Ko'krak saratonida BRCA1 / BRCA2 genlarining mutatsion tahlili

Javascript hozirda brauzeringizda oʻchirib qoʻyilgan. Javascript oʻchirilgan boʻlsa, ushbu veb-saytning baʼzi funksiyalari ishlamaydi.
O'zingizning aniq ma'lumotlaringiz va o'ziga xos dori-darmonlaringiz bilan ro'yxatdan o'ting va biz siz taqdim etgan ma'lumotlarga bizning keng ma'lumotlar bazasidagi maqolalar bilan moslashamiz va sizga PDF nusxasini darhol elektron pochta orqali yuboramiz.
mán Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefaniya Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federika Martorana, 1,2 Mishel Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Kristina Gorgone, 6 Expert, Marko Ficherella712 va C. Tibbiyot, Kataniya universiteti, Kataniya, 95123, Italiya; 2 Eksperimental onkologiya va gematologiya markazi, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Kataniya, 95123, Italiya;3 Tibbiy onkologiya, AOU Policlinico “G.Rodolico – San-Marko”, Kataniya, 95123, Italiya;4 Tibbiy genetika, ARNAS Garibaldi, Kataniya, 95123, Italiya;5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Italiya;6 Biotibbiyot va biotexnologiya fanlari kafedrasi, Kataniya universiteti, Tibbiy genetika, Kataniya, Italiya, 95123;7Oasi tadqiqot instituti-IRCCS, Troina, 94018, Italiya Aloqa: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, email [email protected];[email protected] Maqsad: BRCA1 va BRCA2 va aniqlangan koʻkrak saratoni (BC), tuxumdon (OC) va boshqa saraton kasalligining umr boʻyi xavfi bilan bogʻliq germline mutatsiyalari. BRCA geni uchun test oʻtkazish individual xavfni baholash, shuningdek, sogʻlom tashuvchilarda profilaktika usullarini topish va saraton bilan ogʻrigan bemorlarda davolash usullarini tanlash uchun kalit hisoblanadi. Sitsiliya oilalarida BRCA patogen variantlari mavjud bo'lib, Sitsiliyaning sharqiy qismidagi populyatsiyalarga qaratilgan tadqiqotlar mavjud emas. Bizning tadqiqotimizning maqsadi Sitsiliyaning sharqiy qismidagi BC bilan kasallangan bemorlarning kohortidagi BRCA patogen mikrob o'zgarishlarining tarqalishini va tarqalishini o'rganish va ularning keyingi o'zgarishlar bilan bog'liq bo'lgan o'ziga xos BC belgilari bilan bog'liqligini baholash edi. NATIJALAR: Umuman olganda, 35 (9%) bemorda BRCA patogen varianti, BRCA1da 17 (49%) va BRCA2da 18 (51%). BRCA1 o'zgarishlari uch marta salbiy BC bemorlarda keng tarqalgan, holbuki BRCA2 mutatsiyalari ko'proq luminal, BCCA bo'lmagan bemorlarda ko'proq uchraydi. va proliferativ indeks.Xulosalar: Bizning topilmalarimiz Sitsiliyaning sharqiy qismidagi miloddan avvalgi bemorlarda BRCA mutatsion holati haqida umumiy ma'lumot beradi va irsiy BC bilan kasallangan bemorlarni aniqlashda NGS tahlilining rolini tasdiqlaydi. Umuman olganda, bu ma'lumotlar mutatsiya tashuvchilarda saratonni to'g'ri oldini olish va davolash uchun BRCA skriningini qo'llab-quvvatlovchi oldingi dalillarga mos keladi.
Ko'krak bezi saratoni (BC) dunyo bo'ylab eng keng tarqalgan va ayollarda eng halokatli saraton hisoblanadi.1 BC prognozi va klinik xatti-harakatini belgilovchi biologik xususiyatlar vaqt o'tishi bilan keng o'rganilgan va qisman aniqlangan.Aslida, hozirgi vaqtda BCni turli molekulyar kichik tiplarga tasniflash uchun bir nechta surrogat markerlar qo'llaniladi. Ular BC ni turli molekulyar subtiplarga tasniflash uchun qo'llaniladi. Ular insoniy o'sish faktorlari (reseptorlari) va estrogenlar (reseptorlar) (reseptorlar)dir. yoki 2 (HER2) kuchaytirilishi, proliferatsiya indeksi Ki-67 va o'simta darajasi (G).2 Bu o'zgaruvchilarning kombinatsiyasi quyidagi BC toifalarini aniqladi: 1) ER va / yoki PgR ifodasini ko'rsatadigan luminal o'smalar BCs ning 75% ni tashkil etdi. Bu o'smalar Luminal A ga yana bo'lingan, qachon Luminal A ga bo'lingan va B HER6 dan past bo'lsa, Ki-6 va B2-6, manfiy bo'lganida 20% ga teng yoki undan yuqori bo'lgan va proliferatsiya indeksidan qat'i nazar, HER2 kuchaytirilishi mavjud bo'lganda;2) ER va PgR manfiy, lekin HER2 kuchaytirilishini ko'rsatadigan HER2+ o'smalari. Bu guruh barcha ko'krak o'smalarining 10% ni tashkil qiladi;3) ER va PgR ifodasini va HER2 kuchayishini ko'rsatmaydigan uch marta salbiy ko'krak saratoni (TNBC) ko'krak saratoni kasalliklarining taxminan 15% ni tashkil qiladi.2-4
Ushbu BC subtiplari orasida o'simta darajasi va proliferatsiya indeksi o'simta agressivligi va prognozi bilan bevosita va mustaqil ravishda bog'liq bo'lgan kesma biomarkerlarni ifodalaydi.5,6
Yuqorida aytib o'tilgan biologik xususiyatlarga qo'shimcha ravishda, BC rivojlanishiga olib keladigan irsiy genetik o'zgarishlarning roli so'nggi bir necha yil ichida tobora muhim ahamiyat kasb etmoqda.7 Taxminan 10 ta ko'krak o'smalaridan 1 tasi o'ziga xos genlardagi germline o'zgarishlari tufayli meros bo'lib o'tadi.8 Ikki yirik epidemiologik tadqiqot 180 000 dan ortiq ayollarni qamrab olgan (yaqinda 180 000 dan ortiq AARD, ABR1, ABR1, e TM1, 1800 ayollar) aniqlangan. BRCA2, CHK2, PALB2, RAD51C va RAD51D) asosan irsiy BC uchun javobgardir. Bu genlar orasida BRCA1 va BRCA2 (keyingi o'rinlarda BRCA1/2 deb yuritiladi) ko'krak o'smalarining rivojlanishi bilan eng kuchli bog'liqlikni ko'rsatdi. tuxumdonlar, prostata, oshqozon osti bezi, yo'g'on ichak va melanoma, shu jumladan.
Shunisi e'tiborga loyiqki, yaqinda nashr etilgan nashr BC xavfi PV turiga bog'liqligini ko'rsatmoqda. Aslida, patogen kesish variantlari bilan solishtirganda, yaltiroq noto'g'ri variantlar, ayniqsa BRCA1 genida, ayniqsa keksa ayollarda BC xavfining pasayishi bilan bog'liq.15
BRCA1 yoki BRCA2 PV mavjudligi turli biologik va klinikopatologik xususiyatlar bilan bog'liq edi.16,17 BRCA1 bilan bog'liq BClar klinik jihatdan tajovuzkor, yomon differensial va yuqori proliferativ bo'ladi. Bu o'smalar odatda uch marta salbiy bo'lib, erta boshlanadi. va o'zgaruvchan proliferativ indekslar. Bu o'smalar B lümenida ko'proq uchraydi va odatda keksa odamlarda uchraydi.16-18 E'tiborlisi, BRCA1 va BRCA2 mutatsiyalari maxsus davolash usullariga, shu jumladan platina tuzlariga va poli(ADP-riboza) polimeraza inhibitörleri (PARPi) kabi maqsadli dorilarga sezgirlikni oshiradi.19, 12.
So'nggi bir necha yil ichida klinik amaliyotda yangi avlod sekvensiyasining (NGS) joriy etilishi BC bemorlarining soni ko'payib borayotgan saratonga moyillik sindromlari, shu jumladan BRCA1 / 2.21 uchun molekulyar testdan o'tishga imkon berdi. Shu bilan birga, oilaviy tarix, demografik va klinik xususiyatlarni yaxshiroq aniqlash uchun aniq mezonlarga asoslangan ta'riflar 122, individual xususiyatlarni aniqlash. Shu nuqtai nazardan, ma'lum populyatsiyalarda BRCA1/2 skriningi bo'yicha dalillar to'planib, geografik mintaqalar bo'yicha farqlarni ko'rsatmoqda.24–27 Sitsiliyaning g'arbiy qismida BC kogortasi haqida hisobotlar mavjud bo'lsa-da, Sitsiliyaning sharqiy aholisida BRCA1/2 skriningi haqida kamroq ma'lumotlar mavjud.28,29
Biz bu erda Sitsiliyaning sharqiy qismidagi BC bemorlarida BRCA1/2 germline skrining natijalarini tasvirlab beramiz, bu esa BRCA1 yoki BRCA2 mutatsiyalarining mavjudligini ushbu o'smalarning asosiy klinikopatologik xususiyatlari bilan yanada bog'liqdir.
Kataniyadagi San-Marko Polikliniko kasalxonasida joylashgan "Eksperimental onkologiya va gematologiya markazi"da retrospektiv tadqiqot o'tkazildi. 2017 yil yanvaridan 2021 yil martigacha ko'krak va tuxumdonlar, melanoma, oshqozon osti bezi yoki prostata bezi saratoni genetik diagnostikasi bo'yicha jami 455 nafar bemorga laboratoriya tekshiruvi o'tkazildi. uning tadqiqoti Xelsinki deklaratsiyasiga muvofiq olib borildi va barcha ishtirokchilar molekulyar tahlildan oldin yozma ravishda xabardor qilingan rozilik berdilar.
BC ning gistologik va biologik xarakteristikalari (ER, PgR, HER2 holati, Ki-67 va daraja) asosiy biopsiya yoki jarrohlik namunalarida, faqat agressiv o'simta komponentlarini hisobga olgan holda baholandi. Ushbu belgilarga asoslanib, BClar quyidagicha tasniflandi: luminal A (ER+ va/yoki PgR+, HER2-2/0, PgR+, HER2-%, B+R) HER2-, Ki-67≥20%), luminal B-HER2+ (ER va/yoki PgR+, HER2+), HER2+ (ER va PgR-, HER2+) yoki uch marta salbiy (ER va PgR-, HER2-).
BRCA1 va BRCA2 mutatsion holatini baholashdan oldin, onkolog, genetik va psixologni o'z ichiga olgan multidisipliner jamoa BRCA1 va / yoki BRCA1 mavjudligini aniqlash uchun har bir bemor uchun o'simta genetikasi bo'yicha maslahat o'tkazdi.yoki BRCA2 genida PV xavfi yuqori bo'lgan shaxslar. Bemorni tanlash Italiya Tibbiy Onkologiya Jamiyati (AIOM) ko'rsatmalariga va mahalliy Sitsiliya tavsiyalariga muvofiq amalga oshirildi.30,31 Bu mezonlar quyidagilardan iborat: (i) sezuvchanlik genlarida ma'lum patogen variantlarning oilaviy tarixi (masalan, BRCA1, BRCA5, EN);(ii) BC bilan erkaklar;(iii) BC va OC bo'lganlar;(iv) BC <36 yoshda, TNBC <60 yoshda yoki ikki tomonlama BC <50 yoshda bo'lgan ayollar;(v) BC <50 yil shaxsiy kasallik tarixi va kamida bitta birinchi darajali qarindoshi: (a) BC <50 yil;(b) har qanday yoshdagi shilimshiq bo'lmagan va chegaralanmagan OK;v) ikki tomonlama BC;(d) BC erkak;e) oshqozon osti bezi saratoni;(f) prostata saratoni;(vi) ikki yoki undan ortiq BC > 50 yil shaxsiy tarixi va bir-biriga birinchi darajali qarindoshlar (shu jumladan, u birinchi darajali qarindoshlari bo'lgan qarindoshlar) uchun BC, OK yoki oshqozon osti bezi saratoni bilan kasallanganligi;(vii) OKning shaxsiy tarixi va kamida bitta birinchi darajali qarindoshi: (a) BC <50 yil;(b) MOQ;v) ikki tomonlama BC;(d) BC erkak;(vii) yuqori darajadagi seroz OK bo'lgan ayol.
Har bir bemordan 20 ml periferik qon namunasi olindi va EDTA naychalariga (BD Biosciences) yig‘ildi. Genomik DNK QIAsymphony DSP DNK Midi Izolyatsiya to‘plami (QIAGEN, Hilden, Italiya) yordamida 0,7 ml to‘liq qon namunalaridan ajratildi (QIAGEN, Hilden, Italiya). , Waltham, MA, AQSH) Miqdorni aniqlash.Maqsadni boyitish va kutubxonani tayyorlash Oncomine™ BRCA Research Assay Chef tomonidan amalga oshiriladi, ishlab chiqaruvchining ko'rsatmalariga muvofiq avtomatlashtirilgan kutubxona tayyorlash uchun Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 to'plamiga yuklashga tayyor. To'plam barcha BRCA1 va (NMCA_0500) ni o'rganish uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan ikkita multipleks PCR primer pullaridan iborat (NM05000) genlar.Qisqacha, har bir suyultirilgan DNK namunasidan 15 µL (10 ng) kutubxona tayyorlash uchun shtrixli plitalarga qo‘shildi va barcha reagentlar va sarf materiallari Ion Chef™ asbobiga yuklandi. Keyin Ion Chef™ asbobida avtomatlashtirilgan kutubxona tayyorlash va shtrixli namunalar kutubxonasini birlashtirish amalga oshirildi. Keyin tayyorlangan kutubxonalar soni F3 mkl tomonidan baholandi. tific, Waltham, MA, AQSH) ishlab chiqaruvchi koʻrsatmalariga muvofiq. Nihoyat, kutubxonalar Ion Chef™ kutubxonasi namuna naychalarida (shtrix-kodli naychalar) ekvimolyar nisbatlarda birlashtiriladi va Ion Chef™ asbobiga yuklanadi. Ketma-ketlik Ion Torrent S5 (Thermo Fisher Scientific) (Thermo Fisher Scientific) Fishermo5 (Thermo Fisher Scientific) Scientific Mo510R asbobi yordamida amalga oshirildi. Fisher Scientific).Ma'lumotlar tahlili Amplicon Suite (SmartSeq srl) va Ion Reporter Software tomonidan amalga oshirildi.
Barcha variant nomenklaturasi Internetda mavjud (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen) mavjud Inson Genomi Variatsiyasi Konsorsiumining joriy ko'rsatmalariga amal qildi. BRCA1/2 variantlarining klinik ahamiyati ENIGMA (Evidence-Based Germline Network for Interpreting All Consortium) tasnifi yordamida aniqlangan. ARUP, BRCAEXCHANGE, ClinVar, IARC_LOVD va UMD kabi turli xil ma'lumotlar bazalarida. Tasniflash beshta turli xavf toifalarini o'z ichiga oladi: yaxshi (I toifa), ehtimol yaxshi (II toifa), noaniq ahamiyatga ega variant (VUS, III toifa), ehtimoliy patogen (IV toifa) va patogen V toifadagi protein strukturasiga mutatsiyaga uchragan funktsiyani tahlil qilish va patogen V toifasi. 30 ta ma'lumotlar bazasiga kirish imkoniyati bilan.32
Har bir VUSga potentsial klinik ahamiyatga ega bo'lish uchun proteinni bashorat qilishning quyidagi hisoblash algoritmlaridan foydalanilgan: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu//genetics.bwh.harvard.edu/http://pph2hdg.Gv) u/agvgd_input.php).1 va 2-sinf sifatida tasniflangan variantlar yovvoyi tip deb hisoblangan.
Sanger sekvensiyasi har bir patogen variant mavjudligini tasdiqladi. Qisqacha aytganda, BRCA1 va BRCA2 gen mos yozuvlar ketma-ketliklaridan (NG_005905.2, NM_007294.3 va NG_012772.3, NM_030 tomonidan belgilangan tartibda amalga oshirildi, PC5 tomonidan nishonga olindi). gerni tartiblash.
BRCA1/2 geni uchun manfiy sinovdan o'tgan bemorlar ishlab chiqaruvchining ko'rsatmalariga muvofiq, katta genomik qayta tashkil etish (LGR) mavjudligini baholash uchun multipleks ligatsiyaga bog'liq zond amplifikatsiyasi (MLPA) bilan sinovdan o'tkazildi. Qisqasi, DNK namunalari denatüratsiya qilinadi va har birida taxminan 60 ta BRCA1 va BRCA2 genlari aniqlangan, har birida o'ziga xos nuktalardan foydalaniladi. PCR amplikonlarining noyob to'plamidan iborat bo'lgan uzunlik. Prob kuchaytiruvchi mahsulotlar keyinchalik kapillyar elektroforez va Cofalyser.Net dasturiy ta'minoti tomonidan tegishli partiyaga xos Cofalyser jadvallari (www.mrcholland.com) bilan birgalikda tahlil qilindi.
Tanlangan klinikopatologik o'zgaruvchilar (gistologik daraja va Ki-67% proliferatsiya indeksi) BRCA1/2 PV mavjudligi bilan bog'liq bo'lib, Prism dasturiy ta'minoti v. 8.4 yordamida Fisherning p-qiymati <0,05 muhim deb faraz qilingan aniq testidan foydalangan holda hisoblangan.
2017-yil yanvaridan 2021-yil martigacha 455 nafar bemor germline BRCA1/2 mutatsiyalari uchun skriningdan oʻtkazildi. Mutatsion test Policlinico kasalxonasining Eksperimental onkologiya va gematologiya markazida oʻtkazildi. Sitsiliya yoʻriqnomasiga koʻra (http://www.gurs.regione.it.01V, N.1V, N.1V. Gennaio 2020), Kataniya Rodoliko - San-Marko" umumiy, 389 bemor ko'krak saratoni, 37 tuxumdon saratoni, 16 oshqozon osti bezi saratoni, 8 prostata saratoni va 5 melanoma bor edi.Bemorlarning saraton turi va tahlil natijalari bo'yicha taqsimlanishi 1-rasmda ko'rsatilgan.
1-rasmda tadqiqotning umumiy ko'rinishi ko'rsatilgan oqim diagrammasi ko'rsatilgan. Ko'krak, melanoma, oshqozon osti bezi, prostata yoki tuxumdon o'smalari bo'lgan bemorlar BRCA1 va BRCA2 genlarida mutatsiyalar uchun sinovdan o'tkazildi.
Qisqartmalar: PVs, patogen variant;VUS, noaniq ahamiyatga ega variant;WT, yovvoyi turdagi BRCA1/2 ketma-ketligi.
Biz tadqiqotlarimizni tanlab ko'krak bezi saratoni kogortalariga qaratdik. Bemorlarning o'rtacha yoshi 49 yosh (diapazon 23-89) va asosan ayollar (n=376 yoki 97%) edi.
Ushbu sub'ektlarning 64 tasi (17%) BRCA1/2 mutatsiyasiga ega bo'lib, barchasi ayol edi. O'ttiz beshtasida (9%) PV va 29 tasida (7,5%) VUS bor edi. 35 ta patogen variantning 17 tasi (48,6%) BRCA1da va 18 tasi (51,4%) BRCA2da (%18) va 582 tasi (%12) BRCA . BRCA2 da (1 va 2-rasmlar). MLPA tahlilida LGR mavjud emas edi.
Shakl 2. 389 ko'krak bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda BRCA1 va BRCA2 mutatsiyalarining tahlili. (A) 389 ko'krak bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda patogen variantlar (PV) (qizil), noaniq ahamiyatga ega variantlar (VUS) (to'q sariq) va WT (ko'k) taqsimoti;(B) 389 ko'krak bezi saratoni bemorlar O'ttiz besh (9%) BRCA1 / 2 patogen variantlari (PVs) bor edi. Ularning orasida 17 (48,6%) BRCA1 PV tashuvchisi (to'q qizil) va 18 (51,4%) BRCA2 tashuvchisi (ochiq qizil);(C) 389 sub'ektdan 29 (7,5%) VUS, 5 (17,2%) BRCA1 genlari (to'q to'q sariq) va 24 (82,8%) BRCA2 genlari (ochiq to'q sariq).
Qisqartmalar: PVs, patogen variant;VUS, noaniq ahamiyatga ega variant;WT, yovvoyi turdagi BRCA1/2 ketma-ketligi.
Keyinchalik biz BRCA1/2 PV bilan og'rigan bemorlarda BC molekulyar subtiplari tarqalishini o'rganib chiqdik. Tarqatish 2 (5,7%) luminal A, 15 (42,9%) luminal B, 3 (8,6%) luminal B-HER2+, 2 (5,7%) HER2+ va 13 (37% HER2+) va 13 (37% BCN1BR) bilan kasallangan. 9,4% da luminal B BC, 2 ta (11,8%) HER2+ kasalligi va 10 ta (58,8%) TNBCga ega. BRCA1 mutatsiyalari bo'lmagan o'smalar yo luminal A yoki luminal B-HER2+ edi (3-rasm). BRCA2-musbat kichik guruhida 10 luminal (%) (%), B 10 luminal (%) 6.5. B-HER2+, 3 (16,7%) TNBC va 2 (11,1%) luminal A edi (3-rasm).Ushbu guruhda HER2+ o'smalari mavjud emas edi. Shunday qilib, BRCA1 mutatsiyalari TNBC bemorlarida keng tarqalgan, BRCA2 o'zgarishlari esa B lümenli shaxslarda ustunlik qiladi.
Shakl 3 BRCA1 va BRCA2 patogen variantlari bo'lgan bemorlarda ko'krak bezi saratoni pastki turlarining tarqalishi. Ko'krak bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarning molekulyar subtiplari o'rtasida BRCA1- (to'q qizil) va BRCA2- (ochiq qizil) PVlarning taqsimlanishini ko'rsatadigan gistogrammalar. Har bir quti ichida xabar qilingan raqamlar BRCA21 va har bir ko'krak saratoni subtipi bo'lgan bemorlarning foizini bildiradi.
Qisqartmalar: PVs, patogen variant;HER2+, inson epidermal o'sish omili retseptorlari 2 ijobiy;TNBC, uch marta salbiy ko'krak saratoni.
Keyinchalik, biz BRCA1 va BRCA2 PV larining turi va gen lokalizatsiyasini baholadik. BRCA1 PV da biz 7 ta bitta nukleotid variantini (SNV), 6 ta oʻchirishni, 3 ta dublikatsiyani va 1 ta kiritishni kuzatdik. Faqat bitta mutatsiya (c.5522delG) BRCAda eng koʻp uchraydigan kashfiyotdir. c.155. delCTAAT.Bu oʻzgarish BRCA1-ekson 15da beshta nukleotidning (CTAAT) oʻchirilishini oʻz ichiga oladi, natijada 1679-kodonda aminokislota leysinni tirozin bilan almashtiradi va translatsiya ramkasining prognoz qilingan muqobil toʻxtash kodoniga olib kelishi tufayli, PVda faqat bitta oqsilning erta kesilishi aniqlanmagan. ulanish joyi konsensus mintaqasi (c.4357+1G>T) (1-jadval).
BRCA2 PVga kelsak, biz 6 ta oʻchirish, 6 ta SNV va 2 ta dublikatsiyani kuzatdik. Topilgan oʻzgarishlarning hech biri yangi emas. Bizning populyatsiyada uchta mutatsiya takrorlangan, c.428dup va c.8487+1G>A, 3 ta subʼyektda kuzatilgan, soʻngra c.5851_5854del AG4da c.5851_5854del AG4 ta takrorlangan. BRCA2 ning 5-eksonida kesilgan, funktsional bo'lmagan oqsilni kodlashi taxmin qilinmoqda. c.8487+1G>A mutatsiyasi BRCA2 intron 19 ning intronik hududida (± 1,2) sodir bo'ladi va qo'shilish konsensus ketma-ketligiga ta'sir qiladi, natijada qo'shilish o'zgargan yoki abnormal protein55 AG ga olib keladi. Bu BRCA2 genining 10-kodlash eksonida 5851-5854 nukleotid pozitsiyalaridan 4-nukleotidning oʻchirilishiga bogʻliq boʻlib, bashorat qilingan alternativ toʻxtash-kodon (p.S1951WfsTer) bilan translatsion ramka siljishiga olib keladi. Shunisi eʼtiborga loyiqki, avval xabar qilinganidek, har ikkala oʻzgarishlar ham c0-07T va c08-03-da aniqlangan. 4 Birinchi mutatsiya BRCA2 7 eksonidagi adenozin (A) ni guanin (G) ni o'z ichiga olgan nukleotid bilan almashtirishni o'z ichiga oladi, natijada 211-kodonda valin izolösinga o'zgaradi, izolösin Aminokislota juda o'xshash xususiyatlarga ega aminokislotadir. Bu o'zgarish normal mRNKga ta'sir qiladi va ikkinchisi T ning qo'shilishidan oldin ikkita subonik mintaqada joylashgan. BRCA2 ni kodlovchi genning 13 tasida. c.7008-2A>T o'zgarishi turli uzunlikdagi bir nechta transkriptlarni yaratishi mumkin. Bundan tashqari, BRCA2 PV guruhida 18 o'zgarishdan 4 tasi (22,2%) intronik edi.
Keyin biz funktsional domenlarda va oqsillarni bog'laydigan hududlarda BRCA1 / 2 zararli mutatsiyalarini xaritalashtirdik (4-rasm). BRCA1 genida PVlarning 50% ko'krak bezi saratoni klaster mintaqasida (BCCR) joylashgan bo'lsa, mutatsiyalarning 22% tuxumdon saratoni klasteri mintaqasida (OCCR) joylashgan edi (4-rasm, PVBR BC3 variantida joylashgan). CR mintaqasi va mutatsiyalarning 42,8% OCCRda joylashgan (4B-rasm).Keyingi, biz PV ning BRCA1 va BRCA2 protein domenlaridagi joylashuvini baholadik.BRCA1 oqsili uchun biz halqa va o'ralgan lasan domenlarida uchta PV va ikkita mutatsiyani topdik, BRCTA domenida ikkita mutatsiya, maPV4 domenini takrorlang. Oligo/oligosaxaridlarni bog'lash (OB) va minora (T) domenlarida 3 ta intronik va 3 ta ekzonik o'zgarishlar aniqlandi (4B-rasm).
4-rasm BRCA1 va BRCA2 oqsillarining sxematik ko‘rinishi va patogen variantlarning lokalizatsiyasi. Bu rasmda ko‘krak bezi saratoni bilan og‘rigan bemorlarda BRCA1 (A) va BRCA2 (B) patogen variantlari taqsimoti ko‘rsatilgan. Ekzonik mutatsiyalar ko‘k rangda, intronik variantlar esa to‘q sariq rangda ko‘rsatilgan. Chiziq balandligi holatlar sonini va ularning xabar qilingan BRCABR oqsili (BRCA21) hisoblanadi. oqsil halqa domenini (RING) va yadro lokalizatsiyasi ketma-ketligini (NLS), o'ralgan domenni, SQ/TQ klaster domenini (SCD) va BRCA1 C-terminal domenini (BRCT) o'z ichiga oladi. (B) BRCA2 oqsili sakkizta BRC takrorini, DNKni bog'lovchi domenni o'z ichiga oladi, spiral domen (helikal/bog'lovchi domen) o'z ichiga oladi. minora domeni (T) va C tomonida NLS. Ko‘krak bezi saratoni klasteri hududi (BCCR) va tuxumdon saratoni klasteri hududi (OCCR) deb ataladigan hududlar pastki qismida ko‘rsatilgan.*To‘xtash kodonlarini aniqlaydigan mutatsiyalarni ifodalaydi.
Keyin biz BRCA1 / 2 PV mavjudligi bilan bog'liq bo'lishi mumkin bo'lgan BC klinikopatologik xususiyatlarini o'rganib chiqdik. 181 BRCA1 / 2-salbiy bemorlar (tashuvchilar bo'lmagan) va barcha tashuvchilar (n = 35) uchun to'liq klinik yozuvlar mavjud edi. O'smaning tarqalishi darajasi va darajasi o'rtasida korrelyatsiya mavjud edi.
Biz Ki-67 ning taqsimlanishini kohortimizning medianasi asosida hisobladik (25%, diapazon <10-90%). Ki-67 < 25% boʻlgan subʼyektlar “past Ki-67”, ≥ 25% qiymatga ega boʻlgan shaxslar esa “yuqori Ki-67″ deb taʼriflangan. tashuvchilar (5A-rasm).
5-rasm Ki-67 ning BRCA1 va BRCA2 PVlari bo'lgan va bo'lmagan ko'krak bezi saratoni bilan kasallangan ayollarda daraja taqsimoti bilan o'zaro bog'liqligi. (A) Miloddan avvalgi 181 ta tashuvchi bo'lmagan bemorlarda BRCA1 (18) yoki BRCA2 (17) PV bemorlarida o'rtacha Ki-67 qiymatlarini ko'rsatadigan diagramma diagrammasi. BRCA1 va BRCA2 mutatsion holatiga ko'ra gistologik daraja guruhlari (G2 va G3) (WT sub'ektlari, BRCA1 va BRCA2 PV tashuvchilari).
Xuddi shunday, biz o'simta darajasining BRCA1/2 PV mavjudligi bilan bog'liqligini tekshirdik. Bizning populyatsiyada G1 BC yo'qligi sababli, biz bemorlarni ikki guruhga (G2 yoki G3) ajratdik. Ki-67 natijalariga muvofiq, tahlil o'simta darajasi va BRCA1 proporti bo'lmagan GBR mutatsiyasiga nisbatan statistik jihatdan muhim korrelyatsiyani aniqladi. riers (p<0,005) (5B-rasm).
DNK ketma-ketligi texnologiyasidagi yutuqlar BRCA1/2 genetik testida misli ko'rilmagan yutuqlarga erishdi, bu esa oilada saraton kasalligiga chalingan bemorlar uchun juda muhim ta'sir ko'rsatdi. Bugungi kunga kelib, taxminan 20.000 BRCA1/2 varianti aniqlangan va Amerika Tibbiyot Genetika Jamiyati 35 va EN5CA3BR mutatsiyalar tizimiga muvofiq tasniflangan. geografik mintaqalarda keng farq qiladi.37 Italiyada BRCA1/2 PVs darajasi 8% dan 37% gacha boʻlib, mamlakat ichidagi keng oʻzgaruvchanlikni koʻrsatdi.38,39 Deyarli 5 million aholiga ega Sitsiliya aholisi soni boʻyicha Italiyada beshinchi yirik mintaqa hisoblanadi. orolning bir qismi.
Bizning tadqiqotimiz Sharqiy Sitsiliyadagi BC bemorlarida BRCA1/2 PV bilan kasallanish holatlari haqidagi birinchi hisobotlardan biridir.28 Biz tahlillarimizni BCga qaratdik, chunki bu bizning guruhimizdagi eng keng tarqalgan kasallikdir.
Miloddan avvalgi 389 bemorni sinovdan o'tkazishda 9% BRCA1/2 PV ni olib yurgan, ular BRCA1 va BRCA2 o'rtasida teng taqsimlangan. Bu natijalar Italiya populyatsiyasida ilgari e'lon qilingan natijalarga mos keladi.28 Qizig'i shundaki, bizning kogortamizning 3% (13/389) erkaklar edi. Bu ko'rsatkich bizdagi barcha ko'krak bezi saratoni turlari bo'yicha erkaklarda kutilganidan yuqori (BCCA14) ni aks ettiradi14), Mutatsiya xavfi.Biroq, bu erkaklarning hech biri BRCA1/2 PVni ishlab chiqmagan, shuning uchun ular PALB2, RAD51C va D kabi kamroq tarqalgan mutatsiyalar mavjudligini istisno qilish uchun keyingi molekulyar tahlilga nomzod bo'lgan. Noaniq ahamiyatga ega variantlar BRCAE VUS bo'lgan sub'ektlarning 7 foizida topilgan, bu BRCAE VUS oldingi natijadan iborat edi124, 124.
BRCA1 / 2 mutant ayollarida BC Molekulyar subypepes (55,8%) (58,8%) va BRCA1 PV, BRCA1 va BRCA2 PV oralig'ida (58,6%) tarqatishni tahlil qilganimizda, mavjud adabiyot ma'lumotlariga mos keladi16,43
Keyin biz BRCA1/2 PV turi va joylashuviga e'tibor qaratamiz. Bizning kohortimizda eng keng tarqalgan BRCA1 PV c.5035_5039delCTAAT edi. Garchi Incorvaia va boshqalar.Sitsiliya kogortida bu variantni tasvirlamagan, boshqa mualliflar uni BRCA1 PV germline sifatida xabar qilishgan.34 Bizning kohortimizda bir nechta BRCA1 PV topilgan - masalan c.181T>G, c.514del, c.3253dupA va c.5266dupC - bular SBR118.28 dan ikkita mutatsiyada kuzatilgan. >G va c.5266dupC) odatda Sharqiy va Markaziy Yevropadagi Ashkenazi yahudiylarida (Polsha, Chexiya), sloveniyalik, avstriyalik, vengriyalik, belaruslik va nemislarda uchraydi, 44,45 va AQSh va Argentinada yaqinda “takroriy germline varianti” sifatida aniqlangan, BC va shimoliy koʻkrak bezi saratoni bilan kasallangan italiyalik bemorlarda OC345 oldingi varianti aniqlangan. Palermo va Messinadagi Sitsiliya. Qizig'i shundaki, hatto Incorvaia va boshqalar.Kataniyadagi ba'zi oilalarda c.3253dupA variantini topdi.28 Eng ko'p vakili BRCA2 PV'lari c.428dup, c.5851_5854delAGTT va intronik variant c.8487+1G>A bo'lib, ular batafsilroq ma'lum qilingan 28 Palermodagi bemorda c.425845 uyida c.425845da kuzatilgan. Sitsiliya shimoli-g'arbiy qismida, asosan Trapani va Palermo mintaqalarida, c.5851_5854delAGTT PV esa shimoli-g'arbiy Sitsiliyadagi uy xo'jaliklarida kuzatilgan. 8487+1G>A varianti Messina, Palermo va Kaltanissetta sub'ektlarida ko'proq tarqalgan.28 Rebbeck va boshqalar.avvalroq Kolumbiyadagi c.5851_5854delAGTT oʻzgarishi tasvirlangan.37 Yana bir BRCA2 PV, c.631+1G>A, Sitsiliyadan (Agrigento, Sirakusa va Ragusa) BC va OC bemorlarida topilgan.28 Taʼkidlash joizki, biz ikkita BRCA2 va c.-1G>2T variantining (BRCA2 c.10.8) birgalikda mavjudligini kuzatdik. Xuddi shu bemorda, biz ilgari xabar qilganimizdek, sis rejimida ajratilgan deb faraz qilgandik.34,46 Ushbu BRCA2 uble mutatsiyalari haqiqatan ham Italiya mintaqasida tez-tez kuzatiladi va erta to'xtash kodonlarini kiritgani aniqlangan, bu esa messenjer RNK birlashishiga ta'sir qiladi va BRCA2 oqsilining ishlamay qolishiga olib keladi.47,48
Shuningdek, biz BRCA1 va BRCA2 PV-larini oqsil domenlari va genlarining taxminiy OCCR va BCCR mintaqalarida xaritalashtirdik. Bu hududlar Rebbek va boshqalar tomonidan tasvirlangan.mos ravishda tuxumdonlar va ko'krak saratoni rivojlanishi uchun xavf zonalari sifatida.49 Biroq, germline variantlarining joylashuvi va ko'krak yoki tuxumdon saratoni xavfi o'rtasidagi bog'liqlik haqidagi dalillar munozarali bo'lib qolmoqda.28,50-52 Bizning populyatsiyada BRCA1 PVs asosan BCCR hududida joylashgan bo'lsa, biz BRCA2 PVXdan oldingi hududlarda joylashgan bo'lsak. taxminiy OCCR va BCCR hududlari va BC xususiyatlari o'rtasidagi bog'liqlik. Bu BRCA1/2 mutatsiyalari bo'lgan bemorlarning cheklangan soni bilan bog'liq bo'lishi mumkin. Protein sohasi nuqtai nazaridan, BRCA1 PV'lari butun oqsil bo'ylab taqsimlanadi va BRCA2 o'zgarishlari BRC takrorlash domenida afzal ko'riladi.
Nihoyat, biz BC klinikopatologik xususiyatlarni BRCA1/2 PV bilan bog'ladik. Bemorlarning cheklangan soni tufayli biz Ki-67 va o'simta darajasi o'rtasida faqat sezilarli bog'liqlik borligini aniqladik. Ki-67 ni baholash va talqin qilish biroz munozarali bo'lib qolsa-da, yuqori proliferativ ko'rsatkichlar kasallikning takrorlanish xavfi va qisqarishi bilan bog'liqligi aniq. yuqori" va "past" Ki-67 20% ni tashkil qiladi. Biroq, bu chegara Ki-67 o'rtacha qiymati 25% bo'lgan BRCA1/2 mutatsiyasiga chalingan bemorlarga taalluqli emas. Ki-67 yuqori stavkalaridagi bu tendentsiyani bizning luminal B va TNBC kogortalarida keng tarqalganligi bilan izohlash mumkin. 7 kesish (25-30%) bemorlarni prognozlariga ko'ra yaxshiroq tabaqalashtirishi mumkin.53,54 Bizning tahlilimiz natijalariga ko'ra, muhim korrelyatsiya ajablanarli emas. Yuqori Ki-67 va darajalar va BRCA1 PV mavjudligi o'rtasida sodir bo'ladi.Aslida, BRCA1 bilan bog'liq o'smalar TNBCga xos bo'lib, ko'proq namoyon bo'ladi17.
Xulosa qilib aytganda, ushbu tadqiqot Sitsiliyaning sharqiy qismidagi miloddan avvalgi kohortdagi BRCA1/2 ning mutatsion holati to'g'risida hisobot beradi. Umuman olganda, bizning topilmalarimiz mutatsiyalarning tarqalishi va BCdagi klinikopatologik xususiyatlar bo'yicha ham oldingi dalillarga mos keladi. BRCA1/2-mutantning katta populyatsiyalarida ko'proq tadqiqotlar o'tkazilgan, masalan, ko'p mutatsiyaga uchragan BC genlarini tahlil qilish uchun kengaygan BC genlarini tahlil qilish. lar BRCA1/2 dan farqli va kamroq uchraydi. Bu genetik mutatsiyalar tufayli saraton xavfi ortib borayotgan sub'ektlar sonini aniqlash va to'g'ri boshqarish imkonini beradi.
Biz bemorlar oʻsimta namunalarini tadqiqot maqsadida anonim ravishda chiqarishga rozilik berganligini tasdiqladik. Barcha bemorlar Xelsinki deklaratsiyasiga muvofiq yozma xabardor qilingan rozilikni imzoladilar. AOU Policlinico “G.Rodolico – S.Marko” siyosatiga koʻra, ushbu tadqiqot etik tekshiruvdan ozod qilindi, chunki BRCA1/2 amaliyoti yozma ravishda oʻtkazilgan va barcha bemorlarga tahliliy rozilik berilgan. s shuningdek, ularning ma'lumotlaridan tadqiqot maqsadlarida foydalanishga rozilik beradi.
Professor Paolo Vigneriga Etika qo'mitasi talabiga binoan ko'krak bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarni parvarish qilishda yordam bergani uchun minnatdorchilik bildiramiz.
Federika Martorana Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizerdan gonorar haqida xabar beradi. Boshqa mualliflar bu ishda manfaatlar to'qnashuvi yo'qligini e'lon qilmaydi.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, va boshqalar. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN dunyoning 185 mamlakatida 36 saraton kasalligi bilan kasallanish va o'lim darajasini taxmin qiladi. CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.ca32.doi:


Yuborilgan vaqt: 2022 yil 15 aprel