സ്തനാർബുദത്തിലെ BRCA1/BRCA2 ജീനുകളുടെ മ്യൂട്ടേഷൻ വിശകലനം

നിലവിൽ നിങ്ങളുടെ ബ്രൗസറിൽ Javascript പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കിയിരിക്കുന്നു. javascript പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുമ്പോൾ ഈ വെബ്‌സൈറ്റിന്റെ ചില സവിശേഷതകൾ പ്രവർത്തിക്കില്ല.
നിങ്ങളുടെ നിർദ്ദിഷ്ട വിശദാംശങ്ങളും താൽപ്പര്യമുള്ള നിർദ്ദിഷ്ട മരുന്നും ഉപയോഗിച്ച് രജിസ്റ്റർ ചെയ്യുക, ഞങ്ങളുടെ വിപുലമായ ഡാറ്റാബേസിലെ ലേഖനങ്ങൾക്കൊപ്പം നിങ്ങൾ നൽകുന്ന വിവരങ്ങളുമായി ഞങ്ങൾ പൊരുത്തപ്പെടുത്തുകയും ഉടൻ തന്നെ നിങ്ങൾക്ക് ഒരു PDF പകർപ്പ് ഇമെയിൽ ചെയ്യുകയും ചെയ്യും.
作者 സ്റ്റെല്ല എസ്, വിറ്റേൽ എസ്ആർ, മാർട്ടോറാന എഫ്, മാസിമിനോ എം, പാവോൺ ജി, ലാൻസഫേം കെ, ബിയാൻക എസ്, ബാരോൺ സി, ഗോർഗോൺ സി, ഫിഷെറ എം, മാൻസെല്ല എൽ
സ്റ്റെഫാനിയ സ്റ്റെല്ല, 1,2 സിൽവിയ റീറ്റ വിറ്റേൽ, 1,2 ഫെഡറിക്ക മാർട്ടോറാന, 1,2 മിഷേൽ മാസിമിനോ, 1,2 ജിയുലിയാന പാവോൺ, 3 കാറ്റിയ ലാൻസഫേം, 3 സെബാസ്റ്റ്യാനോ ബിയാങ്ക, 4 ചിയാര ബറോൺ, 5 ക്രിസ്റ്റീന ഗോർഗോൺ ഡിപ്പാർട്ട്‌മെന്റ്, ലിഷെറ 1, ഫിഷെറ 6, 76 ical ആൻഡ് എക്സ്പിരിമെന്റൽ മെഡിസിൻ, കാറ്റാനിയ യൂണിവേഴ്സിറ്റി, കാറ്റാനിയ, 95123, ഇറ്റലി;2 എക്സ്പിരിമെന്റൽ ഓങ്കോളജി ആൻഡ് ഹെമറ്റോളജി സെന്റർ, AOU പോളിക്ലിനിക്കോ "G.Rodolico - San Marco", Catania , 95123, ഇറ്റലി;3 മെഡിക്കൽ ഓങ്കോളജി, AOU പോളിക്ലിനിക്കോ "ജി.റോഡോലിക്കോ - സാൻ മാർക്കോ", കാറ്റാനിയ, 95123, ഇറ്റലി;4 മെഡിക്കൽ ജനറ്റിക്സ്, ARNAS ഗരിബാൾഡി, കാറ്റാനിയ, 95123, ഇറ്റലി;5 മെഡിസിൻ ജനറ്റിക്സ്, എഎസ്പി, സിറാക്കൂസ്, 96100, ഇറ്റലി;6 ഡിപ്പാർട്ട്മെന്റ് ഓഫ് ബയോമെഡിക്കൽ ആൻഡ് ബയോടെക്നോളജി സയൻസസ്, കാറ്റാനിയ യൂണിവേഴ്സിറ്റി, മെഡിക്കൽ ജനറ്റിക്സ്, കാറ്റാനിയ, ഇറ്റലി, 95123;7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Italy Communications: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, ഇമെയിൽ [ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിതം];ഉദ്ദേശ്യം: BRCA1, BRCA2 എന്നിവയിലെ ജെർംലൈൻ മ്യൂട്ടേഷനുകളും സ്തനാർബുദവും (BC), അണ്ഡാശയവും (OC) ആജീവനാന്ത അർബുദ സാധ്യതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട മറ്റുള്ളവയും. BRCA ജീനിനായുള്ള പരിശോധന വ്യക്തിഗത അപകടസാധ്യത വിലയിരുത്തുന്നതിനും അതുപോലെ തന്നെ ആരോഗ്യമുള്ള കാരിയറുകളിൽ പ്രതിരോധ മാർഗ്ഗങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നതിനും കാൻസർ രോഗികളുടെ വ്യാപകമായ ചികിത്സകൾക്കും BRCA 2. s, കൂടാതെ സിസിലിയൻ കുടുംബങ്ങളിലെ BRCA രോഗകാരി വകഭേദങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള ഡാറ്റ നിലവിലുണ്ടെങ്കിലും, കിഴക്കൻ സിസിലിയിലെ ജനസംഖ്യയെ പ്രത്യേകമായി ലക്ഷ്യമിടുന്ന പഠനങ്ങൾ കുറവാണ്. കിഴക്കൻ സിസിലിയിൽ നിന്നുള്ള ബിസി രോഗികളുടെ കൂട്ടത്തിൽ BRCA രോഗകാരിയായ ജെർംലൈൻ വ്യതിയാനങ്ങളുടെ സംഭവങ്ങളും വിതരണവും അന്വേഷിക്കുക എന്നതായിരുന്നു ഞങ്ങളുടെ പഠനത്തിന്റെ ലക്ഷ്യം. ട്യൂമർ ഗ്രേഡും വ്യാപന സൂചികയും. ഫലങ്ങൾ: മൊത്തത്തിൽ, 35 രോഗികൾക്ക് (9%) BRCA രോഗകാരി വേരിയന്റും, BRCA1-ൽ 17 (49%) BRCA2-ലും 18 (51%) BRCA2. BRCA1 മാറ്റങ്ങളും ട്രിപ്പിൾ-നെഗറ്റീവ് BC രോഗികളിൽ കൂടുതലാണ്. BRCA1 വേരിയന്റുകളിൽ ട്യൂമർ ഗ്രേഡും പ്രോലിഫെറേറ്റീവ് ഇൻഡക്സും ഗണ്യമായി ഉയർന്നു.
സ്തനാർബുദമാണ് (ബിസി) ലോകമെമ്പാടുമുള്ള ഏറ്റവും സാധാരണമായ മാരകമായ അർബുദവും സ്ത്രീകളിലെ ഏറ്റവും മാരകമായ അർബുദവുമാണ്. 1 ബിസി രോഗനിർണയവും ക്ലിനിക്കൽ സ്വഭാവവും നിർണ്ണയിക്കുന്ന ജീവശാസ്ത്രപരമായ സവിശേഷതകൾ കാലക്രമേണ വിശദമായി പഠിക്കുകയും ഭാഗികമായി വ്യക്തമാക്കുകയും ചെയ്തിട്ടുണ്ട്. വാസ്തവത്തിൽ, ബിസിയെ വ്യത്യസ്ത തന്മാത്രാ ഉപവിഭാഗങ്ങളായി തരംതിരിക്കുന്നതിന് നിലവിൽ നിരവധി സറോഗേറ്റ് മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു. റിസപ്റ്റർ 2 (HER2) ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ, പ്രൊലിഫെറേഷൻ ഇൻഡക്സ് Ki-67, ട്യൂമർ ഗ്രേഡ് (G).2 ഈ വേരിയബിളുകളുടെ സംയോജനം ഇനിപ്പറയുന്ന ബിസി വിഭാഗങ്ങളെ തിരിച്ചറിഞ്ഞു: 1) ER കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ PgR എക്സ്പ്രഷൻ കാണിക്കുന്ന ലുമിനൽ ട്യൂമറുകൾ, 75% ബിസികളിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു. 67 20% ന് തുല്യമോ അതിൽ കൂടുതലോ ആയിരുന്നു, കൂടാതെ പ്രൊലിഫെറേഷൻ സൂചിക പരിഗണിക്കാതെ തന്നെ HER2 ആംപ്ലിഫിക്കേഷന്റെ സാന്നിധ്യത്തിൽ;2) ER, PgR നെഗറ്റീവ് ആണെങ്കിലും HER2 ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ കാണിക്കുന്ന HER2+ മുഴകൾ. എല്ലാ ബ്രെസ്റ്റ് ട്യൂമറുകളുടെയും 10% ഈ ഗ്രൂപ്പാണ്;3) ER, PgR എക്സ്പ്രഷനും HER2 ആംപ്ലിഫിക്കേഷനും കാണിക്കാത്ത ട്രിപ്പിൾ-നെഗറ്റീവ് ബ്രെസ്റ്റ് ക്യാൻസർ (TNBC), ഏകദേശം 15% സ്തനാർബുദത്തിന് കാരണമാകുന്നു.2-4
ഈ ബിസി ഉപവിഭാഗങ്ങളിൽ, ട്യൂമർ ഗ്രേഡും പ്രൊലിഫെറേഷൻ ഇൻഡക്സും ട്യൂമർ ആക്രമണാത്മകതയും രോഗനിർണയവുമായി നേരിട്ടും സ്വതന്ത്രമായും ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ക്രോസ്-സെക്ഷണൽ ബയോ മാർക്കറുകളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു.5,6
മേൽപ്പറഞ്ഞ ജീവശാസ്ത്രപരമായ സവിശേഷതകൾക്ക് പുറമേ, ബിസിയുടെ വികാസത്തിലേക്ക് നയിക്കുന്ന പാരമ്പര്യ ജനിതക വ്യതിയാനങ്ങളുടെ പങ്ക് കഴിഞ്ഞ കുറച്ച് വർഷങ്ങളായി വർദ്ധിച്ചുവരികയാണ്. BRCA1, BRCA2, CHK2, PALB2, RAD51C, RAD51D എന്നിവ പ്രാഥമികമായി പാരമ്പര്യ ബിസിക്ക് ഉത്തരവാദികളാണ്. ഈ ജീനുകളിൽ, BRCA1, BRCA2 (ഇനിമുതൽ BRCA1/2 എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്നു) എന്നിവ BRCA1/2 എന്ന പേരിൽ ഏറ്റവും ശക്തമായ പരസ്പരബന്ധം കാണിക്കുന്നു. ബിസിയുടെയും അണ്ഡാശയം, പ്രോസ്റ്റേറ്റ്, പാൻക്രിയാറ്റിക്, കൊളോറെക്റ്റൽ, മെലനോമ എന്നിവയുൾപ്പെടെയുള്ള മറ്റ് മാരകമായ അപകടസാധ്യതകൾ. 13 മുതൽ 80 വയസ്സ് വരെ, ബിആർസിഎ1 രോഗകാരിയായ (പിവി) സ്ത്രീകളിൽ ബിസിയുടെ സഞ്ചിത സംഭവങ്ങൾ 72% ആണ്.
ശ്രദ്ധേയമായി, ഒരു സമീപകാല പ്രസിദ്ധീകരണം സൂചിപ്പിക്കുന്നത്, BC അപകടസാധ്യത PV യുടെ തരത്തെ ആശ്രയിച്ചിരിക്കുന്നു. വാസ്തവത്തിൽ, രോഗകാരിയായ വെട്ടിച്ചുരുക്കൽ വകഭേദങ്ങളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, തിളങ്ങുന്ന മിസ്സെൻസ് വകഭേദങ്ങൾ, പ്രത്യേകിച്ച് BRCA1 ജീനിൽ, BC യുടെ അപകടസാധ്യത കുറയുന്നതുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, പ്രത്യേകിച്ച് പ്രായമായ സ്ത്രീകളിൽ.15
BRCA1 അല്ലെങ്കിൽ BRCA2 PV യുടെ സാന്നിധ്യം വ്യത്യസ്ത ജീവശാസ്ത്രപരവും ക്ലിനിക്കൽ പാത്തോളജിക്കൽ സവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.16,17 BRCA1-അനുബന്ധ ബിസികൾ ക്ലിനിക്കലി ആക്രമണാത്മകവും മോശമായി വ്യത്യാസപ്പെട്ടിരിക്കുന്നതും ഉയർന്ന തോതിൽ വ്യാപിക്കുന്നതുമാണ്. ഈ മുഴകൾ സാധാരണയായി ട്രിപ്പിൾ നെഗറ്റീവ് ആണ്, കൂടാതെ BRCA2 ആരംഭിക്കുന്ന പ്രായത്തിന്റെ ചെറുപ്രായത്തിലുമാണ് സാധാരണഗതിയിൽ സംഭവിക്കുന്നത്. ഗ്രേഡുകളും വേരിയബിൾ പ്രൊലിഫെറേറ്റീവ് സൂചികകളും. ഈ മുഴകൾ ല്യൂമെൻ ബിയിൽ കൂടുതലായി കാണപ്പെടുന്നു, സാധാരണയായി പ്രായമായവരിലാണ് ഇത് സംഭവിക്കുന്നത്. 16-18 ശ്രദ്ധേയമായി, BRCA1, BRCA2 എന്നിവയിലെ മ്യൂട്ടേഷനുകൾ പ്ലാറ്റിനം ലവണങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെയുള്ള നിർദ്ദിഷ്ട ചികിത്സകളോട് സംവേദനക്ഷമത വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു, പോളി(എഡിപി-റൈബോസ്) പോളിമറേസ് ഇൻഹിബിറ്ററുകൾ (എഡിപി-റൈബോസ്, പിഎ2ആർപി ഇൻഹിബിറ്ററുകൾ190).
കഴിഞ്ഞ കുറച്ച് വർഷങ്ങളായി, ക്ലിനിക്കൽ പ്രാക്ടീസിൽ അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (NGS) നടപ്പിലാക്കുന്നത്, BRCA1/2.21 ഉൾപ്പെടെയുള്ള കാൻസർ സാധ്യത സിൻഡ്രോമുകൾക്കുള്ള തന്മാത്രാ പരിശോധനയ്ക്ക് വിധേയരാകാൻ വർദ്ധിച്ചുവരുന്ന BC രോഗികളെ പ്രാപ്തരാക്കുന്നു. ഈ സാഹചര്യത്തിൽ, പ്രത്യേക ജനസംഖ്യയിൽ BRCA1/2 സ്ക്രീനിംഗിൽ തെളിവുകൾ ശേഖരിക്കപ്പെടുന്നു, ഭൂമിശാസ്ത്രപരമായ പ്രദേശങ്ങളിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. 24–27 പടിഞ്ഞാറൻ സിസിലിയിലെ ബിസി കോഹോർട്ടിനെക്കുറിച്ച് റിപ്പോർട്ടുകൾ ഉണ്ടെങ്കിലും, കിഴക്കൻ സിസിലി ജനസംഖ്യയിൽ BRCA1/2 സ്ക്രീനിംഗിൽ കുറച്ച് ഡാറ്റ മാത്രമേ ലഭ്യമാകൂ.28,29
കിഴക്കൻ സിസിലിയിൽ നിന്നുള്ള ബിസി രോഗികളിൽ ജെംലൈൻ BRCA1/2 സ്ക്രീനിംഗിന്റെ ഫലങ്ങൾ ഞങ്ങൾ ഇവിടെ വിവരിക്കുന്നു, BRCA1 അല്ലെങ്കിൽ BRCA2 മ്യൂട്ടേഷനുകളുടെ സാന്നിധ്യവും ഈ ട്യൂമറുകളുടെ പ്രധാന ക്ലിനിക്കോപാത്തോളജിക്കൽ സവിശേഷതകളുമായി കൂടുതൽ പരസ്പരബന്ധം പുലർത്തുന്നു.
പോളിക്ലിനിക്കോ ഹോസ്പിറ്റലിലെ "സെന്റർ ഫോർ എക്സ്പിരിമെന്റൽ ഓങ്കോളജി ആൻഡ് ഹെമറ്റോളജിയിൽ" ഒരു മുൻകാല പഠനം നടത്തി. റോഡോലിക്കോ - സാൻ മാർക്കോ കാറ്റാനിയയിൽ. 2017 ജനുവരി മുതൽ 2021 മാർച്ച് വരെ ആകെ 455 രോഗികളിൽ ബ്രെസ്റ്റ്, അണ്ഡാശയം, മെലനോമ, പാൻക്രിയാറ്റിക് അല്ലെങ്കിൽ പ്രോസ്റ്റേറ്റ് ക്യാൻസർ എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ഹെൽസിങ്കിയുടെ പ്രഖ്യാപനത്തിന് അനുസൃതമായി പഠനം നടത്തി, പങ്കെടുത്തവരെല്ലാം തന്മാത്രാ വിശകലനത്തിന് മുമ്പ് രേഖാമൂലമുള്ള സമ്മതം നൽകി.
BC യുടെ ഹിസ്റ്റോളജിക്കൽ, ബയോളജിക്കൽ സ്വഭാവസവിശേഷതകൾ (ER, PgR, HER2 സ്റ്റാറ്റസ്, കി-67, ഗ്രേഡ്) കോർ ബയോപ്സി അല്ലെങ്കിൽ ശസ്ത്രക്രിയാ സാമ്പിളുകളിൽ വിലയിരുത്തി, ആക്രമണാത്മക ട്യൂമർ ഘടകങ്ങൾ മാത്രം പരിഗണിച്ച്. ഈ സ്വഭാവസവിശേഷതകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, BC-കളെ ഇനിപ്പറയുന്ന രീതിയിൽ തരംതിരിച്ചിട്ടുണ്ട്: luminal A (ER+ കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ PgR+%), PgR+%, അല്ലെങ്കിൽ PgR+%, ER2-, Ki-67≥20%), luminal B-HER2+ (ER കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ PgR+, HER2+), HER2+ (ER, PgR-, HER2+) അല്ലെങ്കിൽ ട്രിപ്പിൾ നെഗറ്റീവ് (ER, PgR-, HER2-).
BRCA1, BRCA2 മ്യൂട്ടേഷൻ നില വിലയിരുത്തുന്നതിന് മുമ്പ്, ഒരു ഓങ്കോളജിസ്റ്റ്, ഒരു ജനിതകശാസ്ത്രജ്ഞൻ, ഒരു മനഃശാസ്ത്രജ്ഞൻ എന്നിവരടങ്ങുന്ന ഒരു മൾട്ടി ഡിസിപ്ലിനറി ടീം BRCA1 കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ BRCA1 ന്റെ സാന്നിധ്യം നിർണ്ണയിക്കാൻ ഓരോ രോഗിക്കും ട്യൂമർ ജനിതകശാസ്ത്ര കൺസൾട്ടേഷൻ നടത്തി.അല്ലെങ്കിൽ ബിആർസിഎ2 ജീനിൽ പിവിയുടെ ഉയർന്ന അപകടസാധ്യതയുള്ള വ്യക്തികൾ. ഇറ്റാലിയൻ സൊസൈറ്റി ഓഫ് മെഡിക്കൽ ഓങ്കോളജി (എഐഒഎം) മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശങ്ങളും പ്രാദേശിക സിസിലിയൻ ശുപാർശകളും അനുസരിച്ചാണ് രോഗികളുടെ തിരഞ്ഞെടുപ്പ് നടത്തിയത്.(ii) ബിസി ഉള്ള പുരുഷന്മാർ;(iii) ബിസിയും ഒസിയും ഉള്ളവർ;(iv) BC <36 വയസ്സ്, TNBC <60 വയസ്സ് അല്ലെങ്കിൽ ഉഭയകക്ഷി BC <50 വയസ്സ് ഉള്ള സ്ത്രീകൾ;(v) ബിസി <50 വർഷവും കുറഞ്ഞത് ഒരു ഫസ്റ്റ്-ഡിഗ്രി ബന്ധുവും: (എ) ബിസി <50 വർഷം;(ബി) ഏത് പ്രായത്തിലുമുള്ള നോൺ-മ്യൂസിനസ്, നോൺ-ബോർഡർലൈൻ OC;(സി) ഉഭയകക്ഷി ബിസി;(ഡി) പുരുഷ ബിസി;(ഇ) പാൻക്രിയാറ്റിക് ക്യാൻസർ;(എഫ്) പ്രോസ്റ്റേറ്റ് കാൻസർ;(vi) പരസ്പരം ഫസ്റ്റ്-ഡിഗ്രി ബന്ധുക്കളായ ബന്ധുക്കൾക്ക് (അവൾ ഫസ്റ്റ്-ഡിഗ്രി ബന്ധുക്കളായ ബന്ധുക്കൾ ഉൾപ്പെടെ) ബിസി> 50 വർഷത്തെ രണ്ടോ അതിലധികമോ വ്യക്തിഗത ചരിത്രവും ബിസി, ഒസി, അല്ലെങ്കിൽ പാൻക്രിയാറ്റിക് ക്യാൻസർ എന്നിവയുടെ കുടുംബ ചരിത്രവും;(vii) ഒസിയുടെ വ്യക്തിഗത ചരിത്രവും കുറഞ്ഞത് ഒരു ഫസ്റ്റ്-ഡിഗ്രി ബന്ധുവെങ്കിലും: (എ) ബിസി <50 വർഷം;(ബി) എൻഒസി;(സി) ഉഭയകക്ഷി ബിസി;(ഡി) പുരുഷ ബിസി;(vii) ഉയർന്ന ഗ്രേഡ് സീറസ് OC ഉള്ള സ്ത്രീ.
ഓരോ രോഗിയിൽ നിന്നും 20 മില്ലി പെരിഫറൽ രക്ത സാമ്പിൾ എടുത്ത് EDTA ട്യൂബുകളിലേക്ക് (BD Biosciences) ശേഖരിച്ചു. QIAsymphony DSP DNA Midi kit Isolation Kit (QIAGEN, Hilden, Italy) ഉപയോഗിച്ച് 0.7 mL മുഴുവൻ രക്ത സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നും ജനിതക ഡിഎൻഎ വേർതിരിച്ചെടുത്തു (QIAGEN, Hilden, Italy). entific, Waltham, MA, USA) ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷൻ നടത്തുക.നിർമ്മാതാവിന്റെ നിർദ്ദേശങ്ങൾ അനുസരിച്ച് ഓട്ടോമേറ്റഡ് ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കുന്നതിനായി Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 കിറ്റിലേക്ക് ലോഡ് ചെയ്യാൻ തയ്യാറായ Oncomine™ BRCA റിസർച്ച് അസ്സെ ഷെഫാണ് ടാർഗെറ്റ് സമ്പുഷ്ടീകരണവും ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കലും നടത്തുന്നത്. കിറ്റിൽ രണ്ട് മൾട്ടിപ്ലക്സ് PCR പ്രൈമർ പൂളുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. (NM_000059.3) ജീനുകൾ.ചുരുക്കത്തിൽ, ഓരോ നേർപ്പിച്ച സാമ്പിൾ ഡിഎൻഎയുടെയും 15 µL (10 ng) ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കുന്നതിനായി ബാർകോഡ് പ്ലേറ്റുകളിലേക്ക് ചേർത്തു, കൂടാതെ എല്ലാ റിയാക്ടറുകളും ഉപഭോഗവസ്തുക്കളും അയൺ ഷെഫ്™ ഉപകരണത്തിൽ കയറ്റി. പിന്നീട് ലിബ്രറിയുടെ സ്വയം തയ്യാറാക്കിയ ലൈബ്രറിയുടെ ബാർകോഡിംഗ് സാമ്പിൾ നമ്പർ ലൈബ്രറിയിൽ തയ്യാറാക്കി. ഒരു Qubit® 3.0 Fluorometer (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA) വഴി വിലയിരുത്തി ഇഷർ സയന്റിഫിക്) ഉപകരണം (തെർമോ ഫിഷർ സയന്റിഫിക്) ഒരു അയോൺ 510 ചിപ്പ് (തെർമോ ഫിഷർ സയന്റിഫിക്) ഉപയോഗിച്ചു. ആംപ്ലിക്കൺ സ്യൂട്ടും (സ്മാർട്ട് സെക് എസ്ആർഎൽ) അയോൺ റിപ്പോർട്ടർ സോഫ്റ്റ്‌വെയറും ചേർന്നാണ് ഡാറ്റ വിശകലനം നടത്തിയത്.
ഹ്യൂമൻ ജീനോം വേരിയേഷൻ കൺസോർഷ്യത്തിന്റെ നിലവിലെ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശങ്ങൾ എല്ലാ വേരിയന്റ് നാമകരണവും പിന്തുടരുന്നു, ഓൺലൈനിൽ ലഭ്യമാണ് (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen).BRCA1/2 വേരിയന്റുകളുടെ ക്ലിനിക്കൽ പ്രാധാന്യം നിർവചിച്ചത് ഇന്റർനാഷണൽ കൺസോർഷ്യം ഇന്റർനാഷണൽ കൺസോർഷ്യം ENIGMA (Evidence-Bastedlines ന്റെ ഇന്റർനാഷണൽ കൺസോർഷ്യം ഇന്റർനാഷണൽ കൺസോർഷ്യം ENIGMA, എവിഡൻസ്-Bastedlines) വർഗ്ഗീകരണം ഉപയോഗിച്ചാണ്. ortium.org/) കൂടാതെ ARUP, BRCAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD, UMD എന്നിങ്ങനെയുള്ള വിവിധ ഡാറ്റാബേസുകൾ കൺസൾട്ടിംഗ് ചെയ്യുന്നു. ഈ വർഗ്ഗീകരണത്തിൽ അഞ്ച് വ്യത്യസ്ത അപകട വിഭാഗങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്നു: ബെനിൻ (കാറ്റഗറി I), സാധ്യതയുള്ള ബെനിൻ (വിഭാഗം II), അനിശ്ചിത പ്രാധാന്യത്തിന്റെ വകഭേദം (VUS, പാത്തജനിക് വിഭാഗം), (VUS, സാധ്യത III). 30 ഡാറ്റാബേസുകളിലേക്കുള്ള പ്രവേശനമുള്ള ഒരു വിജ്ഞാനപ്രദമായ ഉപകരണമായ പ്രോട്ടീൻ ഘടനയിലും പ്രവർത്തനത്തിലും മ്യൂട്ടേഷനുകളുടെ സ്വാധീനവും ome വിശകലനം ചെയ്തു.
ഓരോ VUS-നും സാധ്യതയുള്ള ക്ലിനിക്കൽ പ്രാധാന്യം നൽകുന്നതിന്, ഇനിപ്പറയുന്ന കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ പ്രോട്ടീൻ പ്രവചന അൽഗോരിതങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ചു: മ്യൂട്ടേഷൻ ടേസ്റ്റർ, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.gd/Ghd-Ghd-Alvard. .utah.edu/agvgd_input.php).ക്ലാസ് 1, 2 എന്നിങ്ങനെ തരംതിരിച്ചിരിക്കുന്ന വകഭേദങ്ങളെ വൈൽഡ് ടൈപ്പായി കണക്കാക്കി.
സാംഗർ സീക്വൻസിംഗ് ഓരോ രോഗകാരിയായ വേരിയന്റിന്റെയും സാന്നിധ്യം സ്ഥിരീകരിച്ചു. ചുരുക്കത്തിൽ, BRCA1, BRCA2 ജീൻ റഫറൻസ് സീക്വൻസുകൾ (NG_005905.2, NM_007294.3, NG_012772.3, NM_012772.3, NM_0012772.3, NM_0012772.3, NM_0012772.30, NM_00012772.30, NM_00012772.30, NM_00012762. ക്രമപ്പെടുത്തൽ.
ബിആർസിഎ1/2 ജീൻ നെഗറ്റീവ് ആണെന്ന് പരിശോധിച്ച രോഗികളെ നിർമ്മാതാവിന്റെ നിർദ്ദേശങ്ങൾ അനുസരിച്ച് മൾട്ടിപ്ലക്സ് ലിഗേഷൻ-ഡിപെൻഡന്റ് പ്രോബ് ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ (എംഎൽപിഎ) ഉപയോഗിച്ച് പരീക്ഷിച്ചു. ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ നീളമുള്ളതാണ്. പിസിആർ ആംപ്ലിക്കണുകളുടെ തനതായ ഒരു കൂട്ടം അടങ്ങുന്ന പ്രോബ് ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ പിന്നീട് കാപ്പിലറി ഇലക്ട്രോഫോറെസിസ് ഉപയോഗിച്ചും Cofalyser.Net സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ ഉചിതമായ ബാച്ച്-നിർദ്ദിഷ്ട കോഫാലൈസർ ടേബിളുകൾ (www.mrcholland.com) ഉപയോഗിച്ചും വിശകലനം ചെയ്തു.
തിരഞ്ഞെടുത്ത ക്ലിനിക്കോപാത്തോളജിക്കൽ വേരിയബിളുകൾ (ഹിസ്റ്റോളജിക്കൽ ഗ്രേഡും കി-67% പ്രൊലിഫെറേഷൻ ഇൻഡക്സും) BRCA1/2 PV യുടെ സാന്നിധ്യവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, p-മൂല്യം <0.05 എന്ന് കരുതി ഫിഷറിന്റെ കൃത്യമായ പരിശോധന ഉപയോഗിച്ച് പ്രിസം സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ v. 8.4 ഉപയോഗിച്ച് കണക്കാക്കി.
2017 ജനുവരിക്കും 2021 മാർച്ചിനും ഇടയിൽ, 455 രോഗികളെ ജെംലൈൻ BRCA1/2 മ്യൂട്ടേഷനുകൾക്കായി പരിശോധിച്ചു. പോളിക്ലിനിക്കോ ഹോസ്പിറ്റലിന്റെ എക്സ്പിരിമെന്റൽ ഓങ്കോളജി ആൻഡ് ഹെമറ്റോളജി സെന്ററിൽ മ്യൂട്ടേഷൻ പരിശോധന നടത്തി. സിസിലിയൻ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശം അനുസരിച്ച് (http://www.gurs.regione 10 Gennaio 2020), The Rodolico of Catania – San Marco” മൊത്തത്തിൽ, 389 രോഗികൾ സ്തനാർബുദം, 37 അണ്ഡാശയ അർബുദം, 16 പാൻക്രിയാറ്റിക് കാൻസർ, 8 പ്രോസ്റ്റേറ്റ് കാൻസർ, 5 മെലനോമ എന്നിവയുണ്ട്.ക്യാൻസർ തരവും വിശകലന ഫലങ്ങളും അനുസരിച്ച് രോഗികളുടെ വിതരണം ചിത്രം 1 ൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു.
പഠനത്തിന്റെ ഒരു അവലോകനം കാണിക്കുന്ന ഒരു ഫ്ലോ ചാർട്ട് ചിത്രം 1 കാണിക്കുന്നു. ബ്രെസ്റ്റ്, മെലനോമ, പാൻക്രിയാറ്റിക്, പ്രോസ്റ്റേറ്റ് അല്ലെങ്കിൽ അണ്ഡാശയ മുഴകൾ ഉള്ള രോഗികൾ BRCA1, BRCA2 ജീനുകളിലെ മ്യൂട്ടേഷനുകൾക്കായി പരീക്ഷിച്ചു.
ചുരുക്കങ്ങൾ: PVs, pathogenic variant;VUS, അനിശ്ചിത പ്രാധാന്യത്തിന്റെ വകഭേദം;WT, വൈൽഡ്-ടൈപ്പ് BRCA1/2 സീക്വൻസ്.
സ്തനാർബുദ കൂട്ടങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള ഞങ്ങളുടെ പഠനങ്ങൾ ഞങ്ങൾ തിരഞ്ഞെടുത്തു. രോഗികളുടെ ശരാശരി പ്രായം 49 വയസ്സായിരുന്നു (പരിധി 23-89) കൂടുതലും സ്ത്രീകളായിരുന്നു (n=376, അല്ലെങ്കിൽ 97%).
ഈ വിഷയങ്ങളിൽ, 64 (17%) പേർക്ക് BRCA1/2 മ്യൂട്ടേഷനുകൾ ഉണ്ടായിരുന്നു, എല്ലാവരും സ്ത്രീകളായിരുന്നു. മുപ്പത്തിയഞ്ച് (9%) പേർക്ക് PV ഉം 29 (7.5%) പേർക്ക് VUS ഉം ഉണ്ടായിരുന്നു. 35 രോഗകാരി വകഭേദങ്ങളിൽ പതിനേഴും (48.6%) BRCA1-ലും 18 (51.4%) BRCA1-ലും 18 (51.4%), BRCA1-ലും 18 (51.4%) BRCA-ലും സംഭവിച്ചു. BRCA2-ൽ 4 (82.8%) (ചിത്രം 1, 2). MLPA വിശകലനത്തിൽ LGR ഉണ്ടായിരുന്നില്ല.
ചിത്രം 2. 389 സ്തനാർബുദ രോഗികളിൽ BRCA1, BRCA2 മ്യൂട്ടേഷനുകളുടെ വിശകലനം.(A) 389 സ്തനാർബുദ രോഗികളിൽ രോഗകാരിയായ വകഭേദങ്ങളുടെ (PV) (ചുവപ്പ്), അനിശ്ചിത പ്രാധാന്യമുള്ള വകഭേദങ്ങൾ (VUS) (ഓറഞ്ച്), WT (നീല) വിതരണം;(B) 389 സ്തനാർബുദ രോഗികൾ മുപ്പത്തിയഞ്ച് (9%) പേർക്ക് BRCA1/2 രോഗകാരി വകഭേദങ്ങൾ (PVs) ഉണ്ടായിരുന്നു. അവരിൽ 17 (48.6%) BRCA1 PV കാരിയർ (കടും ചുവപ്പ്), 18 (51.4%) BRCA2 കാരിയർ (ഇളം ചുവപ്പ്);(C) 389 വിഷയങ്ങളിൽ 29 (7.5%) VUS, 5 (17.2%) BRCA1 ജീനുകൾ (ഇരുണ്ട ഓറഞ്ച്), 24 (82.8%) BRCA2 ജീനുകൾ (ഇളം ഓറഞ്ച്) എന്നിവ വഹിച്ചു.
ചുരുക്കങ്ങൾ: PVs, pathogenic variant;VUS, അനിശ്ചിത പ്രാധാന്യത്തിന്റെ വകഭേദം;WT, വൈൽഡ്-ടൈപ്പ് BRCA1/2 സീക്വൻസ്.
BRCA1/2 PV ഉള്ള രോഗികളിൽ BC തന്മാത്രാ ഉപവിഭാഗങ്ങളുടെ വ്യാപനം ഞങ്ങൾ അടുത്തതായി അന്വേഷിച്ചു. വിതരണത്തിൽ 2 (5.7%) ലൂമിനൽ A, 15 (42.9%) luminal B, 3 (8.6%) luminal B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+, 13% പോസിറ്റീവ് രോഗികൾ (37. 13, 13) എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. 29.4%) ലുമിനൽ B BC ഉം 2 (11.8%) പേർക്ക് HER2+ രോഗവും 10 (58.8%) പേർക്ക് TNBC ഉം ഉണ്ടായിരുന്നു. BRCA1 മ്യൂട്ടേഷനുകളില്ലാത്ത മുഴകൾ ഒന്നുകിൽ ലുമിനൽ A അല്ലെങ്കിൽ ലൂമിനൽ B-HER2+ (ചിത്രം 3) ആയിരുന്നു. BRCA2- പോസിറ്റീവ് ഉപഗ്രൂപ്പിൽ 10, 6, 10% luminal subgroup (6, 10%) ആയിരുന്നു. minal B-HER2+, 3 (16.7%) TNBC ഉം 2 (11.1%) ഉം ലുമിനൽ A ആയിരുന്നു (ചിത്രം 3 ).ഈ ഗ്രൂപ്പിൽ HER2+ മുഴകളൊന്നും ഉണ്ടായിരുന്നില്ല. അതിനാൽ, TNBC രോഗികളിൽ BRCA1 മ്യൂട്ടേഷനുകൾ വ്യാപകമാണ്, അതേസമയം BRCA2 വ്യതിയാനങ്ങൾ ലുമെൻ വ്യക്തികളിൽ കൂടുതലാണ്.
ചിത്രം 3 BRCA1, BRCA2 എന്നിവയിലെ രോഗകാരികളായ വകഭേദങ്ങളുള്ള രോഗികളിൽ സ്തനാർബുദ ഉപവിഭാഗങ്ങളുടെ വ്യാപനം. സ്തനാർബുദ രോഗികളുടെ തന്മാത്രാ ഉപവിഭാഗങ്ങളിൽ BRCA1- (കടും ചുവപ്പ്), BRCA2- (ഇളം ചുവപ്പ്) PV കളുടെ വിതരണം കാണിക്കുന്ന ഹിസ്റ്റോഗ്രാമുകൾ.
ചുരുക്കങ്ങൾ: PVs, pathogenic variant;HER2+, ഹ്യൂമൻ എപിഡെർമൽ ഗ്രോത്ത് ഫാക്ടർ റിസപ്റ്റർ 2 പോസിറ്റീവ്;TNBC, ട്രിപ്പിൾ-നെഗറ്റീവ് സ്തനാർബുദം.
തുടർന്ന്, BRCA1, BRCA2 PV-കളുടെ തരവും ജീൻ പ്രാദേശികവൽക്കരണവും ഞങ്ങൾ വിലയിരുത്തി. BRCA1 PV-യിൽ, 7 സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് വേരിയന്റുകൾ (SNVs), 6 ഇല്ലാതാക്കലുകൾ, 3 ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനുകൾ, 1 ഇൻസേർഷൻ എന്നിവ ഞങ്ങൾ നിരീക്ഷിച്ചു. BRCA ഒരു മ്യൂട്ടേഷനാണ് (c.5522delG) രണ്ടിലും ഏറ്റവും സാധാരണമായ കണ്ടുപിടുത്തം. 5_5039delCTAAT. ഈ മാറ്റത്തിൽ BRCA1 exon 15-ൽ അഞ്ച് ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ (CTAAT) ഇല്ലാതാക്കുന്നത് ഉൾപ്പെടുന്നു, ഇത് കോഡോൺ 1679-ൽ ടൈറോസിൻ ഉപയോഗിച്ച് അമിനോ ആസിഡ് ല്യൂസിൻ പകരം വയ്ക്കുന്നതിന് കാരണമാകുന്നു, കൂടാതെ ഒരു തർജ്ജമ ഫ്രെയിം ഷിഫ്റ്റ് കാരണം ഒരു പ്രോട്ടീൻ മാത്രം മുൻകൂട്ടി പ്രവചിക്കപ്പെട്ട ഒരു പ്രോട്ടീൻ സ്റ്റോപ്പിലേക്ക് നയിക്കുന്നു. റിപ്പോർട്ട് ചെയ്ത പിവികൾ സ്‌പ്ലൈസ് സൈറ്റ് കൺസെൻസസ് റീജിയണിലാണ് (c.4357+1G>T) (പട്ടിക 1).
BRCA2 PV സംബന്ധിച്ച്, ഞങ്ങൾ 6 ഇല്ലാതാക്കലുകളും 6 SNVകളും 2 ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനുകളും നിരീക്ഷിച്ചു. കണ്ടെത്തിയ മാറ്റങ്ങളൊന്നും പുതുമയുള്ളതല്ല. ഞങ്ങളുടെ ജനസംഖ്യയിൽ മൂന്ന് മ്യൂട്ടേഷനുകൾ ആവർത്തിച്ചു, c.428dup, c.8487+1G>A എന്നിവ 3 വിഷയങ്ങളിൽ നിരീക്ഷിച്ചു, തുടർന്ന് c.5851_5854delAGTT 2 ആവർത്തിച്ചുള്ള രണ്ട് കേസുകളിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു. BRCA2-ന്റെ എക്സോൺ 5-ലെ C, വെട്ടിച്ചുരുക്കിയതും പ്രവർത്തനരഹിതവുമായ ഒരു പ്രോട്ടീൻ എൻകോഡ് ചെയ്യുമെന്ന് പ്രവചിക്കപ്പെടുന്നു. C.8487+1G>BRCA2 ഇൻട്രോൺ 19 (± 1,2) ന്റെ ആന്തരിക മേഖലയിൽ ഒരു മ്യൂട്ടേഷൻ സംഭവിക്കുന്നു, ഇത് വിഭജിക്കുന്ന സമവായ ക്രമത്തെ ബാധിക്കുന്നു. BRCA2 ജീനിന്റെ എക്‌സോൺ 10 കോഡിംഗിൽ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സ്ഥാനങ്ങൾ 5851 മുതൽ 5854 വരെയുള്ള 4-ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് ഇല്ലാതാക്കൽ മൂലമാണ് delAGTT രോഗകാരിയായ വേരിയന്റ് സംഭവിക്കുന്നത്, കൂടാതെ പ്രവചിക്കപ്പെട്ട ഇതര സ്റ്റോപ്പ് കോഡണോടുകൂടിയ ഒരു വിവർത്തന ഫ്രെയിംഷിഫ്റ്റിന് ഇത് കാരണമാകുന്നു (p.S1951WfsTer> c.200, C.200 മുമ്പ് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തതുപോലെ, C.2006). A>T അതേ രോഗിയിൽ കണ്ടെത്തി. 34 ആദ്യത്തെ മ്യൂട്ടേഷനിൽ BRCA2 എക്സോൺ 7 ലെ അഡിനോസിൻ (A) മാറ്റി ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് അടങ്ങിയ ഒരു ഗ്വാനിൻ (G) ഉപയോഗിച്ച് കോഡൺ 211-ൽ വാലൈൻ ഐസോലൂസിൻ ആയി മാറുന്നു, ഐസോലൂസിൻ അമിനോ ആസിഡ് ഒരു അമിനോ ആസിഡാണ്. BRCA2 എന്ന ജീൻ എൻകോഡിംഗിന്റെ എക്സോണിന് 13-ന് മുമ്പുള്ള ഒരു ഇരട്ട എ മുതൽ തൈമിൻ (T) മാറ്റിസ്ഥാപിക്കൽ. c.7008-2A>T മാറ്റം വ്യത്യസ്ത ദൈർഘ്യമുള്ള ഒന്നിലധികം ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ സൃഷ്ടിച്ചേക്കാം. കൂടാതെ, BRCA2 PV-കളുടെ ഗ്രൂപ്പിൽ, 18-ൽ 4 മാറ്റങ്ങളും (22.2%) അന്തർലീനമായിരുന്നു.
ഞങ്ങൾ പിന്നീട് പ്രവർത്തനപരമായ ഡൊമെയ്‌നുകളിലും പ്രോട്ടീൻ-ബൈൻഡിംഗ് മേഖലകളിലും BRCA1/2 ഹാനികരമായ മ്യൂട്ടേഷനുകൾ മാപ്പ് ചെയ്തു (ചിത്രം 4). BRCA1 ജീനിൽ, 50% പിവികൾ സ്തനാർബുദ ക്ലസ്റ്റർ മേഖലയിലാണ് (BCCR), അതേസമയം 22% മ്യൂട്ടേഷനുകൾ അണ്ഡാശയ കാൻസർ ക്ലസ്റ്റർ മേഖലയിലാണ് (OCCR) സ്ഥിതി ചെയ്യുന്നത്. BCCR മേഖലയും 42.8% മ്യൂട്ടേഷനുകളും OCCR-ൽ സ്ഥിതി ചെയ്‌തു (ചിത്രം 4B). അടുത്തതായി, BRCA1, BRCA2 പ്രോട്ടീൻ ഡൊമെയ്‌നുകൾക്കുള്ളിൽ PV യുടെ സ്ഥാനം ഞങ്ങൾ വിലയിരുത്തി. BRCA1 പ്രോട്ടീനിനായി, ലൂപ്പിലും കോയിൽഡ് കോയിൽ ഡൊമെയ്‌നുകളിലും ഞങ്ങൾ മൂന്ന് PV-കൾ കണ്ടെത്തി. BRC റിപ്പീറ്റ് ഡൊമെയ്‌നിലേക്ക്, ഒളിഗോ/ഒലിഗോസാക്കറൈഡ്-ബൈൻഡിംഗ് (OB), ടവർ (T) ഡൊമെയ്‌നുകളിൽ 3 ഇൻട്രോണിക്, 3 എക്‌സോണിക് മാറ്റങ്ങൾ കണ്ടെത്തി (ചിത്രം 4B).
ചിത്രം 4 BRCA1, BRCA2 പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്കീമാറ്റിക് പ്രാതിനിധ്യവും രോഗകാരിയായ വകഭേദങ്ങളുടെ പ്രാദേശികവൽക്കരണവും. സ്തനാർബുദ രോഗികളിൽ BRCA1 (A), BRCA2 (B) എന്നീ രോഗകാരി വകഭേദങ്ങളുടെ വിതരണം ഈ ചിത്രം കാണിക്കുന്നു. എക്സോണിക് മ്യൂട്ടേഷനുകൾ നീല നിറത്തിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു, അതേസമയം ആന്തരിക വകഭേദങ്ങൾ ഓറഞ്ച് നിറത്തിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. .(A) BRCA1 പ്രോട്ടീനിൽ ഒരു ലൂപ്പ് ഡൊമെയ്‌നും (RING) ഒരു ന്യൂക്ലിയർ ലോക്കലൈസേഷൻ സീക്വൻസും (NLS), ഒരു coiled-coil domain, ഒരു SQ/TQ ക്ലസ്റ്റർ ഡൊമെയ്‌ൻ (SCD), ഒരു BRCA1 C-ടെർമിനൽ ഡൊമെയ്‌ൻ (BRCT), ഒരു BRCA1 C-ടെർമിനൽ ഡൊമെയ്‌ൻ (BRCT) എന്നിവ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. nucleotide/oligosaccharide-binding (OB) ഫോൾഡുകൾ, ഒരു ടവർ ഡൊമെയ്ൻ (T), C വശത്ത് NLS. ബ്രെസ്റ്റ് കാൻസർ ക്ലസ്റ്റർ റീജിയൻ (BCCR), അണ്ഡാശയ ക്യാൻസർ ക്ലസ്റ്റർ റീജിയൺ (OCCR) എന്നിങ്ങനെ വിളിക്കപ്പെടുന്ന പ്രദേശങ്ങൾ ചുവടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു.*സ്റ്റോപ്പ് കോഡോണുകൾ നിർണ്ണയിക്കുന്ന മ്യൂട്ടേഷനുകളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു.
BRCA1/2 PV യുടെ സാന്നിധ്യവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടേക്കാവുന്ന BC ക്ലിനിക്കൽ പാത്തോളജിക്കൽ സവിശേഷതകൾ ഞങ്ങൾ പിന്നീട് അന്വേഷിച്ചു. 181 BRCA1/2-നെഗറ്റീവ് രോഗികൾക്കും (Non = 35) എല്ലാ രോഗകാരികൾക്കും (n = 35) പൂർണ്ണമായ ക്ലിനിക്കൽ രേഖകൾ ലഭ്യമാണ്. ട്യൂമർ വ്യാപന നിരക്കും ഗ്രേഡും തമ്മിൽ ഒരു പരസ്പര ബന്ധമുണ്ട്.
ഞങ്ങളുടെ കൂട്ടുകെട്ടിന്റെ (25%, ശ്രേണി <10-90%) കി-67 ന്റെ വിതരണം ഞങ്ങൾ കണക്കാക്കി. Ki-67 <25% ഉള്ള വിഷയങ്ങൾ "കുറഞ്ഞ Ki-67″" ആയി നിർവചിക്കപ്പെട്ടു, അതേസമയം ≥ 25% മൂല്യമുള്ള വ്യക്തികളെ "ഉയർന്ന Ki-67″" ആയി കണക്കാക്കുന്നു. പിവി കാരിയറുകൾ (ചിത്രം 5 എ).
BRCA1, BRCA2 PV-കൾ ഉള്ളതും ഇല്ലാത്തതുമായ സ്തനാർബുദ സ്ത്രീകളിലെ ഗ്രേഡ് വിതരണവുമായി Ki-67-ന്റെ ചിത്രം 5 പരസ്പരബന്ധം.(A) BRCA1 (18) അല്ലെങ്കിൽ BRCA2 (17) PV രോഗികളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്ന 181 കാരിയർ അല്ലാത്ത BC രോഗികളിൽ മീഡിയൻ Ki-67 മൂല്യങ്ങൾ കാണിക്കുന്ന ബോക്സ്പ്ലോട്ട്. കാൻസർ രോഗികളെ BRCA1, BRCA2 മ്യൂട്ടേഷൻ സ്റ്റാറ്റസ് (WT സബ്ജക്റ്റുകൾ, BRCA1, BRCA2 PVs കാരിയർ) അനുസരിച്ച് ഹിസ്റ്റോളജിക്കൽ ഗ്രേഡ് ഗ്രൂപ്പുകളായി (G2, G3)
അതുപോലെ, ട്യൂമർ ഗ്രേഡ് BRCA1/2 PV യുടെ സാന്നിധ്യവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടോ എന്ന് ഞങ്ങൾ പരിശോധിച്ചു. ഞങ്ങളുടെ ജനസംഖ്യയിൽ G1 BC ഇല്ലാതിരുന്നതിനാൽ, ഞങ്ങൾ രോഗികളെ രണ്ട് ഗ്രൂപ്പുകളായി (G2 അല്ലെങ്കിൽ G3) വിഭജിച്ചു. Ki-67 ഫലങ്ങൾക്ക് അനുസൃതമായി, വിശകലനം, ട്യൂമർ ഗ്രേഡും BRCA1 അല്ലാത്തതും തമ്മിലുള്ള ഉയർന്ന അനുപാതത്തിലുള്ള ട്യൂമർ ഗ്രേഡും BRCA1 പരിവർത്തനവും തമ്മിൽ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്ക് പ്രാധാന്യമുള്ള പരസ്പരബന്ധം വെളിപ്പെടുത്തി. -carriers (p<0.005) (ചിത്രം 5B ).
ഡിഎൻഎ സീക്വൻസിങ് ടെക്നോളജിയിലെ പുരോഗതി, അർബുദത്തിന്റെ കുടുംബ ചരിത്രമുള്ള രോഗികൾക്ക് നിർണായകമായ പ്രത്യാഘാതങ്ങളോടെ, BRCA1/2 ജനിതക പരിശോധനയിൽ അഭൂതപൂർവമായ പുരോഗതി പ്രാപ്തമാക്കി. ഇന്നുവരെ, ഏകദേശം 20.000 BRCA1/2 വകഭേദങ്ങൾ കണ്ടെത്തി അമേരിക്കൻ സൊസൈറ്റി ഓഫ് മെഡിക്കൽ ജനറ്റിക്സ് സിസ്റ്റം പ്രകാരം തരംതിരിച്ചിട്ടുണ്ട്. ഭൂമിശാസ്ത്രപരമായ മേഖലകളിലുടനീളം ടാഷണൽ സ്പെക്ട്രം വ്യത്യാസപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.37 ഇറ്റലിയിൽ, BRCA1/2 PV-കളുടെ നിരക്ക് 8% മുതൽ 37% വരെയാണ്. സിലി, ദ്വീപിന്റെ കിഴക്കൻ ഭാഗത്ത് വിപുലമായ തെളിവുകളൊന്നുമില്ല.
കിഴക്കൻ സിസിലിയിലെ ബിസി രോഗികളിൽ BRCA1/2 PV-യുടെ സംഭവങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള ആദ്യ റിപ്പോർട്ടുകളിൽ ഒന്നാണ് ഞങ്ങളുടെ പഠനം.
389 ബിസി രോഗികളെ പരിശോധിക്കുമ്പോൾ, 9% BRCA1/2 PV-കൾ, BRCA1, BRCA2 എന്നിവയ്ക്കിടയിൽ തുല്യമായി വിതരണം ചെയ്തു. ഈ ഫലങ്ങൾ ഇറ്റാലിയൻ ജനസംഖ്യയിൽ മുമ്പ് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടവയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു. എന്നിരുന്നാലും, ഇവരിൽ ആരും തന്നെ BRCA1/2 PV വികസിപ്പിച്ചിട്ടില്ല, അതിനാൽ PALB2, RAD51C, D എന്നിവ പോലുള്ള സാധാരണ മ്യൂട്ടേഷനുകളുടെ സാന്നിധ്യം തള്ളിക്കളയാൻ കൂടുതൽ തന്മാത്രാ വിശകലനത്തിനായി അവർ സ്ഥാനാർത്ഥികളായിരുന്നു. BRCA2 VUS പ്രകടമായ 7% വിഷയങ്ങളിൽ അനിശ്ചിതത്വത്തിന്റെ വകഭേദങ്ങൾ വീണ്ടെടുത്തിട്ടുണ്ട്.
BRCA1/2 മ്യൂട്ടന്റ് സ്‌ത്രീകളിലെ BC മോളിക്യുലാർ സബ്‌ടൈപ്പുകളുടെ വിതരണം ഞങ്ങൾ വിശകലനം ചെയ്തപ്പോൾ, TNBC, BRCA1 PV (58.8%), luminal B BC, BRCA2 PV (55.6%) എന്നിവയ്‌ക്കിടയിലുള്ള അറിയപ്പെടുന്ന ബന്ധങ്ങൾ ഞങ്ങൾ സ്ഥിരീകരിച്ചു.
ഞങ്ങൾ പിന്നീട് BRCA1/2 PV-യുടെ തരത്തിലും സ്ഥാനത്തിലും ശ്രദ്ധ കേന്ദ്രീകരിക്കുന്നു. ഞങ്ങളുടെ കൂട്ടത്തിൽ, ഏറ്റവും സാധാരണമായ BRCA1 PV c.5035_5039delCTAAT ആയിരുന്നു. Incorvaia et al.ഈ വകഭേദത്തെ അവരുടെ സിസിലിയൻ കൂട്ടുകെട്ടിൽ വിവരിച്ചിട്ടില്ല, മറ്റ് രചയിതാക്കൾ ഇതിനെ ഒരു ബീജരേഖയായി റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തിട്ടുണ്ട് BRCA1 PV.34 ഞങ്ങളുടെ കൂട്ടത്തിൽ നിരവധി BRCA1 PV-കൾ കണ്ടെത്തി - ഉദാ c.181T>G, c.514del, c.3253dupA, c.5266dupC - ഇവയിൽ രണ്ടെണ്ണം mu. T>G, c.5266dupC) എന്നിവ സാധാരണയായി കിഴക്കൻ, മധ്യ യൂറോപ്പ് (പോളണ്ട്, ചെക്ക്), സ്ലോവേനിയൻ, ഓസ്ട്രിയൻ, ഹംഗേറിയൻ, ബെലാറഷ്യൻ, ജർമ്മൻ എന്നിവയിലെ അഷ്‌കെനാസി ജൂതന്മാരിൽ കാണപ്പെടുന്നു, 44,45 കൂടാതെ, യുണൈറ്റഡ് സ്റ്റേറ്റ്സിലും അർജന്റീനയിലും, ഈയിടെ നിർവചിക്കപ്പെട്ടത് "മുൻപ് 3 BC, 3 ഇറ്റാലിയൻ രോഗികളിൽ ആവർത്തിച്ചുള്ള ജെംലൈൻ വേരിയന്റാണ്". വടക്കൻ സിസിലിയിൽ നിന്നുള്ള പലേർമോയിലും മെസിനയിലും 8 സ്തനാർബുദ രോഗികൾകാറ്റാനിയയിലെ ചില കുടുംബങ്ങളിൽ c.3253dupA വേരിയന്റ് കണ്ടെത്തി. വടക്കുപടിഞ്ഞാറൻ സിസിലിയിലെ വീടുകളിൽ, പ്രധാനമായും ട്രാപാനി, പലേർമോ മേഖലകളിൽ, c.5851_5854delAGTT PV വടക്കുപടിഞ്ഞാറൻ സിസിലിയിലെ വീടുകളിൽ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. 8487+1G>എ വേരിയന്റ് മെസ്സിന, പലേർമോ, 2 കാൾട്ടനിസെറ്റ എന്നിവിടങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള വിഷയങ്ങളിൽ കൂടുതൽ സാധാരണമാണ്.കൊളംബിയയിലെ c.5851_5854delAGTT മാറ്റം മുമ്പ് വിവരിച്ചിട്ടുണ്ട്. 37 മറ്റൊരു BRCA2 PV, c.631+1G>A, സിസിലിയിൽ നിന്നുള്ള BC, OC രോഗികളിൽ (അഗ്രിജന്റോ, സിറാക്കൂസ, റഗുസ) കണ്ടെത്തിയിട്ടുണ്ട്. A>T) സിസ് മോഡിൽ വേർതിരിക്കപ്പെട്ടതായി ഞങ്ങൾ അനുമാനിച്ച അതേ രോഗിയിൽ, മുമ്പ് റിപ്പോർട്ടുചെയ്‌തതുപോലെ.
പ്രോട്ടീൻ ഡൊമെയ്‌നുകളുടെയും ജീനുകളുടെയും OCCR, BCCR മേഖലകളിൽ ഞങ്ങൾ BRCA1, BRCA2 PV-കൾ മാപ്പ് ചെയ്‌തു.യഥാക്രമം അണ്ഡാശയവും സ്തനാർബുദവും വികസിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള അപകടസാധ്യതയുള്ള മേഖലകളായി. 49 എന്നിരുന്നാലും, ജെർംലൈൻ വേരിയന്റുകളുടെ സ്ഥാനവും ബ്രെസ്റ്റ് അല്ലെങ്കിൽ അണ്ഡാശയ അർബുദ സാധ്യതയും തമ്മിലുള്ള ബന്ധത്തെക്കുറിച്ചുള്ള തെളിവുകൾ വിവാദമായി തുടരുന്നു. OCCR, BCCR മേഖലകളും BC സവിശേഷതകളും. ഇത് BRCA1/2 മ്യൂട്ടേഷനുള്ള രോഗികളുടെ പരിമിതമായ എണ്ണം മൂലമാകാം. ഒരു പ്രോട്ടീൻ ഡൊമെയ്‌ൻ വീക്ഷണകോണിൽ, BRCA1 PV-കൾ മുഴുവൻ പ്രോട്ടീനിലും വിതരണം ചെയ്യപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ BRCA2 മാറ്റങ്ങൾ BRC ആവർത്തന ഡൊമെയ്‌നിൽ മുൻഗണന നൽകുന്നു.
അവസാനമായി, BRCA1/2 PV യുമായി ഞങ്ങൾ BC ക്ലിനിക്കോപാത്തോളജിക്കൽ സവിശേഷതകൾ പരസ്പരം ബന്ധപ്പെടുത്തി. പരിമിതമായ എണ്ണം രോഗികൾ ഉൾപ്പെട്ടതിനാൽ, Ki-67 ഉം ട്യൂമർ ഗ്രേഡും തമ്മിൽ കാര്യമായ ബന്ധം മാത്രമേ ഞങ്ങൾ കണ്ടെത്തിയിട്ടുള്ളൂ. Ki-67 ന്റെ വിലയിരുത്തലും വ്യാഖ്യാനവും ഒരു പരിധിവരെ വിവാദമായി തുടരുന്നുണ്ടെങ്കിലും, രോഗം പുനരുജ്ജീവിപ്പിക്കുന്നതിന്റെ ഉയർന്ന തോതിലുള്ള അപകടസാധ്യത കുറയുന്നു. "ഉയർന്ന", "താഴ്ന്ന" കി-67 എന്നിവയ്ക്കിടയിലുള്ള 20% ആണ്. എന്നിരുന്നാലും, ഞങ്ങളുടെ BRCA1/2 മ്യൂട്ടേഷൻ രോഗികളുടെ ജനസംഖ്യയ്ക്ക് ഈ പരിധി ബാധകമല്ല, അതിന്റെ ശരാശരി Ki-67 മൂല്യം 25% ആണ്. ഉയർന്ന Ki-67 നിരക്കിലുള്ള ഈ പ്രവണത ഞങ്ങളുടെ ലുമിനൽ B, TNBC എന്നിവയിലെ വ്യാപനം കൊണ്ട് വിശദീകരിക്കാം. കട്ട്ഓഫ് (25-30%) രോഗികളെ അവരുടെ പ്രവചനമനുസരിച്ച് മികച്ച രീതിയിൽ തരംതിരിച്ചേക്കാം. 53,54 ഞങ്ങളുടെ വിശകലനത്തിന്റെ ഫലങ്ങളിൽ നിന്ന്, ഒരു പ്രധാന പരസ്പരബന്ധം ആശ്ചര്യകരമല്ല. ഉയർന്ന Ki-67 നും ഗ്രേഡുകൾക്കും BRCA1 PV യുടെ സാന്നിധ്യത്തിനും ഇടയിൽ സംഭവിക്കുന്നു. വാസ്തവത്തിൽ, BRCA1-മായി ബന്ധപ്പെട്ട ട്യൂമറുകൾ TNBC, 1-അഗ്ഗ്രെസ് 1 സവിശേഷതകൾ കൂടുതലാണ്.
ഉപസംഹാരമായി, ഈ പഠനം കിഴക്കൻ സിസിലിയിൽ നിന്നുള്ള ഒരു ബിസി കൂട്ടുകെട്ടിൽ BRCA1/2 ന്റെ മ്യൂട്ടേഷണൽ നിലയെക്കുറിച്ചുള്ള ഒരു റിപ്പോർട്ട് നൽകുന്നു. മൊത്തത്തിൽ, മ്യൂട്ടേഷൻ വ്യാപനത്തിന്റെയും BC-യിലെ ക്ലിനിക്കോപാത്തോളജിക്കൽ സവിശേഷതകളുടെയും അടിസ്ഥാനത്തിൽ ഞങ്ങളുടെ കണ്ടെത്തലുകൾ നിലവിലുള്ള തെളിവുകളുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു. BRCA1/2 നേക്കാൾ വ്യത്യസ്‌തവും കുറഞ്ഞതുമായ പിവികളുടെ സാന്നിധ്യം വിലയിരുത്തുക. ജനിതകമാറ്റം മൂലം ക്യാൻസർ വരാനുള്ള സാധ്യത കൂടുതലുള്ള വിഷയങ്ങളുടെ എണ്ണം തിരിച്ചറിയാനും ശരിയായ മാനേജ്‌മെന്റ് നടത്താനും ഇത് അനുവദിക്കും.
ഗവേഷണ ആവശ്യങ്ങൾക്കായി അജ്ഞാതമായി ട്യൂമർ സാമ്പിളുകൾ പുറത്തുവിടാൻ രോഗികൾ അറിവോടെയുള്ള സമ്മതത്തിൽ ഒപ്പുവെച്ചതായി ഞങ്ങൾ സ്ഥിരീകരിച്ചു. ഹെൽസിങ്കിയുടെ പ്രഖ്യാപനം അനുസരിച്ച് എല്ലാ രോഗികളും രേഖാമൂലമുള്ള അറിവോടെയുള്ള സമ്മതം ഒപ്പിട്ടു. AOU പോളിക്ലിനിക്കോ "G.Rodolico - S.Marco" യുടെ നയം അനുസരിച്ച്, ഈ പഠനം നൈതിക അവലോകനത്തിൽ നിന്ന് ഒഴിവാക്കി. ഗവേഷണ ആവശ്യങ്ങൾക്കായി അവരുടെ ഡാറ്റ ഉപയോഗിക്കുന്നതിനും സമ്മതം നൽകുന്നു.
എത്തിക്‌സ് കമ്മിറ്റി ആവശ്യപ്പെട്ട പ്രകാരം സ്തനാർബുദ രോഗികളുടെ പരിചരണത്തിൽ പ്രൊഫ. പൗലോ വിഗ്നേരി നൽകിയ സഹായത്തിന് ഞങ്ങൾ നന്ദി പറയുന്നു.
ഇസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ടോ ജെന്റിലി, എലി ലില്ലി, നൊവാർട്ടിസ്, ഫൈസർ എന്നിവരിൽ നിന്ന് ഫെഡറിക്ക മാർട്ടോറാന ഓണറേറിയ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നു. മറ്റ് രചയിതാക്കൾ ഈ കൃതിയിൽ താൽപ്പര്യ വൈരുദ്ധ്യങ്ങളൊന്നും പ്രഖ്യാപിക്കുന്നില്ല.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al. ഗ്ലോബൽ ക്യാൻസർ സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്സ് 2020: GLOBOCAN ലോകമെമ്പാടുമുള്ള 185 രാജ്യങ്ങളിലായി 36 ക്യാൻസറുകളുടെ സംഭവവും മരണവും കണക്കാക്കുന്നു. CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-240.cadio


പോസ്റ്റ് സമയം: ഏപ്രിൽ-15-2022