનાવવામાં આવ્યો હતો અને દાંડી અને પાંદડા પર નેક્રોટિક જખમની હાજરી અથવા ગેરહાજરીના આધારે 0 (રોગપ્રતિકારક) થી 9 (ખૂબ જ સંવેદનશીલ) સુધીનો હતો.વધુમાં, સ્કોર કર્યા પછી, છોડનું વજન માપવામાં આવ્યું હતું.માર્કર જીનોટાઇપ્સ અને રોગ ફિનોટાઇપ્સ વચ્ચેના સંબંધોની ગણતરી બિંદુ બે-ક્રમના સહસંબંધો તરીકે કરવામાં આવી હતી (એન્થ્રેકનોઝ પ્રતિકાર ફિનોટાઇપના પૃથ્થકરણ માટે રેખાઓના સમૂહમાં હેટરોઝાયગસ માર્કર્સની ગેરહાજરી).