Gratias tibi ago pro natura.com adire.Versio navigatoris utens quam subsidia limitata CSS habet.Ad optimam experientiam commendamus ut navigatro renovato uteris (vel inactivare Compatibilitas Modus in Penitus Rimor).Interea, ut subsidia continua conservent, locum sine stylis et JavaScript reddemus.
Lupinus angustifolius (NLL, Lupinus angustifolius L.) est leguminosa planta ad esculentas productionis et solius emendationem adhibita.Expansio globalis NLL sicut seges multos fungos pathogenicos attraxit, incluso lupino anthracnoso, qui morbum anthracnosum devastat.Duae allelae, Lanr1 et AnMan, quae resistentiam auctam conferunt, in NLL fetura adhibitae sunt, sed subjectae machinae hypotheticae ignotae manent.In hoc studio, Lanr1 et AnMan figentes usi sunt ad exempla NLL Europaei protegendi.Probatio vaccini in ambitu moderato efficaciam utriusque oblatorum resistentium confirmavit.Differentialis dictio gene profiling fiebat in lineis repraesentativis repugnantibus et susceptibilibus.Anthracnosa resistentia consociata cum nimia expressione generum ontologiae nominum "GO:0006952 defensionis Responsio", "GO:0055114 Processus Redox", et "GO:0015979 Photosynthesis".Praeterea Lanr1(83A:476) linea significans transcriptum ostendit reprogrammatum celerius post inoculationem, dum aliae lineae moram in hac responsione per circiter 42 horas demonstraverunt.Responsiones defensionis sociantur cum genes TIR-NBS, CC-NBS-LRR et NBS-LRR, 10 servo in pathogenesi involuti, translationis lipidorum, endoglucani-1,3-β-glucosidasi, muri celluli glycinei divitum servo, et gena e tramite reactivo oxygenii.Praemature responsiones ad 83A:476, inter accuratam suppressionem genesis cum photosynthesi consociata, cum incremento vegetativo per periodum biologiae fungalis felicis tutelae incidit, suggerens effectorem triggers immunitatem.Mandeloop reactionem retardatur, ut altiore horizontali trahatur.
Lupinus angustus-foliatus (NLL, Lupinus angustifolius L.) est dapibus summus sacrificii in regione Mediterraneana occidentali oriundus, 1.2.Nunc adulta est ut seges esculentis animalibus et hominibus.Consideratur etiam viridis stercoris in segetibus systematis gyrationis ob nitrogenium fixationis symbioticae nitrogenii bacterii fixi et altiore structurae solii emendatio.NLL rapidum domesticationis processum in superiore saeculo passus est et adhuc sub alto fetura pressuris 3,4,5,6,7,8,9,10,11,12.Cum diffusa NLL cultura, successio fungi pathogenici novas scholas agriculturae excoluit et novos morbos segetes destruentes effecit. Praestantissima lupinorum agricolarum et eculorum species erat anthracnosi, causata fungus morbificae, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Praestantissima lupinorum agricolarum et eculorum species erat anthracnosi, causata fungus morbificae, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. аиболее примечательным для ермеров и селекционеров люпина было появление антракнозка, вызванного вызванного вызванного . dar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Praeclarissimus lupinorum cultoribus et eculis ortus erat anthracnose ex fungo pathogenico Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原真菌 Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13Colletotrichum lupini (Bondar) Haired。1 аиболее поразительным для ермеров и селекционеров люпина вляется появление антракнозного вызыпаееного вызыпаееного вызы паееного вызы паеноного to аеноноо . ni (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Praestantissima lupinis colonis et eculis est ortus anthracnosos ex fungo pathogenico Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13.Primae morbi relationes e Brasilia et Civitatibus Foederatis Americae advenerunt, cum indicia typica anno 1912 et 1929 comparentia respective.Tamen, post 30 annos circiter, pathogen designatum est Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. & Sacc., teleomorph Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., teleomorph Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., телеоморф Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., teleomorph of Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc.Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld。 & Sacc.Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld。 & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld в еленаправленной орфологии. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld in Targeted Morphology. & H. Schrenk,. & H. Schrenk, .and H. Schrenk. & H. & H.and H. Schlenk, .Morbus praeliminaris phenotyping in medio 20th century facto in NLL lupino flavo (L. luteo L.) accessiones aliquas resistentias ostendit, sed omnes lupini albi (L. albus L.) accessiones probatae valde susceptible erant 15,16.Studiis docuimus progressum anthracnosum cum praecipitatione aucta (aeris humiditatis) et temperaturae (in latitudine 12-28°C) coniungi, ducens ad resistentiae violationem in superioribus temperaturis 17, 18. Re quidem vera, tempus conidiae germinandi et morbi incipiendi requisitum, quater brevius erat in 24°C (4 horis) quam ad 12°C (16 horas) sub alta humiditate conditiones 19 .Sic calefactio globalis permanentis ad anthracnosam dilatationem perduxit.Morbus tamen observatus est in Gallia (1982) et Ucraina (1983) quasi praenuntia imminentis comminationis, sed videtur neglecta industria lupini tempore 20,21.Paucis post annis hic morbus vastus per totum mundum diffusus est ac etiam maioribus regionibus lupino producendis afficiebatur, ut Australia, Polonia et Germania 22, 23,24.Sequens tumultum anthracnosum in medio annorum 1990, ampla protegendi consecuta est identificatio plurium oblatorum resistentium in NLL19 exemplis.NLL resistentia anthracnoso regitur per duas allelas dominas separatas in diversis fontibus germplasmi inventas: Lanr1 in cultivar Tanjil et Wonga et AnMan in cultivar.Mandalay 25, 26. Hae allelae complent figmenta hypotheticas quae sustinent electionem germplasmi repugnantis in programmatis fetura 25, 26, 27, 28, 29,30.Resistentia fetura 83A:476 portante Lanr1 allelam transmissa est cum linea silvestri P27255 ad obtinendum RIL populationem segregantem pro resistentia anthracnosa, quae effecit ut Locum Lanr1 chromosomatum NLL-1131, 32, 33. Connexionis tabularum notarum transfretandi a resistentia locorum ad anthracnosim cum genomica in omnibus tribus locis (NL-11-11) patefactis in omnibus positionibus (NL. 34,35.Nihilominus, ob paucitatem RILs et magnam distantiam geneticae inter venalicium et allelarum respondentem, nullae certae conclusiones de genes subiectae sumi possunt.E contra, usus geneticorum e contrario in lupinis difficilis est propter nimiam regenerationem potentialem, quae manipulationem geneticam facit gravia.
Explicatio germplasmi domestici allelam desideratam in statu homozygoo ferens, ut 83A:476 (Lanr1) et Mandelup (AnMan), ianuam aperuit ut resistentiam anthracnosam studeat in facie praesentiae coniunctionum adversarum allelarum in populis agrestibus.Facultates machinationes hypotheticae.Confer responsiones defensionis genotypes specificas generatas.Hoc studium aestimavit transcriptum antiquum NLL ad C. lupini vaccination.Primum, tabulae germplasmi Europae NLL continens 215 lineas muniebat adhibitis figmentis hypotheticis quae Lanr1 et AnMan alleles notant.Anthracnosum phaenotypum tunc in 50 NLL lineis fiebat, antea ad venalicium hypotheticum delectus, sub conditionibus moderatis.Ex his experimentis, quattuor lineae in anthracnoso resistentia differentes et Lanr1/AnMan compositio allelica selectae sunt ad differentiam gene locutionis defensionis profiling, utentes duas accessiones complementarias: summus throughput RNA sequens ac real-time PCR quantitatis.
Tegendis propositio NLL germplasmi (N = 215) cum notis Lanr1 (Anseq3 et Anseq4) et AnMan (Anseq4) et AnMan (AnManM1) ostendit unam tantum lineam (95726, prope Salamanca-b) amplificat allelam "resistentiam" pro omnibus figmentis, dum "praesentia allelarum" 158 (~73) proportionem allelarum (~ 73) invenit.Tresdecim lineae duas allelae Lanr1 titulum productae sunt, et 8 lineae productae "resistentes" allelae Lanr1 productae sunt.titulum.The "resistentia" allelarum AnMan titulum (Supplementary Table S1).Duae lineae heterozygoae erant pro Anseq3 titulo et una heterozygoa pro AnManM1 titulo.42 lineae (19.5%) oppositas gradus Allelarum Anseq3 et Anseq4 detulerunt, significantes magnam frequentiam recombinationis inter hos duos locos.Phenotypa anthracnosa sub conditionibus moderatis (Tabulae S2 Supplementaria) variabilitatem manifestavit in resistentia genotyporum probatorum, quae in acerbitate anthracnosi repercussa erat.Differentiae scorpii in sordido ab 1.8 (modice resistentes) ad 6.9 (susceptibiles) et differentiae pon- tae ab 0.62 (susceptibiles) ad 4.45 g (resistentes). Nota inter valores in duabus experimentorum replicationibus observatis (0,51 pro morborum acerbitate ustulo, P = 0.00017 et 0,61 ponderis plantarum, P < 0.0001) necnon inter hos duos parametri (− 0.59 et − 0,77, P <0.0001). Notabilis erat relatio inter valores experimenti observatos in duabus replicationibus (0,51 pro morborum acerbitate ustulo, P = 0.00017 et 0.61 ad pondus plantarum, P < 0.0001) necnon inter hos duos parametri (− 0.59 et − 0,77, P <0.0001). влена ​​достоверная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях эксперимента (0,51 длои инаиента (0,51 длои и) (0,51 длои и ксперимента (0,51 длоо инаиента (0,51 дло; и 0,61 для массы растения, P <0,0001), а также ежду тими двумя параметрами (-0,59 и -0,77, <0,0001) 0,0001). Nota relatio inter valores observatos in duabus repetitionibus experimenti (0,51 pro morborum acerbitate ustulo, P = 0.00017 et 0,61 ad pondus plantarum, P <0.0001), necnon inter hos duos parametri (- 0.59 et -0.77, P <0.0001) 0.0001).0.51，P = 0.00017，植物重量为0.61，P < 0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 - 0.77，P < 0.0001)。0.51 ， p = 0.00017 0.61 p <0.0001） - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 - 0.59 аблюдалась начительная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях (оценка, тяжлести саеа товторностях (оценка, тяжести аатина а растения 0,61, P<0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,0001) 0,77, P<0,0001. Nota fuit relatio inter valores in du- plici observatos (morbus severitatis 0.51, P = 0.00017 et pondus plantarum 0.61, P < 0.0001) et inter hos duos parametri (-0.59 et -0 .0001) 0.77, P<0.0001. ).Signa typica visa in plantis susceptilibus includunt kinking et retorto caulis instar "arcus pastoris" structuram, quam sequuntur laesiones ovales sporozoitis aurantiis/rosei (supplementariae Fig. 1).Accessiones Australiae portantes Lanr1 (83A:476 et Tanjil) et AnMan (Mandelup) genes mediocriter repugnant, 0,0331 et 0.0036).Nonnullae lineae quae etiam "reluctans" Lanr1 et/vel AnMan allelae signa morbi ferunt.
Interestingly, paucae NLL lineae quaecunque desunt lineae "repugnantis" titulum allelae altam anthracnosi resistentiae (comparabilem vel altiorem quam pro genotypes Lanr1 vel AnMan), ut Boregine (P valor <0.0001 utriusque parametri), Bojar (P valor <0.0001 pro sexaginta et 0.001 pro pondere ponderis) et Incolae B-549/79b (P valorem <0.0001 pro utroque parametri), Bojar (P valor <0.0001 pro sexaginta et 0.001 pro pondere ponderis) et Incolae B-549/79b (P valorem <0.0001 pro pondere et non significatu). Interestingly, paucae NLL lineae quaecunque desunt lineae "repugnantis" titulum allelae altam anthracnosi resistentiae (comparabilem vel altiorem quam pro genotypes Lanr1 vel AnMan), ut Boregine (P valor <0.0001 utriusque parametri), Bojar (P valor <0.0001 pro sexaginta et 0.001 pro pondere ponderis) et Incolae B-549/79b (P valorem <0.0001 pro utroque parametri), Bojar (P valor <0.0001 pro sexaginta et 0.001 pro pondere ponderis) et Incolae B-549/79b (P valorem <0.0001 pro pondere et non significatu). нтересно, то несколько линий NLL, лишенных какого-либо «резистентного» маркерного алленн каказалиро показолиовоказалиоокаалио к антракнозу (сопоставимый или более высокий, чем д. начение P < 0,0001 для оценки и 0,001 для массы растения) и популяции B-549/79b (значение P <0,0001 для оыенки и незначи сляначи сляначи слначи си. Interestingly, plures lineae NLL quibuscunque 'resistentis' titulus allele carentibus ostendit anthracnosum (comparabilem vel superiorem quam Lanr1 vel AnMan genotypes), ut Boregine (P valor <0.0001 utriusque parametri), Bojar (P valorem <0.0001 ad aestimationem et 0.001 ad pondus plantarum) et incolarum B-549/79b (P valor <0.0001 pro utroque parametro), Bojar (P valorem <0.0001 ad aestimationem et 0.001 ad pondus plantarum) et multitudo B-549/79b (P 0.000b pondus) et multitudo B-549/79b (P valor <0.0001 pro utroque parametro), Bojar (P valor <0.0001 pro aestimatione et 0.001 ad pondus plantarum) et multitudo B-549/79b (P valoris <0.0001 pro utroque parametri)有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽病抗性（与Lanr1 或AnMan 基因型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001，植物重量为0.001）和种群B-549/79b（得分P 值< 0.0001，重量不显着）。 Iucundum est nonnullas rationes NLL, quae nullum "antigenicum" figunt, altam resistentiam horizontalem ostendunt (aequivalent gena Lanr1 vel AnMan vel superior), ut Boregine (parametri P < 0.0001), Bojar (valorem P <0.0001, pondus plantae 0.001) et intendere B-549/79b (valorem P < 0.0001, pondus non significantem). Интересно, что некоторые лтто некоторые лаких, лишенные какихостий лезиернххнтности »пезизали высокие уровни высоки уровни высоки уровни высокие уровни высоки уровни встойчи Вости к Антракнозу (Сравнимые или Выше, чем ули генотипов Lanr1 или Anman), такметров дбоих (закмение для <обоих параметров <0,01), Bojar ( значение P <0-201, Масса растения 0,001) и популяля b, DXLIX / 79b (оценка p-значение <0,0001 засса незначиельна). Interestingly, nonnullae lineae NLL quibuscunque 'resistentiae' titulus allelae carent, gradus anthracnosi resistentiae (comparabiles vel altiores quam Lanr1 vel AnMan genotypes), ut Boregine (P valor utriusque parametri <0.0001), Bojar (P-valu < 0.0001, pondus 0.001) et multitudo B-549/79b (P-value notabile).Hoc phaenomenon suggerit possibilitatem novi fontis genetici resistendi, observata correlationi defectus explicans inter genotypa et phaenotypa morborum (P valores ab ~0.42 ad ~0.98).Ita, Kolmogorov-Smirnov experimentum ostendit notitias in anthracnosa resistentia proxime normaliter distributas esse pro ustulo (P-valores 0.25 et 0.11) et massam plantare (P-valores 0.47 et 0.55), suggerens hypothesizare plus allelae quam Lanr1 et AnMan implicari.
Ex eventibus resistentiae anthracnosi protegendo, 4 lineae ad analysim transcriptoma selectae sunt: ​​83A:476, Boregine, Mandelup et Populatio 22660. Hae lineae anthrax resistentiae in experimentis inoculationis ab RNA sequencentibus retestabantur, dummodo eaedem essent ac in priore experimento.Octoginta valores fuerunt: Boregin (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), Mandelup (3.82 ± 1.42) et incolarum 22660 (6.11 ± 1.29).
Illumina NovaSeq 6000 protocollum medium 40.5 Mread paria per specimen consecuta (29.7 ad 54.4 Mreads) (Tabula supplementaria S3).Noctis ustulo in ordine referente distans ab 75.5% ad 88.6%.Mediocris relatio lectionis computationis notitiarum inter variantes experimentales inter replicationes biologicas ab 0.812 ad 0.997 ordinatas (medium 0.959). Ex 35, 170 genes explicantur, 2917 nulla expressio revelatur, et reliqua 4785 gena in gradu contemptibili expressa sunt (basi medium < 5). Ex 35, 170 genes explicantur, 2917 nulla expressio revelatur, et reliqua 4785 gena in gradu contemptibili expressa sunt (basi medium < 5). 35 170 проанализированных енов 2917 не проявляли экспрессии, а остальные 4785 енов экспрессировалису (наловалису (на остальные вое среднее<5). 35. 170 genes explicantur, 2917 nullam expressionem ostenderunt, et reliquae 4785 genes expressae sunt in gradu vili (basi medium <5).35,170 2917 4785 < 5）。35, 170 35 170 проанализированных енов 2917 не кспрессировались, а остальные 4785 генов имели незначительпрессительнеоеительное ительное кеов имели (. ачение (5). 35. 170 genes explicantur, 2917 non expressa sunt, et reliqua, 4785 genes contemptibilis expressio habuit (basi medium <5).Ita, numerus genesis expressus (basis medium ≥ 5) in experimento erat 27,468 (78.1%) (Supplentary Table S4).
Ex puncto temporis primo, omnes lineae NLL ad inoculationem C. lupini respondentes (strain Col-08) reprogramming transcriptum (Tabula 1), tamen notabiles differentiae inter lineas observatae sunt.Ita, linea resistentiae 83A:476 (Lan- gene portans) reprogrammatum significans ostendit in puncto primo (6 hpi) cum 31-69 duplici augmento in numero separatorum et descendentium comparatorum ad alia puncta temporis huius temporis.Insuper hoc apicem breve fuit, cum significatio paucarum generum tantum in puncto secundo puncto 12 signanter mutatae manserunt.Interestingly, Boregine, quae etiam altam repugnantiam in testi insertionis ostendit, talem reprogrammationem transcriptionalem in experimento non sustinuit.Attamen numerus generum differentialiter expressus idem erat in Boregine et 83A:476 ad 12 HPI.Ambo Mandelup et multitudo 22660 cacumina DEG ostendit in ultimo puncto temporis (48 l/s), relativam moram in responsionibus defensionis demonstrans.
Propter 83A:476 reprogrammatum magnum subiit cum responsione C. lupini in 6 HPI comparatis omnibus aliis lineis, ~ 91% deGs, quae hoc tempore observatae erant, genus speciale (Fig. 1).Nihilominus in primis responsa inter lineas studiorum, ut 68.5%, 50.9%, et 52.6% DEG in Boregine, Mandelup, et incolarum 22660, obductae sunt cum iis quae in 83A:476 in quibusdam punctis in tempore reperiuntur.Attamen hae DEGs pro exigua fractione (0.97-1.70%) omnium DEGs nunc utentes 83A:476 detectae sunt.Praeterea 11 DEGs ab omnibus lineis hoc tempore cohaerebant (Tabulae supplementariae S4-S6), inter communes partes plantarum responsabilium defensionis: interdum translationis lipidorum (TanjilG_32225), endoglucan-1,3-β-glucoside enzyme (TanjilG_23384), duo accentus-inducibiles proteins late sicut SAM22 (TanjilG.G_3152), e. , et duo glycineo-fabricata muri cellulae structuris (TanjilG_19701 et TanjilG_19702).Etiam in re- sionibus transumptinis relativum inter 83A:476 et Boregine ad 24 HPI (totalis 16-38% DEG) fuit, et inter Mandelupum et Populationem 22660 ad 48 HPI (totum 14-20% DEG).
Venn diagramma exhibens numerum genesis differentialiter expressum (DEG) in lupinis angustis-foliatis (NLL) lineis inoculatum apud Colletotrichum lupini (strein Col-08 nactus e lupinis agris in Wierzhenice, Polonia, 1999).Lineae NLL enucleatae erant: 83A:476 (repugnans, portans Lanr1 allelam), Boregine (repugnans, color geneticus ignotus), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allelam) et incolarum 22660 (valde susceptibilis).Abbreviatio hpi stat pro horis post vaccinationem.Valores nullae remotae ad graphum simpliciorem reddunt.
Copia expressorum generum 6 hpi ad praesentiam ditionum generum canonicarum R enucleata est (Supplementary Table S7).Hoc studium transcriptum revelatum est inductio morbi classici resistentiae genes cum dominiis NBS-LRR tantum ad 83A:476.Hic ordo constabat ex uno gene TIR-NBS-LRR (tanjilg_05042), quinque CC-NBS-LRR genes (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, et tanjilg_16162), et quattuor NBS-LR, Tanjilg_R-B1662, et quattuor NBS-L-R. 16162) et Quatuor NBS-LRR (TANJILG_16162).Quae omnia genes habent domains canonicis in seriebus conservatis dispositi.Praeter generum domain NBS-LRR, plures RLL kinases in 6 hpi aguntur, nempe una in Boregine (TanjilG_19877), duae in Mandelup (TanjilG_07141 et TanjilG_19877) et in multitudine 22660 (TanjilG_09014 et TanjilG_10361) et duo in 83A 27:476.
Genes cum expressione signanter mutata in responsione ad inoculationem cum C. lupini (strain Col-08) gene ontologiae (GO) analysi locupletanda subiectae sunt (Supplementary Table S8). Frequentius terminus processus biologicus repraesentatus erat "GO:0006952 responsio defensionis" quae apparuit in 6 e 16 (tempus linea) iuncturas magni momenti (P ​​valor <0.001) (Fig. 2). Frequentius terminus processus biologicus repraesentatus erat "GO:0006952 responsio defensionis" quae apparuit in 6 e 16 (tempus linea) iuncturas magni momenti (P ​​valor <0.001) (Fig. 2). аиболее асто резмерно представленным термином биологического процесса л «GO: 0006952 ащитный 6отвеов» (ролоического процесса л «GO: 0006952 ащитный 6ответ» (ровотлств) емя × линия) комбинаций с высокой начимостью (значение P <0.001) (рис. 2). Frequentius terminus processus biologici repraesentatus erat "GO:0006952 responsio defensionis", quae apparuit in 6 de 16 (tempore × genere) combinationum magni momenti (P ​​valor < 0.001) (Fig. 2)."GO:0006952 "，它出现在16 6 P < 0.001）（图2）。 Terminus processus biologicus maxime repraesentativus est "GO:0006952 responsio defensionis", quod in 6 de 16 (时间×线) compositionibus apparet, magna significatione (P valor <0.001) (图2). аиболее асто резмерно представленным термином биологического процесса л «GO: 0006952 Defensio Responsionis», котолц пояииеского процесса л «GO: 0006952 Defensio Responsionis », котол поииеского процесса л « GO: 0006952 Defensio Responsio емя × линия) с высокой начимостью (значение P <0.001) (рис. 2). Frequentissimus terminus processus biologicus repraesentatus erat "GO:0006952 Defensio Responsionis", quae apparuit in 6 e 16 junctionibus (tempus ) cum significatione magni momenti (P ​​valor <0.001) (Fig. 2).Hic terminus duobus punctis in 83A repraesentatus est: 476 et Boregine (6 et 24 hpi) et uno tempore punctum in Mandelup et Incolae 22660 (12 et 6 hpi, respective).Hoc est eventum expectatum, quatenus responsio antifungal linearum resistentium est.Praeterea, 83A:476 C. lupini respondit, genesis celerius inducentia ad ruptionem oxidativae quae per vocabulum "GO:0055114 processus redox" significat, specifica defensione responsio, cum Boregine responsiones specificas defensionis relatas ad terminum "GO" relatum.:0006950 Accentus responsio".Populatio 22660 excitavit resistentiam horizontalem responsionis metabolitarum secundarum involventium, quatenus nimius numerus vocabulorum "GO:0016104 biosynthesis triterpenes" et "GO:0006722 Processus metabolismi triterpenes" (utriusque termini ad idem genesis pertinent), attentis eventibus GO termini ditiorationis analysis, Mandelupa stabilitas fuit inter Boregine et Populatio CCXXVI. et Populatio 22660 vocabulum GO:0015979 "photosynthesis" et alii processus biologicos affines.
Bioprocessus gene ontologiae vocabula selecta in annotatione differentiali genesis expressa per transcriptomas responsiones lupini angusti-foliati (NLL) inoculatae cum lupino anthrace (Col-08 cola ex lupinis agris in Wierzhenice, Polonia anno 1999) aucti sunt.Lineae NLL enucleatae erant: 83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allelam), Boregine (repugnans, ignotus geneticus), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allelam homozygous) et incolarum 22660 (susceptibilem).
Cum hoc studium ad cognoscendum genes quae ad resistentiam anthracnosam conferunt, gena terminis GO "GO: 0006952 Responsionum defensivorum" et "GO: 0055114 Processus Redox" enucleata sunt cum abscisis cum basiline media ≥ 30 cum una saltem linea.× punctum temporis peraeque signanter valores de log2 componendo (duplici mutatione).Numerus generum his indiciis occurrens erat 65 pro GO:0006952 et 524 pro GO:0055114.
83A:476 duo DEG apices annotavit cum termino GO:0006952, prima ad 6 genes per inch (64 genes, sursum et deorsum ordinatio) et secunda ad 24 genes per inch (15 genes, up regulation only).Boregine etiam ostendit GO:0006952 simul punctum spicatum, sed minus DEG (11 et 8) et activationem potiorem.Mandeloop duos apices GO:0006952 ad 12 et 48 HPI ostendit, utrumque 12 genes portans (primum genes activum, alterum cum genes tantum suppressivorum), dum 22660 multitudo ad 6 HPI (13 genes) maiorem aucti apicem praedominantia habuit.expers.Animadvertendum est 96.4% GO:0006952 DEG in his iugis eandem responsionis speciem habuisse (sursum vel deorsum), significantem aliudque in responsionibus defensionis notandum, licet differentiae in numero generum implicatarum.Maxima series sequentium ad terminum GO:0006952 encodet Accentus Nuntius Associatus dapibus 22 (SAM22-similis), quod est classium 10 pathogenesis associatorum dapibus (PR-10) cladem dapibus ac latex nuclei.interdum (Fig. 3).Duo coetus in natura locutionis et in responsionis directione discrepabant.genes descriptam SAM22 quasi servo-inductionem constantem et significantem inductionem in punctorum primorum temporum (6 vel 12 hpi) demonstraverunt et plerumque in fine experimenti (48 hpi) malebant, dum MLP quasi servo coordinationem in 6 hpi praebuerunt.hpi.83A:476 et Mandelup in 48 hp/in, omnia fere alia puncta data sunt male gratus.Praeter differentias expressionum profiles SAM22-similium interdum genes secutae variabilitatem in resistentia anthracnosa observata sunt, sicut lineae magis resistentes plus temporis puncta signanter inducebant haec gena quam genes susceptibilis.Alius LlR18A/B quasi PR-10 gene ostendit simillimam expressionis exemplar ad SAM22 quasi gene interdum.
Partes principales processus vocabuli biologici "GO:0006952 Defensio Responsionis" et expressiones generum candidatorum Lanr1 et AnMan allelae notae sunt.Scala Log2 valores log2 (supplex mutationis) inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 colatus) ex lupinis agris, Wizhenica, Polonia, 1999) ac potestate (sham-inoculatum) plantas simul punctum obtinet.Sequentes anguste folium lupinum enucleatae sunt: ​​83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allele), Boregine (repugnans, background ignotus geneticus), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allele homozygous), et Populatio 22660 (susceptibilis).
Praeterea expressio profile RNA-seq candidatorum genes Lanr1 (TanjilG_05042) et AnMan (TanjilG_12861) aestimabantur (fig. 3).Gene TanjilG_05042 responsio significantem ostendit (activationem) ad 83A:476 solum ad primum punctum (6 hpi), cum TanjilG_12861 significans in Mandeloop tantum ad duo puncta temporis: 6 hpi (descendentia ordinatio) et 24 hpi (6 hpi).Cum.).Novifacta)).
Genera maxime expressa in termino GO:0055114 "processus redox" erant genes descriptae cytochrome P450 servo et peroxidase (Fig. 4).Exempla enim ab 83A:476 ad 6 HPI, maximum vel minimum log2 (variae mutationis) valorum (pro 86.6% genesis) observatae sunt inter plantas inoculatas et temperantias, quatenus princeps responsionis huius genotypi ad sexum inoculandum.83A:476 GO: 0055114 DEG ad 6 hpi (503 genes), reliquae lineae ad 48 hpi (Boregine, 31 genes; Mandelup, 85 genes; et Incolae 22660, 78 genes)).In plerisque familiae GO:0055114 duo genera responsionum vaccinationis (activatio et inhibitionis) observata sunt.Interestingly, usque ad 97.6% de DEGs quae pro termino GO: 0055114 in Mandelupe in 48 hp. Haec animadversiones suggerunt, licet scalae signanter minora (id est numerus genesis redox mutati, 85 versus 503), exemplar responsorum dilati mandeloupi ad anthracnosum, simile est primae responsioni 83A:476.In Boregine et Populatione 22660, haec concursus inferior est ad 51.6% et 75,6%, respective.
Exempla expressionis principalium partium termini processus biologici "GO:0055114 processus Redox" revelata sunt.Scala Log2 valores log2 (supplex mutationis) inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 colatus) ex lupinis agris, Wizhenica, Polonia, 1999) ac potestate (sham-inoculatum) plantas simul punctum obtinet.Sequentes anguste folium lupinum enucleatae sunt: ​​83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allele), Boregine (repugnans, background ignotus geneticus), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allele homozygous), et Populatio 22660 (susceptibilis).
83A:476 Responsiones Transcriptomicae ad inoculationem cum C. lupini (cola Col-08) inclusa etiam genesis silentii coordinata attribuuntur vocabulo GO:0015979 "photosynthesis" et alii processus biologici relatii (FIG. 5).Hoc GO:0015979 DEG pone continebat 105 genes quae signanter repressae erant ad 6 hpi ad 83A:476.In hoc subset, 37 gena etiam in Mandelup in 48 HPI et 35 simul in numero 22660 ordinantur, incluso 19 DEGs utrique genotypo communes.Nulla DEGs ad terminum GO pertinentia: 0015979 signanter in compositione aliqua reducitur (line x temporis).
Exempla expressionis principalium partium termini processus biologici "GO:0015979 Photosynthesis" revelata sunt.Scala Log2 valores log2 (supplex mutationis) inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 colatus) ex lupinis agris, Wizhenica, Polonia, 1999) ac potestate (sham-inoculatum) plantas simul punctum obtinet.Sequentes anguste folium lupinum enucleatae sunt: ​​83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allele), Boregine (repugnans, background ignotus geneticus), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allele homozygous), et Populatio 22660 (susceptibilis).
Ex eventus analysi differentialis expressionis ac fortasse in responsionibus defensionis contra fungis pathogenicos implicatis, haec septem generum quantitas locutionis profile per realem tempus PCR electa est (Tabula supplementaria S9).
Dapibus putativus gene TanjilG_10657 signanter inductus est in omnibus lineis et temporis quaesitis punctis ad imperium (mimicis) plantis comparatis (Tabulae supplementae S10, S11).Praeterea, expressio figura TanjilG_10657 magis inclinatio in decursu experimenti omnium linearum ostendit.Incolatio 22660 summae sensus TanjilG_10657 ostendit in inoculationem cum activatione 114 duplici et summa expressionis relativa in gradu (4.4 ± 0.4) ad 24 HPI (Fig. 6a).PR10 LlR18A interdum gene TanjilG_27015 etiam activationem per omnes lineas et puncta temporis ostendit, cum significatu statistica in pluribus punctis notatis (Fig. 6b).Similia cum TanjilG_10657, summa expressio relativa TanjilG_27015 observata est in multitudine inoculata 22660 in 24 HPI (19.5 ± 2.4).Acidum endochitinasis gene TanjilG_04706 in omnibus lineis et in omni tempore punctis insigniter ornatis, excepta Boregine 6 hpi (Fig. 6c).Valde adductum est primo puncto temporis (6 HPI) ad 83A:476 (per 10.5 temporibus) et in aliis lineis mediocriter auctis (per 6.6-7.5 temporibus).Per experimentum expressio TanjilG_04706 in similibus gradibus in 83A:476 et Boregine mansit, dum in Mandelup et Populatio 22660 signanter augetur, ad bona respective alta (5.9 ± 1.5 et 6.2± 1.5, respective).endoglucan-1,3-β-glucosidasa-genica similis TanjilG_23384 altam activationem ostendit in duobus primis punctis (6 et 12 hpi) in omnibus lineis praeter multitudinem 22660 (Fig. 6d).Supremae expressionis relativae gradus TanjilG_23384 secundo puncto observati sunt (12 hpi) in Mandelup (2.7 ± 0.3) et 83A:476 (1.5± 0.1).Ad 24 HPI, TanjilG_23384 significatio erat relative humilis in omnibus lineis exquisitis (ab 0.04 ± 0.009 ad 0.44 ± 0.12).
Expressio profile genesis delectorum (ag) per quantita- tivas PCR revelatur.Numeri 6, 12 et 24 horas post vaccinationem significant.Genera LanDExH7 et LanTUB6 ad ordinationem et LanTUB6 adhibita pro calibratiis inter-seriibus adhibita sunt.Claustra erroris vexillum deviationis repraesentant secundum tres replicationes biologicas, quarum unaquaeque est mediocris trium replicationum technicarum. Significatio statistica differentiarum in locutionis graduum inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 cola, anno 1999 ex agro lupino in Wierzenica, Polonia impetratum) et imperium (irritum-inoculatum) plantarum supra notarum puncta notata sunt (*P valor <0.05, **P valor ≤ 0.01, ***P valor ≤ 0.001). Significatio statistica differentiarum in locutionis graduum inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 cola, anno 1999 ex agro lupino in Wierzenica, Polonia impetratum) et imperium (irritum-inoculatum) plantarum supra notarum puncta notata sunt (*P valor <0.05, **P valor ≤ 0.01, ***P valor ≤ 0.001). татистическая начимость различий в уровнях экспрессии между инокулированными. в ерженице, ольша) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечена над точками, ≤**P. *** значение P ≤ 0,001). Peraeque significantes differentias expressionis gradus inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 colatum, anno 1999 ex agro lupino in Wierzhenice, Polonia impetratum) et imperium (insoculatum) plantae notatae sunt supra puncta data (*P valor <0.05, **P valor ≤ 0.01, ***P-valu ≤ 0.01).Colletotrichum lupini，Col-08株，1999年从波兰Wierzenica的羽扇豆田获得）和对照（模拟接种）植物之间表达水平差异的统计学显着性标记在数据点上方（*P值< 0.05, **P 值≤ 0.01, ***P ≤ 0.001)。colletotrichum lupini color-08 1999 wierzenica *p <0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001)。 татистически начимые различия в уровнях экспрессии ежду инокулированными (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, получнане получнане получнане получаналированными. енице, Польша, в 1999 .) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечены над точками аана (* . 1, ***P-значение ≤ 0,001). Peraeque signanter differentias expressionis gradus inter inoculatos (Colletotrichum lupini, Col-08 colatum, ex campis lupinis in Verzhenice, Polonia, anno 1999) consecuti et moderatio plantae inoculatae supra notata puncta notata sunt (*P valor <0.05, **P-valu ≤ 0.01, ***P-valu ≤ 0.01).Lineae NLL enucleatae erant: 83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allelam), Mandelup (modice resistens, portans AnMan allele homozygous), Boregine (repugnans, incognitus color geneticus), et multitudo 22660 (susceptibilis).
Electus gene TanjilG_05042 apud Lanr1 locum ostendit exemplar expressionis longe diversum a profiles studiis RNA-seq impetratis (Fig. 6e).Significans activatio huius genee in Mandelup observata est et incolarum 22660 (ad 39.7 et 11.7 vicibus respective), inde in relative alta expressione gradus (usque ad 1.4± 0.14 et 7.2± 1.3, respective).83A:476 etiam aliquas upregulationes gene TanjilG_05042 patefecit (usque ad 3.8-ovili), attamen relativa expressio gradus effecti (0.044 ± 0.002) erant plus quam 30-ovili inferior quam quae in Mandelup et 22660 hominum observabantur.per qPCR explicatur differentias significantes expressionis gradus inter genotypa in ludibrium variantium (imperium) variantium, perveniens differentiam 58 triplicem inter incolas 22660 et 83A:476, quam inter incolas 22660 et 22660. Duplex differentia consecuta est inter Boregine et Mandalup.
Genus candidatum apud AnMan Locum, TanjilG_12861, ad vaccinationem in 83A:476 et Mandelup reducitur, neutrum in 22660 hominum fuit, et in Boregine deflexus est (Fig. 6f).Relativa expressio gene TanjilG_12861 summa erat in inoculata 83A: 476 (0.14±0.01).17.4 kDa classis I dapibus gene TanjilG_05080 HSP17.4 impulsus caloris in omnibus modis et punctis quaesitis inferiores expressiones relativas ostendit (fig. 6g).Maxima vis observata est 24 HPI in incolarum 22660 (0.14 ± 0.02, octuplex auctum vaccinationi respondens).
Comparatio generum expressionis profiles (Fig. 7) altam correlationem inter TanjilG_10657 et quattuor aliae genes: TanjilG_27015 (r = 0,89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0,80), et TanjilG_04706 (r=0.79) declaravit.Tales eventus coordinationem horum generum in responsionibus defensionis significare possunt.Genera TanjilG_12861 et TanjilG_23384 varias expressiones profile cum inferioribus Pearson correlationem coefficientium valorum (ab 0.08 ad 0.43 et -0.19 ad 0.28) aliis genes ostenderunt.
Correlationes inter profiles expressiones gene usus quantitatis PCR deprehensi sunt.Sequentes lineae angustae lupini enucleatae sunt: ​​83A:476 (repugnans, portans homozygoum Lanr1 allele), Mandelup (modice resistens, portans homozygoum AnMan allelam), Boregine (resistentem, background geneticum ignotum), et Incolae 22660 (susceptibilem).Tribus temporibus puncta computata sunt (6, 12 et 24 horarum post inoculationem), inter inoculata (Colletotrichum lupini, Col-08 cola, ex lupinis campis in Wierzhenice, Polonia, anno 1999) potitum et plantarum imperium (inoculatum).Scala correlationem coefficientis Pearson ostendit.
Fundatur in notitia impetrata ad VI horsepower per inch, WGCNA fiebat in 9981 DEG notatur comparando inoculata et temperantia plantarum ut focus in responsionibus defensionis primae (S12 suppletivae).Viginti duo moduli gene (botrus) inventi sunt cum relativis (positivis vel negativis) profile expressionis inter genotypa et variantes experimentales. In mediocris, gene elocutionis gradus descendebant in ordine 83A:476 > Mandelup > Boregine > Populatio 22660 (in utroque tamen variantibus, haec inclinatio plus valebat in plantis moderandis). In mediocris, gene elocutionis gradus descendebant in ordine 83A:476 > Mandelup > Boregine > Populatio 22660 (in utroque tamen variantibus, haec inclinatio plus valebat in plantis moderandis). среднем уровни экспрессии генов снижались в порядке 83A:476 > Mandelup> Boregine > Incolae 22660 (в обоих венцались в порядке 83A:476 > Mandelup > Boregine > Incolae 22660 (в обоих венцались в порядке 83A:476 > нее у контрольных растений). In mediocris, gene elocutionis gradus decrevit in ordine 83A:476 > Mandelup > Boregine > Populatio 22660 (in utroque tamen variantibus, haec inclinatio plus erat in plantis moderandis).83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 2266083a: 476> mandelup> boregine> population 22660 的 顺序 среднем уровни экспрессии генов снижались в ряду 83A:476 > Mandelup> Boregine > Incolae 22660 (однако в обоих варилантен итантах итантах итантах итантах контрольных растений). In mediocris, gene expressio gradus decrevit in serie 83A:476 > Mandelup > Boregine > Populatio 22660 (tamen, in utroque variante, haec inclinatio plus valebat in plantis moderandis).Vaccinatio consecuta est in upregulation locutionis gene, praesertim in modulis 18, 19, 14, 6 et 1 (descendendo effectuum), ordinatio negativa (eg moduli 9 et 20) vel cum effectibus neutris (ex. gr. mod. 11, 22, 8 et 13).GO terminus locupletatis analysis (Tabulae S13) revelata "GO: 0006952 Responsoria tutelae" pro modulo inoculato (18) cum activo maximo, inter gena enucleata per qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 et TanjilG_27015), necnon multae imagines inoculatae maxime suppressae (9).Module 18 concentrator (Fig. 8) notus est ut gene TanjilG_26536 modum translitterandi ad interdum PR-10-sicut LlR18B, et modulus 9 concentrator cum TanjilG_28955 gene in modum formatum photosystem II PsbQ notus est.Candidatus anthracnosus resistentiae gene Lanr1, TanjilG_05042, in modulo 22 (Fig. 9) inventus est et cum verbis "GO:0044260 processuum metabolicorum cellularium macromolecularem" et "GO:0006355 Ordinationem Transcriptionalem, DNA templating" portans TanjilG_01212 hub.gene encodes calor accentus transcriptionis factor A-4a (HSFA4a).
Analysis retis ponderati generum co-elocutionis modulorum cum processu biologico repraesentati termini "GO: 0006952 Defensionis responsionum".Ligatio facilior fuit ad exaggerandam quattuor generum per qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 et TanjilG_27015).
Analysis retis ponderati gene co-expressionis moduli cum processu biologico repraesentato termino "GO: 0006355: Ordinatio Transcriptionalis, DNA templating" et gerens candidatum anthracnosum resistentiae gene Lanr1 TanjilG_05042.Ligatio simplicior facta est genem TanjilG_05042 segregare et gene centralis TanjilG_01212.
Anthracnosa resistentia protegendi in Australia collecta ostendit pleraque aratorum veterum dimissi susceptibiles fuisse;Kalya, Coromup et Mandelup modice repugnantes descriptae sunt, Wonga, Tanjil et 83A:476 descriptae sunt valde repugnant 26, 27, 31.Eadem resistentia habuit allelam, Lanr1, designatam, et Coromup et Mandelup aliam allelam designatam AnMan 10, 26, 39, dum Kalya in aliam allelam transiit., Lanr2.Protegendo pro anthracnoso resistentia in Germania consecuta est identificatio lineae resistentis Bo7212 cum candidato allelae quam Lanr1, LanrBo36.
Studium nostrum frequentiam nimis humilem (circiter 6%) de Lanr1 allelam in probata germplasmo patefecit.Haec observatio consentaneum est cum eventibus germinis Europaei Orientalis protegendi utentes Anseq3 et Anseq4 figmenta, quae ostendit Lanr1 allelam in duabus tantum lineis Belarusicis inesse.Hoc insinuat Lanr1 allelam nondum late ab programmatis localibus generandi usum esse, in Australia dissimile, ubi est una clavium allelarum ad feturam adiuvandam.Hoc potest esse ex gradu inferiori resistentiae, provideatur a Lanr1 allele in condiciones campi Europaeae famae Australiae comparatae.Praeterea studia anthracnosi in maximis locis imbribus in Australia ostenderunt resistentia responsa a Lanr1 allelae mediante non posse efficaces esse in tempestatibus, quae incrementum et celeri progressionem pathogen19,42 favent.Re quidem vera, in praesenti studio, nonnulla indicia anthracnosi etiam in genotypes ferentes Lanr1 allelam observata sunt, suggerentes resistentiam sub melioribus condicionibus ad progressionem C. lupini delabi posse.Praeterea falsae affirmativae interpretationes praesentiae Anseq3 et Anseq4 notae, quae sunt circiter 1 cM ex Loco Lanr1, possibilia sunt 28, 30, 43 .
Studium nostrum demonstravit 83A:476, Lanr1 allelam ferens, C. lupini inoculationem cum magna transcriptione reprogrammatum permagnum ostendit in primo temporis puncto (6 hpi) enucleato, cum in Mandelup, portans AnMan allelam, responsiones transcriptomicas multo post observatas esse.(a 24 ad 48 hp).Hae variationes temporales in responsionibus defensionis sociantur cum differentiis morborum symptomata, momentum primae agnitionis pathogeni pro felici responsionis resistentiis.Ad plantam textam inficiendam, sporis anthrax per aliquot gradus progressus in superficie exercitus, inter germinationem, divisionem cellam et appressorii formationem procedere debet.Appendice est structura infectiva quae ad superficiem fortitudinis adiungit et penetrationem in fibras hostiae faciliorem reddit.Sic sporae C. gloeosporioidis in pisi extracto ostendit primam divisionem nuclei post 75-90 minuta incubationis, formatio tubi germi post 90-120 minuta, et suppressio post 4 horas 45 .Mango C. gloeosporioides plus quam 40% germinis conidialis post 3 horas incubationis et circa 20% formationem appressorum post 4 horas ostendit.Virulence-consociata CAP20 gene C. gloeosporioides ostendit activitatem transcriptionem in conidia epiphyto-formantis post 3.5 h incubationem in avocado cerae superficiei cum concentratione altorum interdum dapibus post 4 h 46 min.Similiter actio melanin biosynthesis genesis in C. trifolii inducta est per 2-horam incubationem quam sequitur formatio appressorii post 1 horam.Studia fibrarum foliorum ostenderunt fraga inoculatum cum C. acutatum habere primam suppressionem in 8 hpi, dum tomatoes inoculatae cum C. coccodes primam suppressionem in 4 hpi48,49 habent.maxime congruit cum temporis scala Colletotrichum spp.processus contagiosus.Celeri defensiones responsiones 83A:476 implicationem plantae resistentiae et effectoris urgentis immunitatis (ETI) in hac linea genesis suggerunt, dum Mandelup responsionibus dilatis micro-consociatis exemplaribus hypotheticis hypothesibus laborantibus immunitatem (MTI) hypothesin sustinent 50. Responsiones primae ad 83A: 476 et Mandelup.Partialis insidunt inter generum up- vel descensum in morata responsione etiam hunc conceptum sustinet, sicut ETI saepe reputatur responsio accelerata et aucta MTI quae culminat in programmatibus cellulae mortis in situ contagionis, quae nota est anaphylactica incursu 51,52.
Plerique genes attribuuntur termino repraesentato Gene Ontologia GO:0006952 "Responsio defensionis" sunt 11 homologi accentus ieiunii nuntius 22 interdum (sAM22 similis) et septem majores latex dapibus similes (MLPs).-sicut servo 31, 34, 43 et 423 ostendit sequentiam similitudinem.SAM22-similis gena ostendit activationem significantem quae diutius duravit, gradus anthracnosi resistentiae auctos ostendens (83A:476 et Boregine).Nihilominus, MLP-similis gena tantum in lineis emissis allelam resistentiam gerentibus (83A:476/Lanr1 ad 6 hpi et Mandelup/AnMan ad 24 hpi).Animadvertendum est omnes identificari SAM22-similes homologos oriundi a glomerulo genetivo circa 105 kb, cum MLP-similis genes oriuntur a regionibus genome separatis.Activatio talium SAM22-similium generum ordinatae etiam in praecedenti studio NLL resistentiae inoculationis diaporthetoxicae inventa est, suggerens se implicari in componentibus responsionis defensionis.Haec conclusio etiam confirmatur relationibus responsionis affirmativae SAM22-genearum iniuriae vel curationis cum acido salicylico, inductoribus fungalis vel hydrogenii peroxidi.
MLP-similis gena ostensa est respondere variis passionibus abioticis et bioticis, inclusa infectiones bacterial, virales et pathogenicas fungalorum in multis plantis speciebus55.Directiones responsionis ad certas interactiones inter plantas et pathogenas a valde crescentibus (id est, in infestatione bombicis cum Verticillio dahliae) ad signanter decrescentes (id est post infectionem arboris pomi Alternaria spp.) 56,57.Significans downregulation of MLP-similis 423 generum observatum est in avocado defensionis ad infectionem F. niger et in infectio pomi arboris Botryosphaeria berengeriana f.cn.piricola et Alternaria alternata sunt pomi pathotypes58,59.Praeterea, calli pomum exprimentes MLP-similis 423 generum inferiorem expressionem genesis associati habuerunt et magis susceptibiles ad infectiones fungalorum erant.Fusarium oxysporum f sequens, gene MLP-cn.Fabae contagio LX.
Cetera membra familiae PR-10, quae in nostro RNA-seq notantur, erant genes LlR18A et LlR18B genes in upregulationi respondentes, sicut gene vel ordinati (1 gene) vel ordinati (3 genes) translationis interdiculorum lipidorum DIR1..Praeterea WGCNA gena LlR18B effert quasi centrum in hoc modulo, quod est valde obnoxium vaccinationi et plura gena responsionis tutelae portat.LlR18A et LlR18B genes inductae sunt in foliis lupinis luteis respondens bacteria pathogenica, necnon in NLL caulibus post D. toxica inoculatio, dum oryzae homologus horum generum RSOsPR10 celeriter inductus est per infectionem fungalem, quae in acido jasmonico signante in modum transmissionis 53,61 acquiritur, 62. DIR . (SAR).Cum progressu reactiones tutelares, dapibus DIR1 ab umbilico contagionis per phloem deportatur ad SAR in organis longinquis mo- lestis.Interestingly, TanjilG_02313 gene DIR1 signanter inductum est primum punctum in lineis 84A:476 et incolarum 22660, sed resistentia anthracnosa feliciter tantum in linea 84A:476 evoluta est.Hoc potest significare subfunctionalizationem generum DIR1 in NLL, cum reliqui tres homologi responderint inoculationi tantum in 83A:476 linea 6 hpi, et haec responsio deorsum directa est.
In nostro studio, frequentissima elementa respondentium processui biologico vocati "GO:0055114 processus Redox" erant cytochroma P450 interdum, peroxidase, acidum linoleicum 9S-/13S-lipoxygenase, et acidum 1-aminocyclopropaneum-carboxylicum oxydatum.Praeterea, noster WGCNA definit HSFA4a homologum ut centrum gerendi modulorum qualium resistentia generum Lanr1 candidatorum TanjilG_05042.HSFA4a est componentis constitutionis redox-dependens transcriptionis nuclearis in plantis.
Cytochrome P450 servo oxidoreductases sunt quae catalyzum NADPH et/vel O2-dependentes hydroxylationes reactiones in metabolismo prima et secundario, cum metabolismi xenobioticorum, sicut hormona, acida pinguia, steroli, muri cellulae, biopolymi, et biosynthesis in cytochroma e compositionibus P450 redactae sunt, 69. In cytochroma e compositorum tutelarum in functionibus 69, in cytochromate in -106 mixtorum tutelae. log2 (variae mutationis) ad 5.7 ob magnum numerum homologorum mutatorum (37) et differentiae responsionis formarum inter generum specificum, revisionem sursum reflectentem..Tantum RNA-seq data utens ad elucidandum munus putative biologicum NLL genes in tam magna dapibus superfamilia, valde speculativa esset.Sed memorabile est quaedam cytochroma P450 gena aucta resistentia fungi vel bacteria pathogenico- rum sociari, inclusa contributione ad motus allergicos 69, 70,71.
Classis III peroxidases multifunctionales plantae enzymes implicatae sunt in amplis processibus metabolicorum in incremento et evolutione plantae, necnon in responsio ad passiones environmental sicut salinitas, siccitas, lux alta intensio et impetus pathogeni.Peroxidases involvuntur in commercio plurium plantarum specierum cum anthracis, inter Stylosanthes humilis et C. gloeosporioides, Lens culinaris et C. truncatum, Phaseolus vulgaris et C. lindemuthianum, Cucumis sativus et C. lagenarium 73, 74, 75,76.Responsio est celerissima, interdum etiam ad 4 HPI, antequam fungus plantam texti penetrat.Genicula peroxidase etiam D. toxica NLL inoculatio respondit.Praeter functiones typicas ad moderandam vim oxidativae rupti vel oxidativae tollendam, peroxidases impedire possunt cum incremento pathogeni, quod impedimenta corporis creandi in muro cellulae subnixa in subsidiis ligificationis, subunitis vel cross-coniunctio compositorum specificorum.Hoc munus in silico attribui potest gene ad TanjilG_03329 descriptam peroxidasem putativam lignin-formantem quae signanter in studio nostro in 83A:476 renitente linea 6 HPI tribui potest, non autem in aliis modis et punctis temporis quae non respondebant.
9S-/13S-lipoxygenas acidi linoleici primus gradus est in via oxidativa biosynthesis lipidis.Producti huius viae multiplices functiones habent in defensione plantarum, incluso muro cellularum confirmando per depositorum callosium et pectinem formationem, et moderatio accentus oxidativa per productionem speciei reactivae oxygenii 79, 80, 81, 82,83.In praesenti studio, expressio acidi linoleici 9S-/13S-lipoxygenasi in omnibus modis mutatus est, sed in populatione susceptibilis 22660, upregulation diversis temporis punctis praevaluit, dum in modis repugnantis Lanr1 et AnMan allelae, diversitatem iacuit oxylipini in tutela anthrax reactiones inter haec genotypa effert.
Homologus homologus 1-aminocyclopropaneus-aminocyclopropaneus 1-carboxylatus oxydatus (9 genes) vel cum lupino inoculatus est.Duobus exceptis, omnes hae responsiones factae sunt in 6 hp.ad 83A:476.Reactio enzymatica mediante ACO proteins est gradus rate-terminus in productione ethylene et ideo valde regulatur 84 .Ethylene planta est hormonum quae varias partes agit in regula evolutionis plantae et responsionis ad condiciones accentus abioticas et bioticas.Inductio ACO transcriptionis et activationis ethyleni signantis viae implicatur in augendo resistentiam oryzae ad fungus hemibiotrophici oryzae ordinando productionem speciei oxygenii reciproci et phytoalexini.Persimilis processus folium contagione inter M. oryzae et C. lupini88,89 repertum, contra recessum notabilis upregulationis ACO homologorum in 83A:476 linea in hoc studio relata, possibilitatem resistendi conferendi cum NLL anthracnoso Ethylene significans gradum centralem in meatus hypotheticis.
In praesenti studio, magna-scala suppressio plurium generum cum photosynthesi consociata observata est ad 6 hpi in 83A:476 et ad 48 hpi in Mandeloop et 22660 multitudo.Harum mutationum amplitudo et progressio proportionalis est plano.Anthracnosa resistentia in hoc experimento observata est.Nuper valida et prima repressio transcriptorum photosynthesis relatarum relatum est in pluribus exemplaribus interationes plantae pathogeniae, inclusa bacteria pathogenica et fungos.Festinatio (ex 2 HPI in aliquibus interactionibus) et suppressio genesis globalis cum photoynthesi consociata cum infectio infectio potest trigger immunitatem plantare secundum instruere species oxygeni reactivas et eorum commercium cum acidi salicylici viae ad mediationem motus allergicos 90,94.
In fine, defensionis responsionis mechanismi propositae pro genere repugnanti (83A:476) includuntur rapidam recognitionem pathogenarum per R gene (scilicet TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) et allergicam responsionem mediatam acidum salicylicum et ethylene significantem, sequitur instauratio longi-range SAR.actio sustentatur per DIR-1 interdum.Animadvertendum est periodum biotrophicam pro C. lupini contagione brevissimam esse (circa 2 dies), quam necroticam incrementum 95 sequitur.Transitus inter hos gradus coniungi potest cum necrosi et expressione servo ethyleno-inducibili qui agunt sicut triggers pro reactionibus hypersensivitatis in plantis hospitibus.Ideo tempus C. Lupini in scaena biotrophica valde angusta fenestra pro prospere capta est.Reprogrammatio genesis consociata cum redox et photosynthesi quae in 83A:476 ad 6 hpi convenit cum progressione hypae fungalorum et praeconum progressui felicis responsionis tutelae in scaena biotrophica.Responsiones transcriptomicae Mandelup et 22660 incolarum nimium differri possunt ut fungus capiendi antequam mutando ad incrementum necroticum, tamen Mandelup plus valeret quam 22660 incolarum, quia relativum ieiunium moderatio dapibus horizontalis resistentiae promovet.
ETI, R gene canonice adactus, communis machina fabae anthracnose resistentia esse videtur.Sic in exemplari legumen Medicago truncatula, resistentia anthracnoso confertur a gene RCT1, membrum TIR-NBS-LRR97 planta R gene classis.Haec gene etiam resistentiam lato-spectro anthracnoso confert in alfalfa, cum transfertur ad plantas susceptibiles.In faba communi (P. vulgaris), plus quam duo genera resistentia anthracnosa duodenarum modernorum notata sunt.Horum generum nonnullae reperiuntur in regionibus quibuslibet canonicis R genes carent, quotquot alii ad margines chromosomatum positi sunt, qui botrum generum NBS-LRR, inter TIR-NBS-LRRs99 positi sunt.Genome-latum SSR studium etiam consociationem gene NBS-LRR confirmavit cum resistentia anthracnosa in faba communi.Canonica R gene etiam inventa est in regione genomica ferens anthracnosam maiorem resistentiam locus in lupino albo CI.
Nostrum opus ostendit reactionem immediatam resistentiae, in praematuro plantae contagione (potius quam 12 hpi) effectam, efficaciter tuetur lupinum angustum-foliatum ab anthracnoso causato fungo pathogenico Collelotrichum lupini.Utendo alte per sequelam sequendo, profiles anthracnosi resistentiae genes in NLL differentiales expressiones genesis Lanr1 et AnMan mediatae per resistentiam demonstravimus.Prosperum defensionem gena diligenter designans pro proteins quae in redox, photosynthesi et pathogenesis intra horas primi plantae contactum cum pathogeni involvit.Similes reactiones tutelae, sed in tempore moratae, multo minus valent ad plantas a morbis tutandas.Anthrax resistentia mediata a gene Lanr1 simile celeri responsioni gene R (effectoris-triggered immunitatis), dum AnMan gene maxime probabile praebet responsionem horizontalem (immunitas urguet per exemplarem microbi-associatum hypotheticum), mediocritatem sustinendi praebens.
215 NLL lineae ad anthracnosam notarum tegumentum adhibitae ex 74 aratoribus, 60 lineae transeuntibus vel admissurae habitis, 5 mutantes, et 76 germplasmi silvestres vel originales.Lineae 17 ortae sunt ex regionibus, maxime ex Polonia (58), Hispania (47), Germania (27), Australia (26), Russia (19), Belarus (7), Italia (5) aliisque lineis.de X terris.Copia etiam referens lineas repugnantes includit: 83A:476, Tanjil, Wonga allelam Lanr1 portans, et Mandelup portans AnMan allelam.Lineae ab Europaeo Lupino Resource Genetic Resource Database obtinebantur, a Poznań Planta Breeding Ltd., Wiatrowo, Polonia (Tabulae supplementa S1).
Plantae sub conditionibus moderatis natae sunt (photoperios 16 horae, temperatura 25°C interdiu et noctu 18°C).Duae replicationes biologicae enucleatae sunt.DNA a tribus octo veteribus foliis separata est utens Dneasy Plant Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germania) secundum protocollum.Qualitas et intentio DNA solitariae per methodos spectrophotometricas aestimata sunt (NanoDrop 2000; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA).AnManM1 titulus anthracnosae resistentiae gene AnMan (derivata ex cv. Mandelup) et figunt Anseq3 et Anseq4 circumeuntes gene Lanr1 (ex cv. Tanjil) enucleatae sunt 11,26,28.Homozygotes resistenti allelae notatae sunt ut “1″, susceptibilis – ut “0″, et heterozygotes – ut 0.5.
Ex eventibus protegendi notarum AnManM1, AnSeq3 et AnSeq4 et seminum promptitudo ad experimenta finalia sequentia, 50 lineae NLL electae sunt ad anthracnosum resistentiae phaenotyping.Analysis facta est in duplicata in conservatoribus computatralibus moderata cum 14 horae photoperiodatione cum temperatura amplitudine 22°C interdiu et 19°C noctu.Semina rasa sunt (excisa seminis tunica in contrariam partem embryonis cum acuto mucrone) antequam serantur, ne semen dormancy ob tunicam semen nimis durum sit et ut germinatio uniformis curet.Plantae in ollis creverunt (11 11 21 cm) solo sterili (TS-1 REC 085 Medium Basic, Klasmann-Deilmann Polska, Varsavia, Polonia).Inoculatio facta est apud Colletotrichum lupini Col-08 cantilena, quae anno 1999 crevit e caulibus plantarum lupinum angustae-foliatae in agro Verzhenitsa, in Polonia maiore (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E).Adepto an area.Singulae in SNA medio ad 20° C. sub luce nigra exculta sunt per 21 dies ad sporulationes inducendas.Quattuor septimanas post sationem, cum plantae scaenam 4-6 folium perventum est, inoculatio per suspensionem conidiae spargendo per conidia per ml 0.5 x 106 facta est.Post inoculationem plantae in tenebris conservatae sunt per 24 horas ad humiditatem circiter 98% et temperiem 25°C ad germinationem conidiae et processum contagionis faciliorem.Plantae tunc sub 14-hora photoperiod sub hora 22°C diei / 19°C nocte ac 70% humiditate natae sunt.Morbus score factus est post inoculationem viginti dierum et ab 0 (immune) ad 9 (valde susceptibilis) secundum praesentiam vel absentiam laesiones necroticae in caulibus et foliis.Praeterea, post scoring herbarum pondus mensuratum est.Relationes inter titulum genotyporum et phaenotyporum morborum computatae sunt ut punctum duarum consequentiarum correlationes (absentia figentium heterozygoorum in linearum statutis pro analysi resistentiae phaenotypi anthracnosi).