Mutasjonsanalyse av BRCA1/BRCA2-gener i brystkreft

Javascript er for øyeblikket deaktivert i nettleseren din. Noen funksjoner på denne nettsiden vil ikke fungere når javascript er deaktivert.
Registrer deg med dine spesifikke detaljer og spesifikke medisiner av interesse, og vi vil matche informasjonen du gir med artikler i vår omfattende database og umiddelbart sende deg en PDF-kopi.
Fra Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6, 7. 95123, Italia;2 Senter for eksperimentell onkologi og hematologi, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Italia;3 Medisinsk onkologi, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Italia;4 Medical Genetics, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Italia;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Italia;6 Institutt for biomedisinsk og bioteknologisk vitenskap, Universitetet i Catania, medisinsk genetikk, Catania, Italia, 95123;7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Italia Kommunikasjon: Stefania Stella, tlf +39 095 378 1946, e-post [e-postbeskyttet];[email protected] Formål: Kimlinjemutasjoner i BRCA1 og BRCA2 og etablert brystkreft (BC), ovarie (OC) og annet assosiert med en livstidsrisiko for kreft. Testing for BRCA-genet er nøkkelen til å vurdere individuell risiko, så vel som for å finne forebyggende metoder hos friske bærere og skreddersy behandlinger hos kreftpasienter. Forekomsten av BRCA2 varierer mye på tvers av BRCA2 og geografiske stier. ogene varianter i sicilianske familier, studier spesifikt rettet mot populasjoner i det østlige Sicilia mangler. Målet med vår studie var å undersøke forekomsten og distribusjonen av BRCA patogene kimlinjeendringer i en kohort av BC-pasienter fra østlige Sicilia og å vurdere deres assosiasjon med spesifikke BC-trekk ved bruk av neste generasjons tilstedeværelse av svulst-graderinger og overlevelsessekvenser med altindeksering,SULT. 35 pasienter (9 %) hadde en BRCA-patogen variant, 17 (49 %) i BRCA1 og 18 (51 %) i BRCA2.BRCA1-endringer er utbredt hos trippel-negative BC-pasienter, mens BRCA2-mutasjoner er mer vanlig hos luminale BC-pasienter. Sammenlignet med ikke-bærere, ga forsøkspersoner med en signifikant høyere BRCA1-gradsvarianter og proliferative tumor-varianter: mutasjonsstatus hos BC-pasienter fra østlige Sicilia og bekrefter rollen til NGS-analyse for å identifisere pasienter med arvelig BC. Totalt sett er disse dataene i samsvar med tidligere bevis som støtter BRCA-screening for riktig forebygging og behandling av kreft hos mutasjonsbærere.
Brystkreft (BC) er den vanligste maligniteten over hele verden og den dødeligste kreften hos kvinner.1 De biologiske egenskapene som bestemmer BC-prognose og klinisk atferd har blitt grundig studert og delvis belyst over tid. Faktisk brukes flere surrogatmarkører for tiden til å klassifisere BC i forskjellige molekylære subtyper. De er østrogen (ER) reseptor (progesteron-/H-reseptor-vekstfaktor) og ER2-reseptor. 2) amplifikasjon, proliferasjonsindeks Ki-67 og tumorgrad (G).2 Kombinasjonen av disse variablene identifiserte følgende BC-kategorier: 1) Luminale svulster, som viste ER- og/eller PgR-ekspresjon, utgjorde 75 % av BC-er. Disse svulstene ble videre delt inn i Luminal A, når Ki-67 var under 20 % og HER 20 % og HER lik 20 % og HER 67 negative. tilstedeværelse av HER2-amplifikasjon, uavhengig av proliferasjonsindeks;2) HER2+-svulster som er ER- og PgR-negative, men som viser HER2-amplifikasjon. Denne gruppen står for 10 % av alle brystsvulster;3) Trippel-negativ brystkreft (TNBC), som ikke viser ER- og PgR-ekspresjon og HER2-amplifikasjon, utgjør omtrent 15 % av brystkrefttilfellene.2-4
Blant disse BC-subtypene representerer tumorgrad og proliferasjonsindeks tverrsnittsbiomarkører som er direkte og uavhengig assosiert med tumoraggressivitet og prognose.5,6
I tillegg til de nevnte biologiske egenskapene, har arvelige genetiske endringer som fører til utvikling av BC blitt stadig viktigere i løpet av de siste årene.7 Omtrent 1 av 10 brystsvulster er arvet på grunn av kimlinjeendringer i spesifikke gener.8 To store epidemiologiske studier som involverer mer enn 180 000 kvinner, har nylig identifisert en gruppe av gener, BRCA, BRCA, A1 2, CHK2, PALB2, RAD51C og RAD51D) som er primært ansvarlige for arvelig BC. Blant disse genene viste BRCA1 og BRCA2 (heretter referert til som BRCA1/2) den sterkeste korrelasjonen med utviklingen av brystsvulster. , pankreas, kolorektal og melanom. Fra 13 til 80 år er den kumulative forekomsten av BC 72 % hos kvinner med en BRCA1 patogen variant (PV) og 69 % hos kvinner med BRCA2 PV.14
Spesielt antyder en nylig publikasjon at BC-risiko avhenger av typen PV. Sammenlignet med patogene trunkeringsvarianter, er skarpe missense-varianter, spesielt i BRCA1-genet, assosiert med en redusert risiko for BC, spesielt hos eldre kvinner.15
Tilstedeværelsen av BRCA1 eller BRCA2 PV var assosiert med ulike biologiske og klinikopatologiske trekk.16,17 BRCA1-assosierte BC-er har en tendens til å være klinisk aggressive, dårlig differensierte og svært proliferative. Disse svulstene er vanligvis trippel negative og har en tidlig alder når de debuterer. Svulster som forekommer hos BRCA2-muterte pasienter har typisk godt gradert indifferenterte og prolifererte tumorer. s er mer vanlig i lumen B og forekommer vanligvis hos eldre voksne.16-18 Spesielt øker mutasjoner i BRCA1 og BRCA2 følsomheten for spesifikke behandlinger, inkludert platinasalter og målrettede legemidler som poly(ADP-ribose) polymerasehemmere (PARPi).19,20
I løpet av de siste årene har implementeringen av neste generasjons sekvensering (NGS) i klinisk praksis gjort det mulig for et økende antall BC-pasienter å gjennomgå molekylære tester for kreftfølsomhetssyndromer, inkludert BRCA1/2.21. Samtidig er definisjoner basert på presise kriterier angående familiehistorie, demografi og klinikopatologiske karakteristika som er verdt å identifisere individuelle kjennetegn, BR2CA1,2 verdt å teste bedre. mulerer på BRCA1/2-screening i spesifikke populasjoner, og fremhever forskjeller på tvers av geografiske regioner.24–27 Selv om det er rapporter om BC-kohorten på det vestlige Sicilia, er færre data tilgjengelige om BRCA1/2-screening i den østlige Sicilia-befolkningen.28,29
Vi beskriver her resultatene av kimlinje BRCA1/2-screening hos BC-pasienter fra østlige Sicilia, og korrelerer ytterligere tilstedeværelsen av BRCA1- eller BRCA2-mutasjoner med de viktigste klinikopatologiske egenskapene til disse svulstene.
En retrospektiv studie ble utført ved "Center for Experimental Oncology and Hematology" ved Policlinico Hospital.Rodolico – San Marco i Catania. Fra januar 2017 til mars 2021 ble totalt 455 pasienter med bryst- og eggstokkreft, melanom, bukspyttkjertel- eller prostatakreft henvist til vår genetiske test i samsvar med BRCA-diagnostikken. Helsinki, og alle deltakerne ga skriftlig informert samtykke før molekylær analyse.
Histologiske og biologiske karakteristika (ER, PgR, HER2-status, Ki-67 og grad) av BC ble vurdert på kjernebiopsi eller kirurgiske prøver, og tok kun i betraktning aggressive svulstkomponenter. Basert på disse karakteristikkene ble BC klassifisert som følger: luminal A (ER+ og/eller PgR+, HER2-, B0 Ki-6, HER2-, B0 Ki-6, 7 %) og HER2-, B0Ki-6 -67≥20%), luminal B-HER2+ (ER og/eller PgR+, HER2+), HER2+ (ER og PgR-, HER2+) eller trippel negativ (ER og PgR-, HER2-).
Før vurdering av BRCA1- og BRCA2-mutasjonsstatus, gjennomførte et tverrfaglig team inkludert en onkolog, en genetiker og en psykolog en tumorgenetikkkonsultasjon for hver pasient for å fastslå tilstedeværelsen av BRCA1 og/eller BRCA1.eller individer med høy risiko for PV i BRCA2-genet. Pasientutvelgelse ble utført i henhold til retningslinjer fra Italian Society of Medical Oncology (AIOM) og lokale sicilianske anbefalinger.30,31 Disse kriteriene inkluderer: (i) familiehistorie med kjente patogene varianter i mottakelighetsgener (f.eks. BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN);(ii) hanner med BC;(iii) de med BC og OC;(iv) kvinner med BC <36 år, TNBC <60 år, eller bilateral BC <50 år;(v) personlig medisinsk historie med BC <50 år og minst én førstegrads slektning: (a) BC < 50 år;(b) ikke-mucinøs og ikke-grenseoverskridende OC uansett alder;(c) bilateral BC;(d) hann BC;(e) kreft i bukspyttkjertelen;(f) prostatakreft;(vi) to eller flere Personlig historie med BC > 50 år og familiehistorie med BC, OC eller kreft i bukspyttkjertelen for slektninger som er førstegradsslektninger til hverandre (inkludert slektninger som hun er førstegradsslektninger med);(vii) Personlig historie med OC og minst én førstegradsslektning: (a) BC <50 år;(b) NOC;(c) bilateral BC;(d) hann BC;(vii) hunn med høygradig serøs OC.
En 20 mL perifer blodprøve ble tatt fra hver pasient og samlet inn i EDTA-rør (BD Biosciences). Genomisk DNA ble isolert fra 0,7 mL fullblodprøver ved å bruke QIAsymphony DSP DNA Midi-settet Isolation Kit (QIAGEN, Hilden, Italia) i henhold til produsentens instruksjoner og passert gjennom et Fishormo Performometer, USA 3. kvantifisering.Målberikelse og bibliotekforberedelse utføres av Oncomine ™ BRCA Research Assay Chef, klar til å lastes inn i Ion Ampliseq ™ Chef Reagents DL8 -settet for automatisert bibliotekforberedelse i henhold til produsentens instruksjoner. DE KIT av to multiplex PCR Primer Primer Primer Primer) . Briefly ble 15 ul av hvert utvannet prøvedNA (10 ng) tilsatt til strekkodede plater for bibliotekforberedelse, og alle reagenser og forbruksvarer ble lastet på Ion Chef ™ instrument. MA, USA) I henhold til produsentens instruksjoner. Finalt er biblioteker kombinert i ekvimolare forhold i Ion Chef ™ Library Sample Tubes (strekkodede rør) og lastet på Ion Chef ™ -instrument. Amplicon Suite (SmartSeq SRL) og Ion Reporter -programvare.
All variantnomenklatur fulgte de gjeldende retningslinjene til Human Genome Variation Consortium, tilgjengelig online (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Den kliniske betydningen av BRCA1/2-varianter ble definert ved å bruke klassifiseringen av International Consortium ENIGMA (Evidence-Based Network for Interpreting Germline Mutenigons database, https://www.allernig. UP, BRCAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD og UMD. Klassifikasjonen inkluderer fem distinkte risikokategorier: benign (kategori I), sannsynlig godartet (kategori II), variant av usikker betydning (VUS, kategori III), sannsynlig patogen (kategori IV), og patogen (kategori V, mutert, også analysert proteinstrukturen og 3-funksjonen).VarSome. 32
For å tildele potensiell klinisk betydning til hver VUS, ble følgende beregningsbaserte proteinprediksjonsalgoritmer brukt: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:///genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) og Align_agdgvgd.gd.gd.gd.gd.gd. input.php). Varianter klassifisert som klasse 1 og 2 ble ansett som villtype.
Sanger-sekvensering bekreftet tilstedeværelsen av hver patogen variant. Kort fortalt ble et par spesifikke primere designet for hver detekterte variant ved å bruke BRCA1- og BRCA2-genreferansesekvensene (NG_005905.2, NM_007294.3 og NG_012772.3, NM_000059, henholdsvis NM_000059, etterfulgt av SR. cing.
Pasienter som testet negativt for BRCA1/2-genet, ble testet ved multipleks ligeringsavhengig probeamplifikasjon (MLPA) i henhold til produsentens instruksjoner for å vurdere tilstedeværelsen av store genomiske omorganiseringer (LGR). Kort fortalt denatureres DNA-prøver og det brukes opptil 60 BRCA1- og BRCA2-genspesifikke prober, som hver består av en spesifikk DNA-sekvens med en lengde på ca. av PCR-amplikoner, ble deretter analysert ved kapillærelektroforese og med Cofalyser.Net-programvare i forbindelse med passende batchspesifikke Cofalyser-tabeller (www.mrcholland.com).
Utvalgte klinikopatologiske variabler (histologisk grad og Ki-67 % proliferasjonsindeks) var assosiert med tilstedeværelsen av BRCA1/2 PV, beregnet ved bruk av Prism-programvaren v. 8.4 ved bruk av Fishers eksakte test som antok at p-verdi <0,05 var signifikant.
Mellom januar 2017 og mars 2021 ble 455 pasienter screenet for kimlinje-BRCA1/2-mutasjoner. Mutasjonstesting ble utført ved Policlinico Hospital's Center for Experimental Oncology and Hematology.I henhold til den sicilianske retningslinjen (http://www.gurs.regione.sicilia.it/Inndic,N.2010, N.Htm20, N.Htm20, N.I. 020), Rodolico of Catania – San Marco» totalt, 389 pasienter. Det var brystkreft, 37 eggstokkreft, 16 kreft i bukspyttkjertelen, 8 prostatakreft og 5 melanom.Fordelingen av pasienter etter krefttype og analyseresultater er vist i figur 1.
Figur 1 viser et flytskjema som viser en oversikt over studien. Pasienter med bryst-, melanom-, bukspyttkjertel-, prostata- eller eggstokksvulster ble testet for mutasjoner i BRCA1- og BRCA2-genene.
Forkortelser: PVs, patogen variant;VUS, variant av usikker betydning;WT, villtype BRCA1/2-sekvens.
Vi fokuserte selektivt våre studier på brystkreftkohorter. Pasientene hadde en medianalder på 49 år (spredning 23-89) og var hovedsakelig kvinner (n=376, eller 97%).
Av disse forsøkspersonene hadde 64 (17 %) BRCA1/2-mutasjoner og var alle kvinner. Trettifem (9 %) hadde PV og 29 (7,5 %) hadde VUS. Sytten (48,6 %) av de 35 patogene variantene forekom i BRCA1 og 18 (51,4 %) i BRCA2, mens i BRCA 2,21 %) (8 %) forekom i BRCA 2,21 %). (Figur 1 og 2). LGR var ikke til stede i MLPA-analysen.
Figur 2. Analyse av BRCA1- og BRCA2-mutasjoner hos 389 brystkreftpasienter.(A) Fordeling av patogene varianter (PV) (rød), varianter av usikker betydning (VUS) (oransje) og WT (blå) hos 389 brystkreftpasienter;(B) 389 brystkreftpasienter Trettifem (9 %) hadde BRCA1/2 patogene varianter (PVs). Blant dem var 17 (48,6 %) BRCA1 PV-bærere (mørkerød) og 18 (51,4 %) var BRCA2-bærere (lyserød);(C) 29 (7,5 %) av 389 forsøkspersoner bar VUS, 5 (17,2 %) BRCA1-gener (mørk oransje) og 24 (82,8 %) BRCA2-gener (lys oransje).
Forkortelser: PVs, patogen variant;VUS, variant av usikker betydning;WT, villtype BRCA1/2-sekvens.
Vi undersøkte deretter prevalensen av BC molekylære subtyper hos pasienter med BRCA1/2 PV. Fordelingen inkluderte 2 (5,7 %) luminal A, 15 (42,9 %) luminal B, 3 (8,6 %) luminal B-HER2+, 2 (5,7 %) HER2+ og 13 (37,1 %) pasienter med TN-4CA-positive. B BC, 2 (11,8 %) hadde HER2+-sykdom, og 10 (58,8 %) hadde TNBC. Svulster uten BRCA1-mutasjoner var enten luminal A eller luminal B-HER2+ (Figur 3). I den BRCA2-positive undergruppen var 10 (55,6 %) svulster luminale B, 73 %) (TN12, 6 %) (TN12,6 %). BC og 2 (11,1%) var luminal A (Figur 3). Ingen HER2+-svulster var tilstede i denne gruppen. Dermed er BRCA1-mutasjoner utbredt hos TNBC-pasienter, mens BRCA2-endringer er dominerende hos lumen B-individer.
Figur 3 Prevalens av brystkreftsubtyper hos pasienter med patogene varianter i BRCA1 og BRCA2. Histogrammer som viser fordelingen av BRCA1- (mørkerøde) og BRCA2- (lyserøde) PV-er blant molekylære undertyper av brystkreftpasienter. Tallene som er rapportert i hver boks representerer prosentandelen av pasienter med BRCA1- og BRCA2-kreft-PV-subtype for hver subtype.
Forkortelser: PVs, patogen variant;HER2+, human epidermal vekstfaktor reseptor 2 positiv;TNBC, trippel-negativ brystkreft.
Deretter vurderte vi typen og genlokaliseringen til BRCA1- og BRCA2-PV-er. I BRCA1 PV observerte vi 7 enkeltnukleotidvarianter (SNV-er), 6 delesjoner, 3 duplikasjoner og 1 insersjon. Bare én mutasjon (c.5522delG) representerer en ny oppdagelse. Den vanligste BRCA1-delen ble påvist i begge individene. endring involverer en delesjon av fem nukleotider (CTAAT) i BRCA1 ekson 15, noe som resulterer i substitusjon av aminosyren leucin med tyrosin ved kodon 1679, og på grunn av en translasjonsrammeforskyvning med et forutsagt alternativt stoppkodon fører til for tidlig proteintrunkering. Alle andre endringer er rapportert i kun ett tilfelle av conplicets-regionen. c.4357+1G>T) (tabell 1).
Når det gjelder BRCA2 PV, observerte vi 6 delesjoner, 6 SNV-er og 2 dupliseringer. Ingen av endringene som ble funnet er nye. Tre mutasjoner gjentok seg i vår populasjon, c.428dup og c.8487+1G>A observert hos 3 personer, etterfulgt av c.5851_5854 gjentatte tilfeller av C.5851_5854. 5 av BRCA2, spådd å kode for et avkortet, ikke-funksjonelt protein. c.8487+1G>A-mutasjonen forekommer i den introniske regionen til BRCA2 intron 19 (± 1,2) og påvirker spleisingskonsensussekvensen, noe som resulterer i endret spleising som resulterer i unormal eller fraværende 58-58-5AG-protein-patogen-variant til 58-5AG-4AG-4-58. otiddelesjon fra nukleotidposisjonene 5851 til 5854 i det kodende ekson 10 av BRCA2-genet og resulterer i en translasjonsrammeforskyvning med et forutsagt alternativt stoppkodon (p.S1951WfsTer). Spesielt, som tidligere rapportert, involverer begge endringene c.631G>A og c.2A den samme mutasjonen av den samme ad8-700 pasienten påvist. enosin (A) i BRCA2 ekson 7 med et guanin (G)-holdig nukleotid som resulterer i en endring av valin til isoleucin ved kodon 211, isoleucin Aminosyre er en aminosyre med svært like egenskaper. Denne endringen påvirker normal mRNA-spleising. Den andre varianten er lokalisert i en intronisk region og resulterer i en dobbel A til 13-substitusjon av BRCA-genet en thymine. 7008-2A>T endring kan generere flere transkripsjoner av forskjellig lengde. Videre, i gruppen av BRCA2 PV-er, var 4 av 18 endringer (22,2 %) introniske.
Vi kartla deretter BRCA1/2 skadelige mutasjoner i funksjonelle domener og proteinbindende regioner (Fig. 4). I BRCA1-genet var 50 % av PV-er lokalisert i brystkreftklyngeregionen (BCCR), mens 22 % av mutasjonene var lokalisert i eggstokkreftklyngeregionen (OCCR) (Fig. 3 4A var lokalisert i PV-regionen 7 og variant 4A, og i variant 3A). 42,8 % av mutasjonene var lokalisert i OCCR (fig. 4B). Deretter vurderte vi plasseringen av PV innenfor BRCA1- og BRCA2-proteindomenene. For BRCA1-proteinet fant vi tre PV-er i løkken og coiled coil-domenene, og to mutasjoner i BRCT-domenet (fig. 4A-proteinet, i BRC-domenet, i BRC-proteinet, i BRC-proteinet, i BRC-repetisjonen). tronic og 3 eksoniske endringer ble påvist i oligo/oligosakkarid-bindende (OB) og tårn (T) domener (figur 4B).
Figur 4 Skjematisk representasjon av BRCA1- og BRCA2-proteiner og lokalisering av patogene varianter. Denne figuren viser fordelingen av BRCA1 (A) og BRCA2 (B) patogene varianter hos brystkreftpasienter. Eksoniske mutasjoner er vist i blått, mens introniske varianter er vist i oransje. Søylehøyden representerer antall tilfeller. BRCA1- og BRCA1-proteinsløyfene deres er rapporterte a- og BRCA1-proteindominene. i (RING) og en nukleær lokaliseringssekvens (NLS), et coiled-coil-domene, et SQ/TQ-cluster-domene (SCD) og et BRCA1 C-terminalt domene (BRCT).(B) BRCA2-proteinet inneholder åtte BRC-repetisjoner, et DNA-bindende domene med et spiralformet domene (helicalaccle), tre oligonid-oligona-ob-bindende charotide-oligona-ob-bindende (Helical) (T), og en NLS på C-siden. Områder kalt brystkreftklyngeregionen (BCCR) og ovariekreftklyngeregionen (OCCR) er vist nederst.*Representerer mutasjoner som bestemmer stoppkodoner.
Vi undersøkte deretter BC klinikopatologiske trekk som kan korrelere med tilstedeværelsen av BRCA1/2 PV. Komplette kliniske journaler var tilgjengelige for 181 BRCA1/2-negative pasienter (ikke-bærere) og alle bærere (n = 35). Det var en korrelasjon mellom tumorproliferasjonsrate og grad.
Vi beregnet fordelingen av Ki-67 basert på medianen til vår kohort (25 %, område <10-90%). Forsøkspersoner med Ki-67 < 25 % ble definert som "lav Ki-67", mens individer med verdier ≥ 25 % ble ansett som "høy Ki-67". Signifikante Ki-67-forskjeller ble funnet mellom 1 CA-pv og 1 CA-bærer. bærere (fig. 5A).
Figur 5 Korrelasjon av Ki-67 med karakterfordeling hos brystkreftkvinner med og uten BRCA1 og BRCA2 PVs.(A) Boksplott som viser median Ki-67 verdier hos 181 ikke-bærer BC pasienter versus BRCA1 (18) eller BRCA2 (17) PV pasienter. klassegrupper (G2 og G3) i henhold til BRCA1- og BRCA2-mutasjonsstatus (WT-personer, BRCA1- og BRCA2-PV-bærere).
På samme måte undersøkte vi om svulstgrad korrelerte med tilstedeværelsen av BRCA1/2 PV. Siden G1 BC var fraværende i vår populasjon, delte vi pasientene inn i to grupper (G2 eller G3). I samsvar med Ki-67-resultatene avslørte analysen en statistisk signifikant korrelasjon mellom tumorgrad og BRCA1-mutasjon, med en høyere andel av G3-bærere (BRCA-<Fi0-bærere) sammenlignet med (0p)-bærere. e 5B).
Fremskritt innen DNA-sekvenseringsteknologi har muliggjort enestående fremskritt innen BRCA1/2 genetisk testing, med avgjørende implikasjoner for pasienter med en familiehistorie med kreft. Til dags dato har omtrent 20 000 BRCA1/2 varianter blitt identifisert og klassifisert i henhold til American Society of Medical Genetics 35 og ENIGMA 6 BRCA-systemet på tvers av forskjellige geografiske spekter.32, s.37 Innenfor Italia varierte frekvensen av BRCA1/2 PV-er fra 8 % til 37 %, noe som viser stor variasjon mellom landene.38,39 Med en befolkning på nesten 5 millioner er Sicilia den femte største regionen i Italia når det gjelder antall innbyggere. Selv om det finnes data om fordelingen av BRCA1/2 i den vestlige delen av den vestlige delen av landet, er det ingen omfattende bevis i den vestlige delen.
Vår studie er en av de første rapportene om forekomsten av BRCA1/2 PV hos BC-pasienter i østlige Sicilia.28 Vi fokuserte vår analyse på BC, siden dette er den desidert vanligste sykdommen i vår kohort.
Ved testing av 389 BC-pasienter bar 9 % BRCA1/2 PV-er, jevnt fordelt mellom BRCA1 og BRCA2. Disse resultatene samsvarer med de som tidligere er rapportert i den italienske befolkningen.28 Interessant nok var 3 % (13/389) av vår kohort menn. Denne frekvensen er høyere enn forventet for mannlig brystkreft (1 % av alle populasjoner med mutasjon basert på BRCA) (1 % av alle populasjoner med mutasjon av BRCA) (1 % av populasjonen vår med mutasjon). , utviklet ingen av disse mennene en BRCA1/2 PV, så de var kandidater for videre molekylær analyse for å utelukke tilstedeværelsen av mindre vanlige mutasjoner som blant annet PALB2, RAD51C og D. Varianter av usikker betydning ble hentet hos 7 % av forsøkspersonene der BRCA2 VUS var tydelig.
Da vi analyserte fordelingen av BC molekylære subtyper i BRCA1/2 mutante kvinner, bekreftet vi kjente assosiasjoner mellom TNBC og BRCA1 PV (58,8%) og mellom luminal B BC og BRCA2 PV (55,6%).
Vi fokuserer deretter på typen og plasseringen av BRCA1/2 PV. I vår kohort var den vanligste BRCA1 PV c.5035_5039delCTAAT. Selv om Incorvaia et al.beskrev ikke denne varianten i sin sicilianske kohort, andre forfattere har rapportert den som en kimlinje BRCA1 PV.34 Flere BRCA1 PV-er ble funnet i vår kohort – f.eks. c.181T>G, c.514del, c.3253dupA og c.5266dupC – som har blitt observert i disse to og c.5266dupC – som har blitt observert i disse to og c.18 BRc28 av c. .5266dupC) er ofte funnet hos ashkenazi-jøder i Øst- og Sentral-Europa (Polen, tsjekkiske), slovenske, østerrikske, ungarske, hviterussiske og tyske ), 44,45 og, i USA og Argentina, ble nylig definert som en "tilbakevendende kimlinjevariant" hos italienske pasienter med BC og OC-varianten fra BC og OC5434c. i Palermo og Messina. Interessant nok, selv Incorvaia et al.fant c.3253dupA-varianten i noen familier i Catania.28 De mest representative BRCA2-PV-ene er c.428dup, c.5851_5854delAGTT og intron-varianten c.8487+1G>A, som er rapportert mer detaljert 28 hos en pasient i Palermo med c.428dup-in-hus, c.428d. nordvestlige Sicilia, hovedsakelig i Trapani- og Palermo-regionene, mens c.5851_5854delAGTT PV ble observert i husholdninger i det nordvestlige Sicilia. 8487+1G>A-varianten var mer vanlig hos personer fra Messina, Palermo og Caltanissetta.28 Rebbeck et al.tidligere beskrevet c.5851_5854delAGTT-endringen i Colombia.37 En annen BRCA2 PV, c.631+1G>A, er funnet hos BC- og OC-pasienter fra Sicilia (Agrigento, Siracusa og Ragusa).28 Spesielt observerte vi sameksistensen av to BRCA2-varianter i den samme pasienten. som vi antok å være segregert i cis-modus, som tidligere rapportert slik.34,46 Disse BRCA2 uble-mutasjonene er faktisk ofte observert i den italienske regionen og har vist seg å introdusere premature stoppkodoner, som påvirker messenger-RNA-spleising og forårsaker at BRCA2-proteinet mislykkes.47,48
Vi kartla også BRCA1- og BRCA2-PV-er i antatte OCCR- og BCCR-regioner av proteindomener og gener. Disse regionene ble beskrevet av Rebbeck et al.som risikoområder for å utvikle henholdsvis eggstokkreft og brystkreft.49 Imidlertid er bevisene angående sammenhengen mellom plasseringen av kimlinjevarianter og risiko for bryst- eller eggstokkreft fortsatt kontroversiell.28,50-52 I vår befolkning var BRCA1 PV-er hovedsakelig lokalisert i BCCR-regionen, mens BRCA2 PV-er var lokalisert i de fleste, men det var ikke mulig å finne assosiasjoner i de fleste til OCCR-regioner. OCCR- og BCCR-regioner og BC-funksjoner. Dette kan skyldes det begrensede antallet pasienter med BRCA1/2-mutasjoner. Fra et proteindomeneperspektiv er BRCA1-PV-er fordelt langs hele proteinet, og BRCA2-endringer finnes fortrinnsvis i BRC-repetisjonsdomenet.
Til slutt korrelerte vi BC klinikopatologiske trekk med BRCA1/2 PV. På grunn av det begrensede antallet pasienter som ble inkludert, fant vi bare en signifikant korrelasjon mellom Ki-67 og tumorgrad. Selv om vurderingen og tolkningen av Ki-67 fortsatt er noe kontroversiell, er det sikkert at høye proliferative rater er assosiert med økt risiko for tilbakefall av sykdommen og reduksjon av sykdomsoverlevelse og reduksjon av sykdomsoverlevelse og reduksjon av sykdommen. lav” Ki-67 er 20%. Denne terskelen gjelder imidlertid ikke for vår BRCA1/2-mutasjonspasientpopulasjon, som har en median Ki-67-verdi på 25%.Denne trenden i høye Ki-67-rater kan forklares av prevalensen i våre luminale B- og TNBC-kohorter, hvorav få luminale A-svulster tyder på at en høyere Ki-67-svulster var tilstede (men noen høyere Ki-60-svulster var til stede). stratifiser pasienter i henhold til deres prognose.53,54 Fra resultatene av vår analyse er en signifikant korrelasjon ikke overraskende.Forekommer mellom høy Ki-67 og karakterer og tilstedeværelsen av BRCA1 PV. Faktisk er BRCA1-relaterte svulster typiske for TNBC og viser mer aggressive egenskaper.16,17
Som konklusjon gir denne studien en rapport om mutasjonsstatusen til BRCA1/2 i en BC-kohort fra det østlige Sicilia. Samlet sett er funnene våre i samsvar med eksisterende bevis, både når det gjelder mutasjonsprevalens og klinikopatologiske trekk i BC. Flere studier i større populasjoner av BRCA1/2-mutante BC-pasienter, for eksempel bruk av multigenomer, er tilstedeværelsen av mutasjonsanalyser og mindre PV-analyse nødvendig. hyppigere enn BRCA1/2. Dette vil tillate identifisering og riktig behandling av det økende antallet personer med økt risiko for kreft på grunn av genetiske mutasjoner.
Vi bekreftet at pasienter signerte informert samtykke til å frigi tumorprøvene sine anonymt for forskningsformål. Alle pasienter signerte skriftlig informert samtykke i henhold til Helsinki-erklæringen. I henhold til policyen til AOU Policlinico “G.Rodolico – S.Marco”, ble denne studien unntatt fra etisk gjennomgang fordi BRCA1/2-analysen ble utført i henhold til pasientenes skriftlige informerte bruksdata og ga også samtykke fra pasientene deres til bruk av pasientenes informerte formål for forskning. .
Vi takker Prof. Paolo Vigneri for hans hjelp i omsorgen for brystkreftpasienter som anmodet av Etikkkomiteen.
Federica Martorana rapporterer honoraria fra Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. De andre forfatterne erklærer ingen interessekonflikter i dette arbeidet.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al.Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN estimerer forekomsten og dødeligheten av 36 krefttilfeller i 185 land rundt om i verden.CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.doi: 21603.32: 1603.32.


Innleggstid: 15. april 2022