Analiza e mutacionit të gjeneve BRCA1/BRCA2 në kancerin e gjirit

Javascript është aktualisht i çaktivizuar në shfletuesin tuaj. Disa veçori të kësaj faqeje interneti nuk do të funksionojnë kur Javascript është i çaktivizuar.
Regjistrohuni me detajet tuaja specifike dhe ilaçin specifik me interes dhe ne do t'i përputhim informacionet që ju jepni me artikujt në bazën tonë të të dhënave të gjerë dhe do t'ju dërgojmë menjëherë një kopje PDF.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6 nga Departamenti i Lidhjes, 6 Marco Fichera, Exp. ine, University of Catania, Catania, 95123, Itali;2 Qendra për Onkologji dhe Hematologji Eksperimentale, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania , 95123, Itali;3 Onkologji Mjekësore, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Itali;4 Mjekësore Gjenetika, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Itali;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Italy;6 Departamenti i Shkencave Biomjekësore dhe Bioteknologjisë, Universiteti i Katanias, Gjenetika Mjekësore, Catania, Itali, 95123;7 Instituti i Kërkimeve Oasi-IRCCS, Troina, 94018, Itali Komunikimet: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, email [email protected];[email protected] Qëllimi: Mutacionet e brezit në BRCA1 dhe BRCA2 dhe kanceri i vendosur i gjirit (BC), i vezores (OC) dhe të tjera të lidhura me rrezikun e kancerit gjatë gjithë jetës. Testimi për gjenin BRCA është çelësi për vlerësimin e rrezikut individual, si dhe për gjetjen e metodave parandaluese në transportuesit e shëndetshëm dhe përshtatjen e trajtimeve në të gjithë rajonet e ndryshme të kancerit, BRCA1 më gjerësisht. dhe megjithëse ekzistojnë të dhëna për variantet patogjene BRCA në familjet siciliane, mungojnë studimet që synojnë posaçërisht popullatat në Sicilinë lindore. Qëllimi i studimit tonë ishte të hetonte incidencën dhe shpërndarjen e ndryshimeve të linjës germinale patogjene BRCA në një grup pacientësh BC nga Sicilia lindore dhe të vlerësonte lidhjen e tyre me tipare specifike të BC-së, duke përdorur prezencën e shkallës së indeksimit të brezit tjetër dhe RES. ULTS: Në përgjithësi, 35 pacientë (9%) kishin një variant patogjen BRCA, 17 (49%) në BRCA1 dhe 18 (51%) në BRCA2. BRCA1 ndryshimet janë të përhapura në pacientët BC me tre negativitet, ndërsa mutacionet BRCA2 janë më të shpeshta në pacientët luminal BC. Krahasuar me pacientë të shkallës më të lartë të tumorit BRCA dhe indeks më të lartë. Përfundimet: Gjetjet tona ofrojnë një pasqyrë të statusit mutacional BRCA në pacientët BC nga Sicilia lindore dhe konfirmojnë rolin e analizës NGS në identifikimin e pacientëve me BC trashëgimore. Në përgjithësi, këto të dhëna janë në përputhje me provat e mëparshme që mbështesin shqyrtimin BRCA për parandalimin dhe trajtimin e duhur të kancerit në bartësit e mutacioneve.
Kanceri i gjirit (BC) është kanceri malinj më i zakonshëm në mbarë botën dhe kanceri më vdekjeprurës te femrat.1 Karakteristikat biologjike që përcaktojnë prognozën e BC dhe sjelljen klinike janë studiuar gjerësisht dhe janë sqaruar pjesërisht me kalimin e kohës. Në fakt, disa shënues zëvendësues përdoren aktualisht për të klasifikuar BC në nëntipe të ndryshme molekulare. Ata janë estrogjeni (ER2 receptor ose receptor i rritjes njerëzore). HER2) amplifikimi, indeksi i përhapjes Ki-67 dhe shkalla e tumorit (G).2 Kombinimi i këtyre variablave identifikoi kategoritë e mëposhtme BC: 1) Tumoret luminale, që tregojnë shprehjen e ER dhe/ose PgR, përbënin 75% të BC-ve. % dhe në prani të amplifikimit HER2, pavarësisht nga indeksi i përhapjes;2) Tumoret HER2+ që janë ER dhe PgR negative, por tregojnë përforcim HER2. Ky grup përbën 10% të të gjithë tumoreve të gjirit;3) Kanceri i gjirit trefish negativ (TNBC), i cili nuk tregon shprehje ER dhe PgR dhe amplifikimin HER2, përbën rreth 15% të kancereve të gjirit.2-4
Midis këtyre nëntipave BC, shkalla e tumorit dhe indeksi i përhapjes përfaqësojnë biomarkues ndër-seksional që lidhen drejtpërdrejt dhe në mënyrë të pavarur me agresivitetin dhe prognozën e tumorit.5,6
Përveç veçorive biologjike të lartpërmendura, roli i ndryshimeve gjenetike të trashëguara që çojnë në zhvillimin e BC është bërë gjithnjë e më i rëndësishëm gjatë viteve të fundit.7 Rreth 1 në 10 tumore të gjirit trashëgohen për shkak të ndryshimeve të linjës germinale në gjene specifike. BRCA2, CHK2, PALB2, RAD51C dhe RAD51D) kryesisht përgjegjës për BC trashëgimore. Midis këtyre gjeneve, BRCA1 dhe BRCA2 (në tekstin e mëtejmë BRCA1/2) treguan korrelacionin më të fortë me zhvillimin e tumoreve të gjirit. duke përfshirë vezoret, prostatën, pankreasin, kolorektalin dhe melanomën. Nga mosha 13 deri në 80 vjeç, incidenca kumulative e BC është 72% në gratë me një variant patogjen BRCA1 (PV) dhe 69% në gratë me një BRCA2 PV.14
Veçanërisht, një publikim i kohëve të fundit sugjeron se rreziku i BC varet nga lloji i PV. Në fakt, krahasuar me variantet e shkurtuara patogjene, variantet e paqarta të gabuara, veçanërisht në gjenin BRCA1, shoqërohen me një rrezik të reduktuar të BC, veçanërisht në gratë e moshuara.15
Prania e BRCA1 ose BRCA2 PV u shoqërua me karakteristika të ndryshme biologjike dhe klinikopatologjike. 16,17 BC-të e lidhura me BRCA1 priren të jenë klinikisht agresive, të diferencuara dobët dhe shumë proliferative. Indekset e aftë proliferative. Këto tumore janë më të zakonshme në lumenin B dhe zakonisht ndodhin tek të rriturit më të moshuar.16-18 Veçanërisht, mutacionet në BRCA1 dhe BRCA2 rrisin ndjeshmërinë ndaj trajtimeve specifike, duke përfshirë kripërat e platinit dhe barnat e synuara si frenuesit e polimerazës poli(ADP-ribozë) (PARPi).19,20.
Gjatë viteve të fundit, zbatimi i sekuencës së gjeneratës së ardhshme (NGS) në praktikën klinike ka mundësuar një numër në rritje pacientësh BC që t'i nënshtrohen testeve molekulare për sindromat e ndjeshmërisë ndaj kancerit, duke përfshirë BRCA1/2.21 Në të njëjtën kohë, përkufizimet e bazuara në kritere të sakta në lidhje me historinë familjare, demografike dhe klinikopatologjike2, ia vlen të identifikohen karakteristikat më të mira të këtij konteksti2BRCA2 për të identifikuar karakteristikat më të mira të këtij BRCA2. duke u mbështetur në shqyrtimin BRCA1/2 në popullata specifike, duke theksuar dallimet në të gjithë rajonet gjeografike.24-27 Edhe pse ka raporte për grupin BC në Sicilinë perëndimore, më pak të dhëna janë të disponueshme për shqyrtimin BRCA1/2 në popullsinë e Siçilisë lindore.28,29
Ne përshkruajmë këtu rezultatet e ekzaminimit të linjës germinale BRCA1/2 në pacientët BC nga Sicilia lindore, duke lidhur më tej praninë e mutacioneve BRCA1 ose BRCA2 me tiparet kryesore klinikopatologjike të këtyre tumoreve.
Ky studim retrospektiv u krye në "Qendrën për Onkologjinë Eksperimentale dhe Hematologjinë" në Spitalin Policlinico. Rodolico – San Marco në Catania. Nga janari 2017 deri në mars 2021, gjithsej 455 pacientë me gji dhe vezore, melanoma, testi i pankreasit ose kancerit të prostatës diagnostifikuar CA2 u referuan në laboratorin tonë diagnozë të kancerit të prostatës. u krye në përputhje me Deklaratën e Helsinkit, dhe të gjithë pjesëmarrësit dhanë pëlqimin me shkrim të informuar përpara analizës molekulare.
Karakteristikat histologjike dhe biologjike (ER, PgR, HER2 statusi, Ki-67, dhe shkalla) e BC u vlerësuan në biopsi bërthamore ose mostra kirurgjikale, duke marrë parasysh vetëm komponentët agresivë të tumorit. Bazuar në këto karakteristika, BC-të u klasifikuan si më poshtë: luminale A (ER+ dhe/ose PgR+, HER2-, Ki-Rg%), HER2-, Ki-Rg, 6<7 Ki-67≥20%), B-HER2+ luminal (ER dhe/ose PgR+, HER2+), HER2+ (ER dhe PgR-, HER2+) ose negativ i trefishtë (ER dhe PgR-, HER2-).
Përpara vlerësimit të statusit të mutacionit BRCA1 dhe BRCA2, një ekip multidisiplinar duke përfshirë një onkolog, një gjenetist dhe një psikolog kryen një konsultë gjenetike të tumorit për çdo pacient për të përcaktuar praninë e BRCA1 dhe/ose BRCA1.ose individët me rrezik të lartë të PV në gjenin BRCA2. Përzgjedhja e pacientit u krye sipas udhëzimeve të Shoqatës Italiane të Onkologjisë Mjekësore (AIOM) dhe rekomandimeve lokale siçiliane.30,31 Këto kritere përfshijnë: (i) histori familjare të varianteve të njohura patogjene në gjenet e ndjeshmërisë (p.sh., BRCA1, BRCA2, ENTP53,);(ii) meshkuj me BC;(iii) ato me BC dhe OC;(iv) gratë me BC <36 vjeç, TNBC <60 vjeç, ose BC dypalësh <50 vjeç;(v) historia personale mjekësore e BC <50 vjet dhe të paktën një i afërm i shkallës së parë: (a) BC < 50 vjet;(b) OC jo mucinoze dhe jokufitare e çdo moshe;(c) BC dypalëshe;(d) mashkull BC;(e) kanceri i pankreasit;(f) kanceri i prostatës;(vi) dy ose më shumë histori personale të BC > 50 vjet dhe histori familjare e BC, OC ose kancer pankreatik për të afërmit që janë të afërm të shkallës së parë me njëri-tjetrin (përfshirë të afërmit me të cilët ajo është e afërm i shkallës së parë);(vii) Historia personale e OC dhe të paktën një i afërm i shkallës së parë: (a) BC <50 vjet;(b) NOC;(c) BC dypalëshe;(d) mashkull BC;(vii) femër me OC seroze të shkallës së lartë.
Një kampion gjaku periferik prej 20 mL u mor nga secili pacient dhe u mblodh në tubat EDTA (BD Biosciences). ADN gjenomike u izolua nga 0.7 ml mostra të gjakut të plotë duke përdorur paketën e izolimit të ADN-së Midi QIAsymphony (QIAGEN, Hilden, Itali) sipas udhëzimeve të prodhuesit. , MA, SHBA) Kryeni kuantifikimin.Pasurimi i objektivit dhe përgatitja e bibliotekës kryhen nga kuzhinieri i analizës së kërkimit të Oncomine™ BRCA, gati për t'u ngarkuar në Kompletin Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 për përgatitjen e automatizuar të bibliotekës sipas udhëzimeve të prodhuesit. Kompleti përbëhet nga dy grupe primerësh të shumëfishtë PCR. që mund të përdoren për të studiuar të gjithë BRENDA 059.3) gjenet. Shkurtimisht, 15 µL të secilës mostër të holluar ADN (10 ng) u shtuan në pllakat me barkod për përgatitjen e bibliotekës dhe të gjithë reagentët dhe materialet harxhuese u ngarkuan në instrumentin Ion Chef™. Përgatitja e automatizuar e bibliotekës dhe grumbullimi i bibliotekës së mostrës me barkod u përgatit më pas në instrumentin me numër 3 të Chef™. (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA) sipas udhëzimeve të prodhuesit. Më në fund, bibliotekat kombinohen në raporte ekuimolarë në tubacionet e mostrës së bibliotekës Ion Chef™ (tuba me barkod) dhe ngarkohen në instrumentin Ion Chef™. Sekuenca u krye duke përdorur një Torrent Jon S5 (Instrumentet Thermo Chif™ 1rp) mo Fisher Scientific).Analiza e të dhënave është kryer nga Amplicon Suite (SmartSeq srl) dhe Ion Reporter Software.
E gjithë nomenklatura e varianteve ndoqi udhëzimet aktuale të Konsorciumit të Variacioneve të Gjenomit Njerëzor, i disponueshëm në internet (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Rëndësia klinike e varianteve BRCA1/2 u përcaktua duke përdorur klasifikimin e Konsorciumit Ndërkombëtar ENIGMA (Rrjeti i bazuar në dëshmi për interpretimin e të dhënave të ndryshme të Germlines. të tilla si ARUP, BRCAEXCHANGE, ClinVar, IARC_LOVD dhe UMD. Klasifikimi përfshin pesë kategori të dallueshme rreziku: beninje (kategoria I), me gjasë beninje (kategoria II), varianti me domethënie të pasigurt (VUS, kategoria III), ka gjasa patogjene (kategoria IV), me efekt të analizuar të proteinës me një funksion të kategorisë IV, dhe patogjene (efekti i analizuar me funksionin V të kategorisë V). akses në 30 baza të të dhënave.32
Për t'i caktuar rëndësinë e mundshme klinike çdo VUS, u përdorën algoritmet e mëposhtme llogaritëse të parashikimit të proteinave: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu.http://pph2.VhvhvD) dhe Algoritme gd_input.php).Variantet e klasifikuara si klasa 1 dhe 2 konsideroheshin tip i egër.
Sekuenca e Sanger konfirmoi praninë e secilit variant patogjen. Shkurtimisht, një palë primerësh specifikë u krijua për secilin variant të zbuluar duke përdorur sekuencat e referencës së gjenit BRCA1 dhe BRCA2 (NG_005905.2, NM_007294.3 dhe NG_012772.3, respektivisht, u ndoq nga objektivi P12772.3,0509. Sekuenca e Sanger.
Pacientët që rezultuan negativë për gjenin BRCA1/2 u testuan me amplifikimin e sondës së varur nga lidhja e shumëfishtë (MLPA) sipas udhëzimeve të prodhuesit për të vlerësuar praninë e rirregullimeve të mëdha gjenomike (LGR). Shkurtimisht, mostrat e ADN-së janë denatyruar dhe deri në 60 BRCA1 dhe BRCA2 përdoren përafërsisht në gjatësinë e secilës gjen dhe BRCA2. Produktet e amplifikimit, të përbërë nga një grup unik amplikonësh PCR, u analizuan më pas me elektroforezë kapilar dhe nga softueri Cofalyser.Net në lidhje me tabelat e duhura të Cofalyser specifike të grupit (www.mrcholland.com).
Variablat e zgjedhur klinikopatologjikë (shkalla histologjike dhe indeksi i proliferimit Ki-67%) u shoqëruan me praninë e BRCA1/2 PV, të llogaritur duke përdorur softuerin Prism v. 8.4 duke përdorur testin e saktë të Fisher duke supozuar se vlera p <0.05 është sinjifikative.
Midis janarit 2017 dhe marsit 2021, 455 pacientë u ekzaminuan për mutacione të linjës germinale BRCA1/2. Testimi i mutacioneve u krye në Qendrën e Spitalit Policlinico për Onkologjinë Eksperimentale dhe Hematologjinë. Sipas udhëzuesit Sicilian (http://www.gurs.regione.It. 0 Gennaio 2020), Rodolico of Catania – San Marco” në përgjithësi, 389 pacientë Kishte kancer gjiri, 37 kancer ovarian, 16 kancer pankreatik, 8 kancer prostate dhe 5 melanoma.Shpërndarja e pacientëve sipas llojit të kancerit dhe rezultateve të analizës është paraqitur në Figurën 1.
Figura 1 tregon një grafik rrjedhës që tregon një përmbledhje të studimit. Pacientët me tumore të gjirit, melanoma, pankreatik, prostatë ose ovarian u testuan për mutacione në gjenet BRCA1 dhe BRCA2.
Shkurtesat: PV, variant patogjen;VUS, variant me rëndësi të pasigurt;WT, sekuenca BRCA1/2 e tipit të egër.
Ne i fokusuam në mënyrë selektive studimet tona në grupet e kancerit të gjirit. Pacientët kishin një moshë mesatare 49 vjeç (varg 23-89) dhe ishin kryesisht femra (n=376, ose 97%).
Nga këta subjekte, 64 (17%) kishin mutacione BRCA1/2 dhe ishin të gjitha femra. Tridhjetë e pesë (9%) kishin PV dhe 29 (7.5%) kishin VUS. Shtatëmbëdhjetë (48.6%) nga 35 variantet patogjene u shfaqën në BRCA1 dhe 18 (51.4%) në BRCA1 dhe 2.8% (2.4%) në BRCAUS2, ndërsa 2.4 (2.4%) në BRCAUS2, ndërsa 29 (7.5%) kishin VUS. %) në BRCA2 (Figurat 1 dhe 2). LGR nuk ishte i pranishëm në analizën MLPA.
Figura 2. Analiza e mutacioneve BRCA1 dhe BRCA2 në 389 pacientë me kancer të gjirit.(B) 389 pacientë me kancer gjiri Tridhjetë e pesë (9%) kishin variante patogjene BRCA1/2 (PV). Midis tyre, 17 (48.6%) ishin mbartës të BRCA1 PV (e kuqe e errët) dhe 18 (51.4%) ishin mbartës të BRCA2 (e kuqe e lehtë);(C) 29 (7.5%) nga 389 subjekte mbanin gjene VUS, 5 (17.2%) gjenet BRCA1 (portokalli e errët) dhe 24 (82.8%) gjene BRCA2 (portokalli e lehtë).
Shkurtesat: PV, variant patogjen;VUS, variant me rëndësi të pasigurt;WT, sekuenca BRCA1/2 e tipit të egër.
Më pas hetuam prevalencën e nëntipave molekulare BC në pacientët me BRCA1/2 PV. Shpërndarja përfshinte 2 (5.7%) pacientë luminal A, 15 (42.9%) luminal B, 3 (8.6%) luminal B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+, 13 (37.1%) pacientë me luminalitet (37.1%) (37.1%) luminal. kishte lumin B BC, 2 (11.8%) kishin sëmundje HER2+ dhe 10 (58.8%) kishin TNBC. Tumoret pa mutacione BRCA1 ishin ose luminal A ose luminal B-HER2+ (Figura 3). Në nëngrupin BRCA2-pozitiv, 10 (55.6%) tumore luminale .2.2,3H ishin3 16.7%) TNBC dhe 2 (11.1%) ishin luminale A (Figura 3). Në këtë grup nuk kishte tumore HER2+. Kështu, mutacionet BRCA1 janë të përhapura në pacientët TNBC, ndërsa ndryshimet BRCA2 janë mbizotëruese në individët e lumenit B.
Figura 3 Prevalenca e nëntipave të kancerit të gjirit në pacientët me variante patogjene në BRCA1 dhe BRCA2. Histogramet që tregojnë shpërndarjen e PV-ve BRCA1- (e kuqe e errët) dhe BRCA2- (e kuqe e lehtë) midis nënllojeve molekulare të pacientëve me kancer të gjirit. Numrat e raportuar brenda çdo kutie përfaqësojnë përqindjen e pacientëve me kancer të gjirit BR2CAV.
Shkurtesat: PV, variant patogjen;HER2+, receptori 2 i faktorit të rritjes epidermale të njeriut pozitiv;TNBC, kanceri i gjirit trefish negativ.
Më pas, ne vlerësuam llojin dhe lokalizimin e gjeneve të BRCA1 dhe BRCA2 PV. Në BRCA1 PV, ne vëzhguam 7 variante të vetme nukleotide (SNVs), 6 fshirje, 3 dublikime dhe 1 futje. Vetëm një mutacion (c.5522delG) përfaqëson një subjekt më të zakonshëm të zbuluar në PV50. 039delCTAAT. Ky ndryshim përfshin një fshirje të pesë nukleotideve (CTAAT) në BRCA1 exon 15, duke rezultuar në zëvendësimin e aminoacidit leucinë nga tirozina në kodonin 1679 dhe për shkak të një ndryshimi të kornizës së përkthimit me një kodon ndalues ​​alternativ të parashikuar, nuk u raportua se ndryshimet e parakohshme të një proteine ​​nuk u zbuluan vetëm në një rast tjetër. rajoni konsensus i vendndodhjes së bashkimit (c.4357+1G>T) (Tabela 1).
Në lidhje me BRCA2 PV, ne vëzhguam 6 fshirje, 6 SNV dhe 2 dublikime. Asnjë nga ndryshimet e gjetura nuk është i ri. Tre mutacione u përsëritën në popullatën tonë, c.428dup dhe c.8487+1G>A të vërejtura në 3 subjekte, të ndjekura nga c.5851 c. i C në ekzonin 5 të BRCA2, parashikohet të kodojë një proteinë të cunguar, jofunksionale. Mutacioni c.8487+1G>A ndodh në rajonin intronik të BRCA2 intronit 19 (± 1,2) dhe ndikon në sekuencën e konsensusit të bashkimit, duke rezultuar në ndryshimin e sekuencës së konsensusit të lidhjes. Varianti patogjen TT është për shkak të një fshirjeje 4-nukleotidike nga pozicionet nukleotide 5851 deri në 5854 në ekzonin kodues 10 të gjenit BRCA2 dhe rezulton në një zhvendosje të kornizës translative me një kodon ndalues ​​alternativ të parashikuar (p.S1951WfsTer). Veçanërisht, siç u raportuan më parë al31ter c-06 dhe al-2G>06. në të njëjtin pacient.34 Mutacioni i parë përfshin zëvendësimin e adenozinës (A) në eksonin 7 BRCA2 me një guaninë (G) që përmban nukleotid që rezulton në një ndryshim të valinës në izoleucinë në kodonin 211, izoleucina Aminoacidi është një aminoacid me veti shumë të ngjashme. Ky ndryshim ndikon në rezultatet normale të një ARNT të dyfishtë në një sferë variante. zëvendësimi përpara ekzonit 13 të gjenit që kodon BRCA2. Ndryshimi c.7008-2A>T mund të gjenerojë transkriptime të shumta me gjatësi të ndryshme. Për më tepër, në grupin e PV-ve BRCA2, 4 nga 18 ndryshime (22.2%) ishin intronike.
Më pas ne hartuam mutacionet e dëmshme BRCA1/2 në domenet funksionale dhe rajonet e lidhjes së proteinave (Fig. 4). Në gjenin BRCA1, 50% e PV-ve ishin të vendosura në rajonin e grupit të kancerit të gjirit (BCCR), ndërsa 22% e mutacioneve ishin të vendosura në rajonin e grupit të kancerit ovarian (OCCR) (In the BRCA2% variant). Rajoni BCCR dhe 42.8% e mutacioneve u lokalizuan në OCCR (Fig. 4B). Më pas, ne vlerësuam vendndodhjen e PV brenda domeneve të proteinave BRCA1 dhe BRCA2. Për proteinën BRCA1, gjetëm tre PV në domenet e unazës dhe spirales së mbështjellë dhe dy mutacione në domenin BRCA2, dhe dy mutacione në domenin BRCA2. 3 ndryshime intronike dhe 3 ekzonike u zbuluan në domenet e lidhjes oligo/oligosakaride (OB) dhe tower (T) (Figura 4B).
Figura 4 Paraqitja skematike e proteinave BRCA1 dhe BRCA2 dhe lokalizimi i varianteve patogjene. Kjo figurë tregon shpërndarjen e varianteve patogjene BRCA1 (A) dhe BRCA2 (B) në pacientët me kancer të gjirit. Mutacionet ekzonike tregohen me ngjyrë blu, ndërsa variantet intronike tregohen në portokalli. Lartësia e shiritit përfaqëson numrin e proteinave BRCA2 dhe rastet e tyre (proteina BRCA2). Proteina BRCA1 përmban një domen lak (RING) dhe një sekuencë lokalizimi bërthamor (NLS), një domen me mbështjellje të mbështjellur, një domen grupor SQ/TQ (SCD) dhe një domen C-terminal BRCA1 (BRCT). një domen kullë (T) dhe një NLS në anën C. Zonat e quajtura Rajoni i grupit të kancerit të gjirit (BCCR) dhe Rajoni i grupit të kancerit ovarian (OCCR) janë paraqitur në fund.*Përfaqëson mutacione që përcaktojnë kodonet e ndalimit.
Më pas hetuam tiparet klinikopatologjike të BC që mund të lidhen me praninë e BRCA1/2 PV. Të dhëna të plota klinike ishin të disponueshme për 181 pacientë BRCA1/2-negativë (jo mbartës) dhe të gjithë transportuesit (n = 35). Kishte një korrelacion midis shkallës së përhapjes së tumorit dhe shkallës.
Ne llogaritëm shpërndarjen e Ki-67 bazuar në mesataren e grupit tonë (25%, diapazoni <10-90%). Subjektet me Ki-67 < 25% u përcaktuan si "Ki-67 i ulët", ndërsa individët me vlera ≥ 25% u konsideruan "Ki-67 të lartë". riers (Fig. 5A).
Figura 5 Korrelacioni i Ki-67 me shpërndarjen e shkallës në gratë e kancerit të gjirit me dhe pa PV BRCA1 dhe BRCA2. (A) Boxplot që tregon vlerat mesatare të Ki-67 në 181 pacientë BC jo mbartës kundrejt BRCA1 (18) ose BRCA2 (17) pacientët PV. PV. Pacientët me kancer BC në grupet e shkallës histologjike (G2 dhe G3) sipas statusit të mutacionit BRCA1 dhe BRCA2 (subjektet WT, mbartës të PV BRCA1 dhe BRCA2).
Po kështu, ne ekzaminuam nëse grada e tumorit lidhej me praninë e BRCA1/2 PV. Meqenëse G1 BC mungonte në popullatën tonë, ne i ndamë pacientët në dy grupe (G2 ose G3). Në përputhje me rezultatet e Ki-67, analiza zbuloi një korrelacion statistikisht të rëndësishëm midis shkallës së tumorit dhe mutacionit BRCA1 jo më të lartë në proporcion BRCA-carri. 005) (Figura 5B).
Përparimet në teknologjinë e sekuencës së ADN-së kanë mundësuar përparime të paprecedentë në testimin gjenetik BRCA1/2, me implikime vendimtare për pacientët me një histori familjare të kancerit. Deri më sot, rreth 20.000 variante BRCA1/2 janë identifikuar dhe klasifikuar sipas Shoqërisë Amerikane të Gjenetikës Mjekësore. rumi ndryshon gjerësisht në rajonet gjeografike.37 Brenda Italisë, shkalla e PV-ve BRCA1/2 varionte nga 8% në 37%, duke treguar ndryshueshmëri të gjerë brenda vendit.38,39 Me një popullsi prej gati 5 milionë banorësh, Siçilia është rajoni i pestë më i madh në Itali për sa i përket numrit të banorëve. Edhe pse nuk ka të dhëna të ndara në BRCA1. pjesa lindore e ishullit.
Studimi ynë është një nga raportet e para mbi incidencën e BRCA1/2 PV në pacientët BC në Sicilinë lindore.28 Ne e fokusuam analizën tonë në BC, pasi kjo është deri tani sëmundja më e zakonshme në grupin tonë.
Gjatë testimit të 389 pacientëve para Krishtit, 9% mbanin PV BRCA1/2, të shpërndara në mënyrë të barabartë midis BRCA1 dhe BRCA2. Këto rezultate janë në përputhje me ato të raportuara më parë në popullatën italiane.28 Interesante, 3% (13/389) e grupit tonë ishin meshkuj. Kjo normë është më e lartë se sa pritej për të gjithë kancerin e gjirit të meshkujve BRCA1 (4% e përzgjedhjes sonë BC1) Rreziku i mutacionit. Megjithatë, asnjë nga këta burra nuk zhvilloi një PV BRCA1/2, kështu që ata ishin kandidatë për analiza të mëtejshme molekulare për të përjashtuar praninë e mutacioneve më pak të zakonshme si PALB2, RAD51C dhe D, ndër të tjera. Variantet me rëndësi të pasigurt u gjetën në 7% të subjekteve në të cilat BRCA2 Evidenca 28 ishte evidente.
Kur analizuam shpërndarjen e nëntipave molekulare BC në gratë mutante BRCA1/2, konfirmuam lidhje të njohura midis TNBC dhe BRCA1 PV (58.8%) dhe midis luminal B BC dhe BRCA2 PV (55.6%).
Më pas fokusohemi në llojin dhe vendndodhjen e PV BRCA1/2. Në grupin tonë, PV BRCA1 më e zakonshme ishte c.5035_5039delCTAAT.Edhe pse Incorvaia et al.nuk e përshkruan këtë variant në grupin e tyre sicilian, autorë të tjerë e kanë raportuar atë si një linjë germinale BRCA1 PV.34 Disa BRCA1 PV u gjetën në grupin tonë - p.sh. c.181T>G, c.514del, c.3253dupA dhe c.5266dupC - të cilat janë vërejtur dy. G dhe c.5266dupC) gjenden zakonisht te hebrenjtë Ashkenazi të Evropës Lindore dhe Qendrore (Poloni, Çeke), sllovenë, austriakë, hungareze, bjelloruse dhe gjermane), 44,45 dhe, në Shtetet e Bashkuara dhe Argjentinë, u përcaktua kohët e fundit si një "variant i linjës germinale të përsëritur" në pacientët italianë me kancer BC dhe OC. në Palermo dhe Messina. Interesante, edhe Incorvaia et al.gjeti variantin c.3253dupA në disa familje në Catania.28 PV-të më përfaqësuese BRCA2 janë c.428dup, c.5851_5854delAGTT dhe varianti intronik c.8487+1G>A, të cilat janë raportuar më hollësisht 28 në një pacient në Palermo, është vërejtur në Palermo8855, TT28up me c. familjet në Sicilinë veriperëndimore, kryesisht në rajonet Trapani dhe Palermo, ndërsa c.5851_5854delAGTT PV u vu re në familjet në Sicilinë veriperëndimore. Varianti 8487+1G>A ishte më i zakonshëm në subjektet nga Messina, Palermo dhe Caltanissetta.28 Rebbe.i përshkruar më parë ndryshimin c.5851_5854delAGTT në Kolumbi.37 Një tjetër PV BRCA2, c.631+1G>A, është gjetur te pacientët BC dhe OC nga Siçilia (Agrigento, Siracusa dhe Raguza).28 Veçanërisht, ne vëzhguam bashkëjetesën e dy varianteve c. ) në të njëjtin pacient, i cili supozuam se ishte i ndarë në modalitetin cis, siç u raportua më parë kështu.34,46 Këto mutacione uble BRCA2 vërehen me të vërtetë shpesh në rajonin italian dhe janë zbuluar se futin kodone të ndalimit të parakohshëm, duke ndikuar në bashkimin e ARN-së dhe duke shkaktuar dështimin e proteinës BRCA248.
Ne gjithashtu hartuam PV-të BRCA1 dhe BRCA2 në rajonet e supozuara OCCR dhe BCCR të domeneve dhe gjeneve të proteinave. Këto rajone u përshkruan nga Rebbeck et al.si zona rreziku për zhvillimin e kancerit ovarian dhe të gjirit, përkatësisht.49 Megjithatë, provat në lidhje me lidhjen midis vendndodhjes së varianteve të linjës germinale dhe rrezikut të kancerit të gjirit ose vezoreve mbeten të diskutueshme.28,50-52 Në popullatën tonë, PV-të BRCA1 ishin kryesisht të vendosura në rajonin BCCR, ndërsa BRCA2 PV-të ishin të vendosura në rajonin e papranueshëm për t'u gjetur ndonjëherë. Rajonet OCCR dhe BCCR dhe veçoritë e BC. Kjo mund të jetë për shkak të numrit të kufizuar të pacientëve me mutacione BRCA1/2. Nga këndvështrimi i domenit të proteinave, BRCA1 PV shpërndahen përgjatë gjithë proteinës dhe ndryshimet BRCA2 gjenden më së miri në domenin e përsëritjes BRC.
Së fundi, ne lidhëm tiparet klinikopatologjike të BC me BRCA1/2 PV. Për shkak të numrit të kufizuar të pacientëve të përfshirë, ne gjetëm vetëm një korrelacion të rëndësishëm midis Ki-67 dhe shkallës së tumorit. Edhe pse vlerësimi dhe interpretimi i Ki-67 mbetet disi i diskutueshëm, është e sigurt se ritmet e larta të proliferimit shoqërohen me rritjen e rrezikut dhe uljes së datës së prerjes së sëmundjes. Ki-67 është 20%. Megjithatë, ky prag nuk zbatohet për popullatën tonë të pacientëve me mutacion BRCA1/2, i cili ka një vlerë mesatare Ki-67 prej 25%. Kjo prirje në normat e larta të Ki-67 mund të shpjegohet me prevalencën në grupet tona luminale B dhe TNBC, nga të cilat disa tumore luminale A mund të sugjerojnë që të ketë një provë më të mirë 23-6% H. shtresoj pacientët sipas prognozës së tyre. 53,54 Nga rezultatet e analizës sonë, një korrelacion i rëndësishëm nuk është befasues. Ndodh midis niveleve të larta Ki-67 dhe pranisë së BRCA1 PV. Në fakt, tumoret e lidhura me BRCA1 janë tipike për TNBC dhe shfaqin tipare më agresive.16,17
Si përfundim, ky studim ofron një raport mbi statusin mutacional të BRCA1/2 në një grup BC nga Sicilia lindore. Në përgjithësi, gjetjet tona janë në përputhje me provat paraekzistuese, si në aspektin e prevalencës së mutacionit ashtu edhe në karakteristikat klinikopatologjike në BC. Më shumë studime në popullata më të mëdha të BRCA1/2 të zgjeruara duke përdorur analiza të tilla mutant BCV, duke përdorur analiza multi-mutante të BCV. që janë të dallueshme dhe më pak të shpeshta se BRCA1/2. Kjo do të lejojë identifikimin dhe menaxhimin e duhur të numrit në rritje të subjekteve me rrezik të shtuar të kancerit për shkak të mutacioneve gjenetike.
Ne konfirmuam se pacientët nënshkruan pëlqimin e informuar për të lëshuar mostrat e tyre të tumorit në mënyrë anonime për qëllime kërkimore. Të gjithë pacientët nënshkruan pëlqimin e informuar me shkrim sipas Deklaratës së Helsinkit. Sipas politikës së AOU Policlinico "G.Rodolico – S.Marco", ky studim u përjashtua nga rishikimi etik sepse BRCA1/2 u dha pëlqimin me shkrim të gjithë pacientëve sipas përdorimit të praktikës. të të dhënave të tyre për qëllime kërkimore.
Falenderojmë Prof. Paolo Vigneri për ndihmën e tij në kujdesin e pacientëve me kancer gjiri, siç kërkohet nga Komisioni i Etikës.
Federica Martorana raporton honorare nga Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. Autorët e tjerë deklarojnë se nuk ka konflikt interesi në këtë vepër.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al.Statistikat e Kancerit Global 2020: GLOBOCAN vlerëson incidencën dhe vdekshmërinë e 36 llojeve të kancerit në 185 vende të botës.CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.3332210


Koha e postimit: Prill-15-2022