BRCA1/BRCA2 გენების მუტაციური ანალიზი ძუძუს კიბოს დროს

Javascript ამჟამად გამორთულია თქვენს ბრაუზერში. ამ ვებსაიტის ზოგიერთი ფუნქცია არ იმუშავებს, როდესაც Javascript გამორთულია.
დარეგისტრირდით თქვენი კონკრეტული დეტალებითა და კონკრეტული წამლით, რომელიც თქვენთვის საინტერესოა და ჩვენ შევადარებთ თქვენს მიერ მოწოდებულ ინფორმაციას სტატიებს ჩვენს ვრცელ მონაცემთა ბაზაში და დაუყოვნებლივ გამოგიგზავნით PDF ასლს.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
სტეფანია სტელა, 1,2 სილვია რიტა ვიტალი, 1,2 ფედერიკა მარტორანა, 1,2 მიკელე მასიმინო, 1,2 ჯულიანა პავონე, 3 კატია ლანზაფამე, 3 სებასტიანო ბიანკა, 4 კიარა ბარონე, 5 კრისტინა გორგონე, 6 მარკო ფიჩერა მედალია 12 და 6, ექპერატორის მარკო ფიჩერაი, 1,2 და 6. ine, კატანიას უნივერსიტეტი, კატანია, 95123, იტალია; 2 ექსპერიმენტული ონკოლოგიისა და ჰემატოლოგიის ცენტრი, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, იტალია;3 სამედიცინო ონკოლოგია, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, კატანია, 95123, იტალია;4 სამედიცინო გენეტიკა, ARNAS გარიბალდი, კატანია, 95123, იტალია;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Italy;6 ბიოსამედიცინო და ბიოტექნოლოგიის მეცნიერებათა დეპარტამენტი, კატანიას უნივერსიტეტი, სამედიცინო გენეტიკა, კატანია, იტალია, 95123;7 Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, იტალია კომუნიკაციები: სტეფანია სტელა, ტელ +39 095 378 1946, ელფოსტა [email protected];[ელფოსტა დაცულია] მიზანი: ჩანასახის მუტაციები BRCA1 და BRCA2-ში და დადგენილი ძუძუს კიბო (BC), საკვერცხე (OC) და სხვა, რომლებიც დაკავშირებულია კიბოს სიცოცხლის რისკთან. BRCA გენის ტესტირება არის ინდივიდუალური რისკის შესაფასებლად, ასევე ჯანსაღ მატარებლებში პრევენციის მეთოდების პოვნა და მკურნალობის მორგება BRCA21 სხვადასხვა კიბოს მქონე პაციენტებში. და მიუხედავად იმისა, რომ არსებობს მონაცემები BRCA პათოგენური ვარიანტების შესახებ სიცილიის ოჯახებში, კვლევები, რომლებიც კონკრეტულად მიზნად ისახავს აღმოსავლეთ სიცილიის პოპულაციებს, არ არსებობს. ჩვენი კვლევის მიზანი იყო გამოეკვლია BRCA პათოგენური ჩანასახის ცვლილებების სიხშირე და გავრცელება BC პაციენტების ჯგუფში აღმოსავლეთ სიცილიიდან და შეაფასოს მათი კავშირი BC სპეციფიკურ მახასიათებლებთან სიმსივნის პროტოგენური არსებობის და RES-ის შემდეგი თაობის გამოყენებით. ULTS: საერთო ჯამში, 35 პაციენტს (9%) ჰქონდა BRCA პათოგენური ვარიანტი, 17 (49%) BRCA1-ში და 18 (51%) BRCA2.BRCA1 ცვლილებები გავრცელებულია სამჯერ უარყოფით BC პაციენტებში, ხოლო BRCA2 მუტაციები უფრო ხშირია ლუმინალურ BC-ის მქონე პაციენტებში. .დასკვნა: ჩვენი დასკვნები იძლევა მიმოხილვას BRCA მუტაციური სტატუსის შესახებ BC პაციენტებში აღმოსავლეთ სიცილიიდან და ადასტურებს NGS ანალიზის როლს მემკვიდრეობითი BC-ის მქონე პაციენტების იდენტიფიცირებაში. მთლიანობაში, ეს მონაცემები შეესაბამება წინა მტკიცებულებებს, რომლებიც მხარს უჭერენ BRCA სკრინინგს მუტაციის მატარებლებში კიბოს სათანადო პროფილაქტიკისა და მკურნალობისთვის.
სარძევე ჯირკვლის კიბო (BC) არის ყველაზე გავრცელებული ავთვისებიანი სიმსივნე მსოფლიოში და ყველაზე მომაკვდინებელი კიბო ქალებში.1 ბიოლოგიური მახასიათებლები, რომლებიც განსაზღვრავენ ძვ. HER2) ამპლიფიკაცია, პროლიფერაციის ინდექსი Ki-67 და სიმსივნის ხარისხი (G).2 ამ ცვლადების კომბინაციამ გამოავლინა შემდეგი BC კატეგორიები: 1) სანათური სიმსივნეები, რომლებიც აჩვენებენ ER და/ან PgR ექსპრესიას, შეადგენდნენ BC-ების 75%-ს. ეს სიმსივნეები იყოფა ლუმინალურ A-ად, როდესაც Ki-67 იყო 20%-ზე დაბალი ან ლუმინი 6%-ზე, ხოლო 20-ზე დაბალი იყო % და HER2 გაძლიერების არსებობისას, პროლიფერაციის ინდექსის მიუხედავად;2) HER2+ სიმსივნეები, რომლებიც ER და PgR უარყოფითია, მაგრამ აჩვენებენ HER2 ამპლიფიკაციას. ეს ჯგუფი შეადგენს ძუძუს ყველა სიმსივნის 10%-ს;3) სამმაგი უარყოფითი სარძევე ჯირკვლის კიბო (TNBC), რომელიც არ აჩვენებს ER და PgR ექსპრესიას და HER2 გაძლიერებას, შეადგენს ძუძუს კიბოს დაახლოებით 15%-ს.2-4
ამ BC ქვეტიპებს შორის სიმსივნის ხარისხი და პროლიფერაციის ინდექსი წარმოადგენს კვეთის ბიომარკერებს, რომლებიც პირდაპირ და დამოუკიდებლად ასოცირდება სიმსივნის აგრესიულობასთან და პროგნოზთან.5,6
ზემოაღნიშნული ბიოლოგიური მახასიათებლების გარდა, მემკვიდრეობითი გენეტიკური ცვლილებების როლი, რომელიც იწვევს BC-ს განვითარებას, სულ უფრო მნიშვნელოვანი გახდა ბოლო რამდენიმე წლის განმავლობაში.7 10-დან დაახლოებით 1 სარძევე ჯირკვლის სიმსივნე მემკვიდრეობით მიიღება სპეციფიკურ გენებში ჩანასახის ცვლილების გამო. BRCA2, CHK2, PALB2, RAD51C და RAD51D) ძირითადად პასუხისმგებელნი არიან მემკვიდრეობით BC-ზე. ამ გენებს შორის, BRCA1 და BRCA2 (შემდგომში BRCA1/2) აჩვენეს ყველაზე ძლიერი კორელაცია მკერდის სიმსივნეების განვითარებასთან.9-12 ფაქტობრივად, BCCA1 სხვა მუტაციები მნიშვნელოვნად ზრდის სიცოცხლის რისკს, როგორც BC1/2. საკვერცხის, პროსტატის, პანკრეასის, კოლორექტალური და მელანომის ჩათვლით. 13-დან 80 წლამდე, BC-ის კუმულაციური სიხშირე არის 72% ქალებში BRCA1 პათოგენური ვარიანტით (PV) და 69% ქალებში BRCA2 PV.14.
აღსანიშნავია, რომ ბოლო პუბლიკაცია ვარაუდობს, რომ BC რისკი დამოკიდებულია PV-ს ტიპზე. ფაქტობრივად, პათოგენურ შემკვეცავ ვარიანტებთან შედარებით, თვალშისაცემი არასწორი ვარიანტები, განსაკუთრებით BRCA1 გენში, დაკავშირებულია BC-ის შემცირებულ რისკთან, განსაკუთრებით ხანდაზმულ ქალებში.15
BRCA1 ან BRCA2 PV-ის არსებობა ასოცირებული იყო სხვადასხვა ბიოლოგიურ და კლინიკოპათოლოგიურ მახასიათებლებთან.16,17 BRCA1-თან ასოცირებული BC-ები, როგორც წესი, არიან კლინიკურად აგრესიული, ცუდად დიფერენცირებული და ძლიერ პროლიფერაციული. ეს სიმსივნეები, როგორც წესი, სამმაგად უარყოფითია და აქვთ ადრეული ასაკი. ეს სიმსივნეები უფრო ხშირია B სანათურში და ჩვეულებრივ გვხვდება ხანდაზმულებში.16-18 აღსანიშნავია, რომ BRCA1 და BRCA2-ის მუტაციები ზრდის მგრძნობელობას სპეციფიკური მკურნალობის მიმართ, მათ შორის პლატინის მარილები და მიზნობრივი მედიკამენტები, როგორიცაა პოლი(ADP-რიბოზა) პოლიმერაზას ინჰიბიტორები (PARPi).19,20.
ბოლო რამდენიმე წლის განმავლობაში, კლინიკურ პრაქტიკაში შემდეგი თაობის თანმიმდევრობის (NGS) დანერგვამ საშუალება მისცა BC პაციენტების მზარდ რაოდენობას გაიარონ მოლეკულური ტესტირება კიბოს მგრძნობელობის სინდრომებზე, მათ შორის BRCA1/2.21. ამავდროულად, ოჯახურ ისტორიასთან, დემოგრაფიულ და კლინიკოპათოლოგიურ მახასიათებლებზე დაფუძნებული განმარტებები ზუსტ კრიტერიუმებზე დაყრდნობით, ღირს ამ ინდივიდის2 ტესტის2 უკეთესი მტკიცებულება BRCA2. სპეციფიკურ პოპულაციებში BRCA1/2 სკრინინგის მულტირება, გეოგრაფიულ რეგიონებში განსხვავებებს ხაზს უსვამს.24–27 მიუხედავად იმისა, რომ არსებობს ცნობები დასავლეთ სიცილიაში BC კოჰორტაზე, აღმოსავლეთ სიცილიის პოპულაციაში BRCA1/2 სკრინინგზე ნაკლები მონაცემია ხელმისაწვდომი.28,29
ჩვენ აღვწერთ ჩანასახების BRCA1/2 სკრინინგის შედეგებს აღმოსავლეთ სიცილიიდან BC პაციენტებში, რაც შემდგომში აკავშირებს BRCA1 ან BRCA2 მუტაციების არსებობას ამ სიმსივნეების ძირითად კლინიკოპათოლოგიურ მახასიათებლებთან.
ეს რეტროსპექტული კვლევა ჩატარდა "ექსპერიმენტული ონკოლოგიისა და ჰემატოლოგიის ცენტრში" Policlinico Hospital-ში. Rodolico - San Marco კატანიაში. 2017 წლის იანვრიდან 2021 წლის მარტამდე, სულ 455 პაციენტი სარძევე ჯირკვლისა და საკვერცხეების, მელანომის, პანკრეასის/პროსტატის დიაგნოსტიკის ლაბორატორიაში იყო მოხსენიებული BR CA2 ლაბორატორიული ჯირკვლის კიბოსთვის. ჩატარდა ჰელსინკის დეკლარაციის შესაბამისად და ყველა მონაწილემ უზრუნველყო წერილობითი ინფორმირებული თანხმობა მოლეკულურ ანალიზამდე.
BC-ის ჰისტოლოგიური და ბიოლოგიური მახასიათებლები (ER, PgR, HER2 სტატუსი, Ki-67 და ხარისხი) შეფასებული იყო ბირთვის ბიოფსიაზე ან ქირურგიულ ნიმუშებზე, მხოლოდ აგრესიული სიმსივნის კომპონენტების გათვალისწინებით. ამ მახასიათებლების მიხედვით, BC იყო კლასიფიცირებული შემდეგნაირად: სანათური A (ER+ და/ან PgR+, HER2-, Ki-Rg%), HER2-, Ki-Rg, 6<7 Ki-67≥20%), სანათური B-HER2+ (ER და/ან PgR+, HER2+), HER2+ (ER და PgR-, HER2+) ან სამმაგი უარყოფითი (ER და PgR-, HER2-).
BRCA1 და BRCA2 მუტაციის სტატუსის შეფასებამდე, მულტიდისციპლინურმა გუნდმა, მათ შორის ონკოლოგი, გენეტიკოსი და ფსიქოლოგი, ჩაატარა სიმსივნის გენეტიკური კონსულტაცია თითოეული პაციენტისთვის BRCA1 და/ან BRCA1-ის არსებობის დასადგენად.ან BRCA2 გენში PV-ის მაღალი რისკის მქონე პირები. პაციენტის შერჩევა ჩატარდა იტალიური სამედიცინო ონკოლოგიის საზოგადოების (AIOM) გაიდლაინების და ადგილობრივი სიცილიური რეკომენდაციების მიხედვით.(ii) მამაკაცი ძვ.წ.(iii) პირები BC და OC;(iv) ქალები BC <36 წლით, TNBC <60 წლით, ან ორმხრივი BC <50 წლით;(v) BC <50 წლის პირადი სამედიცინო ისტორია და მინიმუმ ერთი პირველი რიგის ნათესავი: (a) BC < 50 წელი;(ბ) ნებისმიერი ასაკის არამუცინური და არასასაზღვრო OC;(გ) ორმხრივი ძვ.წ.(დ) მამრობითი ძვ.წ.(ე) პანკრეასის კიბო;(ვ) პროსტატის კიბო;(vi) ორი ან მეტი BC > 50 წელზე მეტი პირადი ისტორია და BC, OC, ან პანკრეასის კიბოს ოჯახური ისტორია ნათესავებისთვის, რომლებიც ერთმანეთის პირველი რიგის ნათესავები არიან (მათ შორის, ნათესავები, რომლებთანაც ის არის პირველი რიგის ნათესავები);(vii) OC-ის პირადი ისტორია და მინიმუმ ერთი პირველი რიგის ნათესავი: (a) BC <50 წელი;(ბ) NOC;(გ) ორმხრივი ძვ.წ.(დ) მამრობითი ძვ.წ.(vii) ქალი მაღალი ხარისხის სეროზული OC.
20 მლ პერიფერიული სისხლის ნიმუში აღებული იქნა თითოეული პაციენტისგან და შეგროვდა EDTA მილებში (BD Biosciences). გენომიური დნმ იზოლირებული იყო 0.7 მლ მთლიანი სისხლის ნიმუშებიდან QIAsymphony DSP დნმ Midi ნაკრების საიზოლაციო ნაკრების გამოყენებით (QIAGEN, Hilden, იტალია) მწარმოებლის ინსტრუქციების შესაბამისად (QIAGEN, Hilden, იტალია). , MA, USA) შეასრულეთ რაოდენობები.სამიზნე გამდიდრებას და ბიბლიოთეკის მომზადებას ახორციელებს Oncomine™ BRCA Research Assay Chef, მზად არის ჩასატვირთად Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 კომპლექტში ავტომატური ბიბლიოთეკის მომზადებისთვის მწარმოებლის ინსტრუქციების შესაბამისად. ნაკრები შედგება ორი მულტიპლექსური PCR პრაიმერის აუზისგან, რომლებიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას ყველა სქემის შესასწავლად (NM_200001). 059.3) გენები. მოკლედ, 15 μL თითოეული განზავებული ნიმუშის დნმ-დან (10 ნგ) დაემატა შტრიხკოდირებულ ფირფიტებს ბიბლიოთეკის მომზადებისთვის და ყველა რეაგენტი და სახარჯო მასალა ჩაიტვირთა Ion Chef™ ინსტრუმენტზე. ბიბლიოთეკის ავტომატური მომზადება და შტრიხკოდირებული ბიბლიოთეკის ნიმუშის გაერთიანება მომზადდა, შემდეგ შესრულდა ™ ინსტრუმენტზე Chef numberoo. (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, აშშ) მწარმოებლის ინსტრუქციების მიხედვით. საბოლოოდ, ბიბლიოთეკები გაერთიანებულია თანაბარი თანაფარდობით Ion Chef™ ბიბლიოთეკის ნიმუშების მილებში (შტრიხკოდირებულ მილაკებში) და ჩაიტვირთება Ion Chef™ ინსტრუმენტზე. თანმიმდევრობა შესრულდა Ion Torrent S5-ის გამოყენებით (ThermoFirp)HermoFirp. mo Fisher Scientific). მონაცემთა ანალიზი ჩატარდა Amplicon Suite (SmartSeq srl) და Ion Reporter Software-ის მიერ.
ყველა ვარიანტის ნომენკლატურა მიჰყვებოდა ადამიანის გენომის ვარიაციის კონსორციუმის მიმდინარე გაიდლაინებს, რომელიც ხელმისაწვდომია ონლაინ (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). BRCA1/2 ვარიანტების კლინიკური მნიშვნელობა განისაზღვრა საერთაშორისო კონსორციუმის ENIGMA (Evidence-Based Network for Interpreting All. როგორიცაა ARUP, BRCAEXCHANGE, ClinVar, IARC_LOVD და UMD. კლასიფიკაცია მოიცავს ხუთ განსხვავებულ რისკის კატეგორიას: კეთილთვისებიანი (კატეგორია I), სავარაუდო კეთილთვისებიანი (კატეგორია II), გაურკვეველი მნიშვნელობის ვარიანტი (VUS, კატეგორია III), სავარაუდო პათოგენური (IV კატეგორიის) და პათოგენური (ინფორმირებული ფუნქციის პროტეინის სტრუქტურის IV და პათოგენური) ანალიზები. წვდომა 30 მონაცემთა ბაზაზე.32
თითოეული VUS-ისთვის პოტენციური კლინიკური მნიშვნელობის მინიჭების მიზნით გამოყენებული იქნა ცილების პროგნოზირების შემდეგი გამოთვლითი ალგორითმები: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu.pph-agci.VhvG) და Algord. gd_input.php). 1 და 2 კლასის კლასიფიცირებული ვარიანტები განიხილებოდა ველურ ტიპად.
Sanger-ის თანმიმდევრობამ დაადასტურა თითოეული პათოგენური ვარიანტის არსებობა. მოკლედ, კონკრეტული პრაიმერების წყვილი შეიქმნა თითოეული გამოვლენილი ვარიანტისთვის BRCA1 და BRCA2 გენის საცნობარო თანმიმდევრობების გამოყენებით (NG_005905.2, NM_007294.3 და NG_012772.3, შესაბამისად შესრულებული იყო სამიზნე. სანჯერის თანმიმდევრობა.
BRCA1/2 გენზე უარყოფითი ტესტის მქონე პაციენტებს ტესტირება ჩაუტარდათ მულტიპლექს ლიგირებაზე დამოკიდებული ზონდის ამპლიფიკაციით (MLPA) მწარმოებლის ინსტრუქციების შესაბამისად, რათა შეფასდეს დიდი გენომიური გადაწყობების არსებობა (LGR). მოკლედ, დნმ-ის ნიმუშები დენატურირებულია და 60-მდე BRCA1 და BRCA2 გამოიყენება დაახლოებით დნმ-ის სიგრძის სეგმენტში. გამაძლიერებელი პროდუქტები, რომელიც შედგებოდა PCR ამპლიკონების უნიკალური ნაკრებისგან, შემდეგ გაანალიზდა კაპილარული ელექტროფორეზით და Cofalyser.Net პროგრამული უზრუნველყოფით შესაბამის პარტიაზე სპეციფიკურ Cofalyser ცხრილებთან ერთად (www.mrcholland.com).
შერჩეული კლინიკოპათოლოგიური ცვლადები (ჰისტოლოგიური ხარისხი და Ki-67% პროლიფერაციის ინდექსი) დაკავშირებული იყო BRCA1/2 PV-ის არსებობასთან, გამოთვლილი Prism პროგრამული უზრუნველყოფის გამოყენებით v. 8.4 ფიშერის ზუსტი ტესტის გამოყენებით, ვარაუდით, რომ p-მნიშვნელობა <0.05 მნიშვნელოვანია.
2017 წლის იანვრიდან 2021 წლის მარტამდე პერიოდში 455 პაციენტი ჩაუტარდა სკრინინგი ჩანასახის BRCA1/2 მუტაციისთვის. მუტაციის ტესტი ჩატარდა Policlinico Hospital-ის ექსპერიმენტული ონკოლოგიისა და ჰემატოლოგიის ცენტრში. სიცილიური გაიდლაინის თანახმად (http://www.gurs.regione.Indiceia. 0 Gennaio 2020), კატანიის როდოლიკო - სან მარკო“ საერთო ჯამში, 389 პაციენტი იყო ძუძუს კიბო, 37 საკვერცხის კიბო, 16 პანკრეასის კიბო, 8 პროსტატის კიბო და 5 მელანომა.პაციენტების განაწილება კიბოს ტიპისა და ანალიზის შედეგების მიხედვით ნაჩვენებია სურათზე 1.
სურათი 1 გვიჩვენებს ნაკადის სქემას, რომელიც გვიჩვენებს კვლევის მიმოხილვას. პაციენტებს სარძევე ჯირკვლის, მელანომის, პანკრეასის, პროსტატის ან საკვერცხის სიმსივნეებით ჩაუტარდათ ტესტირება BRCA1 და BRCA2 გენებში მუტაციებზე.
აბრევიატურები: PVs, პათოგენური ვარიანტი;VUS, გაურკვეველი მნიშვნელობის ვარიანტი;WT, ველური ტიპის BRCA1/2 თანმიმდევრობა.
ჩვენ შერჩევით გავამახვილეთ ჩვენი კვლევები ძუძუს კიბოს კოჰორტებზე. პაციენტებს ჰქონდათ საშუალო ასაკი 49 წელი (დიაპაზონი 23-89) და იყვნენ უპირატესად ქალი (n=376, ან 97%).
ამ სუბიექტიდან 64 (17%) ჰქონდა BRCA1/2 მუტაცია და ყველა იყო ქალი. ოცდათხუთმეტს (9%) ჰქონდა PV და 29 (7.5%) ჰქონდა VUS. ჩვიდმეტი (48.6%) 35 პათოგენური ვარიანტიდან დაფიქსირდა BRCA1-ში და 18 (51.4%) (51.4%) BRCA2-ში და 7.8% (51.4%) BRCAUS1-ში, ხოლო 7.8% (5.8%) BRCAUS2-ში. %) BRCA2-ში (სურათები 1 და 2). LGR არ იყო წარმოდგენილი MLPA ანალიზში.
სურათი 2. BRCA1 და BRCA2 მუტაციების ანალიზი ძუძუს კიბოს 389 პაციენტში.(B) 389 ძუძუს კიბოს პაციენტს 35 (9%) ჰქონდა BRCA1/2 პათოგენური ვარიანტები (PV). მათ შორის, 17 (48.6%) იყო BRCA1 PV მატარებელი (მუქი წითელი) და 18 (51.4%) იყო BRCA2 მატარებელი (ღია წითელი);(C) 389 სუბიექტიდან 29 (7.5%) გაატარა VUS, 5 (17.2%) BRCA1 გენი (მუქი ნარინჯისფერი) და 24 (82.8%) BRCA2 გენი (ღია ნარინჯისფერი).
აბრევიატურები: PVs, პათოგენური ვარიანტი;VUS, გაურკვეველი მნიშვნელობის ვარიანტი;WT, ველური ტიპის BRCA1/2 თანმიმდევრობა.
ჩვენ შემდეგ გამოვიკვლიეთ BC მოლეკულური ქვეტიპების გავრცელება პაციენტებში BRCA1/2 PV. განაწილება მოიცავდა 2 (5.7%) სანათურს A, 15 (42.9%) სანათურს B, 3 (8.6%) სანათურში B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+, 13 (NBC2.9.5%)-დადებით პაციენტს (37.1%). ჰქონდა სანათური B BC, 2 (11.8%) ჰქონდა HER2+ დაავადება და 10 (58.8%) ჰქონდა TNBC. სიმსივნეები BRCA1 მუტაციების გარეშე იყო ლუმინალური A ან სანათური B-HER2+ (სურათი 3). BRCA2-დადებით ქვეჯგუფში, 10 (55.6%) ლუმინალური სიმსივნე. 16.7%) TNBC და 2 (11.1%) იყო ლუმინალური A (სურათი 3). HER2+ სიმსივნეები არ იყო ამ ჯგუფში. ამრიგად, BRCA1 მუტაციები გავრცელებულია TNBC პაციენტებში, ხოლო BRCA2 ცვლილებები უპირატესად B სანათურშია.
სურათი 3 სარძევე ჯირკვლის კიბოს ქვეტიპების გავრცელება პაციენტებში პათოგენური ვარიანტებით BRCA1 და BRCA2. ჰისტოგრამები, რომლებიც აჩვენებენ BRCA1- (მუქი წითელი) და BRCA2- (ღია წითელი) PV-ების განაწილებას სარძევე ჯირკვლის კიბოთი დაავადებულთა მოლეკულურ ქვეტიპებს შორის. თითოეულ უჯრაში მოხსენებული რიცხვები წარმოადგენს BRCAV ძუძუს კიბოს მქონე პაციენტთა პროცენტს და BRCAV1 ქვეტიპს.
აბრევიატურები: PVs, პათოგენური ვარიანტი;HER2+, ადამიანის ეპიდერმული ზრდის ფაქტორის რეცეპტორ 2 დადებითი;TNBC, სამმაგი უარყოფითი სარძევე ჯირკვლის კიბო.
შემდგომში, ჩვენ შევაფასეთ BRCA1 და BRCA2 PV-ების ტიპი და გენის ლოკალიზაცია. BRCA1 PV-ში, ჩვენ დავაკვირდით 7 ერთნუკლეოტიდურ ვარიანტს (SNV), 6 წაშლას, 3 დუბლირებას და 1 ჩასმას. მხოლოდ ერთი მუტაცია (c.5522delG) წარმოადგენს ყველაზე გავრცელებულ PV5-ში აღმოჩენილ სუბიექტს. 039delCTAAT. ეს ცვლილება გულისხმობს ხუთი ნუკლეოტიდის (CTAAT) წაშლას BRCA1 ეგზონ 15-ში, რის შედეგადაც ამინომჟავა ლეიცინი ჩანაცვლდა ტიროზინით კოდონში 1679 და თარგმანის ჩარჩოში ცვლის გამო წინასწარმეტყველებული ალტერნატიული გაჩერების კოდონით, მოხსენებული არ არის ნაპოვნი V პროტეინის ნაადრევი ცვლილებების გამოვლენა მხოლოდ ერთი შემთხვევა. შეერთების ადგილის კონსენსუსის რეგიონი (c.4357+1G>T) (ცხრილი 1).
რაც შეეხება BRCA2 PV-ს, ჩვენ დავაფიქსირეთ 6 წაშლა, 6 SNV და 2 გაორმაგება. არცერთი ნაპოვნი ცვლილება არ არის ახალი. სამი მუტაცია განმეორდა ჩვენს პოპულაციაში, c.428dup და c.8487+1G>A დაფიქსირდა 3 სუბიექტში, რასაც მოჰყვა c.5851-2 განმეორებითი შემთხვევა AG2-5854 განმეორებით. C-ის BRCA2-ის მე-5 ეგზონში, ნაწინასწარმეტყველებია, რომ დაშიფვრა შეკვეცილი, არაფუნქციური პროტეინი. c.8487+1G>A მუტაცია ხდება BRCA2 ინტრონი 19-ის ინტრონიკურ რეგიონში (± 1,2) და გავლენას ახდენს შერწყმის კონსენსუსზე, რის შედეგადაც ხდება შეცვლილი ცილის8 abdel5 ან AG15 აბსოლიტური5. TT პათოგენური ვარიანტი განპირობებულია 4-ნუკლეოტიდის წაშლით ნუკლეოტიდის პოზიციებიდან 5851-დან 5854-მდე BRCA2 გენის კოდირებულ ეგზონ 10-ში და იწვევს ტრანსლაციის ჩარჩოს ცვლას პროგნოზირებული ალტერნატიული გაჩერების კოდონით (p.S1951WfsTer). იმავე პაციენტში.34 პირველი მუტაცია გულისხმობს ადენოზინის (A) ჩანაცვლებას BRCA2 ეგზონ 7-ში გუანინით (G), რომელიც შეიცავს ნუკლეოტიდს, რის შედეგადაც ხდება ვალინის ცვლილება იზოლეიცინზე კოდონ 211-ზე, იზოლეიცინი ამინომჟავა არის ამინომჟავა უაღრესად მსგავსი თვისებებით. ჩანაცვლება BRCA2-ის მაკოდირებელი გენის მე-13 ეგზონამდე. c.7008-2A>T ცვლილებამ შეიძლება წარმოქმნას სხვადასხვა სიგრძის მრავალი ტრანსკრიპტი. გარდა ამისა, BRCA2 PV-ების ჯგუფში 18 ცვლილებადან 4 (22.2%) იყო ინტრონიკი.
შემდეგ ჩვენ დავაფიქსირეთ BRCA1/2 მავნე მუტაციები ფუნქციურ დომენებში და ცილებთან დამაკავშირებელ რეგიონებში (ნახ. 4). BRCA1 გენში PV-ების 50% განლაგებული იყო სარძევე ჯირკვლის კიბოს კლასტერულ რეგიონში (BCCR), ხოლო მუტაციების 22% განლაგებული იყო საკვერცხის კიბოს კლასტერულ რეგიონში (OCCR) (ნახ. BCCR რეგიონი და მუტაციების 42,8% განლაგებული იყო OCCR-ში (ნახ. 4B). შემდეგ, ჩვენ შევაფასეთ PV-ს მდებარეობა BRCA1 და BRCA2 პროტეინის დომენებში. BRCA1 პროტეინისთვის, ჩვენ ვიპოვეთ სამი PV მარყუჟის და დახვეული ხვეულის დომენებში, ხოლო ორი მუტაცია BRCA2 პროტეინში, ხოლო BRCA2 პროტეინის გამეორება (ნახ. გამოვლინდა 3 ინტრონიკი და 3 ეგზონური ცვლილება ოლიგო/ოლიგოსაქარიდთან შემაკავშირებელ (OB) და კოშკის (T) დომენებში (სურათი 4B).
სურათი 4 BRCA1 და BRCA2 პროტეინების სქემატური წარმოდგენა და პათოგენური ვარიანტების ლოკალიზაცია. ეს ფიგურა გვიჩვენებს BRCA1 (A) და BRCA2 (B) პათოგენური ვარიანტების განაწილებას სარძევე ჯირკვლის კიბოს მქონე პაციენტებში. ეგზონური მუტაციები ნაჩვენებია ლურჯად, ხოლო ინტრონიკული ვარიანტები ნაჩვენებია ნარინჯისფრად. ზოლის სიმაღლე წარმოადგენს BRCA2 პროტეინის რაოდენობას და შემთხვევების რაოდენობას. BRCA1 ცილა შეიცავს მარყუჟის დომენს (RING) და ბირთვული ლოკალიზაციის თანმიმდევრობას (NLS), ხვეული ხვეულის დომენს, SQ/TQ კლასტერულ დომენს (SCD) და BRCA1 C-ტერმინალურ დომენს (BRCT). კოშკის დომენი (T) და NLS C მხარეს. უბნები, რომელსაც ეწოდება ძუძუს კიბოს კლასტერული რეგიონი (BCCR) და საკვერცხის კიბოს კლასტერული რეგიონი (OCCR).* წარმოადგენს მუტაციებს, რომლებიც განსაზღვრავენ გაჩერების კოდონებს.
შემდეგ ჩვენ გამოვიკვლიეთ BC კლინიკოპათოლოგიური მახასიათებლები, რომლებიც შესაძლოა დაკავშირებული იყოს BRCA1/2 PV-ის არსებობასთან. სრული კლინიკური ჩანაწერები ხელმისაწვდომი იყო 181 BRCA1/2-უარყოფითი პაციენტისთვის (არამატარებელი) და ყველა მატარებლისთვის (n = 35). იყო კორელაცია სიმსივნის პროლიფერაციის სიჩქარესა და ხარისხს შორის.
ჩვენ გამოვთვალეთ Ki-67-ის განაწილება ჩვენი კოჰორტის მედიანაზე დაყრდნობით (25%, დიაპაზონი <10-90%). სუბიექტები Ki-67 < 25% განისაზღვრა, როგორც „დაბალი Ki-67“, ხოლო ინდივიდები მნიშვნელობებით ≥ 25% ჩაითვალეს „მაღალი Ki-67″. მნიშვნელოვანი სხვაობა Ki-67-ს შორის. რიერები (სურ. 5A).
სურათი 5 Ki-67-ის კორელაცია ხარისხით განაწილებასთან ძუძუს კიბოს ქალებში BRCA1 და BRCA2 PV-ებით და გარეშე. (A) Boxplot, რომელიც აჩვენებს Ki-67-ის მედიანურ მნიშვნელობებს 181 არამატარებელ BC პაციენტში BRCA1 (18) ან BRCA2 (17) PV პაციენტების მიმართ. BC კიბოს პაციენტები ჰისტოლოგიური ხარისხის ჯგუფებად (G2 და G3) BRCA1 და BRCA2 მუტაციური სტატუსის მიხედვით (WT სუბიექტები, BRCA1 და BRCA2 PVs მატარებლები).
ანალოგიურად, ჩვენ გამოვიკვლიეთ, იყო თუ არა სიმსივნის ხარისხი BRCA1/2 PV-ის არსებობასთან. ვინაიდან G1 BC არ იყო ჩვენს პოპულაციაში, ჩვენ დავყავით პაციენტები ორ ჯგუფად (G2 ან G3). Ki-67 შედეგების შესაბამისად, ანალიზმა გამოავლინა სტატისტიკურად მნიშვნელოვანი კორელაცია სიმსივნური ხარისხისა და BRCA1-ის არასასიამოვნო ხარისხისა და BRCA1 მუტაციას შორის. 005) (სურათი 5B).
დნმ-ის თანმიმდევრობის ტექნოლოგიის მიღწევებმა შესაძლებელი გახადა უპრეცედენტო მიღწევები BRCA1/2 გენეტიკურ ტესტირებაში, რაც გადამწყვეტი მნიშვნელობისაა პაციენტებისთვის, რომლებსაც აქვთ კიბოს ოჯახური ისტორია. დღემდე, დაახლოებით 20,000 BRCA1/2 ვარიანტი იქნა იდენტიფიცირებული და კლასიფიცირებული ამერიკული საზოგადოების სამედიცინო გენეტიკის სისტემის მიხედვით. რომი ფართოდ განსხვავდება გეოგრაფიულ რეგიონებში.37 იტალიაში, BRCA1/2 PV-ების მაჩვენებელი მერყეობდა 8%-დან 37%-მდე, რაც აჩვენებს ფართო ცვალებადობას ქვეყნის შიგნით. კუნძულის გვერდითი ნაწილი.
ჩვენი კვლევა არის ერთ-ერთი პირველი მოხსენება BRCA1/2 PV-ის სიხშირის შესახებ BC პაციენტებში აღმოსავლეთ სიცილიაში.28 ჩვენ გავამახვილეთ ჩვენი ანალიზი BC-ზე, რადგან ეს არის ყველაზე გავრცელებული დაავადება ჩვენს კოჰორტაში.
ძვ. წ. 389 პაციენტის ტესტირებისას, 9%-ს ატარებდა BRCA1/2 PV-ები, თანაბრად განაწილებული BRCA1-სა და BRCA2-ს შორის. ეს შედეგები შეესაბამება ადრე მოხსენებულს იტალიის პოპულაციაში.28 საინტერესოა, რომ ჩვენი კოჰორტის 3% (13/389) იყო მამაკაცი. ეს მაჩვენებელი უფრო მაღალია, ვიდრე მოსალოდნელი იყო მამრობითი ძუძუს კიბოს 4% BC1-ზე დაფუძნებული (BRCA1) ყველა ძუძუს კიბოს მიხედვით (4% BC1). მუტაციის რისკი. თუმცა არცერთ ამ მამაკაცს არ განუვითარდა BRCA1/2 PV, ამიტომ ისინი იყვნენ კანდიდატები შემდგომი მოლეკულური ანალიზისთვის, რათა გამორიცხულიყო ისეთი ნაკლებად გავრცელებული მუტაციების არსებობა, როგორიცაა PALB2, RAD51C და D, მათ შორის სხვა.
როდესაც ჩვენ გავაანალიზეთ BC მოლეკულური ქვეტიპების განაწილება BRCA1/2 მუტანტ ქალებში, ჩვენ დავადასტურეთ ცნობილი ასოციაციები TNBC და BRCA1 PV (58.8%) და B BC და BRCA2 PV (55.6%) სანათურს შორის.
შემდეგ ჩვენ ყურადღებას ვამახვილებთ BRCA1/2 PV-ის ტიპსა და მდებარეობაზე. ჩვენს კოჰორტაში, ყველაზე გავრცელებული BRCA1 PV იყო c.5035_5039delCTAAT. თუმცა Incorvaia et al.არ აღწერეს ეს ვარიანტი მათ სიცილიურ კოჰორტაში, სხვა ავტორებმა ის მოიხსენიეს, როგორც BRCA1 PV ჩანასახის ხაზი. G და c.5266dupC) ჩვეულებრივ გვხვდება აღმოსავლეთ და ცენტრალური ევროპის აშკენაზ ებრაელებში (პოლონეთი, ჩეხეთი), სლოვენიელი, ავსტრიელი, უნგრელი, ბელორუსი და გერმანელი), 44,45 და, შეერთებულ შტატებსა და არგენტინაში, ახლახან განისაზღვრა, როგორც „განმეორებადი ჩანასახის ვარიანტი“ იტალიელ პაციენტებში BC და OC-ით. პალერმოში და მესინაში.საინტერესოა, თუნდაც ინკორვაია და სხვ.ნაპოვნია c.3253dupA ვარიანტი ზოგიერთ ოჯახში კატანიაში.28 ყველაზე წარმომადგენლობითი BRCA2 PVs არის c.428dup, c.5851_5854delAGTT და ინტრონიკული ვარიანტი c.8487+1G>A, რომლებიც უფრო დეტალურად იყო მოხსენებული 28 პალერმოში პალერმოში დაფიქსირდა cTT528up1, TT528, c. შინამეურნეობები ჩრდილო-დასავლეთ სიცილიაში, ძირითადად ტრაპანისა და პალერმოს რეგიონებში, ხოლო c.5851_5854delAGTT PV დაფიქსირდა ჩრდილო-დასავლეთ სიცილიის შინამეურნეობებში. 8487+1G>A ვარიანტი უფრო გავრცელებული იყო სუბიექტებში მესინადან, პალერმოდან და კალტანისეტიდან.28 Rebbe.ადრე აღწერილი c.5851_5854delAGTT ცვლილება კოლუმბიაში.37 სხვა BRCA2 PV, c.631+1G>A, ნაპოვნია BC და OC პაციენტებში სიცილიიდან (აგრიჯენტო, სირაკუზა და რაგუზა). ) იმავე პაციენტში, რომელიც ჩვენ ვივარაუდეთ, რომ იყო სეგრეგირებული ცის რეჟიმში, როგორც ადრე იყო მოხსენებული.34,46 ეს BRCA2 uble მუტაციები მართლაც ხშირად შეინიშნება იტალიის რეგიონში და აღმოჩნდა, რომ შემოაქვს ნაადრევი გაჩერების კოდონები, რომლებიც გავლენას ახდენენ მესინჯერ რნმ-ის შერწყმაზე და იწვევს BRCA2 ცილის48 უკმარისობას.
ჩვენ ასევე დავაფიქსირეთ BRCA1 და BRCA2 PV-ები პროტეინის დომენებისა და გენების სავარაუდო OCCR და BCCR რეგიონებში. ეს რეგიონები აღწერილია რებეკმა და სხვებმა.როგორც საკვერცხის და სარძევე ჯირკვლის კიბოს განვითარების რისკის ზონა, შესაბამისად.49 თუმცა, მტკიცებულება, რომელიც დაკავშირებულია ჩანასახის ვარიანტების მდებარეობასა და სარძევე ჯირკვლის ან საკვერცხის კიბოს რისკს შორის, საკამათო რჩება. OCCR და BCCR რეგიონები და BC მახასიათებლები. ეს შეიძლება გამოწვეული იყოს BRCA1/2 მუტაციების მქონე პაციენტების შეზღუდული რაოდენობით. ცილის დომენის პერსპექტივიდან, BRCA1 PV ნაწილდება მთელ პროტეინზე და BRCA2 ცვლილებები უპირატესად გვხვდება BRC განმეორებით დომენში.
დაბოლოს, ჩვენ ვაკავშირებდით BC კლინიკოპათოლოგიურ მახასიათებლებს BRCA1/2 PV-თან. ჩართული პაციენტების შეზღუდული რაოდენობის გამო, ჩვენ ვიპოვნეთ მხოლოდ მნიშვნელოვანი კორელაცია Ki-67-სა და სიმსივნის ხარისხს შორის. მიუხედავად იმისა, რომ Ki-67-ის შეფასება და ინტერპრეტაცია გარკვეულწილად საკამათო რჩება, დარწმუნებულია, რომ მაღალი პროლიფერაციული სიხშირე ასოცირდება "დაავადების გადაცემის თარიღის გაზრდის რისკსა და შემცირებას შორის". Ki-67 არის 20%. თუმცა, ეს ზღვარი არ ვრცელდება ჩვენს BRCA1/2 მუტაციის მქონე პაციენტების პოპულაციაზე, რომელსაც Ki-67 საშუალო მნიშვნელობა აქვს 25%. Ki-67 მაღალი მაჩვენებლების ეს ტენდენცია აიხსნება ჩვენს სანათურში B და TNBC კოჰორტებში გავრცელებით, რომელთაგან რამდენიმე ლუმინალური A სიმსივნე შეიძლება მიუთითებდეს, რომ ზოგიერთი 23-6 უკეთესი მტკიცებულება იყო. პაციენტების სტრატიფიცირება მათი პროგნოზის მიხედვით.53,54 ჩვენი ანალიზის შედეგებიდან გამომდინარე, მნიშვნელოვანი კორელაცია გასაკვირი არ არის. ადგილი აქვს Ki-67-ის მაღალ ხარისხსა და BRCA1 PV-ს არსებობას შორის. ფაქტობრივად, BRCA1-თან დაკავშირებული სიმსივნეები ტიპიურია TNBC-სთვის და ავლენს უფრო აგრესიულ მახასიათებლებს.16,17
დასკვნის სახით, ეს კვლევა იძლევა ანგარიშს BRCA1/2-ის მუტაციურ სტატუსზე BC კოჰორტაში აღმოსავლეთ სიცილიიდან. მთლიანობაში, ჩვენი დასკვნები შეესაბამება ადრე არსებულ მტკიცებულებებს, როგორც მუტაციის გავრცელების, ისე კლინიკოპათოლოგიური თავისებურებების თვალსაზრისით BC. BRCA1/2-მუტაციური მუტანტის მქონე BCV ანალიზში გაფართოვდა. რომლებიც განსხვავდებიან და ნაკლებად ხშირია ვიდრე BRCA1/2. ეს საშუალებას მისცემს გენეტიკური მუტაციების გამო კიბოს გაზრდილი რისკის ქვეშ მყოფი სუბიექტების იდენტიფიცირებას და სათანადო მართვას.
ჩვენ დავადასტურეთ, რომ პაციენტებმა ხელი მოაწერეს ინფორმირებულ თანხმობას სიმსივნის ნიმუშების ანონიმურად გამოშვებაზე კვლევის მიზნებისთვის. ყველა პაციენტმა ხელი მოაწერა წერილობით ინფორმირებულ თანხმობას ჰელსინკის დეკლარაციის მიხედვით. AOU Policlinico „G.Rodolico – S.Marco“-ს პოლიტიკის მიხედვით, ეს კვლევა გათავისუფლებული იყო ეთიკური მიმოხილვისაგან, რადგან BRCA1/2 წერილობითი ანალიზები ასევე შესრულდა. მათი მონაცემები კვლევის მიზნებისთვის.
ჩვენ მადლობას ვუხდით პროფესორ პაოლო ვიგნერს ეთიკის კომიტეტის მიერ მოთხოვნილი დახმარებისთვის ძუძუს კიბოს პაციენტების მოვლის საქმეში.
Federica Martorana იტყობინება ჰონორარი Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. სხვა ავტორები არ აცხადებენ ინტერესთა კონფლიქტის შესახებ ამ ნაშრომში.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al.Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN აფასებს 36 კიბოს შემთხვევას და სიკვდილიანობას მსოფლიოს 185 ქვეყანაში.CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.doi:3210.


გამოქვეყნების დრო: აპრ-15-2022