Nature.com ಗೆ ಭೇಟಿ ನೀಡಿದ್ದಕ್ಕಾಗಿ ಧನ್ಯವಾದಗಳು.ನೀವು ಬಳಸುತ್ತಿರುವ ಬ್ರೌಸರ್ ಆವೃತ್ತಿಯು ಸೀಮಿತ CSS ಬೆಂಬಲವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ಉತ್ತಮ ಅನುಭವಕ್ಕಾಗಿ, ನೀವು ನವೀಕರಿಸಿದ ಬ್ರೌಸರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಲು ನಾವು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ (ಅಥವಾ ಇಂಟರ್ನೆಟ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರರ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮೋಡ್ ಅನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿ).ಈ ಮಧ್ಯೆ, ನಿರಂತರ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು, ನಾವು ಶೈಲಿಗಳು ಮತ್ತು ಜಾವಾಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಇಲ್ಲದೆ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ರೆಂಡರ್ ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ವಿಕಸನವು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ನಡುವಿನ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಸುಧಾರಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಡ್ರಿಫ್ಟ್, ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಮತ್ತು ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ.ಇಲ್ಲಿ, ಒಂದೇ ಮ್ಯಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ನ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಈ ಪ್ರತಿರೋಧವು ಹೇಗೆ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ನಾವು ಎನ್ಸೆಫಾಲಿಟೊಜೂನ್ ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿಯ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ರಚನೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತೇವೆ, ಇದು ಪ್ರಕೃತಿಯಲ್ಲಿನ ಚಿಕ್ಕ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾದ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಯಾಗಿದೆ.E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಯ ತೀವ್ರ ಕಡಿತವು ಅಭೂತಪೂರ್ವ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಇರುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ಫ್ಯೂಸ್ಡ್ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಲಿಂಕರ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಉಬ್ಬುಗಳಿಲ್ಲದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ.ಇದರ ಜೊತೆಯಲ್ಲಿ, ಇ. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ rRNA ತುಣುಕುಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ನಷ್ಟದಿಂದ ಉಳಿದುಕೊಂಡಿದ್ದು, ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳನ್ನು ಕ್ಷೀಣಿಸಿದ rRNA ತುಣುಕುಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಅನುಕರಣೆಯಾಗಿ ಬಳಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ, ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳು ಕಡಿಮೆ, ಕ್ಷೀಣಿಸಲು ಮತ್ತು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿವೆ ಎಂದು ದೀರ್ಘಕಾಲ ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ನಾವು ತೋರಿಸುತ್ತೇವೆ, ಇದು ತೀವ್ರವಾದ ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೋಚನಗಳ ಹೊರತಾಗಿಯೂ ಅವುಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿರಿಸುವ ಹಲವಾರು ಪರಿಹಾರ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಗುಂಪುಗಳು ತಮ್ಮ ಅತಿಥೇಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಆಣ್ವಿಕ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, ನಾವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ವಿವಿಧ ಗುಂಪುಗಳಿಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಚಿಕಿತ್ಸಕಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ1,2.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಹೊಸ ಪುರಾವೆಗಳು ಪರಾವಲಂಬಿ ವಿಕಾಸದ ಕೆಲವು ಅಂಶಗಳು ಒಮ್ಮುಖವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬಹುಮಟ್ಟಿಗೆ ಊಹಿಸಬಹುದಾದವು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು3,4,5,6,7,8,9 ನಲ್ಲಿ ವಿಶಾಲ ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಗಳಿಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಆಧಾರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಹಿಂದಿನ ಕೆಲಸವು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತ ಅಥವಾ ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆತ 10,11,12,13 ಎಂಬ ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಕಸನೀಯ ಪ್ರವೃತ್ತಿಯನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದೆ.ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು ತಮ್ಮ ಮುಕ್ತ ಜೀವನಶೈಲಿಯನ್ನು ತ್ಯಜಿಸಿದಾಗ ಮತ್ತು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಾಗಿ (ಅಥವಾ ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್‌ಗಳು) ಮಾರ್ಪಟ್ಟಾಗ, ಅವುಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು ಲಕ್ಷಾಂತರ ವರ್ಷಗಳಿಂದ ನಿಧಾನವಾದ ಆದರೆ ಅದ್ಭುತವಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಂಶೋಧನೆ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ9,11.ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆತ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಹಿಂದೆ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಅನೇಕ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಸ್ಯೂಡೋಜೆನ್‌ಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಕ್ರಮೇಣ ಜೀನ್ ನಷ್ಟ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಕುಸಿತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ14,15.ಈ ಕುಸಿತವು ನಿಕಟವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಹಳೆಯ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ 95% ರಷ್ಟು ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ನಾಶಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ಹೀಗಾಗಿ, ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ವಿಕಸನವು ಎರಡು ಎದುರಾಳಿ ಶಕ್ತಿಗಳ ನಡುವಿನ ಹಗ್ಗಜಗ್ಗಾಟವಾಗಿದೆ: ಡಾರ್ವಿನಿಯನ್ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆ, ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ಸುಧಾರಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ನ ಕುಸಿತ, ಪರಾವಲಂಬಿಗಳನ್ನು ಮರೆವುಗೆ ಎಸೆಯುತ್ತದೆ.ಪರಾವಲಂಬಿಯು ಈ ಟಗ್-ಆಫ್-ವಾರ್‌ನಿಂದ ಹೊರಬರಲು ಮತ್ತು ಅದರ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಯ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೇಗೆ ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳುವಲ್ಲಿ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿದೆ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ.
ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆಯುವಿಕೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಇದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಆಗಾಗ್ಗೆ ಆನುವಂಶಿಕ ದಿಕ್ಚ್ಯುತಿಯಿಂದಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ.ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಸಣ್ಣ, ಅಲೈಂಗಿಕ ಮತ್ತು ತಳೀಯವಾಗಿ ಸೀಮಿತ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಕಾರಣ, ಡಿಎನ್‌ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಂಭವಿಸುವ ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಅವು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ತೊಡೆದುಹಾಕಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.ಇದು ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗದ ಶೇಖರಣೆಗೆ ಮತ್ತು ಪರಾವಲಂಬಿ ಜೀನೋಮ್ನ ಕಡಿತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ.ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಪರಾವಲಂಬಿಯು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ತನ್ನ ಉಳಿವಿಗಾಗಿ ಇನ್ನು ಮುಂದೆ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲದ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ.ವಿರಳ ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ತೊಡೆದುಹಾಕಲು ಪರಾವಲಂಬಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಅಸಮರ್ಥತೆಯಾಗಿದೆ, ಇದು ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಅವುಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಜೀನೋಮ್‌ನಾದ್ಯಂತ ಸಂಗ್ರಹಗೊಳ್ಳಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ.
ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತದ ಬಗ್ಗೆ ನಮ್ಮ ಪ್ರಸ್ತುತ ತಿಳುವಳಿಕೆಯು ಕೇವಲ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಹೋಲಿಕೆಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ, ಮನೆಗೆಲಸದ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುವ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಔಷಧ ಗುರಿಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ನಿಜವಾದ ಅಣುಗಳಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಕಡಿಮೆ ಗಮನ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ.ಹಾನಿಕಾರಕ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಹೊರೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಚಲು ಮತ್ತು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸಲು ಮುಂದಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತುಲನಾತ್ಮಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಚಾಪೆರೋನ್ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಶಾಖಕ್ಕೆ ಅತಿಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿದೆ19,20,21,22,23.ಇದರ ಜೊತೆಯಲ್ಲಿ, ವಿವಿಧ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು-ಸ್ವತಂತ್ರ ವಿಕಸನವು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ 2.5 ಶತಕೋಟಿ ವರ್ಷಗಳಷ್ಟು ಬೇರ್ಪಟ್ಟಿದೆ-ತಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ5,6 ಮತ್ತು DNA ದುರಸ್ತಿ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ಕೇಂದ್ರಗಳ ಇದೇ ರೀತಿಯ ನಷ್ಟವನ್ನು ಅನುಭವಿಸಿತು.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಹೆಚ್ಚುತ್ತಿರುವ ಹೊರೆಗೆ ಆಣ್ವಿಕ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಸೇರಿದಂತೆ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮ್ಯಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ಗಳ ಎಲ್ಲಾ ಇತರ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಜೀವನಶೈಲಿಯ ಪ್ರಭಾವದ ಬಗ್ಗೆ ಸ್ವಲ್ಪವೇ ತಿಳಿದಿದೆ.
ಈ ಕೆಲಸದಲ್ಲಿ, ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ವಿಕಸನವನ್ನು ಚೆನ್ನಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ನಾವು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿ ಎನ್ಸೆಫಾಲಿಟೊಜೂನ್ ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಿದ್ದೇವೆ.E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ ಎಂಬುದು ಶಿಲೀಂಧ್ರದಂತಹ ಜೀವಿಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿದ್ದು, ಇದು ಅಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಚಿಕ್ಕದಾದ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಜೀನೋಮ್ ಕ್ಷಯವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ25,26,27,28,29,30.ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ, ಪ್ಯಾರಾನೋಸೆಮಾ ಲೋಕಸ್ಟೇ, ಮತ್ತು ವೈರಿಮೊರ್ಫಾ ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ 31,32 (~3.2 Mb ಜೀನೋಮ್) ನ ಮಧ್ಯಮ ಕಡಿಮೆಯಾದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು.ನೆರೆಯ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೊಸ ಸಂಪರ್ಕಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಅಥವಾ ಹೊಸ msL131,32 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಸ್ವಾಧೀನದಿಂದ rRNA ವರ್ಧನೆಯ ಕೆಲವು ನಷ್ಟವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಈ ರಚನೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.ಎನ್ಸೆಫಾಲಿಟೊಜೂನ್ (ಜೀನೋಮ್ ~ 2.5 ಮಿಲಿಯನ್ ಬಿಪಿ), ಅವುಗಳ ಹತ್ತಿರದ ಸಂಬಂಧಿ ಆರ್ಡೋಸ್ಪೊರಾ ಜೊತೆಗೆ, ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತದ ಅಂತಿಮ ಹಂತವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ - ಅವು 2000 ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ವಿಘಟನೆಯ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಂದ ಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು) ಇ. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ ಜಿನೋಮ್26,27,28 ರಲ್ಲಿ ಹೋಮೋಲೋಗ್‌ಗಳ ಕೊರತೆಯಿಂದಾಗಿ ನಾಲ್ಕು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.ಆದ್ದರಿಂದ, ನಾವು E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆಯುವಿಕೆಗೆ ಅಣುಗಳ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಾಗಿ ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಬಹುದು ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿದೆ.
ನಮ್ಮ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ರಚನೆಯು ಚಿಕ್ಕದಾದ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತದ ಅಂತಿಮ ಮಟ್ಟವು ಜೀವಕೋಶಕ್ಕೆ ಅವಿಭಾಜ್ಯವಾಗಿರುವ ಆಣ್ವಿಕ ಯಂತ್ರಗಳ ರಚನೆ, ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸದ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂಬುದರ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ತತ್ವಗಳನ್ನು ಉಲ್ಲಂಘಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಹೊಸ, ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದ್ದೇವೆ.ತೀರಾ ಅನಿರೀಕ್ಷಿತವಾಗಿ, ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ವಿಕಸನಗೊಳಿಸಿವೆ ಎಂದು ನಾವು ತೋರಿಸುತ್ತೇವೆ ಮತ್ತು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಮೊಟಕುಗಳು ವಿಕಸನೀಯ ಆವಿಷ್ಕಾರಗಳನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಿ ಅದು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಉಪಯುಕ್ತ ಗುಣಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ವಿಕಾಸದ ಕುರಿತು ನಮ್ಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಲು, ಅವುಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಲು ಮತ್ತು ಈ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಸೋಂಕಿತ ಸಸ್ತನಿ ಕೋಶಗಳ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳಿಂದ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ನಾವು ನಿರ್ಧರಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವನ್ನು ಪಡೆಯುವುದು ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವನ್ನು ಪೋಷಕಾಂಶದ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಬದಲಾಗಿ, ಅವು ಆತಿಥೇಯ ಕೋಶದೊಳಗೆ ಮಾತ್ರ ಬೆಳೆಯುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ.ಆದ್ದರಿಂದ, ರೈಬೋಸೋಮ್ ಶುದ್ಧೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ಬಯೋಮಾಸ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಲು, ನಾವು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಬೀಜಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಸ್ತನಿಗಳ ಮೂತ್ರಪಿಂಡದ ಜೀವಕೋಶದ RK13 ಅನ್ನು ಸೋಂಕುಗೊಳಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯನ್ನು ಬೆಳೆಯಲು ಮತ್ತು ಗುಣಿಸಲು ಹಲವಾರು ವಾರಗಳವರೆಗೆ ಈ ಸೋಂಕಿತ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಬೆಳೆಸಿದ್ದೇವೆ.ಸುಮಾರು ಅರ್ಧ ಚದರ ಮೀಟರ್‌ನ ಸೋಂಕಿತ ಕೋಶದ ಏಕಪದರವನ್ನು ಬಳಸಿ, ನಾವು ಸುಮಾರು 300 ಮಿಗ್ರಾಂ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಲು ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಅವುಗಳನ್ನು ಬಳಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು.ನಾವು ನಂತರ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿದ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಗಾಜಿನ ಮಣಿಗಳಿಂದ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಲೈಸೇಟ್‌ಗಳ ಹಂತ ಹಂತದ ಪಾಲಿಎಥಿಲಿನ್ ಗ್ಲೈಕಾಲ್ ಭಿನ್ನರಾಶಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕಚ್ಚಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಇದು ನಮಗೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಸರಿಸುಮಾರು 300 µg ಕಚ್ಚಾ E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಅವಕಾಶ ಮಾಡಿಕೊಟ್ಟಿತು.
ನಂತರ ನಾವು ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ದೊಡ್ಡ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕ, ಸಣ್ಣ ಉಪಘಟಕ ತಲೆ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಉಪಘಟಕಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಮುಖವಾಡಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಈ ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ, ನಾವು ಸುಮಾರು 108,000 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಕಣಗಳ ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 2.7 Å ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಕಂಪ್ಯೂಟೆಡ್ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ್ದೇವೆ (ಪೂರಕ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು 1-3).ನಾವು ನಂತರ rRNA, ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್, ಮತ್ತು E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ (Fig. 1a, b) ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ Mdf1 ಮಾದರಿಗೆ cryoEM ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿದ್ದೇವೆ.
ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ Mdf1 (pdb id 7QEP) ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿರುವ E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ರಚನೆ.b ಇ. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ Mdf1 ನ ನಕ್ಷೆ.ಸಿ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಮ್ಯಾಪ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯನ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಚೇತರಿಸಿಕೊಂಡ rRNAಯನ್ನು ತಿಳಿದಿರುವ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸುತ್ತದೆ.ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ (DC), ಸಾರ್ಸಿನಿಸಿನ್ ಲೂಪ್ (SRL), ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಫರೇಸ್ ಸೆಂಟರ್ (PTC) ಸೇರಿದಂತೆ ವರ್ಧಿತ rRNA ತುಣುಕುಗಳು (ES) ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಫಲಕಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ.d E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಪೆಪ್ಟಿಡೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಫರೇಸ್ ಕೇಂದ್ರಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯು ಈ ವೇಗವರ್ಧಕ ಸೈಟ್ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಪರಾವಲಂಬಿ ಮತ್ತು H. ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಅದರ ಅತಿಥೇಯಗಳಲ್ಲಿ ಅದೇ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಇ, ಎಫ್ ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೆಂಟರ್ (ಇ)ನ ಅನುಗುಣವಾದ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸಾಂದ್ರತೆ ಮತ್ತು ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೆಂಟರ್ (ಎಫ್) ನ ಸ್ಕೀಮ್ಯಾಟಿಕ್ ರಚನೆಯು E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿಯು ಅನೇಕ ಇತರ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ A1491 (E. ಕೋಲಿ ಸಂಖ್ಯೆ) ಬದಲಿಗೆ U1491 ಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಬದಲಾವಣೆಯು ಈ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಗೆ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಹಿಂದೆ ಸ್ಥಾಪಿತವಾದ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ಎರಡೂ ರಚನೆಗಳು ಒಂದೇ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಕುಟುಂಬ ನೊಸೆಮ್ಯಾಟಿಡೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಹೋಲುತ್ತವೆ), 31,32 E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು rRNA ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಘಟನೆಯ ಹಲವಾರು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ.ಮತ್ತಷ್ಟು ಡಿನಾಟರೇಶನ್ (ಪೂರಕ ಚಿತ್ರಗಳು 4-6).rRNAಯಲ್ಲಿ, ಅತ್ಯಂತ ಗಮನಾರ್ಹ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ವರ್ಧಿತ 25S rRNA ತುಣುಕು ES12L ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಷ್ಟ ಮತ್ತು h39, h41 ಮತ್ತು H18 ಹೆಲಿಸ್‌ಗಳ ಭಾಗಶಃ ಅವನತಿ (Fig. 1c, ಪೂರಕ ಚಿತ್ರ 4).ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಅತ್ಯಂತ ಗಮನಾರ್ಹ ಬದಲಾವಣೆಗಳು eS30 ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಷ್ಟ ಮತ್ತು eL8, eL13, eL18, eL22, eL29, eL40, uS3, uS9, uS14, uS17, ಮತ್ತು eS7 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಷ್ಟವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ (ಚಿತ್ರಗಳು 4).
ಹೀಗಾಗಿ, ಎನ್ಸೆಫಲೋಟೊಜೂನ್/ಆರ್ಡೋಸ್ಪೊರಾ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ತೀವ್ರ ಕಡಿತವು ಅವುಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಫಲಿಸುತ್ತದೆ: E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಂಶದ ಅತ್ಯಂತ ನಾಟಕೀಯ ನಷ್ಟವನ್ನು ಅನುಭವಿಸುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳು ರಚನಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳು ಆರ್ಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಜೀವನದ ಮೂರು ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ.E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ರಚನೆಯು ಈ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಮೊದಲ ಆಣ್ವಿಕ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಜೈವಿಕ ಅಣು ರಚನೆಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳೆರಡರಿಂದಲೂ ಕಡೆಗಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ವಿಕಸನೀಯ ಘಟನೆಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ (ಅನುಬಂಧ ಚಿತ್ರ. 7).ಕೆಳಗೆ, ನಾವು ಈ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಘಟನೆಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲಗಳು ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೇಲೆ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪ್ರಭಾವದ ಜೊತೆಗೆ ವಿವರಿಸುತ್ತೇವೆ.
ದೊಡ್ಡ rRNA ಮೊಟಕುಗಳ ಜೊತೆಗೆ, E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ತಮ್ಮ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದರಲ್ಲಿ rRNA ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ನಾವು ನಂತರ ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಪೆಪ್ಟಿಡೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಫರೇಸ್ ಕೇಂದ್ರವು ಇತರ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಂತೆಯೇ (Fig. 1d) ಅದೇ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ 1491 (E. ಕೋಲಿ ಸಂಖ್ಯೆ, ಚಿತ್ರ 1e, f) ನಲ್ಲಿನ ಅನುಕ್ರಮ ವ್ಯತ್ಯಾಸದಿಂದಾಗಿ ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಕೇಂದ್ರವು ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ.ಈ ಅವಲೋಕನವು ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ G1408 ಮತ್ತು A1491 ಶೇಷಗಳನ್ನು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ-ಮಾದರಿಯ ಶೇಷಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ A1408 ಮತ್ತು G1491 ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ಅಮಿನೋಗ್ಲೈಕೋಸೈಡ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ವಿಭಿನ್ನ ಸಂವೇದನೆ ಮತ್ತು ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಇತರ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿದೆ.E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ನಲ್ಲಿ, ಶೇಷ A1491 ಅನ್ನು U1491 ನೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಯಿತು, ಈ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಒಂದು ಅನನ್ಯ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ರಚಿಸುತ್ತದೆ.ಅದೇ A14901 ರೂಪಾಂತರವು P. ಲೋಕಸ್ಟೇ ಮತ್ತು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್‌ನಂತಹ ಇತರ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಇದೆ, ಇದು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ (Fig. 1f).
ನಮ್ಮ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಮಾದರಿಗಳು ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಬೀಜಕಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವುದರಿಂದ, ಒತ್ತಡ ಅಥವಾ ಹಸಿವಿನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಹಿಂದೆ ವಿವರಿಸಿದ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ ನಾವು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಅಂಶಗಳು 31,32,36,37, 38. ನಾವು ಈ ಹಿಂದೆ ಸ್ಥಾಪಿತವಾದ ಹೈಬರ್ನೇಟಿಂಗ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ರಚನೆಯನ್ನು E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ನಕ್ಷೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೊಂದಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಡಾಕಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ, S. ಸೆರೆವಿಸಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ Stm138, ಲೊಕಸ್ಟ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು Lso232 ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಮತ್ತು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು Mdf1 ಮತ್ತು Mdf231 ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು.ಅದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಉಳಿದ ಅಂಶ Mdf1 ಗೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.Mdf1 ಅನ್ನು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಬಂಧಿಸುವಂತೆಯೇ, Mdf1 ಸಹ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಇದು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ E ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಪ್ರಾಯಶಃ ಪರಾವಲಂಬಿ ಬೀಜಕಗಳು ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಂಡಾಗ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಲಭ್ಯವಾಗುವಂತೆ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ (ದೇಹದ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯತೆಯ ಮೇಲೆ ಚಿತ್ರ 2).)
Mdf1 ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ E ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿ ಬೀಜಕಗಳು ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯವಾದಾಗ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಿಂದ ಡೀಸಿಲೇಟೆಡ್ tRNA ಯನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲು ಅನುಕೂಲವಾಗುವ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಭಾಗವಾದ L1 ರೈಬೋಸೋಮ್ ಕಾಂಡದೊಂದಿಗೆ Mdf1 ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.ಈ ಸಂಪರ್ಕಗಳು Mdf1 ಡೀಸಿಟೈಲೇಟೆಡ್ tRNA ಯಂತೆಯೇ ಅದೇ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಿಂದ ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಪುನಃ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ರೈಬೋಸೋಮ್ Mdf1 ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಸಂಭವನೀಯ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಆದಾಗ್ಯೂ, ನಮ್ಮ ರಚನೆಯು Mdf1 ಮತ್ತು L1 ರೈಬೋಸೋಮ್ ಲೆಗ್ (ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಿಂದ ಡೀಸಿಲೇಟೆಡ್ tRNA ಯನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುವ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಭಾಗ) ನಡುವಿನ ಅಜ್ಞಾತ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು.ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ, Mdf1 ಡೀಸಿಲೇಟೆಡ್ tRNA ಅಣುವಿನ (Fig. 2) ಮೊಣಕೈ ವಿಭಾಗದಂತೆಯೇ ಅದೇ ಸಂಪರ್ಕಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ.ಈ ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ಆಣ್ವಿಕ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ Mdf1 ಡೀಸಿಟೈಲೇಟೆಡ್ tRNA ಯಂತೆಯೇ ಅದೇ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಿಂದ ವಿಭಜನೆಯಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಪುನಃ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಈ ಹೈಬರ್ನೇಶನ್ ಅಂಶವನ್ನು ಹೇಗೆ ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.
rRNA ಮಾದರಿಯನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸುವಾಗ, E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅಸಹಜವಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ rRNA ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ, ಅದನ್ನು ನಾವು ಫ್ಯೂಸ್ಡ್ rRNA ಎಂದು ಕರೆಯುತ್ತೇವೆ (Fig. 3).ಜೀವನದ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿರುವ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ರಚನೆಗಳಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಬೇಸ್‌ಗಳು ಬೇಸ್ ಪೇರ್ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, rRNAಗಳು ತಮ್ಮ ಕೆಲವು ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ಗಳನ್ನು ತೆರೆದ rRNA ಪ್ರದೇಶಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಮೂಲಕ ಈ ಮಡಿಸುವ ತತ್ವವನ್ನು ಉಲ್ಲಂಘಿಸುತ್ತವೆ.
S. ಸೆರೆವಿಸಿಯೇ, V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್, ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿಯಲ್ಲಿ H18 25S rRNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ನ ರಚನೆ.ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ, ಮೂರು ಜೀವಿತ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿರುವ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಈ ಲಿಂಕರ್ 24 ರಿಂದ 34 ಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ಗೆ ಸುರುಳಿಯಾಗುತ್ತದೆ.ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ, ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಈ rRNA ಲಿಂಕರ್ ಅನ್ನು ಕೇವಲ 12 ಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡು ಸಿಂಗಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಯೂರಿಡಿನ್-ರಿಚ್ ಲಿಂಕರ್‌ಗಳಿಗೆ ಕ್ರಮೇಣ ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಈ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನವು ದ್ರಾವಕಗಳಿಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್‌ನ ಸಾಮಾನ್ಯ ತತ್ವಗಳನ್ನು ಉಲ್ಲಂಘಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅಂಕಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಇತರ ಬೇಸ್‌ಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ.ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ, ಕೆಲವು ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ತುಣುಕುಗಳು ಪ್ರತಿಕೂಲವಾದ ಪದರವನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಹಿಂದಿನ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಬಹುತೇಕ ಸರಳ ರೇಖೆಯಲ್ಲಿ ಉದ್ದವಾದ ಏಕ-ಎಳೆಯ ತುಣುಕಾಗುತ್ತದೆ.ಈ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗೆ ಕನಿಷ್ಠ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ದೂರದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
ಈ ವಿಕಸನೀಯ ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಅತ್ಯಂತ ಗಮನಾರ್ಹ ಉದಾಹರಣೆಯನ್ನು H18 25S rRNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್ (Fig. 3) ನಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸಬಹುದು.E. ಕೊಲಿಯಿಂದ ಮಾನವರವರೆಗಿನ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ, ಈ rRNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಬೇಸ್ಗಳು 24-32 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಸ್ವಲ್ಪ ಅನಿಯಮಿತ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ.V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇ, 31,32 ನಿಂದ ಹಿಂದೆ ಗುರುತಿಸಲಾದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ H18 ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ನ ಬೇಸ್‌ಗಳು ಭಾಗಶಃ ಸುರುಳಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬೇಸ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿಯಲ್ಲಿ ಈ rRNA ತುಣುಕು 228UUUGU232 ಮತ್ತು 301UUUUUUUU307 ಅತಿ ಚಿಕ್ಕ ಲಿಂಕರ್ ಆಗುತ್ತದೆ.ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ rRNA ತುಣುಕುಗಳಂತಲ್ಲದೆ, ಈ ಯುರಿಡಿನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಲಿಂಕರ್‌ಗಳು ಸುರುಳಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾಪಕ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ.ಬದಲಿಗೆ, ಅವರು ದ್ರಾವಕ-ತೆರೆದ ಮತ್ತು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ತೆರೆದ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತಾರೆ, ಇದರಲ್ಲಿ rRNA ಎಳೆಗಳನ್ನು ಬಹುತೇಕ ನೇರವಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.H16 ಮತ್ತು H18 rRNA ಹೆಲಿಸ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ 33 Å ಅಂತರವನ್ನು ತುಂಬಲು E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿಯು ಕೇವಲ 12 RNA ಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಈ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ವಿನ್ಯಾಸವು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಇತರ ಪ್ರಭೇದಗಳಿಗೆ ಅಂತರವನ್ನು ತುಂಬಲು ಕನಿಷ್ಠ ಎರಡು ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚು rRNA ಬೇಸ್‌ಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ.
ಹೀಗಾಗಿ, ಶಕ್ತಿಯುತವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕೂಲವಾದ ಮಡಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವು ಜೀವನದ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಜಾತಿಗಳಾದ್ಯಂತ ವಿಶಾಲವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ವಿಭಾಗಗಳನ್ನು ಸಹ ಸಂಕುಚಿತಗೊಳಿಸುವ ತಂತ್ರವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದೆ ಎಂದು ನಾವು ಪ್ರದರ್ಶಿಸಬಹುದು.ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ, ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ಗಳನ್ನು ಶಾರ್ಟ್ ಪಾಲಿ-ಯು ಲಿಂಕರ್‌ಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಇ. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿಯು ದೂರದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾದಷ್ಟು ಕಡಿಮೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ರಚಿಸಬಹುದು.ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವು ತಮ್ಮ ರಚನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಮಗ್ರತೆಯನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳದೆ ತಮ್ಮ ಮೂಲ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಹೇಗೆ ನಾಟಕೀಯ ಕಡಿತವನ್ನು ಸಾಧಿಸಿತು ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಇದು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ rRNA ಯ ಮತ್ತೊಂದು ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ದಪ್ಪವಾಗದೆ rRNA ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದು (ಚಿತ್ರ 4).ಉಬ್ಬುಗಳು ಮೂಲ ಜೋಡಿಗಳಿಲ್ಲದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳಾಗಿದ್ದು, ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಅಡಗಿಕೊಳ್ಳುವ ಬದಲು ತಿರುಚುತ್ತವೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ rRNA ಮುಂಚಾಚಿರುವಿಕೆಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಅಂಟುಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಪಕ್ಕದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಅಥವಾ ಇತರ rRNA ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಕೆಲವು ಉಬ್ಬುಗಳು ಕೀಲುಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಕ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿ ಮಡಚಲು ಮತ್ತು ಮಡಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
a rRNA ಮುಂಚಾಚಿರುವಿಕೆ (S. ಸೆರೆವಿಸಿಯಾ ಸಂಖ್ಯೆ) E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯಿಂದ ಇರುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಇತರ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳು b E. ಕೋಲಿ, S. ಸೆರೆವಿಸಿಯೇ, H. ಸೇಪಿಯನ್ಸ್, ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಆಂತರಿಕ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತದೆ.ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಪ್ರಾಚೀನ, ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ rRNA ಉಬ್ಬುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ.ಈ ದಪ್ಪವಾಗುವಿಕೆಗಳು ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ;ಆದ್ದರಿಂದ, ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯು ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಲ್ಲಿ rRNA ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಕಡಿಮೆ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.P ಕಾಂಡಗಳೊಂದಿಗಿನ ಹೋಲಿಕೆ (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ L7/L12 ಕಾಂಡಗಳು) rRNA ಉಬ್ಬುಗಳ ನಷ್ಟವು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಕಳೆದುಹೋದ ಉಬ್ಬುಗಳ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಹೊಸ ಉಬ್ಬುಗಳ ಗೋಚರಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.23S/28S rRNAಯಲ್ಲಿನ H42 ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಒಂದು ಪುರಾತನ ಉಬ್ಬನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (Saccharomyces cerevisiae ನಲ್ಲಿ U1206) ಜೀವನದ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅದರ ರಕ್ಷಣೆಯಿಂದಾಗಿ ಕನಿಷ್ಠ 3.5 ಶತಕೋಟಿ ವರ್ಷಗಳಷ್ಟು ಹಳೆಯದು ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ.ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ, ಈ ಉಬ್ಬು ಹೊರಹಾಕಲ್ಪಡುತ್ತದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕಳೆದುಹೋದ ಉಬ್ಬು (E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿಯಲ್ಲಿ A1306) ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಹೊಸ ಉಬ್ಬು ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿತು.
ಆಶ್ಚರ್ಯಕರವಾಗಿ, E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಇತರ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಉಬ್ಬುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ, ಇತರ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾದ 30 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಉಬ್ಬುಗಳು (ಚಿತ್ರ 4a).ಈ ನಷ್ಟವು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕಗಳು ಮತ್ತು ಪಕ್ಕದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಹೆಲಿಸ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಅನೇಕ ಸಂಪರ್ಕಗಳನ್ನು ನಿವಾರಿಸುತ್ತದೆ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನೊಳಗೆ ದೊಡ್ಡ ಟೊಳ್ಳಾದ ಖಾಲಿಜಾಗಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ, ಹೆಚ್ಚು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಹೆಚ್ಚು ರಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ (Fig. 4b).ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ, ಈ ಹಿಂದೆ ಗುರುತಿಸಲಾದ V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇ ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಉಬ್ಬುಗಳು ಕಳೆದುಹೋಗಿವೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ, ಇವುಗಳನ್ನು ಹಿಂದಿನ ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳಿಂದ ಕಡೆಗಣಿಸಲಾಗಿದೆ31,32.
ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ rRNA ಉಬ್ಬುಗಳ ನಷ್ಟವು ಕಳೆದುಹೋದ ಉಬ್ಬುಗಳ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಹೊಸ ಉಬ್ಬುಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯೊಂದಿಗೆ ಇರುತ್ತದೆ.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ರೈಬೋಸೋಮಲ್ P-ಕಾಂಡವು U1208 ಉಬ್ಬುವಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (ಸಕ್ಕರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾದಲ್ಲಿ) ಇದು E. ಕೊಲಿಯಿಂದ ಮಾನವರಿಗೆ ಉಳಿದುಕೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ 3.5 ಶತಕೋಟಿ ವರ್ಷಗಳಷ್ಟು ಹಳೆಯದು ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ.ಪ್ರೊಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಈ ಉಬ್ಬು ತೆರೆದ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ರಚನೆಗಳ ನಡುವೆ P ಕಾಂಡವನ್ನು ಚಲಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಭಾಷಾಂತರ ಅಂಶಗಳನ್ನು ನೇಮಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್‌ಗೆ ತಲುಪಿಸುತ್ತದೆ.E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಈ ದಪ್ಪವಾಗುವುದು ಇರುವುದಿಲ್ಲ;ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮೂರು ಮೂಲ ಜೋಡಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಇರುವ ಹೊಸ ದಪ್ಪವಾಗುವುದು (G883) P ಕಾಂಡದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ನಮ್ಯತೆಯ ಮರುಸ್ಥಾಪನೆಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತದೆ (Fig. 4c).
ಉಬ್ಬುಗಳಿಲ್ಲದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮೇಲಿನ ನಮ್ಮ ಡೇಟಾವು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅಂಶಗಳ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ರೈಬೋಸೋಮ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು, ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆಣ್ವಿಕ ದೋಷವನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ, ಅದು ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ.ಜೀವಂತ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಮಾಡಿದ ನಂತರ, ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಘಟಕಗಳು ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಚಿತ್ರದ ಮೂರು ಭಾಗಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು ತುಣುಕುಗಳು ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳಾಗಿವೆ (ಚಿತ್ರ 5, ಪೂರಕ ಚಿತ್ರ 8).ಮೊದಲ ವಿಭಾಗವು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಾದ uL15 ಮತ್ತು eL18 ನಡುವೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ eL18 ನ C-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಿಂದ ಆಕ್ರಮಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿದೆ, ಇದನ್ನು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.ಈ ಅಣುವಿನ ಗುರುತನ್ನು ನಾವು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗದಿದ್ದರೂ, ಈ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ದ್ವೀಪದ ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ಆಕಾರವನ್ನು ಸ್ಪರ್ಮಿಡಿನ್ ಅಣುಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಿಂದ ಚೆನ್ನಾಗಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ.ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಅದರ ಬಂಧವು uL15 ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Asp51 ಮತ್ತು Arg56) ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದ ಸ್ಥಿರಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಇದು ಈ ಸಣ್ಣ ಅಣುವಿಗೆ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಬಾಂಧವ್ಯವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅವು uL15 ಗೆ ಸಣ್ಣ ಅಣುವನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮಲ್‌ಗೆ ಸುತ್ತುವಂತೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಪೂರಕ ಚಿತ್ರ 2).8, ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಡೇಟಾ 1, 2).
E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗೆ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ರೈಬೋಸ್‌ನ ಹೊರಗೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್‌ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುವ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಚಿತ್ರಣ.E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ, ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ 25S rRNA A3186 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ (ಸ್ಯಾಕರೋಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯೇ ನಂಬರಿಂಗ್) ನಂತಹ ಇತರ ಯೂಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅದೇ ಸ್ಥಾನವನ್ನು ಆಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ.b E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ, ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಾದ uL9 ಮತ್ತು eL20 ನಡುವೆ ಇದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವೆ cd eL20 ಅನುಕ್ರಮ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ.ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜಾತಿಯ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ (c) ಮತ್ತು eL20 ಪ್ರೊಟೀನ್ (d) ನ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅವಶೇಷಗಳು F170 ಮತ್ತು K172 ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ವಿಶಿಷ್ಟ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, S. lophii ಹೊರತುಪಡಿಸಿ, ಆರಂಭಿಕ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ.ಇ ಈ ಅಂಕಿ ಅಂಶವು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್-ಬಂಧಿಸುವ ಅವಶೇಷಗಳು F170 ಮತ್ತು K172 ಹೆಚ್ಚು ಕಡಿಮೆಯಾದ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜೀನೋಮ್‌ನ eL20 ನಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಇರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇತರ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ.ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ, ಈ ಡೇಟಾವು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯನ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಅದು AMP ಅಣುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಅವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ.ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿನ ಈ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅದರ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯು ಈ ಸೈಟ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾಕ್ಕೆ ಆಯ್ದ ಬದುಕುಳಿಯುವ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಒದಗಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಹೀಗಾಗಿ, ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪಾಕೆಟ್ ಈ ಹಿಂದೆ ವಿವರಿಸಿದಂತೆ ಕ್ಷೀಣಗೊಳ್ಳುವ ಲಕ್ಷಣ ಅಥವಾ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅವನತಿಯ ಅಂತಿಮ ರೂಪವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವುದಿಲ್ಲ, ಬದಲಿಗೆ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಬಂಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಒಂದು ಉಪಯುಕ್ತ ವಿಕಸನೀಯ ಆವಿಷ್ಕಾರವಾಗಿದೆ.ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಬಿಲ್ಡಿಂಗ್ ಬ್ಲಾಕ್ಸ್.ಈ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅನ್ನು ಏಕೈಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಅದರ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬಿಲ್ಡಿಂಗ್ ಬ್ಲಾಕ್ ಆಗಿ ಬಳಸುವ ಏಕೈಕ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಆಗಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಎಫ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್‌ನಿಂದ ಪಡೆದ ಕಾಲ್ಪನಿಕ ವಿಕಸನ ಮಾರ್ಗ.
ಎರಡನೇ ಕಡಿಮೆ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕದ ಸಾಂದ್ರತೆಯು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಇಂಟರ್‌ಫೇಸ್‌ನಲ್ಲಿದೆ uL9 ಮತ್ತು eL30 (Fig. 5a).ಈ ಇಂಟರ್‌ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಹಿಂದೆ ಸ್ಯಾಕ್ರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯೆ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ 25S ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ rRNA A3186 (ES39L rRNA ವಿಸ್ತರಣೆಯ ಭಾಗ) 38 ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಸ್ಥಳವಾಗಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ.ಕ್ಷೀಣಿಸಿದ P. ಲೋಕಸ್ಟೇ ES39L ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಈ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅಜ್ಞಾತ ಸಿಂಗಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ 31 ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ rRNA ಯ ಕಡಿಮೆ ಅಂತಿಮ ರೂಪವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ rRNA ಯ ಉದ್ದವು ~130-230 ಬೇಸ್‌ಗಳು.ES39L ಅನ್ನು ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ 32.43 ಗೆ ಇಳಿಸಲಾಗಿದೆ.ನಮ್ಮ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಚಿತ್ರಗಳು ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್‌ಗಳಿಂದ ವಿವರಿಸಬಹುದು ಎಂಬ ಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತವೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ನಮ್ಮ ರಚನೆಯ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಎಕ್ಸ್‌ಟ್ರಾರಿಬೋಸೋಮಲ್ ಅಣು, ಪ್ರಾಯಶಃ AMP (Fig. 5a, b) ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ.
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿದೆಯೇ ಅಥವಾ ಅದು ಹಿಂದೆ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆಯೇ ಎಂದು ನಾವು ನಂತರ ಕೇಳಿದ್ದೇವೆ.ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮುಖ್ಯವಾಗಿ eL30 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ನಲ್ಲಿನ Phe170 ಮತ್ತು Lys172 ಶೇಷಗಳಿಂದ ಮಧ್ಯವರ್ತಿಯಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ನಾವು 4396 ಪ್ರತಿನಿಧಿ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಈ ಅವಶೇಷಗಳ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಮೇಲಿನ uL15 ನಂತೆ, ನಾವು Phe170 ಮತ್ತು Lys172 ಶೇಷಗಳು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ, ಆದರೆ ವಿಲಕ್ಷಣವಾದ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಮೈಟೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಮ್ ಮತ್ತು ಆಂಫಿಯಾಂಬ್ಲಿಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಇತರ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವುದಿಲ್ಲ, ಇದರಲ್ಲಿ ES349L ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ r.4c45, r. RNA frag45 ಅಲ್ಲ.-ಇ).
ಒಟ್ಟಾಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಂಡರೆ, rRNA ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟೀನ್ ಮಟ್ಟಗಳಲ್ಲಿನ ಕುಸಿತವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸಲು ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಸಣ್ಣ ಮೆಟಾಬಾಲೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯಶಃ ಇತರ ಅಂಗೀಕೃತ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾಗಳು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿವೆ ಎಂಬ ಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ಈ ಡೇಟಾ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ.ಹಾಗೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ಅವರು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಹೊರಗೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ, ಪರಾವಲಂಬಿ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳು ಹೇರಳವಾದ ಸಣ್ಣ ಮೆಟಾಬಾಲೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಕ್ಷೀಣಿಸಿದ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ತುಣುಕುಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಅನುಕರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸರಿದೂಗಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ..
ದೊಡ್ಡ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ನಮ್ಮ ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ನಕ್ಷೆಯ ಮೂರನೇ ಅನುಕರಿಸದ ಭಾಗ.ನಮ್ಮ ನಕ್ಷೆಯ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ (2.6 Å) ಈ ಸಾಂದ್ರತೆಯು ದೊಡ್ಡ ಸೈಡ್ ಚೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸಂಯೋಜನೆಯೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಸೇರಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಈ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಹಿಂದೆ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲು ನಮಗೆ ಅವಕಾಶ ಮಾಡಿಕೊಟ್ಟಿತು, ಇದನ್ನು ನಾವು msL2 (ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ- ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ L2) ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಿದ್ದೇವೆ (ವಿಧಾನಗಳು, ಚಿತ್ರ 6).ಎನ್ಸೆಫಾಲಿಟರ್ ಮತ್ತು ಓರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಮ್ ಕುಲದ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಕ್ಲಾಡ್‌ನಲ್ಲಿ msL2 ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ಹೋಮಾಲಜಿ ಹುಡುಕಾಟವು ತೋರಿಸಿದೆ, ಆದರೆ ಇತರ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಸೇರಿದಂತೆ ಇತರ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವುದಿಲ್ಲ.ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ, ವಿಸ್ತೃತ ES31L rRNA ನಷ್ಟದಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಅಂತರವನ್ನು msL2 ಆಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಶೂನ್ಯದಲ್ಲಿ, msL2 rRNA ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ES31L ನಷ್ಟವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 6).
ಇ. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ msL2 ನ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸಾಂದ್ರತೆ ಮತ್ತು ಮಾದರಿ.b ಸ್ಯಾಕ್ರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯ 80S ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ES19L rRNA ವರ್ಧನೆಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯನ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಹೋಗಿವೆ.V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಹಿಂದೆ ಸ್ಥಾಪಿತವಾದ ರಚನೆಯು ಈ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಲ್ಲಿ ES19L ನಷ್ಟವನ್ನು ಹೊಸ msL1 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ವಿಕಾಸದಿಂದ ಸರಿದೂಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ RNA ಮಿಮಿಕ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅನ್ನು ES19L ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಸ್ಪಷ್ಟ ಪರಿಹಾರವಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, msL2 (ಪ್ರಸ್ತುತ ಕಾಲ್ಪನಿಕ ECU06_1135 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಂದು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ) ಮತ್ತು msL1 ವಿಭಿನ್ನ ರಚನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.c ವಿಕಸನೀಯವಾಗಿ ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದ msL1 ಮತ್ತು msL2 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ಪೀಳಿಗೆಯ ಈ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ತಮ್ಮ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಯಲ್ಲಿ ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದರೆ, ಅವು ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳ ಸಣ್ಣ ಉಪವಿಭಾಗದಲ್ಲೂ ಅಭೂತಪೂರ್ವ ಮಟ್ಟದ ಸಂಯೋಜನೆಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಮೂಲ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸವನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟಪಡಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಕಡಿಮೆಯಾದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮತ್ತು ಜಾತಿಗಳಾದ್ಯಂತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ ಅಸಹಜ ವ್ಯತ್ಯಾಸಕ್ಕೆ ಹೆಸರುವಾಸಿಯಾಗಿದೆ.
ನಾವು ನಂತರ msL2 ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅನ್ನು ಹಿಂದೆ ವಿವರಿಸಿದ msL1 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದೆವು, V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಏಕೈಕ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್.msL1 ಮತ್ತು msL2 ವಿಕಸನೀಯವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆಯೇ ಎಂಬುದನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ನಾವು ಬಯಸಿದ್ದೇವೆ.ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ msL1 ಮತ್ತು msL2 ಒಂದೇ ಕುಳಿಯನ್ನು ಆಕ್ರಮಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ತೋರಿಸಿದೆ, ಆದರೆ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಮತ್ತು ತೃತೀಯ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಅವುಗಳ ಸ್ವತಂತ್ರ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 6).ಹೀಗಾಗಿ, msL2 ನ ನಮ್ಮ ಆವಿಷ್ಕಾರವು rRNA ತುಣುಕುಗಳ ನಷ್ಟವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸಲು ಕಾಂಪ್ಯಾಕ್ಟ್ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜಾತಿಗಳ ಗುಂಪುಗಳು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ವಿಕಸನಗೊಳಿಸಬಹುದು ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಪುರಾವೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಒಂದೇ ಕುಟುಂಬದ 81 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಒಂದು ಬದಲಾಗದ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವಲ್ಲಿ ಈ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿದೆ.ವಿಸ್ತೃತ rRNA ವಿಭಾಗಗಳ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದ ವಿವಿಧ ವರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ msL1 ಮತ್ತು msL2 ಗೋಚರಿಸುವಿಕೆಯು ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ಅವನತಿಯು ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಸರಿದೂಗಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ವಿವಿಧ ಪರಾವಲಂಬಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸ್ವಾಧೀನಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.ರಚನೆಗಳು.
ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ನಮ್ಮ ಮಾದರಿಯು ಪೂರ್ಣಗೊಂಡಾಗ, ನಾವು ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಊಹಿಸಲಾದ E. ಕ್ಯೂನಿಕುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಹೋಲಿಸಿದ್ದೇವೆ.eL14, eL38, eL41, ಮತ್ತು eS30 ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಜೀನೋಮ್‌ನಿಂದ ಅವುಗಳ ಹೋಮೋಲಾಗ್‌ಗಳ ಸ್ಪಷ್ಟ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಿಂದಾಗಿ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಜೀನೋಮ್‌ನಿಂದ ಕಾಣೆಯಾಗಿದೆ ಎಂದು ಹಿಂದೆ ಭಾವಿಸಲಾಗಿತ್ತು.ಅನೇಕ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ನಷ್ಟವು ಇತರ ಹೆಚ್ಚು ಕಡಿಮೆಯಾದ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಮತ್ತು ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು 54 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಒಂದೇ ಕುಟುಂಬವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಕೇವಲ 11 ಹೋಸ್ಟ್-ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆ ಮಾಡಬಹುದಾದ ಹೋಮೊಲಾಗ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.ಈ ಕಲ್ಪನೆಗೆ ಬೆಂಬಲವಾಗಿ, eL38 ಮತ್ತು eL4131,32 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ಕೊರತೆಯಿರುವ V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ನಷ್ಟವನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಆದಾಗ್ಯೂ, E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಕೇವಲ eL38, eL41 ಮತ್ತು eS30 ಮಾತ್ರ ಕಳೆದುಹೋಗಿವೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ರಚನೆಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ.eL14 ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ನಮ್ಮ ರಚನೆಯು ಈ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅನ್ನು ಹೋಮಾಲಜಿ ಹುಡುಕಾಟದಲ್ಲಿ ಏಕೆ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಗಲಿಲ್ಲ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ (ಚಿತ್ರ 7).E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, rRNA-ಆಂಪ್ಲಿಫೈಡ್ ES39L ನ ಅವನತಿಯಿಂದಾಗಿ eL14 ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಭಾಗವು ಕಳೆದುಹೋಗುತ್ತದೆ.ES39L ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ, eL14 ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿತು, ಮತ್ತು eL14 ಅನುಕ್ರಮದ ಕೇವಲ 18% ಮಾತ್ರ E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಮತ್ತು S. ಸೆರೆವಿಸಿಯಾದಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಆಗಿರುತ್ತದೆ.ಈ ಕಳಪೆ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಸ್ಯಾಕ್ರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯೆ ಮತ್ತು ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್-1.5 ಶತಕೋಟಿ ವರ್ಷಗಳ ಅಂತರದಲ್ಲಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡ ಜೀವಿಗಳು-ಇಎಲ್ 14 ನಲ್ಲಿ 51% ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಅದೇ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ eL14 ಅನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತ M970_061160 ಪ್ರೊಟೀನ್ ಎಂದು ಏಕೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು eL1427 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅಲ್ಲ ಎಂದು ಸಂರಕ್ಷಣೆಯ ಈ ಅಸಂಗತ ನಷ್ಟವು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.
ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್ ES39L rRNA ವಿಸ್ತರಣೆಯನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿತು, ಇದು eL14 ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಭಾಗಶಃ ತೆಗೆದುಹಾಕಿತು.ES39L ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ, eL14 ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೋರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಹಿಂದಿನ rRNA-ಬಂಧಕ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಕನಿಷ್ಠ ಉದ್ದದ ಲೂಪ್ ಆಗಿ ಕ್ಷೀಣಿಸುತ್ತದೆ.b ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯು eL14 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ (57% ಯೀಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಹೋಮೊಲಾಗ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತು), ಆದರೆ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಳಪೆಯಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ (ಇದರಲ್ಲಿ 24% ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಶೇಷಗಳು ಹೋಮೋಲೋಗ್‌ಗೆ ಹೋಲುವಂತಿಲ್ಲ).S. ಸೆರೆವಿಸಿಯಾ ಅಥವಾ H. ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ ನಿಂದ).ಈ ಕಳಪೆ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಮತ್ತು ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿಯಲ್ಲಿ eL14 ಹೋಮೋಲಾಗ್ ಏಕೆ ಕಂಡುಬಂದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯಲ್ಲಿ ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಳೆದುಹೋಗಿದೆ ಎಂದು ಏಕೆ ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, E. ಕ್ಯುನಿಕುಲಿ eL14 ಅನ್ನು ಹಿಂದೆ M970_061160 ಪ್ರೊಟೀನ್ ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ.ಈ ಅವಲೋಕನವು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜೀನೋಮ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತ ಅತಿಯಾಗಿ ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ: ಪ್ರಸ್ತುತ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಹೋಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾದ ಕೆಲವು ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೂ ಹೆಚ್ಚು ವಿಭಿನ್ನ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ;ಬದಲಿಗೆ, ಕೆಲವು ವರ್ಮ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಕೋಡ್ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ (ಉದಾ, ಕಾಲ್ಪನಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ M970_061160) ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಇತರ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ.
ಈ ಸಂಶೋಧನೆಯು rRNA ಡಿನಾಟರೇಶನ್ ಪಕ್ಕದ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯ ನಾಟಕೀಯ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೋಮಾಲಜಿ ಹುಡುಕಾಟಗಳಿಗೆ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಹೀಗಾಗಿ, ನಾವು ಸಣ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅಣುಗಳ ಅವನತಿಯ ನಿಜವಾದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಅತಿಯಾಗಿ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಬಹುದು, ಏಕೆಂದರೆ ಕಳೆದುಹೋಗಿವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾದ ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಬದಲಾದ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ.
ವಿಪರೀತ ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ತಮ್ಮ ಆಣ್ವಿಕ ಯಂತ್ರಗಳ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೇಗೆ ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು?ನಮ್ಮ ಅಧ್ಯಯನವು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯ ಸಂಕೀರ್ಣ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಯನ್ನು (ರೈಬೋಸೋಮ್) ವಿವರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಈ ಪ್ರಶ್ನೆಗೆ ಉತ್ತರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಚಿಕ್ಕ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅಣುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅವುಗಳ ಏಕರೂಪದ ಅಣುಗಳಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸುಮಾರು ಎರಡು ದಶಕಗಳಿಂದ ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳು ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ಕೇಂದ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಗಾತ್ರದ 50% ಕ್ಕೆ ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ.ಮಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವ ಅನೇಕ ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಅನೇಕ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಮತ್ತು ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಸಣ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೀವಿಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು ಹಲವಾರು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಮೂರನೇ ಒಂದು ಭಾಗದಷ್ಟು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ics.
ಸ್ಥೂಲ ಅಣುಗಳ ರಚನೆಯು ವಿಕಸನದ ಅನೇಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಬಹುದು ಎಂದು ನಮ್ಮ ಅಧ್ಯಯನವು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಹೋಸ್ಟ್-ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲು ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ (ಅನುಬಂಧ ಚಿತ್ರ. 7).ಉದಾಹರಣೆಗೆ, eL14 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ನ ಉದಾಹರಣೆಯು ಪರಾವಲಂಬಿ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಆಣ್ವಿಕ ಉಪಕರಣದ ಅವನತಿಯ ನಿಜವಾದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ನಾವು ಅತಿಯಾಗಿ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ಎನ್ಸೆಫಾಲಿಟಿಕ್ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ನೂರಾರು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಈಗ ನಂಬಲಾಗಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ತೋರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ಕೆಲವು ಜೀನ್‌ಗಳು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಇತರ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವ ಜೀನ್‌ಗಳ ವಿಭಿನ್ನ ರೂಪಾಂತರಗಳಾಗಿವೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ.ಇದಲ್ಲದೆ, msL2 ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಉದಾಹರಣೆಯು ನಾವು ಹೊಸ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಕಡೆಗಣಿಸುತ್ತೇವೆ ಮತ್ತು ಪರಾವಲಂಬಿ ಆಣ್ವಿಕ ಯಂತ್ರಗಳ ವಿಷಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಅಂದಾಜು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ಉದಾಹರಣೆಯು ಪರಾವಲಂಬಿ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿನ ಅತ್ಯಂತ ಚತುರ ಆವಿಷ್ಕಾರಗಳನ್ನು ನಾವು ಹೇಗೆ ಕಡೆಗಣಿಸಬಹುದು ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ ಅದು ಅವರಿಗೆ ಹೊಸ ಜೈವಿಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಒಟ್ಟಾಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಂಡರೆ, ಈ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಹೋಸ್ಟ್-ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಮುಕ್ತ-ಜೀವಂತ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅವುಗಳ ಪ್ರತಿರೂಪಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಬಗ್ಗೆ ನಮ್ಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ.ಆಣ್ವಿಕ ಯಂತ್ರಗಳು, ಕಡಿಮೆ ಎಂದು ದೀರ್ಘಕಾಲ ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಕ್ಷೀಣಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿರುತ್ತದೆ, ಬದಲಿಗೆ ವ್ಯವಸ್ಥಿತವಾಗಿ ಕಡೆಗಣಿಸಲಾದ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ರಚನಾತ್ಮಕ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ನಾವು ತೋರಿಸುತ್ತೇವೆ.
ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿಯ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡ ಬೃಹತ್-ಅಲ್ಲದ rRNA ತುಣುಕುಗಳು ಮತ್ತು ಫ್ಯೂಸ್ಡ್ ತುಣುಕುಗಳು ಜೀನೋಮ್ ಕಡಿತವು ಜೀವನದ ಮೂರು ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಮೂಲಭೂತ ಆಣ್ವಿಕ ಯಂತ್ರಗಳ ಭಾಗಗಳನ್ನು ಸಹ ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ - ಸುಮಾರು 3.5 ಶತಕೋಟಿ ವರ್ಷಗಳ ನಂತರ .ಜಾತಿಗಳ ಸ್ವತಂತ್ರ ವಿಕಸನ.
E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಉಬ್ಬು-ಮುಕ್ತ ಮತ್ತು ಸಮ್ಮಿಳನಗೊಂಡ rRNA ತುಣುಕುಗಳು ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಟಿಕ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ RNA ಅಣುಗಳ ಹಿಂದಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳ ಬೆಳಕಿನಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆಸಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಗಿಡಹೇನುಗಳ ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್ ಬುಚ್ನೆರಾ ಅಫಿಡಿಕೋಲಾದಲ್ಲಿ, ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳು ಎ+ಟಿ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಪಕ್ಷಪಾತ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದಿಂದಾಗಿ ತಾಪಮಾನ-ಸೂಕ್ಷ್ಮ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ20,50.ಆರ್‌ಎನ್‌ಎದಲ್ಲಿನ ಈ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಪಾಲುದಾರರ ಮೇಲೆ ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್‌ಗಳ ಅತಿಯಾದ ಅವಲಂಬನೆಗೆ ಮತ್ತು ಶಾಖ 21, 23 ಅನ್ನು ವರ್ಗಾಯಿಸಲು ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಾಂಟ್‌ಗಳ ಅಸಮರ್ಥತೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಈಗ ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ.ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ಈ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಸ್ವರೂಪವು ಕಡಿಮೆ ಉಷ್ಣ ಸ್ಥಿರತೆ ಮತ್ತು ಚಾಪೆರೋನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಮೇಲಿನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅವಲಂಬನೆಯು ಕಡಿಮೆ ಜಿನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅಣುಗಳ ಸಾಮಾನ್ಯ ಲಕ್ಷಣಗಳಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, ಪರಾವಲಂಬಿ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾವು ವಿಶಾಲವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ rRNA ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ವಿರೋಧಿಸುವ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ವಿಕಸನಗೊಳಿಸಿದೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ರಚನೆಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ.ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆ ಅವನತಿ..rRNAಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತುಣುಕುಗಳ ನಷ್ಟವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸುವ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳು ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿಯ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳು uL15 ಮತ್ತು eL30 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಉಳಿಕೆಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬ ಅಂಶದಿಂದ ಈ ಅಭಿಪ್ರಾಯವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುವುದು ಧನಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಉತ್ಪನ್ನವಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳಿಗೆ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕಾಗಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಜೀವಿಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಸ್ಮಾರ್ಟ್ ನಾವೀನ್ಯತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪರಾವಲಂಬಿ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳು ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸುವ ವಿಕಾಸದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ ತಮ್ಮ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೇಗೆ ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಕುರಿತು ನಮಗೆ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಪ್ರಸ್ತುತ, ಈ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ.ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿನ ಈ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ನೋಟವು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವೆ ಏಕೆ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ.ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ವಿ. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್‌ನ eL20 ಮತ್ತು K172 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ F170 ಶೇಷದ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇಯ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಏಕೆ ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್‌ನ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ.ಈ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯು ಶೇಷ 43 uL6 (ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪಾಕೆಟ್ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿದೆ) ನಿಂದ ಉಂಟಾಗಬಹುದು, ಇದು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಟೈರೋಸಿನ್ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು E. ಕ್ಯೂನಿಕ್ಯುಲಿ ಮತ್ತು P. ಲೋಕಸ್ಟೇಯಲ್ಲಿ ಥ್ರೆಯೋನಿನ್ ಅಲ್ಲ.Tyr43 ನ ಬೃಹತ್ ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಸೈಡ್ ಚೈನ್ ಸ್ಟೆರಿಕ್ ಅತಿಕ್ರಮಣದಿಂದಾಗಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್‌ಗೆ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಬಹುದು.ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ, ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯು ಕ್ರಯೋ-ಇಎಮ್ ಇಮೇಜಿಂಗ್‌ನ ಕಡಿಮೆ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿರಬಹುದು, ಇದು V. ನೆಕಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ತುಣುಕುಗಳ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್‌ಗೆ ಅಡ್ಡಿಯಾಗುತ್ತದೆ.
ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, ನಮ್ಮ ಕೆಲಸವು ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆಯುವಿಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಆವಿಷ್ಕಾರಕ ಶಕ್ತಿಯಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ತುಣುಕುಗಳ ನಷ್ಟವು ರೈಬೋಸೋಮ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುವ ವಿಕಸನೀಯ ಒತ್ತಡವನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ರಚನೆಯು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್‌ನಿಂದ ದೂರದಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆಯಾದ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಯಿಂದ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಬಹುದಾದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು (ಅಥವಾ ಪುನಃಸ್ಥಾಪಿಸಲು) ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಪ್ರಮುಖ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಜೀನ್ ಡ್ರಿಫ್ಟ್ ಅನ್ನು ಬಫರ್ ಮಾಡುವ ಅಗತ್ಯವಾಗಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿದೆ ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಬಹುಶಃ ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್‌ನಿಂದ ಉತ್ತಮವಾಗಿ ವಿವರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಇದು ಇತರ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಇದುವರೆಗೆ ಗಮನಿಸಿಲ್ಲ.ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್-ಬಂಧಿಸುವ ಅವಶೇಷಗಳು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇತರ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳು ಕಣ್ಮರೆಯಾಗಲು ಕಾಯುತ್ತಿರುವ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲ ಅಥವಾ ವೈಯಕ್ತಿಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳ ರೂಪಕ್ಕೆ ಮರುಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅಂತಿಮ ತಾಣವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಬದಲಾಗಿ, ಈ ಸೈಟ್ ಧನಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಹಲವಾರು ಸುತ್ತುಗಳಲ್ಲಿ ವಿಕಸನಗೊಳ್ಳಬಹುದಾದ ಉಪಯುಕ್ತ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯದಂತೆ ತೋರುತ್ತಿದೆ.ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಉಪ-ಉತ್ಪನ್ನವಾಗಿರಬಹುದು: ಒಮ್ಮೆ ES39L ಕ್ಷೀಣಿಸಿದರೆ, ES39L ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ತವಾದ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಜೈವಿಕ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಮರುಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಮೈಕ್ರೊಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಒತ್ತಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ES39L ನಲ್ಲಿನ A3186 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ನ ಅಣು ಸಂಪರ್ಕಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸಬಲ್ಲದರಿಂದ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅಣುವು ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನ ಬಿಲ್ಡಿಂಗ್ ಬ್ಲಾಕ್ ಆಗುತ್ತದೆ, eL30 ಅನುಕ್ರಮದ ರೂಪಾಂತರದಿಂದ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯು ಮತ್ತಷ್ಟು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ.
ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ವಿಕಸನಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ನಮ್ಮ ಅಧ್ಯಯನವು ಡಾರ್ವಿನಿಯನ್ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಶಕ್ತಿಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆಯುವಿಕೆಯ ಆನುವಂಶಿಕ ಡ್ರಿಫ್ಟ್ ಸಮಾನಾಂತರವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಆಂದೋಲನವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ, ಆನುವಂಶಿಕ ದಿಕ್ಚ್ಯುತಿಯು ಜೈವಿಕ ಅಣುಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ನಿವಾರಿಸುತ್ತದೆ, ಪರಿಹಾರವು ತುಂಬಾ ಅಗತ್ಯವಾಗಿದೆ.ಡಾರ್ವಿನಿಯನ್ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಮೂಲಕ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಈ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ಪೂರೈಸಿದಾಗ ಮಾತ್ರ ಅವರ ಸ್ಥೂಲ ಅಣುಗಳು ತಮ್ಮ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಭಾವಶಾಲಿ ಮತ್ತು ನವೀನ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಅವಕಾಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.ಮುಖ್ಯವಾಗಿ, E. ಕ್ಯುನಿಕ್ಯುಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್‌ನಲ್ಲಿನ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳ ವಿಕಸನವು ಆಣ್ವಿಕ ವಿಕಸನದ ಈ ನಷ್ಟ-ಲಾಭದ ಮಾದರಿಯು ಹಾನಿಕಾರಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ವಿರೂಪಗೊಳಿಸುವುದಲ್ಲದೆ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಪರಾವಲಂಬಿ ಸ್ಥೂಲ ಅಣುಗಳ ಮೇಲೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಹೊಸ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಈ ಕಲ್ಪನೆಯು ಸೆವೆಲ್ ರೈಟ್‌ನ ಚಲಿಸುವ ಸಮತೋಲನ ಸಿದ್ಧಾಂತದೊಂದಿಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿದೆ, ಇದು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು 51,52,53 ಅನ್ನು ಆವಿಷ್ಕರಿಸುವ ಜೀವಿಗಳ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಮಿತಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಹೇಳುತ್ತದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಆನುವಂಶಿಕ ದಿಕ್ಚ್ಯುತಿಯು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಿದರೆ, ಈ ದಿಕ್ಚ್ಯುತಿಗಳು ತಮ್ಮಲ್ಲಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಿಲ್ಲದ (ಅಥವಾ ಹಾನಿಕಾರಕ) ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಬಹುದು ಆದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಫಿಟ್‌ನೆಸ್ ಅಥವಾ ಹೊಸ ಜೈವಿಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.ಜೈವಿಕ ಅಣುಗಳ ಮಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಅದೇ ರೀತಿಯ ರೂಪಾಂತರವು ಅದರ ಸುಧಾರಣೆಗೆ ಮುಖ್ಯ ಪ್ರಚೋದಕವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಎಂದು ವಿವರಿಸುವ ಮೂಲಕ ನಮ್ಮ ಚೌಕಟ್ಟು ಈ ಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ.ಗೆಲುವು-ಗೆಲುವಿನ ವಿಕಸನೀಯ ಮಾದರಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ, ನಮ್ಮ ಅಧ್ಯಯನವು ಜೀನೋಮ್ ಕೊಳೆತವನ್ನು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ ಕ್ಷೀಣಗೊಳ್ಳುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ನೋಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ನಾವೀನ್ಯತೆಯ ಪ್ರಮುಖ ಚಾಲಕವಾಗಿದೆ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಮತ್ತು ಬಹುಶಃ ಮ್ಯಾಕ್ರೋ ಅಣುಗಳು ಹೊಸ ಪರಾವಲಂಬಿ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.ಅವುಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು.