Misaotra anao nitsidika ny Nature.com.Ny kinova browser ampiasainao dia manana fanohanana CSS voafetra.Mba hahazoana traikefa tsara indrindra, manoro hevitra anao izahay hampiasa navigateur nohavaozina (na esory ny Compatibility Mode amin'ny Internet Explorer).Mandritra izany fotoana izany, mba hiantohana ny fanohizana ny fanohanana, dia hanolotra ny tranokala tsy misy fomba sy JavaScript izahay.
Ny Angustifolius lupine (NLL, Lupinus angustifolius L.) dia zavamaniry legumina ampiasaina amin'ny famokarana sakafo sy fanatsarana ny tany.Ny fanitarana maneran-tany ny NLL ho toy ny voly dia nahasarika holatra pathogen maro, anisan'izany ny lupine anthracnose, izay mahatonga ny aretina anthracnose manimba.Alleles roa, Lanr1 sy AnMan, izay manome fanoherana mitombo, dia nampiasaina tamin'ny fiompiana NLL, saingy mbola tsy fantatra ny mekanika molekiola fototra.Amin'ity fanadihadiana ity, ny marika Lanr1 sy AnMan dia nampiasaina handinihana ny santionany NLL Eoropeana.Ny fitiliana ny vaksiny amin'ny tontolo voafehy dia nanamafy ny fahombiazan'ireo mpamatsy vola roa ireo.Notanterahina tamin'ny tsipika mahatohitra sy mora azo ny fanaovana profiling général differential.Ny fanoherana anthracnose dia mifandray amin'ny fanehoana tafahoatra ny teny momba ny fototarazo "GO: 0006952 Defense Response", "GO: 0055114 Redox Process", ary "GO: 0015979 Photosynthesis".Ho fanampin'izany, ny tsipika Lanr1 (83A: 476) dia nampiseho famerenan'ny transcriptome manan-danja haingana taorian'ny inoculation, raha ny andalana hafa kosa dia naneho fahatarana tamin'ity valiny ity tamin'ny 42 ora teo ho eo.Ny valin'ny fiarovana dia mifandray amin'ny fototarazo TIR-NBS, CC-NBS-LRR ary NBS-LRR, proteinina 10 tafiditra amin'ny pathogenesis, proteinina famindrana lipid, endoglucan-1,3-β-glucosidase, proteinina misy glycine manankarena amin'ny rindrina, ary ny fototarazo avy amin'ny lalan'ny oksizenina.Ny valinteny voalohany momba ny 83A: 476, anisan'izany ny fanafoanana amim-pitandremana ireo fototarazo mifandray amin'ny photosynthesis, dia nifanandrify tamin'ny fiarovana mahomby nandritra ny dingan'ny fitomboan'ny zavamaniry amin'ny biôlôjia holatra, izay milaza fa misy effector miteraka hery fiarovana.Ny fihetsik'i Mandeloop dia miadana, toy ny fisintonana marindrano amin'ny ankapobeny.
Ny lupine tery raviny (NLL, Lupinus angustifolius L.) dia voamadinika be proteinina avy any amin'ny faritra andrefan'i Mediterane1,2.Izy io dia ambolena ho sakafo ho an'ny biby sy ny olona amin'izao fotoana izao.Heverina ihany koa ny zezika maitso amin'ny rafitra fihodinan'ny voly noho ny fametahana azota amin'ny alàlan'ny bakteria mametaka azota symbiotika ary fanatsarana ankapobeny ny firafitry ny tany.NLL dia nandalo dingana haingana ny trano fonenana tamin'ny taonjato farany ary mbola eo ambany fanerena fiompiana avo3,4,5,6,7,8,9,10,11,12.Miaraka amin'ny fambolena miely patrana ny NLL, ny fifandimbiasana ny holatra pathogen dia namolavola toeram-pambolena vaovao ary niteraka aretina vaovao manimba ny voly. Ny tena niavaka indrindra ho an'ny mpamboly sy mpiompy lupine dia ny fisehon'ny anthracnose, vokatry ny holatra pathogen, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Ny tena niavaka indrindra ho an'ny mpamboly sy mpiompy lupine dia ny fisehon'ny anthracnose, vokatry ny holatra pathogen, Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Наиболее примечательным для фермеров и селекционеров люпина было появление антракноза, вызванного памогенеров люпина было появление антракноза, вызванного памогенкринборный , Feiler & Hagedorn13. Ny tena nanamarika ny mpamboly sy ny mpiompy lupine dia ny fipoiran'ny anthracnose vokatry ny holatra pathogenic Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原真由病原真tric菌 Lupinbergi (ondarhum) 引起的.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原真菌lu。 Наиболее поразительным для фермеров и селекционеров люпина является появление антракноза, вызываемогего приматор Nirenberg, Feiler & Hagedorn13. Ny tena manaitra ny mpamboly sy mpiompy lupine dia ny fipoiran'ny anthracnose vokatry ny holatra pathogenic Colletotrichum lupini (Bondar) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13.Ny tatitra voalohany momba ny aretina dia avy any Brezila sy Etazonia, izay misy soritr'aretina mahazatra niseho tamin'ny 1912 sy 1929.Rehefa afaka 30 taona teo ho eo anefa, dia nantsoina hoe Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz ilay otrikaretina. & Sacc., teleomorph Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., teleomorph Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., телеоморф Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., teleomorph an'ny Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc.，有目的形态的Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc.，有目的形态的Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld в Целенаправленной морфологии. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld amin'ny Morphologie targeted. & H. Schrenk,. & H. Schrenk, .ary H. Schrenk. & H.施伦克，。 & H.施伦克，。ary H. Schlenk, .Ny phenotyping aretina mialoha natao tamin'ny tapaky ny taonjato faha-20 dia naneho fanoherana ny NLL sy ny fidirana amin'ny lupine mavo (L. luteus L.), fa ny fidirana amin'ny lupine fotsy (L. albus L.) voasedra dia tena mora voan'ny aretina15,16.Ny fandinihana dia naneho fa ny fivoaran'ny anthracnose dia mifandray amin'ny fitomboan'ny rotsak'orana (hamandoana rivotra) sy ny mari-pana (eo amin'ny 12-28 ° C), izay mitarika ho amin'ny fanitsakitsahana ny fanoherana amin'ny mari-pana ambony17, 18. Raha ny marina, ny fotoana takiana amin'ny conidia mitsimoka sy ny aretina manomboka , dia avo efatra heny amin'ny 24 ° C amin'ny 12 ora (4 ora) ambony kokoa (4 ora) C.Noho izany, ny fiakaran'ny hafanana maneran-tany dia nitarika ny fihanaky ny anthracnose.Na izany aza, ny aretina dia hita tany Frantsa (1982) sy Ukraine (1983) ho toy ny harbinger ny fandrahonana mananontanona, fa toa tsy noraharahain'ny indostria lupine tamin'izany fotoana izany20,21.Taona vitsivitsy taty aoriana dia niparitaka nanerana izao tontolo izao ity aretina manimba ity ary nihatra tamin'ireo firenena mpamokatra lupine lehibe toa an'i Aostralia, Polonina ary Alemana22,23,24.Taorian'ny fipoahan'ny anthracnose tamin'ny tapaky ny taona 1990, ny fitiliana be dia be dia nahitana mpanome mahatohitra maromaro tamin'ny santionany NLL19.Ny fanoherana ny NLL amin'ny anthracnose dia fehezin'ny alleles roa misaraka hita amin'ny loharano mikraoba samihafa: Lanr1 ao amin'ny cultivar Tanjil sy Wonga ary AnMan ao amin'ny cultivar.Mandalay 25, 26. Ireo alleles ireo dia mameno ny marika molekiola izay manohana ny fifantenana ny germplasma mahatohitra amin'ny programa fiompiana25,26,27,28,29,30.Ny tsipika fiompiana mahatohitra 83A: 476 mitondra ny Allele Lanr1 dia niampita miaraka amin'ny tsipika mahatsikaiky P27255 mba hahazoana mponina RIL manasaraka amin'ny fanoherana anthracnose, izay nahafahana nametraka ny toerana Lanr1 ho an'ny krômôzôma NLL-1131, 32, 33. dia nanambara ny toerana misy ny alleles telo ao amin'ny krômôzôma iray ihany (NLL-11), saingy amin'ny toerana samihafa29,34,35.Na izany aza, noho ny fahavitsian'ny RIL sy ny halaviran'ny fototarazo lehibe eo amin'ny marika sy ny alleles mifanaraka amin'izany, dia tsy misy fanatsoahan-kevitra azo antoka azo raisina momba ny fototarazony.Amin'ny lafiny iray, sarotra ny fampiasana ny fototarazo mivadika amin'ny lupins noho ny mety ho fahaterahana ambany dia ambany, izay mahatonga ny fanodikodinana fototarazo ho sarotra37.
Ny fivoaran'ny plasma mikraoba ao an-trano mitondra ny allele irina ao amin'ny fanjakana homozygous, toy ny 83A: 476 (Lanr1) sy Mandelup (AnMan), dia nanokatra ny varavarana hianarana ny fanoherana anthracnose manoloana ny fisian'ny fitambaran'ny alleles mifanohitra amin'ny mponina an-dia.Ny fahafahan'ny mekanika molekiola.Ampitahao ny valin'ny fiarovana nateraky ny genotype manokana.Ity fanadihadiana ity dia nanombana ny valin'ny transcriptome tany am-boalohany momba ny NLL amin'ny vaksiny C. lupini.Voalohany, ny tontonana germplasm Eropeana NLL misy andalana 215 dia nojerena tamin'ny fampiasana marika molekiola izay manamarika ny Alleles Lanr1 sy AnMan.Ny phenotyping anthracnose dia natao tamin'ny tsipika 50 NLL, nofantenana teo aloha ho an'ny marika molekiola, eo ambanin'ny fepetra voafehy.Mifototra amin'ireo andrana ireo, tsipika efatra tsy mitovy amin'ny fanoherana anthracnose sy Lanr1 / AnMan allelic composition no nofantenana ho an'ny fanehoan-kevitry ny fototarazo fiarovan-tena amin'ny fampiasana fomba roa mifameno: ny filaharana RNA avo lenta sy ny fatran'ny PCR amin'ny fotoana tena izy.
Ny fitiliana ny andiana germplasma NLL (N = 215) miaraka amin'ny marika Lanr1 (Anseq3 sy Anseq4) ary AnMan (Anseq4) ary AnMan (AnManM1) dia nampiseho fa andalana iray ihany (95726, akaikin'i Salamanca-b) no manamafy ny "fanoherana" allele ho an'ny marika rehetra, raha toa kosa ny "Pressence allelesus 5" amin'ny marika rehetra (8~7) .5%) andalana.Andalana telo ambin'ny folo no namokatra alleles "mahatohitra" roa an'ny marika Lanr1, ary andalana 8 no namokatra alleles "mahatohitra" an'ny Lanr1.marika.Ny allele "fanoherana" an'ny marika AnMan (Tabilao fanampiny S1).Andalana roa dia heterozygous ho an'ny marika Anseq3 ary heterozygous iray ho an'ny marika AnManM1.Ny andalana 42 (19.5%) dia nitondra dingana mifanohitra amin'ny Anseq3 sy Anseq4 alleles, izay manondro matetika ny famerenana indray eo amin'ireo toerana roa ireo.Ny phenotypes anthracnose eo ambanin'ny fepetra voafehy (Tabilao fanampiny S2) dia nanambara ny fiovaovan'ny fanoherana ny genotype voasedra, izay hita taratra amin'ny hamafin'ny anthracnose.Ny fahasamihafana eo amin'ny salan'isa antonony dia avy amin'ny 1.8 (mahatohitra antonony) hatramin'ny 6.9 (mora) ary ny fahasamihafan'ny lanjan'ny zavamaniry dia avy amin'ny 0.62 (mora) hatramin'ny 4.45 g (mahatohitra). Nisy fifamatorana lehibe teo amin'ny soatoavina hita tamin'ny replication roa tamin'ny fanandramana (0.51 ho an'ny hamafin'ny aretina, P = 0.00017 sy 0.61 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry, P <0.0001) ary koa eo anelanelan'ireo paramètre roa ireo (- 0.59 sy - 0.77, P <0.000). Nisy fifamatorana lehibe teo amin'ny soatoavina hita tamin'ny replication roa tamin'ny fanandramana (0.51 ho an'ny hamafin'ny aretina, P = 0.00017 ary 0.61 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry, P <0.0001) ary koa eo amin'ireo paramètre roa ireo (- 0.59 sy - 0.77, P <0.77). Выявлена ​​достоверная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях эксперимента (0,51 для бля, 0,51 для бля 0017 и 0,61 для массы растения, P < 0,0001), а также между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,77, Р < 0,0001) . Nisy fifamatorana lehibe hita teo amin'ny soatoavina voamarika tamin'ny famerimberenana indroa ny fanandramana (0.51 ho an'ny hamafin'ny aretina, P = 0.00017 ary 0.61 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry, P <0.0001), ary koa eo anelanelan'ireo masontsivana roa ireo (- 0.59 sy -0.77, P <0.0001)在两次重复实验中观察到的值之间存在显着相关性（疾病严重程度评分不程度评分为0，00.量为0.61，P <0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 和- 0.77，P <0.0001).在 两 次 重复 实验 中 观察 的 值 之间 存在 相关性 （疾病 严重 程度 了 评 度 了 1 ， p = 0.00017 ， 植物 为 为 0.61 ， p <0.0001） 以及 两 个 参数 之间 （（（（（- 0.0001） 以及 两 个 参数 之间 （（（（- 0.5–5. 9 和- 0.77, P < 0.0001). Наблюдалась значительная корреляция между значениями, наблюдаемыми в двух повторностях (оценка тяжести за1,0,0,0,0,0,0 сса растения 0,61, P <0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,0001) 0,77, P <0,0001. Nisy fifamatorana lehibe teo amin'ny soatoavina voamarika tamin'ny dika mitovy (isa 0.51 ny hamafin'ny aretina, P = 0.00017 ary lanjan'ny zavamaniry 0.61, P <0.0001) ary teo anelanelan'ireo paramètre roa ireo (-0.59 sy -0.0001) 0.77, P <0.0001 ).Ny soritr'aretina mahazatra hita amin'ny zava-maniry mora voan'ny aretina dia ny fikitikitika sy fihodinkodinana ny taho mitovitovy amin'ny firafitry ny “tsipìkan'ny mpiandry ondry”, arahin'ny fery oval miaraka amin'ny sporozoite voasary/mavokely (sary fanampiny 1).Ny fidirana Aostraliana mitondra ny fototarazo Lanr1 (83A: 476 sy Tanjil) sy AnMan (Mandelup) dia mahatohitra antonony, 0.0331 sy 0.0036).Ny andalana sasany izay mitondra ihany koa ny Lanr1 sy/na AnMan alleles "mahatohitra" dia mampiseho soritr'aretina.
Mahavariana fa misy tsipika NLL vitsivitsy tsy misy allele marika "mahatohitra" dia nanambara ny haavon'ny fanoherana anthracnose (ampitahaina na ambony noho ny genotypes Lanr1 na AnMan), toy ny Boregine (P value <0.0001 ho an'ny paramètres roa), Bojar (P value <0.0001 ho an'ny isa ary 0.001 ho an'ny lanjany ary 0.001 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry B9-5) isa ary tsy misy dikany amin'ny lanjany). Mahavariana fa misy tsipika NLL vitsivitsy tsy misy allele marika "mahatohitra" dia nanambara ny haavon'ny fanoherana anthracnose (ampitahaina na ambony noho ny genotypes Lanr1 na AnMan), toy ny Boregine (P value <0.0001 ho an'ny paramètres roa), Bojar (P value <0.0001 ho an'ny isa ary 0.001 ho an'ny lanjany ary 0.001 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry B9-5) isa ary tsy misy dikany amin'ny lanjany). Интересно, что несколько линий NLL, лишенных какого-либо «резистентного» маркерного аллеля, показали высокний констраного у (сопоставимый или более высокий, чем для генотипов Lanr1 или AnMan), таких как Boregine (значение P <0,0001 для обои обои (х парад, 0, Boregine) оценки и 0,001 для массы растения) и популяции B-549/79b (значение P <0,0001 для оценки и незначимо дсыя масы). Mahaliana fa ny tsipika NLL maromaro tsy misy allele marika 'mahatohitra' dia mampiseho fanoherana avo lenta amin'ny anthracnose (ampitahao na ambony noho ny genotypes Lanr1 na AnMan), toy ny Boregine (P value <0.0001 ho an'ny masontsivana roa), Bojar (P value <0.0001 ho an'ny fanombanana ary 0.0001 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry sy 0.0001 ho an'ny lanjan'ny zavamaniry <0.0001) ho an'ny fanombanana fa tsy manan-danja amin'ny lanjany).有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽病抗他们一一一上型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001，不量礍片B-549/79b（得分P 值< 0.0001，重量不显着）。 Mahaliana fa ny rafitra NLL sasany izay tsy misy marika "antigenika" dia mampiseho fanoherana mitsivalana avo (mitovy amin'ny fototarazo Lanr1 na AnMan na ambony), toy ny Boregine (samy P <0,0001), Bojar (P value <0,0001, lanjan'ny zavamaniry 0,001) ary ny lanjan'ny B-549 / 79b (P <1,000). Интересно, что некоторые линии NLL, лишенные каких-либо маркерных аллелей «резистентности», показали высокие уростики уротник внимые или выше, чем у генотипов Lanr1 или AnMan), такие как Boregine (значение P для обоих параметров <0,0001), Bojar (значение P 0,001) популяция B-549/79b (оценка P-значение <0,0001, масса незначительна). Mahaliana fa ny tsipika NLL sasany tsy misy marika famantarana 'fanoherana' dia nampiseho avo lenta amin'ny fanoherana anthracnose (ampitahao na ambony noho ny genotypes Lanr1 na AnMan), toy ny Boregine (sanda P ho an'ny masontsivana roa <0,0001), Bojar (P-value <0,0001, lanjan'ny zavamaniry 0,000-0,001) lanja tsy manan-danja).Ity trangan-javatra ity dia manolotra ny mety hisian'ny loharanon-tsarimihetsika vaovao momba ny fanoherana, manazava ny tsy fahampian'ny fifandraisana misy eo amin'ny genotypes marika sy ny phenotypes amin'ny aretina (ny sanda P avy amin'ny ~ 0.42 hatramin'ny ~ 0.98).Noho izany, ny fitsapana Kolmogorov-Smirnov dia naneho fa ny angon-drakitra momba ny fanoherana anthracnose dia nizara ara-dalàna ho an'ny isa (P-values ​​0.25 sy 0.11) sy ny plant mass (P-values ​​0.47 sy 0.55), manoro hevitra aho fa ny alleles kokoa noho ny Lanr1 sy AnMan no tafiditra.
Miorina amin'ny valin'ny fitiliana fanoherana anthracnose, andalana 4 no nofantenana ho an'ny fanadihadiana transcriptome: 83A: 476, Boregine, Mandelup, ary Population 22660. Ireo andalana ireo dia nozahana indray ho an'ny fanoherana ny anthrax amin'ny fanandramana inoculation amin'ny alàlan'ny sequencing RNA, raha toa ka mitovy amin'ny fitsapana teo aloha izy ireo.Ny sandan'ny isa dia toy izao manaraka izao: Boregin (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), Mandelup (3.82 ± 1.42) ary mponina 22660 (6.11 ± 1.29).
Ny protocol Illumina NovaSeq 6000 dia nahatratra salan'isa 40.5 Mread isaky ny santionany (29.7 hatramin'ny 54.4 Mreads) (Tabilao fanampiny S3).Ny isa fampifanarahana amin'ny filaharan'ny reference dia avy amin'ny 75.5% hatramin'ny 88.6%.Ny salan'isa mifandraika amin'ny angon-drakitra voavaky eo amin'ny variana andrana eo amin'ny replika biolojika dia avy amin'ny 0.812 ka hatramin'ny 0.997 (midika 0.959). Amin'ireo fototarazo 35,170 nodinihina, ny 2917 dia tsy nanambara fanehoan-kevitra, ary ny fototarazo 4785 hafa dia naseho tamin'ny ambaratonga tsy dia misy dikany (base midika <5). Amin'ireo fototarazo 35,170 nodinihina, ny 2917 dia tsy nanambara fanehoan-kevitra, ary ny fototarazo 4785 hafa dia naseho tamin'ny ambaratonga tsy dia misy dikany (base midika <5). Из 35 170 проанализированных генов 2917 не проявляли экспрессии, а остальные 4785 генов экспресиронвались на тельном е среднее <5). Amin'ireo fototarazo 35,170 nodinihina, ny 2917 dia tsy naneho fanehoan-kevitra, ary ny fototarazo 4785 sisa dia naseho tamin'ny ambaratonga tsy dia misy dikany (base midika <5).在分析的35,170 个基因中，2917 个没有表达，其他4785 个基因的表达可以忽略可以忽略不城。35,170 Из 35 170 проанализированных генов 2917 не экспрессировались, а остальные 4785 генов имели незначительнсуюбискиб значение <5). Amin'ireo fototarazo 35,170 nodinihina, ny 2917 dia tsy nambara ary ny fototarazo 4785 sisa dia nanana fitenenana tsinontsinona (base midika <5).Noho izany, ny isan'ny fototarazo heverina nambara (base midika ≥ 5) nandritra ny fanandramana dia 27.468 (78.1%) (Tabilao fanampiny S4).
Hatramin'ny fotoana voalohany, ny andalana NLL rehetra dia namaly ny fanonganana ny C. lupini (strain Col-08) tamin'ny alàlan'ny fampandehanana ny transcriptome (Table 1), na izany aza, nisy fahasamihafana lehibe hita teo amin'ireo tsipika.Noho izany, ny tsipika fanoherana 83A: 476 (mitondra ny fototarazo Lanr1) dia nampiseho fanovàna transcriptome manan-danja tamin'ny teboka voalohany (6 hpi) miaraka amin'ny fitomboana 31-69 heny amin'ny isan'ny fototarazo mitokana miakatra sy midina raha oharina amin'ny teboka hafa amin'izao fotoana izao.Fanampin'izany, tsy naharitra ela io tampon'isa io, satria ny fanehoana ny fototarazo vitsivitsy ihany no niova be tamin'ny teboka fanindroany (12 hpi).Mahaliana fa i Boregine, izay naneho fanoherana avo lenta ihany koa tamin'ny fitsapana grefy, dia tsy nandalo fanovàna transcriptional goavana toy izany nandritra ny fanandramana.Na izany aza, mitovy ny isan'ny fototarazo (DEG) ho an'ny Boregine ary 83A: 476 amin'ny 12 HPI.Na i Mandelup sy ny mponina 22660 dia samy nampiseho tampon'isa DEG tamin'ny fotoana farany (48 l/s), izay manondro ny fahatarana eo amin'ny valin'ny fiarovana.
Satria ny 83A: 476 dia nandalo reprogramming transcriptome faobe ho setrin'ny C. lupini amin'ny 6 HPI raha oharina amin'ny andalana hafa rehetra, ~ 91% amin'ny DEGs voamarika tamin'io fotoana io dia voafaritra manokana (sary 1).Na izany aza, nisy fifandonana teo amin'ny valinteny tany am-boalohany teo anelanelan'ny andalana fandalinana, satria 68,5%, 50,9%, ary 52,6% DEG tao Boregine, Mandelup, ary mponina 22660, tsirairay avy, nifanizina tamin'ireo hita ao amin'ny 83A: 476 amin'ny fotoana sasany.Na izany aza, ireo DEG ireo dia tsy nahitana afa-tsy ampahany kely (0.97-1.70%) amin'ny DEG rehetra hita amin'izao fotoana izao amin'ny fampiasana 83A: 476.Ankoatr'izay, ny 11 DEGs avy amin'ny andalana rehetra dia nifanaraka tamin'io fotoana io (Tabilao fanampiny S4-S6), anisan'izany ny singa mahazatra amin'ny valin'ny fiarovana amin'ny zavamaniry: proteinina famindrana lipid (TanjilG_32225), endoglucan-1,3-β-glucoside enzyme (TanjilG_23384), proteinina roa-inducible toy ny SAM22 (TanjilG_3225) proteinina (TanjilG_325) 32352), ary proteinina roa manankarena glycine (TanjilG_19701 sy TanjilG_19702).Nisy ihany koa ny fifandimbiasan'ny valinteny transcriptome teo anelanelan'ny 83A: 476 sy Boregine amin'ny 24 HPI (total 16-38% DEG) ary eo anelanelan'i Mandelup sy ny mponina 22660 amin'ny 48 HPI (total 14-20% DEG).
Diagram Venn mampiseho ny isan'ny fototarazo (DEG) amin'ny tsipika lupine (NLL) misy raviny tery voatsindrona amin'ny Colletotrichum lupini (train Col-08 azo avy amin'ny saha lupine tany Wierzhenice, Polonina, 1999).Ny tsipika NLL nodinihina dia: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny Allele Lanr1), Boregine (mahatohitra, tsy fantatra ny fototarazo), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny Allele AnMan) ary mponina 22660 (tena mora voan'ny aretina).Ny fanafohezana hpi dia mijoro mandritra ny ora maro aorian'ny vaksiny.Nesorina ny sanda zero mba hanatsorana ny kisary.
Ny fitambaran'ny fototarazo overexpressed amin'ny 6 hpi dia nodinihina noho ny fisian'ny domaine kanônika R (tabilao fanampiny S7).Ity fanadihadiana ity dia nanambara ny fampidirana transcriptome ny fototarazo fanoherana aretina mahazatra miaraka amin'ny sehatra NBS-LRR ao amin'ny 83A: 476.Ity andiany ity dia ahitana fototarazo TIR-NBS-LRR iray (tanjilg_05042), fototarazo CC-NBS-LRR dimy (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, ary tanjilg_16162), ary Four NBS-LR,16jilg2 (4 NBS-LR, 16jilg2), ary Four NBS-LR16jilg2 (NBS-16162) ) ary koa NBS-Lrr efatra (tanjilg_16162) ary NBS-LRR efatra (TANJILG_16162).Ireo fototarazo rehetra ireo dia manana sehatra kanonika voalamina araka ny filaharany voatahiry.Ho fanampin'ny fototarazo domaine NBS-LRR dia misy kinase RLL maromaro no navitrika tao amin'ny 6 hpi, izany hoe ny iray ao Boregine (TanjilG_19877), roa ao Mandelup (TanjilG_07141 sy TanjilG_19877) ary amin'ny mponina 22660 (TanjilG_09014 sy TanjilG_19877) ary roa ao amin'ny 68014 sy TanjilG_103.
Ny fototarazo misy fitenenana be dia be ho setrin'ny inoculation miaraka amin'ny C. lupini (strain Col-08) dia iharan'ny fanadihadiana momba ny Gene Ontology (GO) (Tabilao fanampiny S8). Ny teny hoe "GO: 0006952 defense response" dia ny teny hoe "GO: 0006952 defense response" izay niseho tamin'ny 6 avy amin'ny 16 (fotoana × andalana) miaraka amin'ny lanjany ambony (P value <0.001) (sary 2). Ny teny hoe "GO: 0006952 defense response" dia ny teny hoe "GO: 0006952 defense response" izay niseho tamin'ny 6 avy amin'ny 16 (fotoana × andalana) miaraka amin'ny lanjany ambony (P value <0.001) (sary 2). Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 защитный ответный» 16 (время × линия) комбинаций с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2). Ny teny hoe "GO: 0006952 defense response" dia ny teny hoe "GO: 0006952 defense response", izay niseho tao amin'ny 6 amin'ny 16 (fotoana × lineage) miaraka amin'ny lanjany lehibe (P value <0.001) (sary 2).最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”，它出现在16 个（时间（时间（时间）一一一一一一一一一一上具有高显着性（P 值< 0.001）（图2）。 Ny teny fizotry ny biolojika maneho indrindra dia ny “GO:0006952 valinteny fiarovana”, izay hita ao amin'ny 6 amin'ireo fitambarana 16 (时间×线), manana lanjany ambony (sanda P <0.001) (图2). Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 Defense Response», котовлыл 6 поского процесса был ий (время × линия) с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2). Ny teny hoe "GO: 0006952 Defense Response" dia ny teny hoe "GO: 0006952 Defense Response", izay niseho tao amin'ny 6 amin'ny 16 fitambarana (fotoana × andalana) misy dikany avo (P value <0.001) (sary 2).Io teny io dia naseho tamin'ny teboka roa tao amin'ny 83A: 476 sy Boregine (6 sy 24 hpi) ary tamin'ny fotoana iray tany Mandelup sy ny mponina 22660 (12 sy 6 hpi, tsirairay avy).Ity dia vokatra andrasana, manasongadina ny valin'ny antifungal amin'ny tsipika mahatohitra.Fanampin'izany, namaly ny C. lupini ny 83A: 476 tamin'ny alàlan'ny famporisihana haingana ny fototarazo mifandraika amin'ny fipoahan'ny oxidative aseho amin'ny teny hoe "GO: 0055114 redox process", izay manondro valiny fiarovana manokana, raha i Boregine kosa dia nanambara valiny fiarovana manokana, mifandraika amin'ny teny hoe 'GO'.:0006950 Valiny adin-tsaina”.Ny mponina 22660 dia nanetsika ny valin'ny fanoherana marindrano misy metabolites faharoa, manasongadina ny isan'ny teny be loatra "GO: 0016104 Fizotry ny biosynthesis triterpene" sy "GO: 0006722 Fizotry ny metabolisma triterpene" (ireo teny roa ireo dia mitovy amin'ny fitambaran'ny fototarazo), amin'ny fiheverana ny valin'ny fanehoan-kevitry ny GO: 0016104. Fanampin'izany, ny fanehoan-kevitra voalohany 83A:476 (6 hpi) sy ny fanehoan-kevitra tara Mandelup sy ny mponina 22660 dia ahitana ny teny hoe GO:0015979 'photosynthesis' sy ireo dingana biolojika hafa mifandraika amin'izany.
Ny teny bioprocess général ontology nofantenana tamin'ny fanoritsoritana ny fototarazo tsy mitovy amin'ny valin'ny transcriptome amin'ny lupine narrow-leaved (NLL) voatsindrona amin'ny lupine anthrax (Col-08 azo avy amin'ny saha lupine tany Wierzhenice, Polonina, tamin'ny 1999) dia nitombo be.Ny tsipika NLL nodinihina dia: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Boregine (mahatohitra, tsy fantatra ny fototarazo fototra), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele) ary mponina 22660 (mora).
Satria ity fandalinana ity dia mikendry ny hamantatra ireo fototarazo izay mandray anjara amin'ny fanoherana anthracnose, ny fototarazo nomena ny teny hoe GO "GO: 0006952 Valiny fiarovana" sy "GO: 0055114 dingana Redox" dia nodinihina tamin'ny fanapahana satria midika hoe ≥ 30 miaraka amin'ny andalana iray farafahakeliny.× teboka amin'ny fotoana manambatra ny sanda manan-danja ara-statistika amin'ny log2 (fiovan'ny fony).Ny isan'ny fototarazo mahafeno ireo fepetra ireo dia 65 ho an'ny GO:0006952 ary 524 ho an'ny GO:0055114.
83A: 476 dia nanambara tampon'ny DEG roa voamarika miaraka amin'ny teny hoe GO: 0006952, ny voalohany amin'ny fototarazo 6 isaky ny santimetatra (genina 64, ny fitsipika ambony sy ambany) ary ny faharoa amin'ny fototarazo 24 isaky ny santimetatra (genina 15, ny fitsipika ambony ihany).Nasehon'i Boregine ihany koa fa ny GO: 0006952 dia nitombo tamin'ny fotoana iray ihany, saingy tamin'ny DEG kely kokoa (11 sy 8) sy ny fampahavitrihana manokana.Mandeloop dia nampiseho tampon'ny GO: 0006952 tamin'ny 12 sy 48 HPI, samy mitondra ny fototarazo 12 (ny voalohany misy fototarazo mavitrika, ary ny faharoa miaraka amin'ny fototarazo manafoana ihany), raha ny mponina 22660 ao amin'ny 6 HPI (genina 13) dia nanana ny tampon'ny fitomboana.fitsipika.Tsara homarihina fa ny 96.4% amin'ny GO: 0006952 DEG amin'ireo tampon'isa ireo dia nanana karazana valiny mitovy (miakatra na midina), izay manondro ny fifandimbiasana lehibe amin'ny valin'ny fiarovana na dia eo aza ny fahasamihafana eo amin'ny isan'ny fototarazo tafiditra.Ny vondrona lehibe indrindra amin'ny filaharana mifandraika amin'ny teny GO: 0006952 dia mametraka ny Protein Message Protein 22 (SAM22-tahaka) amin'ny hanoanana Stress-Associated, izay an'ny class 10 pathogenesis-associated protein (PR-10) clade proteinina sy ny latex proteinina fototra.proteinina mitovy (MLP-tahaka)) proteinina (sary 3).Tsy nitovy ny fomba fanehoan-kevitra sy ny fitarihana ny valiny ireo vondrona roa ireo.Ny fototarazo mandika ny proteinina mitovy amin'ny SAM22 dia nampiseho induction tsy miovaova sy manan-danja tamin'ny fotoana voalohany (6 na 12 hpi) ary tamin'ny ankapobeny dia tsy namaly tamin'ny faran'ny fanandramana (48 hpi), raha ny proteinina MLP-tahaka kosa dia nampiseho fandrindrana tamin'ny 6 hpi.hpi.83A: 476 sy Mandelup amin'ny 48 hp/in, saika ny teboka angon-drakitra hafa rehetra dia tsy namaly.Fanampin'izany, ny fahasamihafana eo amin'ny mombamomba ny fanehoana ny fototarazo proteinina SAM22 dia nanaraka ny fiovaovan'ny fanoherana anthracnose, satria ny tsipika mahatohitra dia manana teboka bebe kokoa amin'ny famporisihana ireo fototarazo ireo noho ny fototarazo mora kokoa.Ny fototarazo PR-10 LlR18A/B iray hafa dia nampiseho endrika fanehoana mitovy amin'ny fototarazo proteinina mitovy amin'ny SAM22.
Ny singa fototra amin'ny teny biolojika "GO: 0006952 Defense Response" sy ny fomba fanehoana ny fototarazon'ny kandidan'ny Alleles Lanr1 sy AnMan dia fantatra.Ny mari-pamantarana Log2 dia maneho ny soatoavina log2 (fiovan'ny fo) eo anelanelan'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo avy amin'ny saha lupine, Wizhenica, Polonina, 1999) sy ny zavamaniry (sham-inoculated) amin'ny fotoana mitovy.Ny tsipika lupine narrowleaf manaraka dia nodinihina: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Boregine (mahatohitra, fototarazo tsy fantatra), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele), ary Population 22660 (mora).
Ankoatr'izay, ny mombamomba ny fanehoan-kevitry ny RNA-seq candidat genes Lanr1 (TanjilG_05042) sy AnMan (TanjilG_12861) dia nodinihina (sary 3).Ny fototarazo TanjilG_05042 dia naneho valiny lehibe (fampahavitrihana) tamin'ny 83A: 476 tamin'ny fotoana voalohany (6 hpi), raha ny TanjilG_12861 dia manan-danja tao Mandeloop tamin'ny teboka roa: 6 hpi (fitsipika ambany) ary 24 hpi (6 hpi).Miaraka amin'ny.).Adjustable)).
Ny fototarazo be loatra amin'ny teny hoe GO: 0055114 "fizotry ny redox" dia ny fototarazo mamadika proteinina cytochrome P450 sy peroxidase (sary 4).Ho an'ny santionany mitoka-monina amin'ny 83A: 476 amin'ny 6 HPI, ny sanda ambony indrindra na kely indrindra (ho an'ny 86.6% amin'ny fototarazo) dia hita matetika eo anelanelan'ny zavamaniry voatsindrona sy mifehy, manasongadina ny valin'io karazana genotype io amin'ny firaisana ara-nofo.83A: 476 dia nampiseho ny GO manan-danja indrindra: 0055114 DEG amin'ny 6 hpi (503 fototarazo), raha ny sisa amin'ny andalana amin'ny 48 hpi (Boregine, 31 fototarazo; Mandelup, 85 fototarazo; ary Population 22660, 78 fototarazo)).Ao amin'ny ankamaroan'ny fototarazo ao amin'ny fianakaviana GO: 0055114, karazana valinteny roa amin'ny vaksiny (fampahavitrihana sy fanakanana) no hita.Mahaliana fa hatramin'ny 97.6% amin'ireo DEG nofaritana ho an'ny teny hoe GO: 0055114 ao Mandelupe amin'ny 48 hp Ireo fanamarihana ireo dia milaza fa, na dia eo aza ny haavony kely kokoa (izany hoe, ny isan'ny fototarazo redox mutated, 85 versus 503), ny lamin'ny valin'ny transcriptome nahemotra amin'ny mandeloup 6 dia mitovy amin'ny 8.Ao amin'ny Boregine sy ny mponina 22660, io fifanandrinana io dia ambany amin'ny 51,6% ary 75,6%, tsirairay avy.
Naseho ny lamina fanehoana ireo singa fototra amin'ny fizotry ny biolojika "GO:0055114 process Redox".Ny mari-pamantarana Log2 dia maneho ny soatoavina log2 (fiovan'ny fo) eo anelanelan'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo avy amin'ny saha lupine, Wizhenica, Polonina, 1999) sy ny zavamaniry (sham-inoculated) amin'ny fotoana mitovy.Ny tsipika lupine narrowleaf manaraka dia nodinihina: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Boregine (mahatohitra, fototarazo tsy fantatra), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele), ary Population 22660 (mora).
83A: 476 Ny valin'ny transcriptomika amin'ny inoculation miaraka amin'ny C. lupini (strain Col-08) dia nahitana ihany koa ny fampanginana ny fototarazo mifandraika amin'ny teny hoe GO: 0015979 "photosynthesis" sy ireo dingana biolojika hafa mifandraika amin'izany (sary 5).Ity andiany GO: 0015979 DEG ity dia misy fototarazo 105 izay voatsindry mafy amin'ny 6 hpi amin'ny 83A: 476.Ao anatin'ity ampahany ity, ny fototarazo 37 dia nahena ihany koa tao Mandelup tamin'ny 48 HPI ary 35 tamin'ny fotoana mitovy amin'ny mponina 22660, anisan'izany ny 19 DEG mahazatra amin'ny genotypes roa.Tsy misy DEG mifandraika amin'ny teny GO: 0015979 dia navitrika be tamin'ny fitambarana rehetra (andalana x ora).
Naseho ny lamina fanehoana ireo singa fototra amin'ny fizotry ny biolojika "GO:0015979 Photosynthesis".Ny mari-pamantarana Log2 dia maneho ny soatoavina log2 (fiovan'ny fo) eo anelanelan'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo avy amin'ny saha lupine, Wizhenica, Polonina, 1999) sy ny zavamaniry (sham-inoculated) amin'ny fotoana mitovy.Ny tsipika lupine narrowleaf manaraka dia nodinihina: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Boregine (mahatohitra, fototarazo tsy fantatra), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele), ary Population 22660 (mora).
Miorina amin'ny valin'ny famakafakana fanehoan-kevitra samihafa ary azo inoana fa tafiditra amin'ny valin'ny fiarovana amin'ny holatra pathogen, ity andiana fototarazo fito ity dia nofantenana mba hamaritana ny mombamomba ny fanehoan-kevitra amin'ny PCR (Tabilao fanampiny S9).
Ny fototarazon'ny proteinina putative TanjilG_10657 dia nampidirina be dia be tamin'ny andalana rehetra sy ny fotoana nianarana raha oharina amin'ny zavamaniry mifehy (mimic) (Tabilao fanampiny S10, S11).Fanampin'izany, ny mombamomba ny fanehoan-kevitry ny TanjilG_10657 dia nampiseho fironana mitombo nandritra ny andrana ho an'ny andalana rehetra.Ny mponina 22660 dia naneho ny fahatsapana avo indrindra amin'ny TanjilG_10657 amin'ny inoculation miaraka amin'ny fampahavitrihana in-114 ary ny haavon'ny fanehoana avo indrindra (4.4 ± 0.4) amin'ny 24 HPI (sary 6a).Ny fototarazo proteinina PR10 LlR18A TanjilG_27015 dia nampiseho fampahavitrihana manerana ny andalana sy ny fotoana rehetra, miaraka amin'ny lanjany ara-statistika amin'ny ankamaroan'ny teboka (sary 6b).Mitovy amin'ny TanjilG_10657, ny haavon'ny fanehoana avo indrindra amin'ny TanjilG_27015 dia hita tamin'ny mponina 22660 voatsindrona tamin'ny 24 HPI (19.5 ± 2.4).Ny fototarazo endochitinase asidra TanjilG_04706 dia nitombo be tamin'ny andalana rehetra sy tamin'ny fotoana rehetra afa-tsy ny Boregine 6 hpi (sary 6c).Nipoitra mafy tamin'ny teboka voalohany (6 HPI) tamin'ny 83A: 476 (amin'ny in-10.5) ary nitombo tsikelikely tamin'ny andalana hafa (amin'ny in-6.6-7.5).Nandritra ny fanandramana, ny fanehoana an'i TanjilG_04706 dia nijanona tamin'ny ambaratonga mitovy amin'ny 83A: 476 sy Boregine, raha ao amin'ny Mandelup sy ny mponina 22660 kosa dia nitombo be izany, nahatratra ny soatoavina avo lenta (5.9 ± 1.5 ary 6.2 ± 1.5, tsirairay avy).Ny endoglucan-1,3-β-glucosidase-like gene TanjilG_23384 dia nampiseho fampahavitrihana avo tamin'ny teboka roa voalohany (6 sy 12 hpi) amin'ny andalana rehetra afa-tsy ny mponina 22660 (sary 6d).Ny haavon'ny fanehoana avo indrindra amin'ny TanjilG_23384 dia hita tamin'ny teboka faharoa (12 hpi) tao Mandelup (2.7 ± 0.3) ary 83A: 476 (1.5 ± 0.1).Ao amin'ny 24 HPI, ny fanehoana TanjilG_23384 dia somary ambany amin'ny andalana rehetra nodinihina (avy amin'ny 0.04 ± 0.009 ka hatramin'ny 0.44 ± 0.12).
Ny mombamomba ny fanehoana ny fototarazo voafantina (ag) nasehon'ny PCR quantitative.Ny isa 6, 12 ary 24 dia maneho ora aorian'ny fanaovana vaksiny.Ny fototarazo LanDExH7 sy LanTUB6 dia nampiasaina ho an'ny normalization ary LanTUB6 dia nampiasaina ho an'ny calibration inter-series.Ny barana diso dia maneho ny fiviliana manara-penitra mifototra amin'ny replika biolojika telo, ny tsirairay amin'izy ireo dia ny salan'ny replika ara-teknika telo. Ny lanjany ara-statistika amin'ny fahasamihafana eo amin'ny haavon'ny fitenenana eo amin'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo tamin'ny 1999 avy amin'ny sahan'ny lupine any Wierzenica, Polonina) sy ny fanaraha-maso (mock-inoculated) dia voamarika eo amin'ny teboka data (* P value < 0.05, ** P sanda ≤ 0.01, *** P 0.01, *** P 0.01). Ny lanjany ara-statistika amin'ny fahasamihafana eo amin'ny haavon'ny fitenenana eo amin'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo tamin'ny 1999 avy amin'ny sahan'ny lupine any Wierzenica, Polonina) sy ny fanaraha-maso (mock-inoculated) dia voamarika eo amin'ny teboka data (* P value < 0.05, ** P sanda ≤ 0.01, *** P 0.01, *** P 0.01). Статистическая значимость различий в уровнях экспрессии между инокулированными (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, получен гля в 1999 г. женице, Польша) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечена над точками данных (*значение P < 0,05 P < 0,05 p. P ≤ 0,001). Ny fahasamihafana manan-danja amin'ny statistika eo amin'ny haavon'ny fitenenana eo amin'ny inoculation (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo tamin'ny 1999 avy amin'ny saha lupine ao Wierzhenice, Polonina) sy ny zavamaniry fanaraha-maso (sham-inoculated) dia voamarika eo ambonin'ny teboka data (* P value <0.05, ** P-value ≤ 0.01, *** P-0.接种（Colletotrichum lupini，Col-08株，1999年从波兰Wierzenica的羽扇豆田获得）和对照（模拟接种義义中文差异的统计学显着性标记在数据点上方（*P值< 0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001).接种 （colletotrichum lupini ， color-08 株 ， 1999 年 波兰 波兰 wierzenica 的 羽扇 获得） 和 对照 （ 接紗差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值 <0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001). Статистически значимые различия в уровнях экспрессии между инокулированными (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, полученплый спо, Польша, в 1999 г.) и контрольными (ложно инокулированными) растениями отмечены над точками данных (* з, ч-0, нич на точками данных (* з, ч0,0нич их (* з, ч-0,0нич на данных (* з, ч-0,0нич) ***P-значение ≤ 0,001). Ny fahasamihafana manan-danja amin'ny statistika eo amin'ny haavon'ny fitenenana eo amin'ny tsimokaretina (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo avy amin'ny sahan'ny lupine any Verzhenice, Polonina, tamin'ny 1999) sy ny zavamaniry fanaraha-maso (sham-inoculated) dia voamarika eo amin'ny teboka data (* P value < 0.05 , ** P-value ≤ 0.01, ≤ 0. *** 0.00).Ny tsipika NLL nodinihina dia: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele), Boregine (mahatohitra, tsy fantatra ny fototarazo fototra) ary mponina 22660 (mora).
Ny fototarazo candidat TanjilG_05042 ao amin'ny toerana Lanr1 dia nampiseho endrika fanehoana hafa tanteraka avy amin'ny mombamomba azo avy amin'ny fandalinana RNA-seq (sary 6e).Ny fampahavitrihana lehibe an'io fototarazo io dia hita tao amin'ny Mandelup sy ny mponina 22660 (hatramin'ny 39.7 sy 11.7, tsirairay avy), ka nahatonga ny haavon'ny fanehoana avo lenta (hatramin'ny 1.4 ± 0.14 sy 7.2 ± 1.3, tsirairay avy).83A: 476 dia nanambara ihany koa ny fampitomboana ny fototarazo TanjilG_05042 (hatramin'ny 3.8 heny), na izany aza, ny haavon'ny fitenenana mifandraika (0.044 ± 0.002) dia mihoatra ny 30 heny noho ny hita tao Mandelup sy ny mponina 22660.nodinihina tamin'ny qPCR dia nampiseho fahasamihafana lehibe teo amin'ny haavon'ny fitenenana teo amin'ny genotypes amin'ny variana vaccinated (fanaraha-maso), mahatratra 58 heny ny fahasamihafana eo amin'ny mponina 22660 sy 83A: 476, ary koa eo amin'ny mponina 22660 sy 22660. Nisy fahasamihafana roa heny teo amin'i Boregine sy Mandalup.
Ny fototarazo kandida ao amin'ny toerana AnMan, TanjilG_12861, dia navitrika ho setrin'ny vaksiny tamin'ny 83A: 476 ary Mandelup, dia tsy miandany amin'ny mponina 22660, ary nihena tao Boregine (sary 6f).Ny fitenenana momba ny fototarazo TanjilG_12861 no avo indrindra amin'ny 83A: 476 (0.14 ± 0.01).Ny 17.4 kDa class I heat shock protein gene TanjilG_05080 HSP17.4 dia nampiseho ny haavon'ny fitenenana ambany kokoa amin'ny tebiteby rehetra sy ny fotoana (sary 6g).Ny sanda ambony indrindra dia hita tamin'ny 24 HPI tamin'ny mponina 22660 (0.14 ± 0.02, fitomboana avo valo heny ho valin'ny vaksiny).
Ny fampitahana ny mombamomba ny fanehoan-kevitry ny fototarazo (sary 7) dia naneho fifandraisana avo teo amin'ny TanjilG_10657 sy ny fototarazo efatra hafa: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.80), ary TanjilG_9.Ny vokatra toy izany dia mety manondro ny fiaraha-miombon'antoka amin'ireo fototarazo ireo mandritra ny valin'ny fiarovana.Ny fototarazo TanjilG_12861 sy TanjilG_23384 dia naneho ny mombamomba ny fanehoan-kevitra samihafa miaraka amin'ny sandan'ny coefficient correlation Pearson (avy amin'ny 0.08 ka hatramin'ny 0.43 ary -0.19 hatramin'ny 0.28, tsirairay avy) raha oharina amin'ny fototarazo hafa.
Ny fifandraisana misy eo amin'ny mombamomba ny fanehoana ny fototarazo dia hita tamin'ny fampiasana PCR quantitative.Ireto manaraka ireto ny tsipika lupine narrowleaf dia nodinihina: 83A: 476 (mahatohitra, mitondra ny homozygous Lanr1 allele), Mandelup (mahatohitra antonony, mitondra ny homozygous AnMan allele), Boregine (mahatohitra, fototarazo tsy fantatra), ary Population 22660 (mora).Teboka telo no nanaovana kajy (6, 12 ary 24 ora taorian'ny inoculation), anisan'izany ny inoculation (Colletotrichum lupini, strain Col-08, azo avy amin'ny saha lupine tany Wierzhenice, Polonina, tamin'ny 1999) sy ny fanaraha-maso (sham-inoculated) zavamaniry.Ny maridrefy dia mampiseho ny sandan'ny coefficient correlation Pearson.
Miorina amin'ny angon-drakitra azo amin'ny 6 horsepower isaky ny santimetatra, ny WGCNA dia natao tamin'ny 9981 DEG fantatra amin'ny fampitahana ireo zavamaniry voatsindrona sy mifehy mba hifantoka amin'ny valin'ny fiarovana aloha (Tabilao fanampiny S12).Roa amby roapolo ny môdelin'ny fototarazo (vondrona) hita miaraka amin'ny mombamomba ny fitenenana mifamatotra (tsara na ratsy) eo anelanelan'ny genotypes sy ny variana andrana. Amin'ny ankapobeny dia nidina araka ny filaharana 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 ny haavon'ny fanehoana ny fototarazo (amin'ireo variana roa ireo anefa dia matanjaka kokoa io fironana io amin'ny zavamaniry mifehy). Amin'ny ankapobeny dia nidina araka ny filaharana 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 ny haavon'ny fanehoana ny fototarazo (amin'ireo variana roa ireo anefa dia matanjaka kokoa io fironana io amin'ny zavamaniry mifehy). Всреднем уровни экспрессии генов снижались в порядке 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 контрольных растений). Amin'ny ankapobeny, nihena ny haavon'ny fanehoana ny fototarazo ao amin'ny lamina 83A: 476> Mandelup> Boregine> Population 22660 (amin'ny karazany roa, na izany aza, io fironana io dia matanjaka kokoa amin'ny zavamaniry mifehy).平均而言，基因表达水平按83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 的顺序下降（然而，在两种变住照植物中更强）。平均 而 言 ， 基因 水平 按 按 83a: 476> mandelup> boregine> mponina 22660 的 顺序 下降 （， 在 种 中 在 种 中中 更） . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . В среднем уровни экспрессии генов снижались в ряду 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 рольных растений). Amin'ny ankapobeny, nihena ny haavon'ny fanehoana fototarazo ao amin'ny andian-dahatsoratra 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 (na izany aza, amin'ireo variana roa ireo, io fironana io dia matanjaka kokoa amin'ny zavamaniry mifehy).Ny vakisiny dia nahatonga ny fampitomboana ny fanehoana ny fototarazo, indrindra amin'ny modules 18, 19, 14, 6 ary 1 (amin'ny filaharana midina), ny fitsipika ratsy (ohatra ny modules 9 sy 20) na misy fiantraikany tsy miandany (ohatra ny modules 11, 22, 8 ary 13).Mandehana ao amin'ny famakafakana fanamboarana (latabatra fanampiny s13) ).Ny concentrator Module 18 (sary 8) dia fantatra amin'ny anarana hoe TanjilG_26536 Gene encoding ny proteinina LlR18B mitovy amin'ny PR-10, ary ny concentrator module 9 dia fantatra amin'ny anarana hoe TanjilG_28955 fametahana ny proteinina photosystem II PsbQ.Ny candidat anthracnose resistance gene Lanr1, TanjilG_05042, dia hita ao amin'ny module 22 (sary 9) ary mifandray amin'ny teny hoe "GO: 0044260 Cellular macromolecular metabolic process" ary "GO: 0006355 Transcriptional regulation, DNA templating" mitondra ny TanjilG_01212 hub.Ny fototarazo dia mamaritra ny fatran'ny fiovan'ny hafanana A-4a (HSFA4a).
Famakafakana tambajotra mavesatra amin'ny fanehoana ny fototarazo miaraka amin'ny teny fizotry ny biolojika be loatra "GO: 0006952 Valiny fiarovana".Notsotsotra ny ligation mba hanasongadinana ireo fototarazo efatra nodinihina tamin'ny qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 ary TanjilG_27015).
Famakafakana tambajotra mavesatra momba ny fiaraha-mientana amin'ny mody miaraka amin'ny teny fizotry ny biolojika be loatra "GO: 0006355: Fitsipika Transcriptional, templating ADN" ary mitondra fototarazo fanoherana anthracnose kandida Lanr1 TanjilG_05042.Notsotsotra ny ligation mba hanavahana ny fototarazo TanjilG_05042 sy ny fototarazo TanjilG_01212 afovoany.
Ny fitiliana ny fanoherana anthracnose nangonina tany Aostralia dia nampiseho fa ny ankamaroan'ny voly navoaka voalohany dia mora voan'ny aretina;Kalya, Coromup ary Mandelup dia voalaza fa mahatohitra antonony, raha i Wonga, Tanjil ary 83A: 476 kosa dia voalaza fa tena mahatohitra26,27,31.nanana allele fanoherana mitovy, voatondro Lanr1, ary Coromup sy Mandelup dia nanana allele hafa, voatondro AnMan10, 26, 39, raha i Kalya kosa nandalo tamina allele hafa., Lanr2.Ny fitiliana ho an'ny fanoherana anthracnose tany Alemaina dia nahatonga ny famantarana ny tsipika mahatohitra Bo7212 miaraka amin'ny allele kandida ankoatry ny Lanr1, antsoina hoe LanrBo36.
Ny fandinihanay dia nanambara fa matetika (eo amin'ny 6%) amin'ny allele Lanr1 ao amin'ny germplasm nosedraina.Ity fandinihana ity dia mifanaraka amin'ny valin'ny fitiliana ny germplasma Eoropeana Atsinanana amin'ny fampiasana ny marika Anseq3 sy Anseq4, izay mampiseho fa ny Allele Lanr1 dia tsy misy afa-tsy tsipika Belarosiana roa.Izany dia manondro fa ny Allele Lanr1 dia mbola tsy ampiasaina betsaka amin'ny programa fiompiana eo an-toerana, tsy toy ny any Aostralia, izay iray amin'ireo alleles manan-danja amin'ny fiompiana miaraka amin'ny marika.Mety ho noho ny fihenan'ny fanoherana nomen'ny Lanr1 allele amin'ny toe-javatra eoropeana raha oharina amin'ny tatitra Aostraliana.Ankoatr'izay, ny fanadihadiana momba ny anthracnose any amin'ny faritra be rotsak'orana any Aostralia dia naneho fa ny valin'ny fanoherana ataon'ny Lanr1 allele dia mety tsy hahomby amin'ny toetr'andro izay mankasitraka ny fitomboana sy ny fampandrosoana haingana ny pathogen19,42.Raha ny marina, tamin'ity fanadihadiana ity, ny soritr'aretina sasany amin'ny anthracnose dia hita ihany koa amin'ny genotypes mitondra ny Allele Lanr1, izay manoro hevitra fa mety hanjavona ny fanoherana amin'ny toe-javatra tsara indrindra ho an'ny fampandrosoana ny C. lupini.Ankoatr'izay, ny fandikana tsara diso momba ny fisian'ny marika Anseq3 sy Anseq4, izay eo amin'ny 1 cM avy amin'ny toerana Lanr1, dia azo atao 28,30,43.
Ny fandinihanay dia naneho fa ny 83A: 476, mitondra ny Allele Lanr1, dia namaly ny inoculation C. lupini miaraka amin'ny reprogramming transcriptome lehibe amin'ny fotoana anadihadiana voalohany (6 hpi), raha tao Mandelup, nitondra ny AnMan allele, ny valin'ny transcriptomic dia hita taty aoriana.(avy amin'ny 24 ka hatramin'ny 48 hp).Ireo fiovana ara-nofo amin'ny valin'ny fiarovana ireo dia mifandray amin'ny fahasamihafana amin'ny soritr'aretina, manasongadina ny maha-zava-dehibe ny fanekena ny pathogen aloha ho an'ny valiny mahomby amin'ny fanoherana.Mba hifindran'ny vatan'ny zavamaniry, ny spores anthrax dia tsy maintsy mandalo dingana maro amin'ny fivoarana eo amin'ny sehatry ny mpampiantrano, ao anatin'izany ny fitsimohany, ny fizarazarana sela ary ny fananganana appressorium.Ny appendage dia firafitry ny areti-mifindra izay mipetaka eo amin'ny tampon'ny mpampiantrano ary manamora ny fidiran'ny sela misy azy.Noho izany, ny spores C. gloeosporioides ao amin'ny pea extract dia nampiseho ny fizarana voalohany ny nucleus taorian'ny 75-90 minitra incubation, ny fananganana fantsona mikraoba taorian'ny 90-120 minitra, ary ny fanafoanana taorian'ny 4 ora 45.Mango C. gloeosporioides dia mampiseho mihoatra ny 40% ny tsimokaretina conidial taorian'ny 3 ora incubation ary manodidina ny 20% ny fananganana apppressors rehefa afaka 4 ora.Ny fototarazo CAP20 mifandraika amin'ny virulence an'ny C. gloeosporioides dia nampiseho hetsika transcriptional amin'ny epiphyte-forming conidia taorian'ny incubation 3.5 h amin'ny savoka avocado miaraka amin'ny proteinina CAP20 avo lenta aorian'ny 4 h 46 min.Toy izany koa, ny asan'ny fototarazo biosynthesis melanine ao amin'ny C. trifolii dia voatarika nandritra ny 2 ora incubation arahin'ny fananganana appressorium aorian'ny 1 ora.Ny fandinihana ny tadin-dravina dia naneho fa ny frezy voatsindrona amin'ny C. acutatum dia manana tsindrim-peo voalohany amin'ny 8 hpi, raha ny voatabia voatsindrona amin'ny C. coccodes kosa dia manana 4 hpi48,49 voalohany.mifanaraka amin'ny haavon'ny fotoanan'ny Colletotrichum spp.dingana mifindra.Ny valin'ny fiarovana haingana amin'ny 83A: 476 dia manome soso-kevitra ny fandraisan'anjaran'ny fanoherana ny zavamaniry sy ny fototarazon'ny hery fiarovana (ETI) amin'ity andalana ity, raha toa kosa ny valin'ny fanemoran'i Mandelup dia manohana ny hypothesis micro-associated molecular pattern-triggered immunity (MTI) 50. Valiny aloha tamin'ny 83A: 476.Ny fifandimbiasan'ny ampahany eo amin'ny fototarazo miakatra na midina amin'ny valin'ny tara dia manohana io hevitra io ihany koa, satria matetika ny ETI dia heverina ho valin'ny MTI haingana sy manatsara izay miafara amin'ny fahafatesan'ny sela voaprograma eo amin'ny toerana misy ny aretina, fantatra amin'ny anarana hoe anaphylactic shock 51,52.
Ny ankabeazan'ny fototarazo dia nomena ny teny hoe Gene Ontology GO: 0006952 "Defense Response" dia ireo homologues 11 amin'ny hafatra fifadian-kanina vokatry ny adin-tsaina 22 proteinina (mitovy amin'ny SAM22) ary ireo fito lehibe mitovy amin'ny proteinina latex (MLPs).-toy ny proteinina 31, 34, 43 ary 423 dia nampiseho fitovizana filaharana.Ny fototarazo mitovy amin'ny SAM22 dia mampiseho fampahavitrihana manan-danja izay naharitra ela kokoa, mampiseho ny fitomboan'ny fanoherana anthracnose (83A: 476 sy Boregine).Na izany aza, ny fototarazo mitovy amin'ny MLP dia tsy voafehy afa-tsy amin'ny tsipika mitondra ny allele fanoherana kandidà (83A: 476 / Lanr1 amin'ny 6 hpi ary Mandelup / AnMan amin'ny 24 hpi).Marihina fa ny homologues mitovy amin'ny SAM22 fantatra rehetra dia avy amin'ny vondron'ny fototarazo mirefy 105 kb eo ho eo, fa ny fototarazo mitovy amin'ny MLP dia avy amin'ny faritra misaraka amin'ny génome.Ny fampahavitrihana mifandrindra amin'ny fototarazo mitovy amin'ny SAM22 dia hita ihany koa tamin'ny fandalinana nataontsika teo aloha momba ny fanoherana ny NLL amin'ny fikorianan'ny Diaporthetoxica, izay manoro hevitra fa izy ireo dia tafiditra ao anatin'ny singa marindrano amin'ny valin'ny fiarovana.Ity fehin-kevitra ity dia tohanan'ny tatitra momba ny valinteny tsara amin'ny fototarazo mitovy amin'ny SAM22 amin'ny ratra na fitsaboana amin'ny asidra salicylic, inducers fungal, na peroxyde hydrogène.
Ny fototarazo mitovy amin'ny MLP dia hita fa mamaly ireo adin-tsaina abiotika sy biôtika isan-karazany, ao anatin'izany ny areti-mifindra amin'ny bakteria, viriosy ary pathogen amin'ny karazana zavamaniry maro55.Ny torolalan'ny valin'ny fifandraisana sasany eo amin'ny zavamaniry sy ny otrikaretina dia avy amin'ny fitomboana mafy (izany hoe, nandritra ny fiparitahan'ny landihazo miaraka amin'ny Verticillium dahliae) ka hatramin'ny nihena be (izany hoe, taorian'ny fihanaky ny hazo paoma miaraka amin'ny Alternaria spp.)56,57.Ny fihenan'ny fifehezana lehibe ny fototarazo 423 mitovy amin'ny MLP dia hita nandritra ny fiarovana ny zavoka amin'ny aretina F. niger sy nandritra ny fihanaky ny hazo paoma Botryosphaeria berengeriana f.cn.piricola sy Alternaria alternata dia paoma pathotypes58,59.Fanampin'izany, ny paoma calli izay manetsika ny fototarazo 423 mitovy amin'ny MLP dia manana fanehoana ambany kokoa ny fototarazo mifandraika amin'ny fanoherana ary mora voan'ny aretina fungal59.Taorian'ny Fusarium oxysporum f, ny fototarazo 423 mitovy amin'ny MLP dia nesorina ihany koa tao amin'ny germplasma tsaramaso mahazatra mahatohitra.cn.Infection tsaramaso 60.
Ny mpikambana hafa ao amin'ny fianakaviana PR-10 fantatra amin'ny fandinihanay RNA-seq dia ny fototarazo LlR18A sy LlR18B ho setrin'ny fampitandremana, ary koa ny fototarazo (gen 1) na ambany (3) ho an'ny proteinina famindrana lipid DIR1..Fanampin'izany, ny WGCNA dia manasongadina ny fototarazo LlR18B ho ivon'ity môdely ity, izay tena mora voan'ny vaksiny ary mitondra fototarazo fiarovana maro.Ny fototarazo LlR18A sy LlR18B dia voatarika tamin'ny ravina lupine mavo ho setrin'ny bakteria pathogen, ary koa ao amin'ny NLL stems taorian'ny D. toxica inoculation, raha ny homologue ny vary amin'ireo fototarazo ireo, RSOsPR10, dia voatarika haingana amin'ny otrikaretina fungal izay azo inoana fa tafiditra ao amin'ny asidra jasmonic acid signaling signaling pathway 63, DIR162 lipida. izay takiana amin'ny fanombohana ny fanoherana azo avy amin'ny rafitra (SAR).Miaraka amin'ny fivoaran'ny fanehoan-kevitra miaro, ny proteinina DIR1 dia entina avy amin'ny fifantohan'ny otrikaretina amin'ny alàlan'ny phloem mba hanentanana ny SAR amin'ny taova lavitra.Mahaliana fa ny fototarazo TanjilG_02313 DIR1 dia voatarika be tamin'ny teboka voalohany tamin'ny andalana 84A: 476 sy Population 22660, fa ny fanoherana anthracnose dia nahomby tamin'ny andalana 84A: 476 ihany.Izany dia mety manondro ny subfunctionalization ny DIR1 gene ao amin'ny NLL, satria ny homologues telo sisa dia namaly ny inoculation afa-tsy amin'ny tsipika 83A: 476 amin'ny 6 hpi, ary io valiny io dia nitodika midina.
Ao amin'ny fandinihanay, ny singa mahazatra indrindra mifandraika amin'ny dingana biolojika antsoina hoe "GO: 0055114 Redox process" dia proteinina cytochrome P450, peroxidase, asidra linoleika 9S- / 13S-lipoxygenase, ary 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase.Ho fanampin'izay, ny WGCNAy dia mamaritra ny homologue HSFA4a ho hub mitondra maody toy ny kandidan'ny fototarazo fanoherana Lanr1 TanjilG_05042.Ny HSFA4a dia singa iray amin'ny fifehezana redox miankina amin'ny transcription nokleary amin'ny zavamaniry.
Ny proteinina cytochrome P450 dia oxidoreductases izay manangana ny NADPH sy / na ny fanehoan-kevitry ny hydroxylation miankina amin'ny O2 amin'ny metabolisma voalohany sy faharoa, ao anatin'izany ny metabolism ny xenobiotics, ary koa ny hormones, asidra matavy, sterols, singa rindrin'ny sela, biopolymers, ary ny biosynthesis ny kapoaky ny fiarovana 69. Ao amin'ny fandalinana ny cytochrome amin'ny zavamaniry P40. fiovana mivalona) ho 5.7 noho ny isan'ny homologues novaina (37) sy ny fahasamihafan'ny fomba famaliana eo amin'ny fototarazo manokana, izay maneho ny fanavaozana miakatra..Ny fampiasana angon-drakitra RNA-seq fotsiny mba hanazavana ny fiasan'ny biolojika azo avy amin'ny fototarazo NLL ao amin'ny superfamily proteinina lehibe toy izany dia mety ho tombantombana.Na izany aza, tsara ny manamarika fa ny fototarazo cytochrome P450 sasany dia mifandray amin'ny fitomboan'ny fanoherana ny holatra pathogen na bakteria, anisan'izany ny fandraisana anjara amin'ny fanehoan-kevitra mahazaka69,70,71.
Class III peroxidase dia anzima zava-maniry isan-karazany tafiditra amin'ny fizotry ny metabolika isan-karazany mandritra ny fitomboan'ny zavamaniry sy ny fivoaran'ny zavamaniry, ary koa ho setrin'ny adin-tsaina ara-tontolo iainana toy ny salinity, haintany, hamafin'ny hazavana, ary fanafihana pathogen72.Ny peroxidases dia tafiditra amin'ny fifandraisan'ny karazana zavamaniry maromaro miaraka amin'ny Anthracis, anisan'izany ny Stylosanthes humilis sy C. gloeosporioides, Lens culinaris ary C. truncatum, Phaseolus vulgaris ary C. lindemuthianum, Cucumis sativus ary C. lagenarium73,74,75,76.Ny valiny dia tena haingana, indraindray na dia amin'ny 4 HPI aza, alohan'ny hidiran'ny holatra ao amin'ny vatan'ny zavamaniry73.Ny fototarazo peroxidase koa dia namaly ny fanodikodinana D. toxica NLL.Ho fanampin'ny fiasa mahazatra azy ireo amin'ny fifehezana ny fipoahan'ny oxidative na ny fanafoanana ny adin'ny oxidative, ny peroxidases dia mety hanelingelina ny fitomboan'ny pathogen amin'ny alàlan'ny famoronana sakana ara-batana mifototra amin'ny fanamafisana ny rindrin'ny sela mandritra ny lignification, subunit na fifamatorana amin'ny singa manokana.Ity fiasa ity dia azo lazaina amin'ny silico amin'ny fototarazo TanjilG_03329 mandika ny peroxidase anion-n'ny lignin izay nitombo be tamin'ny fandalinanay tao amin'ny tsipika 83A: 476 amin'ny 6 HPI, fa tsy amin'ny tsipika hafa sy ny fotoana tsy namaly.
9S-/13S-lipoxygenase amin'ny asidra linoleika no dingana voalohany amin'ny lalan'ny oxidative amin'ny biosynthesis lipid78.Ny vokatra amin'ity lalana ity dia manana asa maro amin'ny fiarovana ny zavamaniry, ao anatin'izany ny fanamafisana ny rindrin'ny sela amin'ny alàlan'ny fananganana ny callose sy ny pectin, ary ny fifehezana ny adin-tsaina amin'ny alàlan'ny famokarana karazana oksizenina mihetsika79,80,81,82,83.Ao amin'ny fanadihadiana amin'izao fotoana izao, ny fanehoana ny asidra linoleika 9S-/13S-lipoxygenase dia novaina tamin'ny tebiteby rehetra, fa tamin'ny mponina mora 22660, dia nanjaka tamin'ny fotoana samy hafa ny fihoaram-pefy, raha tamin'ny tebiteby mitondra Lanr1 mahatohitra sy ny AnMan allele, dia manantitrantitra ny fahasamihafana eo amin'ireo sosona fiarovana anthraxlipinx ireo.
Ny homologue 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase (ACO) dia nitombo be (9 fototarazo) na nihena (2 fototarazo) rehefa voaroaka tamin'ny lupine.Miaraka amin'ny maningana roa, ireo valinteny rehetra ireo dia nitranga tamin'ny 6 hp.ny 83a:476.Ny fihetsiketsehan'ny enzymatic mpanelanelana amin'ny proteinina ACO no dingana mametra ny tahan'ny famokarana ethylene ary noho izany dia voafehy tsara84.Ethylene dia hormonina zavamaniry izay mitana andraikitra isan-karazany amin'ny fandrindrana ny fivoaran'ny zavamaniry sy ny valin'ny toe-javatra abiotika sy biotika.Ny fampidirana ny transcription ACO sy ny fampahavitrihana ny lalana famantarana ny ethylene dia tafiditra amin'ny fampitomboana ny fanoherana ny vary amin'ny holatra hemibiotrophic oryzae oryzae amin'ny alàlan'ny fifehezana ny famokarana karazana oksizenina mihetsika sy phytoalexins.Ny fizotry ny fihanaky ny ravina mitovy amin'ny hita eo amin'ny M. oryzae sy C. lupini88,89, manoloana ny fiakarana lehibe amin'ny homologues ACO ao amin'ny tsipika 83A: 476 notaterina tamin'ity fanadihadiana ity, dia manova ny mety hisian'ny fanoherana ny NLL anthracnose Ethylene ho dingana afovoany famantarana amin'ny lalan'ny molekiola.
Ao amin'ny fanadihadiana amin'izao fotoana izao, ny famoretana lehibe amin'ny fotosynthesis dia hita ao amin'ny 6 hpi amin'ny 83A: 476 ary amin'ny 48 hpi ao Mandeloop sy ny mponina 22660.Ny halehibe sy ny fivoaran'ireo fiovana ireo dia mifanaraka amin'ny ambaratonga.Ny fanoherana anthracnose dia voamarika tamin'ity fanandramana ity.Vao haingana, ny famoretana mahery vaika sy aloha ny transcript mifandraika amin'ny photosynthesis dia notaterina tamin'ny modely maro amin'ny fifandraisan'ny zavamaniry-pathogen, ao anatin'izany ny bakteria pathogen sy ny holatra.Ny haingana (avy amin'ny 2 HPI amin'ny fifandraisana sasany) sy ny fanafoanana manerantany ny fotosynthesis ho setrin'ny otrikaretina dia mety hitarika ny tsy fahampian'ny zavamaniry mifototra amin'ny fametrahana karazana oksizenina mihetsika sy ny fifandraisany amin'ny lalan'ny asidra salicylic hanelanelana ny fanehoan-kevitra mahazaka 90,94.
Ho fehin-kevitra, ny mekanika valin'ny fiarovan-tena natolotra ho an'ny taranaka mahatohitra indrindra (83A: 476) dia ahitana ny fanekena ny pathogen haingana avy amin'ny fototarazo R (azo inoana fa TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) sy ny asidra salicylic sy ny famantarana ethylene, arahin'ny fananganana SAR lavitra.Ny hetsika dia tohanan'ny proteinina DIR-1.Marihina fa fohy dia fohy (eo ho eo amin'ny 2 andro) ny fe-potoana biotrophique amin'ny otrikaretina C. lupini, arahin'ny fitomboan'ny necrotic95.Ny fifindrana eo amin'ireo dingana ireo dia mety ho mifandray amin'ny necrosis sy ny fanehoana ny ethylene-inducible proteinina izay miasa ho toy ny trigger ny hypersensitivity fanehoan-kevitra ao amin'ny zavamaniry mpampiantrano.Noho izany, ny varavarankelin'ny fotoana hahazoana fahombiazana ny C. lupini amin'ny dingana biotrophic dia tena tery.Ny fandrindrana ny fototarazo mifandraika amin'ny redox sy ny photosynthesis hita ao amin'ny 83A: 476 amin'ny 6 hpi dia mifanaraka amin'ny fivoaran'ny hyphae holatra ary manambara ny fivoaran'ny valin'ny fiarovana mahomby amin'ny dingana biotrophic.Ny valintenin'ny transcriptomic an'i Mandelup sy ny mponina 22660 dia mety ho tara loatra mba hisambotra ny holatra alohan'ny hidirana amin'ny fitomboan'ny necrotic, na izany aza, i Mandelup dia mety hahomby kokoa noho ny mponina 22660 satria ny fifehezana haingana ny proteinina PR-10 dia mampiroborobo ny fanoherana horizontaly.
Ny ETI, entin'ny fototarazo R kanonika, dia toa fomba fanao mahazatra amin'ny fanoherana ny anthracnose.Noho izany, ao amin'ny modely legume Medicago truncatula, ny fanoherana ny anthracnose dia omen'ny RCT1 gene, mpikambana ao amin'ny TIR-NBS-LRR97 plant R gene class.Ity fototarazo ity koa dia manome fanoherana anthracnose midadasika amin'ny alfalfa rehefa afindra any amin'ny zavamaniry mora voan'ny aretina.Ao amin'ny tsaramaso mahazatra (P. vulgaris), maherin'ny roapolo ny fototarazo fanoherana anthracnose no fantatra hatramin'izao.Ny sasany amin'ireo fototarazo ireo dia hita any amin'ny faritra tsy misy fototarazo R kanônika, fa ny hafa kosa dia hita eo amin'ny sisin'ny krômôzôma mitondra ny krômôzôma NBS-LRR, anisan'izany ny TIR-NBS-LRRs99.Ny fandalinana SSR amin'ny genome dia nanamafy ihany koa ny fikambanan'ny fototarazo NBS-LRR miaraka amin'ny fanoherana anthracnose amin'ny tsaramaso mahazatra.Ny fototarazo R kanônika koa dia hita tao amin'ny faritra génomika mitondra ny toerana lehibe fanoherana anthracnose ao amin'ny lupine fotsy 101.
Ny asantsika dia mampiseho fa ny fanehoan-kevitra fanoherana eo no ho eo, mavitrika amin'ny dingana voalohany amin'ny otrikaretina zavamaniry (indrindra raha tsy mihoatra ny 12 hpi), dia miaro amin'ny fomba mahomby ny lupine misy ravina tery amin'ny anthracnose vokatry ny holatra pathogen Collelotrichum lupini.Amin'ny fampiasana filaharana avo lenta, dia nasehonay ny mombamomba ny fanehoan-kevitra samihafa momba ny fototarazo fanoherana anthracnose ao amin'ny zavamaniry NLL nanelanelana ny fototarazo fanoherana Lanr1 sy AnMan.Ny fiarovana mahomby dia ny famolavolana tsara ny fototarazo ho an'ny proteinina tafiditra amin'ny redox, ny photosynthesis ary ny pathogenesis ao anatin'ny ora maro aorian'ny fifandraisan'ny zavamaniry amin'ny pathogen.Ny fanehoan-kevitra fiarovana mitovy, saingy tara amin'ny fotoana, dia tsy dia mahomby loatra amin'ny fiarovana ny zavamaniry amin'ny aretina.Ny fanoherana anthrax ateraky ny fototarazo Lanr1 dia mitovy amin'ny valiny haingana mahazatra amin'ny fototarazo R (tsy fahampiana vokatry ny effector), raha toa kosa ny fototarazon'ny AnMan dia manome valiny marindrano (tsy fahampiana ateraky ny molekiola mifandray amin'ny mikraoba), manome ny haavon'ny faharetana.
Ny tsipika 215 NLL nampiasaina tamin'ny fitiliana ireo marika anthracnose dia nahitana karazana 74, tsipika 60 azo tamin'ny fiampitana na fiompiana, mutant 5, ary 76 germplasms bibidia na tany am-boalohany.Avy amin'ny firenena 17 ny andalana, indrindra avy any Polonina (58), Espaina (47), Alemana (27), Aostralia (26), Rosia (19), Belarosia (7), Italia (5) ary andalana hafa.avy amin'ny firenena 10.Ahitana tsipika mahatohitra reference ihany koa ilay set: 83A: 476, Tanjil, Wonga mitondra ny Allele Lanr1, ary Mandelup mitondra ny Allele AnMan.Ny andalana dia azo avy amin'ny European Lupine Genetic Resource Database nokarakarain'ny Poznań Plant Breeding Ltd., Wiatrowo, Polonina (Tabilao fanampiny S1).
Ny zavamaniry dia nambolena tao anatin'ny fepetra voafehy (photoperiod 16 ora, hafanana 25 ° C mandritra ny andro ary 18 ° C amin'ny alina).Replika biolojika roa no nodinihina.Ny ADN dia natokana tamin'ny ravina telo herinandro tamin'ny fampiasana ny DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany) araka ny protocol.Ny kalitao sy ny fifantohana amin'ny ADN mitoka-monina dia nodinihina tamin'ny fomba spectrophotometric (NanoDrop 2000; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, Etazonia).Ny marika AnManM1 manamarika ny fototarazo fanoherana anthracnose AnMan (nalaina avy amin'ny cv. Mandelup) ary ny marika Anseq3 sy Anseq4 manamorona ny fototarazo Lanr1 (nalaina avy amin'ny cv. Tanjil) dia nodinihina 11,26,28.Ny homozygote ho an'ny allele mahatohitra dia nomena isa ho "1", mora - ho "0", ary heterozygotes - ho 0.5.
Miorina amin'ny valin'ny fitiliana ny marika AnManM1, AnSeq3 ary AnSeq4 ary ny fisian'ny masomboly ho an'ny fanandramana fanaraha-maso farany, tsipika 50 NLL no nofantenana ho an'ny phenotyping fanoherana anthracnose.Ny famakafakana dia natao tamin'ny dika mitovy tao amin'ny trano fonenana fehezin'ny ordinatera miaraka amin'ny photoperiod 14 ora miaraka amin'ny mari-pana 22 ° C mandritra ny andro ary 19 ° C amin'ny alina.Voasokajy ny masomboly (manapaka ny akanjon'ny voa eo amin'ny ilany mifanohitra amin'ny embryon amin'ny lelany maranitra) alohan'ny famafazana mba hisorohana ny fandrian'ny voa noho ny akanjon'ny voa mafy loatra ary hiantohana ny fitsimohany mitovy.Ny zavamaniry dia nambolena tao anaty vilany (11 × 11 × 21 cm) miaraka amin'ny tany sterile (TS-1 REC 085 Medium Basic, Klasmann-Deilmann Polska, Warsaw, Polonina).Ny inoculation dia natao tamin'ny Colletotrichum lupini Col-08 strain, nitombo tamin'ny 1999 avy amin'ny tahon'ny zavamaniry lupine tery raviny nambolena tao amin'ny saha Verzhenitsa, Polonina Lehibe (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E ).Makà faritra iray.Ny mitoka-monina dia nokolokoloina tao amin'ny media SNA amin'ny 20 ° C. eo ambanin'ny hazavana mainty mandritra ny 21 andro mba hamporisihana ny sporulation.Herinandro efatra taorian'ny famafazana, rehefa tonga amin'ny dingana 4-6 ny zavamaniry, dia natao ny inoculation tamin'ny alàlan'ny famafazana amin'ny fampiatoana ny conidia amin'ny fifantohana 0,5 x 106 conidia isaky ny ml.Aorian'ny famafazana dia tazonina ao anaty haizina mandritra ny 24 ora ny zavamaniry amin'ny hamandoana 98% eo ho eo ary ny mari-pana 25 ° C mba hanamora ny fitsimohany ny conidia sy ny fizotry ny aretina.Ny zavamaniry dia nambolena tao anatin'ny 14 ora photoperiod amin'ny 22 ° C andro / 19 ° C alina ary 70% ny hamandoana.Ny isan'ny aretina dia natao 22 andro taorian'ny inoculation ary manomboka amin'ny 0 (immune) ka hatramin'ny 9 (tena mora voan'ny aretina) miankina amin'ny fisiana na tsy fisian'ny ratra necrotic amin'ny taho sy ny ravina.Ankoatra izany, taorian'ny naoty dia norefesina ny lanjan'ny zavamaniry.Ny fifandraisana misy eo amin'ny genotypes marika sy ny phenotypes aretina dia nokajiana ho toy ny teboka roa-sequence correlations (tsy fisian'ny heterozygous marika ao amin'ny andian-tsipika ho an'ny fanadihadiana ny anthracnose fanoherana phenotype).